Clc06G16380 (gene) Watermelon (cordophanus) v2

Overview
NameClc06G16380
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus cv. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationClcChr06: 27158665 .. 27162728 (-)
RNA-Seq ExpressionClc06G16380
SyntenyClc06G16380
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAGGTTACATTTGGTTTCTCGCTGAAGTGGGTGTGCTCTTTTGGTTGCTGTAGGTTTCTGGGTTTTCCTCAGCTAACTCTCTCATGAATCTTCTCCAAACACCATATGCGTCCCATGTTTCGAAAACCCGAAGGCCCTTTCGTTTCAACTTTTAAGCTCTCATCTAAAGAACCACACTTGAAACTTTGGCCATTTGTGGTGCAATTGTATGTCAAACCATCAGTTCAACCAACTGCACTCACTCTCCATGAAAGTTTAACATTTATTGGCATGATTTCAGCCAGACTAATTTTTGGTATTTAATATACAACGATTTATATGTCTTCAGTCATTTTCATCCAATGGTTCGTGTTAAATAGGTTAGGGTTCTGGAGTCCTGATTGGGCAAATTAATAAACAGTTTGGATTTTTAAAGGCTGAATTCACTGTCATCTTCTTGTAAGAGTTAGTTAAGTGGGTTTCTTATGGAAATATGTATTTTTAACTTTAATTTCAGTTTAGATCTTGTAGTCGCTATCTTGCAGCTCTCTATAAAACTTATTTCATTGCCCAACTTGCTGTTATTTTTAATTTCATAGGTACATTTCCATCCTATATAGTTGCAATACATCTTGCAATCTATTAGTGCAGCTCTTGTAGCTTCCCATGTGTGTTTTCAGAGTGAGGTTAAAACCTATGGTTTTGCTTAGCCAAATTGGTTAATGTGATGGAAAAAATTATTCACTTTGGATTACATATCTACCATATTTTCAAAGTTGGACTTTTAACTTTTTATTCATGAATAAATGTTTGTCTCTTTAAAAGGATTTCATTTTGCAGGTGAAATAGCCTAGAAATTTGTTAGGATAGACCTAACAAGATAAATCAAAAGATAGTAATATATTGTAATATCAAAAGAAGTTACAATATATTAAAATGTTATACGAATAGAAATTTCTAGGCTATTTCACATGATTTTATCTGTTTATATCTTTTCTTATTGAGAAATCTAATATTGTTCACTAGGTTTTTCGATTTTTGCTATATGTTTATTATTATTTTTAATACATCTAATATGTTGGTCTTTAGATTTAAAAAATTCAAATTGAGAAGAAAAGGAGCGATAACCACAATTTTAATTTTAAATAGATAAGTCCCACTATTATTTATCCAGATTATTCGATAAACCTCATCTTCACGTTGGGATGCCGTTACAATCAGCAAACAGGGGAAAATCAACATTTTTTTTGTTTTGTTTTTTGTTTTTGTCTGTTGAAGCATGTAAGAATGTATCGCTAGGATGACAGTCAGTGGTTGAGCTTCAATGTAGCCAGGGAGCAATGTTGAGAAATAGATGGGTAGAAGGCTTGCTCTGTGGGTGTTTGAATGCTCTCCTCAGTTGGACAATTCAGAATGAAGCGAAAGATATGAACGATTAGGAATGAAAGGATGAAAGTTTGAGAAACTACCTATAGTATCGGAAAATTCTTGTAAAGAAAATTACCTTTTTAGACTTTGAGTCATTAAAATGTATCTTTTTAATCCTATGTTTTTTAAAATAAGTTACTAATGGCTAAAGTGAGCATAACTCAACTAAAAACAATAGTTATCAACATAGCTCAATTAGCACAAGACTTGTGTTATTGACCTCGAGGTTAGAGGTCTATATCCCTACCCCATATTTCAAAATAAATGATTAGATATGAAATGAAACACTTGAGGACACCACTCATTCAAGCAGCTCCTGTGATATGATGCTTTAGGATTTGGTGGCTTGCCATGCTGCGTGTTCTTCAATGGAGCTGAACCTTTCTCAGCTTCTTTTACAATTTCATGAAACTCCATTGGCCCACCACATGGAACTCTAGTGATTCTCAGTGGGTGTAATCCACTTATCATCTTCTTGTCATTAATCTCTGTAGCCATTCTGTCTGGAATTGTGAATGATATCCCAAATTTGATCTGAGGCAGAGTTCTTCTGATACAAAAAACCCTCATTCTTTGCTTTGTGGCTTTTTCAAGCTTCTCTGTGAAGCCAAGCTTTTGCCTTATTGACAGCTTCTTGACTTTAAACCGTTTTGCTATCATTCGAGCTCGGTACCTCTTCGCCTTTGTGTGTTTGTTTCTTGTTTTGGTCATGGTTGGGGTGAAGATTTGGAATGCAAAAATGGAAATTTTCAAGCTGTATGATAAGGGAAATTAGGGCTGCTTTTGTATTCTCAAAGAAAATGAGAATGAGTAGAGTGAATTGAAATCCCATTATAAAACTTATTGGAGAAGCCTAAGAAGCGTATGAAATAAGCATCTCTTGGAGGCTCAGACTTAATTATTATTCCCACGCTTAGTCTAAGCATTTGTTTGCCATTACATTTTTCGATCCCACCACTTTTTAGCTTTTATTCTCGGACGTATTCATATGGTCAAAGAAACTCTCAATTTCTTTCATCTAATCCAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAAAAATCAATGTTCATCCTTCCGTTATATGTTGATAGGTCATTCTCCATTTCTTACTCGGATTCTGGTCTCCAAAGGGGTCACTGTTCTTTTTACCTCACATCAATCCAATCTTAAATTGAATCTTGATTATAATCTTTGAAGTTATGAAATCCTTGGCATTGATTAGTTGAAGGGAAATAATATGATTTTATTGATATAGGCCGAAGCTTTTTATAGAGAAACTAATACACAAACACCTAATAATAAATGGCCTAACTGAAACGAATACACATAATACCAATAATTTAAACTCATAAAATACTCCATCCTTATGAGTTGTTTTGGGAAGAAAGTTCATTTACTTCAGATCAATTATATTATTCATAATATCAATAATAAGATTAGATTGTCTTCAAATATAGAAAAATAAATTAATTTATTTATAAATATATAAATGTAGATACTTGGCAGTTTTACCCTTTAAAAAAACATAAAGAAGAAAGAAAAAGAAGTTTTCGAAGTCGATATTGATTTTCATTGGATTTTTGCACTGAAAAACAGAGATTCTTGAAAATGGCTACCCACGTCCGCTGCCACTTCTCCACCGCCGGCGACCGCTTTCTCATTTAGTGCGCTGCCGGCAACTGCTTTCCTTTCTATTCCGCGCCTGCCGCCTTCATCCCCTTCCCAGTTCGTACGCCTCCTCCTTTCAGTGCTCTTTTCCGACCACTCCTCCTTCCCGCCGTTTACCACCGCCCATTTCGCCGTTGATTTACAAATTTGCCGCCGCCTCCGTAAAGTTTCTATTTTTAAGGTTGAATTTCCTTGTCCCATGGCTGAAAATTGGCAATGGTAATAGATTTTGAATGTGATTAGTTCGATTCTACACACACACAAAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAAATAATAATAATAATAATAATAAAAAAAAAAAATTGAAGATTGGGGTGGTGAGAGTAATTTCTATGATGTTTTGAATGAAGTTTTGGACTTTCAATAACTCAAAAATAGACGTGTTATGATGTTCTAAGTGTAGTTGGTTAGAATCACAAAACTTGTTACTTCCTACCTTCAATATCATGAGGAAGATTGTCTCTCACCAACTAAATCAAATATCTCATTTACTTTGCAATTTGAATAGTTATGGTATAAGTGCAAACATATCCATGAGTTTAGATTCAATTTAAATTCTTAATAGCAATGCAATCAATGGAACCGAAGGTAACCAATTGTGAATAATAAGTGTTTAGGTTGAATGCTGATTAAAAATAGTAAACAAGGGGGAGTTGAGCATGGATGCAGTTTAGTTTCAACCTTAAGACAATATGCGTTAGGAAATGCAGCTACATCATATATGGATAGTGACTTGTCATTGACAAAAAAACTACTGATTTGATCTTGTATCAAGTTACTTTAAGACCCTAAGTAGCTAATGTTATATTTCTATGGTTGGTTGAATCTTAGATTAATTTCATGCAATTTCTTTATTTTATGGTGTAGTAGGTGTAACATATGTTGCACCTAATCTCATGCTTAGGTGCTCTGGTCTGCACAGAAATGGGTGCAGCCCAAACTCCATTTAA

mRNA sequence

ATGAGGCCGAAGCTTTTTATAGAGAAACTAATACACAAACACCTAATAATAAATGGCCTAACTGAAACGAATACACAGATTCTTGAAAATGGCTACCCACGTCCGCTGCCACTTCTCCACCGCCGGCGACCGCTTTCTCATTTAGTGCGCTGCCGGCAACTGCTTTCCTTTCTATTCCGCGCCTGCCGCCTTCATCCCCTTCCCAGTTCGTACGCCTCCTCCTTTCAGTGCTCTTTTCCGACCACTCCTCCTTCCCGCCGTTTACCACCGCCCATTTCGCCGTTGATTTACAAATTTGCCGCCGCCTCCGTAAAGTTTCTATTTTTAAGGTTGAATTTCCTTGTCCCATGGCTGAAAATTGGCAATGGTGTAACATATGTTGCACCTAATCTCATGCTTAGGTGCTCTGGTCTGCACAGAAATGGGTGCAGCCCAAACTCCATTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGAGGCCGAAGCTTTTTATAGAGAAACTAATACACAAACACCTAATAATAAATGGCCTAACTGAAACGAATACACAGATTCTTGAAAATGGCTACCCACGTCCGCTGCCACTTCTCCACCGCCGGCGACCGCTTTCTCATTTAGTGCGCTGCCGGCAACTGCTTTCCTTTCTATTCCGCGCCTGCCGCCTTCATCCCCTTCCCAGTTCGTACGCCTCCTCCTTTCAGTGCTCTTTTCCGACCACTCCTCCTTCCCGCCGTTTACCACCGCCCATTTCGCCGTTGATTTACAAATTTGCCGCCGCCTCCGTAAAGTTTCTATTTTTAAGGTTGAATTTCCTTGTCCCATGGCTGAAAATTGGCAATGGTGTAACATATGTTGCACCTAATCTCATGCTTAGGTGCTCTGGTCTGCACAGAAATGGGTGCAGCCCAAACTCCATTTAA

Protein sequence

MRPKLFIEKLIHKHLIINGLTETNTQILENGYPRPLPLLHRRRPLSHLVRCRQLLSFLFRACRLHPLPSSYASSFQCSFPTTPPSRRLPPPISPLIYKFAAASVKFLFLRLNFLVPWLKIGNGVTYVAPNLMLRCSGLHRNGCSPNSI
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Clc06G16380.1Clc06G16380.1mRNA