Clc07G05530 (gene) Watermelon (cordophanus) v2

Overview


Name	Clc07G05530
Type	gene
Organism	Citrullus lanatus subsp. cordophanus cv. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Description	S-protein homolog
Location	ClcChr07: 7480322 .. 7528702 (+)
RNA-Seq Expression	Clc07G05530
Synteny	Clc07G05530

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide

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mRNA sequence

ATGCATCAACTCATGTTATTATCATTAGGCTTCTTACTTATCGCGTTTCGACCAACAGTTGGAAGTGCAGTAAGACAACCGAATAGATCTCTTATTGATCTAAAGAAATTTCATGTAGAAATTCGTAACATGATGGAAATGTATATATTGGATAGCCATTGTCGGTCAAAAGACAACGATTTAGGGTTACATATACTTCTTCCAGGTGAAAAACAACGTTGGTCATTCAGAACGAATATTTGGGAAACAACCTTATTCCATTGCACATTGAAATGGGAAAGAGGGTCTAGGGAGTTTAAAGCATTTTATTTTGATGATGCTTTCTTTAGTGTGTTCTGTCCCGAAAGAGAATGTGTTTGGTTAGCCGAACAAGGTGGACTTTCTATGGTGAATAGAGCTGGTATATGTATTTTAGGGTTGGTAAACTTTCAAGTATTGAAGGAAGAAGTGAACGAAGCTAGAAGTATTTTAGCTCTTGATTATCGATCTTTCTCACCTCCACACATTGAAATTGGAGATCTCAACATTGAGTTGAGGGAAGACTCACCGTTGGCTCCTGAGCATAGTGAAGTGTCTATTCTCCCACCTACTGAAGAAGAAAATTTGAGGGAGCCGACACCACCACCTCCTCCGCCTGCAGTTGAACAAAATTTGTCTTCAAACGTTGTGGAGTCAATGCACCAAAACTCCTCACCGCCATCGCCCATTGAAATTGAAAAGGAAAAGACTTTAGACCCTGTGGAGTCATCAAATCAACCTATCATCCTGCCGCCACCTACTATTAATGACCCAATTGGCCAAGGCCCCAGCACTTTATAA

Coding sequence (CDS)

ATGCATCAACTCATGTTATTATCATTAGGCTTCTTACTTATCGCGTTTCGACCAACAGTTGGAAGTGCAGTAAGACAACCGAATAGATCTCTTATTGATCTAAAGAAATTTCATGTAGAAATTCGTAACATGATGGAAATGTATATATTGGATAGCCATTGTCGGTCAAAAGACAACGATTTAGGGTTACATATACTTCTTCCAGGTGAAAAACAACGTTGGTCATTCAGAACGAATATTTGGGAAACAACCTTATTCCATTGCACATTGAAATGGGAAAGAGGGTCTAGGGAGTTTAAAGCATTTTATTTTGATGATGCTTTCTTTAGTGTGTTCTGTCCCGAAAGAGAATGTGTTTGGTTAGCCGAACAAGGTGGACTTTCTATGGTGAATAGAGCTGGTATATGTATTTTAGGGTTGGTAAACTTTCAAGTATTGAAGGAAGAAGTGAACGAAGCTAGAAGTATTTTAGCTCTTGATTATCGATCTTTCTCACCTCCACACATTGAAATTGGAGATCTCAACATTGAGTTGAGGGAAGACTCACCGTTGGCTCCTGAGCATAGTGAAGTGTCTATTCTCCCACCTACTGAAGAAGAAAATTTGAGGGAGCCGACACCACCACCTCCTCCGCCTGCAGTTGAACAAAATTTGTCTTCAAACGTTGTGGAGTCAATGCACCAAAACTCCTCACCGCCATCGCCCATTGAAATTGAAAAGGAAAAGACTTTAGACCCTGTGGAGTCATCAAATCAACCTATCATCCTGCCGCCACCTACTATTAATGACCCAATTGGCCAAGGCCCCAGCACTTTATAA

Protein sequence

MHQLMLLSLGFLLIAFRPTVGSAVRQPNRSLIDLKKFHVEIRNMMEMYILDSHCRSKDNDLGLHILLPGEKQRWSFRTNIWETTLFHCTLKWERGSREFKAFYFDDAFFSVFCPERECVWLAEQGGLSMVNRAGICILGLVNFQVLKEEVNEARSILALDYRSFSPPHIEIGDLNIELREDSPLAPEHSEVSILPPTEEENLREPTPPPPPPAVEQNLSSNVVESMHQNSSPPSPIEIEKEKTLDPVESSNQPIILPPPTINDPIGQGPSTL

Homology

[Close]

BLAST of Clc07G05530 vs. NCBI nr
Match: KAG7031483.1 (S-protein-like 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma])

HSP 1 Score: 170.2 bits (430), Expect = 2.4e-38
Identity = 77/138 (55.80%), Postives = 101/138 (73.19%), Query Frame = 0


Query: 1   MHQLMLLSLGFLLIAFRPTVGSA----VRQPNRSLIDLKKFHVEIRNMMEMYILDSHCRS 60
           M +L+LL LG LL+   PT G++     +Q  RSL+D+ KFHVEIRN ++MYILDSHC S
Sbjct: 183 MDRLVLLWLGLLLMMSCPTTGASEEQQQQQQERSLVDIPKFHVEIRNGLKMYILDSHCFS 242

Query: 61  KDNDLGLHILLPGEKQRWSFRTNIWETTLFHCTLKWERGSREFKAFYFDDAFFSVFCPER 120
           KD+DLGLHIL P ++Q WSFR N W  TLFHC L+WERG +EF AF+ D+ FF  +C   
Sbjct: 243 KDDDLGLHILFPDDQQSWSFRDNFWGRTLFHCRLEWERGFKEFDAFFVDEVFFDEYCSNF 302

Query: 121 ECVWLAEQGGLSMVNRAG 135
            C+W+A+Q G+ M+N+AG
Sbjct: 303 RCIWIAKQDGIYMLNKAG 320

[Close]

BLAST of Clc07G05530 vs. NCBI nr
Match: KAG6600849.1 (S-protein-like 74, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 162.2 bits (409), Expect = 6.5e-36
Identity = 69/119 (57.98%), Postives = 90/119 (75.63%), Query Frame = 0


Query: 18  PTVGSA--VRQPNRSLIDLKKFHVEIRNMMEMYILDSHCRSKDNDLGLHILLPGEKQRWS 77
           PT G++   +Q  RSL+D+ KFHVEIRN ++MYILDSHC SKD+DLGLHIL P ++Q WS
Sbjct: 5   PTTGASKEQQQQERSLVDIPKFHVEIRNGLKMYILDSHCFSKDDDLGLHILFPDDQQSWS 64

Query: 78  FRTNIWETTLFHCTLKWERGSREFKAFYFDDAFFSVFCPERECVWLAEQGGLSMVNRAG 135
           FR N W  TLFHC L+WERG +EF AF+ D+ FF  +C    C+W+A+Q G+ M+N+AG
Sbjct: 65  FRDNFWGRTLFHCRLEWERGFKEFDAFFVDEVFFDEYCSNFRCIWIAKQDGIYMLNKAG 123

[Close]

BLAST of Clc07G05530 vs. NCBI nr
Match: XP_023546939.1 (S-protein homolog 74-like [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 158.7 bits (400), Expect = 7.2e-35
Identity = 67/110 (60.91%), Postives = 85/110 (77.27%), Query Frame = 0


Query: 25  RQPNRSLIDLKKFHVEIRNMMEMYILDSHCRSKDNDLGLHILLPGEKQRWSFRTNIWETT 84
           +Q  RSLID+ KF VEIRN ++MYILDSHC SKD+DLGLHIL P ++Q WSFR NIW  T
Sbjct: 9   QQQERSLIDIPKFRVEIRNGLQMYILDSHCFSKDDDLGLHILFPDDQQSWSFRDNIWGRT 68

Query: 85  LFHCTLKWERGSREFKAFYFDDAFFSVFCPERECVWLAEQGGLSMVNRAG 135
           LFHC L+WERG +EF AF+ D+ FF  +C    C+W+A+Q G+ M+N+AG
Sbjct: 69  LFHCRLEWERGFKEFDAFFVDEVFFDEYCSNFRCIWIAKQDGIYMLNKAG 118

[Close]

BLAST of Clc07G05530 vs. NCBI nr
Match: KGN51432.1 (hypothetical protein Csa_007732 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 127.1 bits (318), Expect = 2.3e-25
Identity = 63/134 (47.01%), Postives = 82/134 (61.19%), Query Frame = 0


Query: 2   HQLMLLSLGFLLIAFRPTVGSAVRQPNR-SLIDLKKFHVEIRNMMEMYILDSHCRSKDND 61
           H L+LL   FL++ F  ++      P + S+I L  + +EI N +EMY+LDSHC SKDND
Sbjct: 4   HLLVLLIFLFLIVLFDMSMARFSFAPQKSSIIQLHHYQIEIHNDLEMYLLDSHCFSKDND 63

Query: 62  LGLHILLPGEKQRWSFRTNIWETTLFHCTLKWERGSREFKAFYFDDAFFSVFCPERECVW 121
           LGLHIL PGE Q WSF+ N +ETT F C L+WE G  EF +F  +  F + FC    C W
Sbjct: 64  LGLHILFPGELQDWSFQDNDFETTKFRCILEWENGLLEFDSFKTNHNFLNNFCGNLTCSW 123

Query: 122 LAEQGGLSMVNRAG 135
            A Q G+ + N  G
Sbjct: 124 SARQDGVYLTNVKG 137

[Close]

BLAST of Clc07G05530 vs. NCBI nr
Match: XP_008453057.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103493879, partial [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 124.0 bits (310), Expect = 2.0e-24
Identity = 56/102 (54.90%), Postives = 70/102 (68.63%), Query Frame = 0


Query: 30  SLIDLKKFHVEIRNMMEMYILDSHCRSKDNDLGLHILLPGEKQRWSFRTNIWETTLFHCT 89
           S+I L+ + V+I N +EMY+LDSHC SKDNDLGLHIL PGE+Q WSF  NI+ETT F C 
Sbjct: 14  SIIQLRHYQVKIHNDLEMYLLDSHCFSKDNDLGLHILFPGEQQDWSFEDNIFETTKFRCR 73

Query: 90  LKWERGSREFKAFYFDDAFFSVFCPERECVWLAEQGGLSMVN 132
           L+WE G  EF +F  D  F + FC    C W A+Q G+ + N
Sbjct: 74  LEWENGLLEFDSFKSDLDFLNNFCGNLTCSWSAKQDGVYLTN 115

[Close]

BLAST of Clc07G05530 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2HQ46 (S-protein homolog 74 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SPH74 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 59.3 bits (142), Expect = 7.8e-08
Identity = 30/81 (37.04%), Postives = 43/81 (53.09%), Query Frame = 0


Query: 53  HCRSKDNDLGLHILLPGEKQRWSFRTNIWETTLFHCTLKWERGSREFKAFYFDDAFFSVF 112
           HC+SK+NDLG   L   ++  W+F  N+  +TLF C +  + G    K F+ DD      
Sbjct: 58  HCKSKENDLGDINLKFLDRFSWNFGENMLHSTLFWCYMSKDDGHMNVKVFW-DDVILFHR 117

Query: 113 CPERECVWLAEQGGLSMVNRA 134
           C  + CVW A+  GL + N A
Sbjct: 118 CDWKNCVWTAKNDGLYLWNSA 137

[Close]

BLAST of Clc07G05530 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B3H730 (S-protein homolog 18 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SPH18 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 57.4 bits (137), Expect = 3.0e-07
Identity = 31/79 (39.24%), Postives = 36/79 (45.57%), Query Frame = 0


Query: 50  LDSHCRSKDNDLGLHILLPGEKQRWSFRT--NIWETTLFHCTLKWERGSREFKAFYFDDA 109
           L  HC+SK  DLG   L P   Q W F    N+WETTLF C   WE  SR F      + 
Sbjct: 43  LGLHCKSKGKDLGPQSLAP--HQHWGFTASLNVWETTLFFCHFVWENQSRWFD--ILKEK 102

Query: 110 FFSVFCPERECVWLAEQGG 127
             ++ C    CVW     G
Sbjct: 103 RDTIVCKYHPCVWSIRPSG 117

[Close]

BLAST of Clc07G05530 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4JLQ5 (S-protein homolog 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SPH2 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 55.8 bits (133), Expect = 8.6e-07
Identity = 33/99 (33.33%), Postives = 44/99 (44.44%), Query Frame = 0


Query: 30  SLIDLKKFHVEIRN-MMEMYILDSHCRSKDNDLGLHILLPGEKQRWSFRTNIWETTLFHC 89
           S+    K  VEI N +     L  HC+SKD+DLG   L PGE   +SF    +  TL+ C
Sbjct: 41  SVFPTSKRTVEINNDLGNQLTLLYHCKSKDDDLGNRTLQPGESWSFSFGRQFFGRTLYFC 100

Query: 90  TLKWERGSREFKAFY-FDDAFFSVFCPERECVWLAEQGG 127
           +  W   S  F  +    D+     C    CVW   + G
Sbjct: 101 SFSWPNESHSFDIYKDHRDSGGDNKCESDRCVWKIRRNG 139

[Close]

BLAST of Clc07G05530 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O23020 (S-protein homolog 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SPH5 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 55.1 bits (131), Expect = 1.5e-06
Identity = 24/69 (34.78%), Postives = 44/69 (63.77%), Query Frame = 0


Query: 39  VEIRNMMEMYILDSHCRSKDNDLGLHILLPGEKQRWSFRTNIWETTLFHCTLKWERGSRE 98
           V + N++    L  HC+SK +DLG+H++   ++  + F+ N+W++TLF C+ +W+    +
Sbjct: 31  VTMTNLIGGPPLTIHCKSKQDDLGIHVVPFKQEYHFKFQPNLWKSTLFFCSFQWD---SQ 90

Query: 99  FKAFYFDDA 108
           FK+F   DA
Sbjct: 91  FKSFDIYDA 96

[Close]

BLAST of Clc07G05530 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FMQ4 (S-protein homolog 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SPH3 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 54.7 bits (130), Expect = 1.9e-06
Identity = 27/57 (47.37%), Postives = 34/57 (59.65%), Query Frame = 0


Query: 50  LDSHCRSKDNDLGLHILLPGEKQRWSFRTNIWETTLFHCTLKWERGSREFKAFYFDD 107
           L+ HC+S D+DLGL IL P     + FRT+I  TTLF+C   W   S+ F   Y DD
Sbjct: 51  LNLHCKSADDDLGLKILAPNGSWSFKFRTSIVGTTLFYCHFTWPGQSKRFD-IYDDD 106

[Close]

BLAST of Clc07G05530 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KSN2 (S-protein homolog OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G538550 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 127.1 bits (318), Expect = 1.1e-25
Identity = 63/134 (47.01%), Postives = 82/134 (61.19%), Query Frame = 0


Query: 2   HQLMLLSLGFLLIAFRPTVGSAVRQPNR-SLIDLKKFHVEIRNMMEMYILDSHCRSKDND 61
           H L+LL   FL++ F  ++      P + S+I L  + +EI N +EMY+LDSHC SKDND
Sbjct: 4   HLLVLLIFLFLIVLFDMSMARFSFAPQKSSIIQLHHYQIEIHNDLEMYLLDSHCFSKDND 63

Query: 62  LGLHILLPGEKQRWSFRTNIWETTLFHCTLKWERGSREFKAFYFDDAFFSVFCPERECVW 121
           LGLHIL PGE Q WSF+ N +ETT F C L+WE G  EF +F  +  F + FC    C W
Sbjct: 64  LGLHILFPGELQDWSFQDNDFETTKFRCILEWENGLLEFDSFKTNHNFLNNFCGNLTCSW 123

Query: 122 LAEQGGLSMVNRAG 135
            A Q G+ + N  G
Sbjct: 124 SARQDGVYLTNVKG 137

[Close]

BLAST of Clc07G05530 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BVC0 (S-protein homolog OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103493879 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 124.0 bits (310), Expect = 9.5e-25
Identity = 56/102 (54.90%), Postives = 70/102 (68.63%), Query Frame = 0


Query: 30  SLIDLKKFHVEIRNMMEMYILDSHCRSKDNDLGLHILLPGEKQRWSFRTNIWETTLFHCT 89
           S+I L+ + V+I N +EMY+LDSHC SKDNDLGLHIL PGE+Q WSF  NI+ETT F C 
Sbjct: 14  SIIQLRHYQVKIHNDLEMYLLDSHCFSKDNDLGLHILFPGEQQDWSFEDNIFETTKFRCR 73

Query: 90  LKWERGSREFKAFYFDDAFFSVFCPERECVWLAEQGGLSMVN 132
           L+WE G  EF +F  D  F + FC    C W A+Q G+ + N
Sbjct: 74  LEWENGLLEFDSFKSDLDFLNNFCGNLTCSWSAKQDGVYLTN 115

[Close]

BLAST of Clc07G05530 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KL79 (S-protein homolog OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G016040 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 119.0 bits (297), Expect = 3.1e-23
Identity = 54/108 (50.00%), Postives = 70/108 (64.81%), Query Frame = 0


Query: 27  PNRSLIDLKKFHVEIRNMMEMYILDSHCRSKDNDLGLHILLPGEKQRWSFRTNIWETTLF 86
           PN  ++  ++F VEI N + M+ILDSHC SKD+DLGLHIL P EKQ WSF+ N   TT F
Sbjct: 18  PNNPVVMFERFTVEIHNDLRMFILDSHCYSKDDDLGLHILFPDEKQDWSFKGNWIATTSF 77

Query: 87  HCTLKWERGSREFKAFYFDDAFFSVFCPERECVWLAEQGGLSMVNRAG 135
           HC L+WE G  EF +F     F + +C  + C+W A Q G+ + N AG
Sbjct: 78  HCRLEWEVGYLEFDSFKSAPDFVTNYCGNQTCIWSARQDGVYLNNAAG 125

[Close]

BLAST of Clc07G05530 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FMU2 (S-protein homolog OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111447244 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 119.0 bits (297), Expect = 3.1e-23
Identity = 54/108 (50.00%), Postives = 72/108 (66.67%), Query Frame = 0


Query: 27  PNRSLIDLKKFHVEIRNMMEMYILDSHCRSKDNDLGLHILLPGEKQRWSFRTNIWETTLF 86
           PN+  I L+KF V IRN + MY+LDSHC SKD+DLG+ ++ P ++QRWSFR N   +T F
Sbjct: 42  PNQPAIALRKFDVHIRNGLRMYLLDSHCCSKDDDLGVRVIYPDDEQRWSFRGNWLGSTNF 101

Query: 87  HCTLKWERGSREFKAFYFDDAFFSVFCPERECVWLAEQGGLSMVNRAG 135
           HC L+W  G  EF AF  D  F + FC +  CVW A+Q GL + ++ G
Sbjct: 102 HCKLEWAYGFVEFDAFADDLNFVTSFCGDSSCVWTAKQDGLYLADQNG 149

[Close]

BLAST of Clc07G05530 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BUQ9 (S-protein homolog OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103493877 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 118.6 bits (296), Expect = 4.0e-23
Identity = 52/114 (45.61%), Postives = 71/114 (62.28%), Query Frame = 0


Query: 21  GSAVRQPNRSLIDLKKFHVEIRNMMEMYILDSHCRSKDNDLGLHILLPGEKQRWSFRTNI 80
           G  + +P+  L+   KF++ I N ++MY+LDSHC SKD+DLG  +L P ++Q WSFR N 
Sbjct: 14  GPELPKPHEPLVTFHKFNIRIYNELQMYLLDSHCYSKDDDLGTKVLYPNDEQSWSFRGNW 73

Query: 81  WETTLFHCTLKWERGSREFKAFYFDDAFFSVFCPERECVWLAEQGGLSMVNRAG 135
             TT FHC L+WE G  EF AF  D  F + FC +  C W A Q G+ + N+ G
Sbjct: 74  LGTTNFHCKLEWENGYLEFDAFSNDVKFLTNFCAKSSCCWSARQDGVYLTNQNG 127

[Close]

BLAST of Clc07G05530 vs. TAIR 10
Match: AT4G29035.1 (Plant self-incompatibility protein S1 family )

HSP 1 Score: 59.3 bits (142), Expect = 5.5e-09
Identity = 30/81 (37.04%), Postives = 43/81 (53.09%), Query Frame = 0


Query: 53  HCRSKDNDLGLHILLPGEKQRWSFRTNIWETTLFHCTLKWERGSREFKAFYFDDAFFSVF 112
           HC+SK+NDLG   L   ++  W+F  N+  +TLF C +  + G    K F+ DD      
Sbjct: 58  HCKSKENDLGDINLKFLDRFSWNFGENMLHSTLFWCYMSKDDGHMNVKVFW-DDVILFHR 117

Query: 113 CPERECVWLAEQGGLSMVNRA 134
           C  + CVW A+  GL + N A
Sbjct: 118 CDWKNCVWTAKNDGLYLWNSA 137

[Close]

BLAST of Clc07G05530 vs. TAIR 10
Match: AT5G04350.1 (Plant self-incompatibility protein S1 family )

HSP 1 Score: 59.3 bits (142), Expect = 5.5e-09
Identity = 35/116 (30.17%), Postives = 56/116 (48.28%), Query Frame = 0


Query: 13  LIAFRPTVGSAVRQPNRSLIDLKKFHVEIRNMME-MYILDSHCRSKDNDLGLHILLPGEK 72
           L  F   +G  +   N +  ++ +  V + N +E   +L  HCRSKD+DLG HIL  G+ 
Sbjct: 4   LFIFSIVIGLCIGVSN-AFHEIGESKVVLSNQLEHSKLLKVHCRSKDDDLGEHILKIGQD 63

Query: 73  QRWSFRTNIWETTLFHCTLKWERGSREFKAFYFDDAFFSVFCPERECVWLAEQGGL 128
             ++F  NIW+TT F C +      +    F   +  +S    E  C W+  + G+
Sbjct: 64  YEFTFGDNIWQTTSFSCQMDQGPNFKHHLDFVAYETSWSK-ALEASCKWIGREDGI 117

[Close]

BLAST of Clc07G05530 vs. TAIR 10
Match: AT4G24973.1 (Plant self-incompatibility protein S1 family )

HSP 1 Score: 57.4 bits (137), Expect = 2.1e-08
Identity = 31/79 (39.24%), Postives = 36/79 (45.57%), Query Frame = 0


Query: 50  LDSHCRSKDNDLGLHILLPGEKQRWSFRT--NIWETTLFHCTLKWERGSREFKAFYFDDA 109
           L  HC+SK  DLG   L P   Q W F    N+WETTLF C   WE  SR F      + 
Sbjct: 43  LGLHCKSKGKDLGPQSLAP--HQHWGFTASLNVWETTLFFCHFVWENQSRWFD--ILKEK 102

Query: 110 FFSVFCPERECVWLAEQGG 127
             ++ C    CVW     G
Sbjct: 103 RDTIVCKYHPCVWSIRPSG 117

[Close]

BLAST of Clc07G05530 vs. TAIR 10
Match: AT4G16195.1 (Plant self-incompatibility protein S1 family )

HSP 1 Score: 55.8 bits (133), Expect = 6.1e-08
Identity = 33/99 (33.33%), Postives = 44/99 (44.44%), Query Frame = 0


Query: 30  SLIDLKKFHVEIRN-MMEMYILDSHCRSKDNDLGLHILLPGEKQRWSFRTNIWETTLFHC 89
           S+    K  VEI N +     L  HC+SKD+DLG   L PGE   +SF    +  TL+ C
Sbjct: 41  SVFPTSKRTVEINNDLGNQLTLLYHCKSKDDDLGNRTLQPGESWSFSFGRQFFGRTLYFC 100

Query: 90  TLKWERGSREFKAFY-FDDAFFSVFCPERECVWLAEQGG 127
           +  W   S  F  +    D+     C    CVW   + G
Sbjct: 101 SFSWPNESHSFDIYKDHRDSGGDNKCESDRCVWKIRRNG 139

[Close]

BLAST of Clc07G05530 vs. TAIR 10
Match: AT1G04645.1 (Plant self-incompatibility protein S1 family )

HSP 1 Score: 55.1 bits (131), Expect = 1.0e-07
Identity = 24/69 (34.78%), Postives = 44/69 (63.77%), Query Frame = 0


Query: 39  VEIRNMMEMYILDSHCRSKDNDLGLHILLPGEKQRWSFRTNIWETTLFHCTLKWERGSRE 98
           V + N++    L  HC+SK +DLG+H++   ++  + F+ N+W++TLF C+ +W+    +
Sbjct: 31  VTMTNLIGGPPLTIHCKSKQDDLGIHVVPFKQEYHFKFQPNLWKSTLFFCSFQWD---SQ 90

Query: 99  FKAFYFDDA 108
           FK+F   DA
Sbjct: 91  FKSFDIYDA 96

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Clc07G05530 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
KAG7031483.1	2.4e-38	55.80	S-protein-like 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]	[more]
KAG6600849.1	6.5e-36	57.98	S-protein-like 74, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]	[more]
XP_023546939.1	7.2e-35	60.91	S-protein homolog 74-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]	[more]
KGN51432.1	2.3e-25	47.01	hypothetical protein Csa_007732 [Cucumis sativus]	[more]
XP_008453057.1	2.0e-24	54.90	PREDICTED: uncharacterized protein LOC103493879, partial [Cucumis melo]	[more]

BLAST of Clc07G05530 vs. ExPASy Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description
Q2HQ46	7.8e-08	37.04	S-protein homolog 74 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SPH74 PE=2 SV=1	[more]
B3H730	3.0e-07	39.24	S-protein homolog 18 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SPH18 PE=3 SV=1	[more]
F4JLQ5	8.6e-07	33.33	S-protein homolog 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SPH2 PE=3 SV=1	[more]
O23020	1.5e-06	34.78	S-protein homolog 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SPH5 PE=2 SV=1	[more]
Q9FMQ4	1.9e-06	47.37	S-protein homolog 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SPH3 PE=2 SV=1	[more]

BLAST of Clc07G05530 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A0A0KSN2	1.1e-25	47.01	S-protein homolog OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G538550 PE=3 SV=1	[more]
A0A1S3BVC0	9.5e-25	54.90	S-protein homolog OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103493879 PE=3 SV=1	[more]
A0A0A0KL79	3.1e-23	50.00	S-protein homolog OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G016040 PE=3 SV=1	[more]
A0A6J1FMU2	3.1e-23	50.00	S-protein homolog OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111447244 PE=3 SV=1	[more]
A0A1S3BUQ9	4.0e-23	45.61	S-protein homolog OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103493877 PE=3 SV=1	[more]

BLAST of Clc07G05530 vs. TAIR 10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT4G29035.1	5.5e-09	37.04	Plant self-incompatibility protein S1 family	[more]
AT5G04350.1	5.5e-09	30.17	Plant self-incompatibility protein S1 family	[more]
AT4G24973.1	2.1e-08	39.24	Plant self-incompatibility protein S1 family	[more]
AT4G16195.1	6.1e-08	33.33	Plant self-incompatibility protein S1 family	[more]
AT1G04645.1	1.0e-07	34.78	Plant self-incompatibility protein S1 family	[more]

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
IPR010264	Plant self-incompatibility S1	PFAM	PF05938	Self-incomp_S1	coord: 38..131 e-value: 3.2E-19 score: 69.4
IPR010264	Plant self-incompatibility S1	PANTHER	PTHR31232	FAMILY NOT NAMED	coord: 21..127
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 185..272
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 201..215
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 216..236
None	No IPR available	PANTHER	PTHR31232:SF47	SUBFAMILY NOT NAMED	coord: 21..127

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Clc07G05530.2	Clc07G05530.2	mRNA