Clc06G13275 (gene) Watermelon (cordophanus) v2

Overview
NameClc06G13275
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus cv. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationClcChr06: 24216575 .. 24222203 (-)
RNA-Seq ExpressionClc06G13275
SyntenyClc06G13275
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGAGACCCATAGAGAAGCCCAGCAATAATGGCCAAGCTCAGATATCTGTTTGTGCATGTGGTTCTCCAAGTGCTTTTGCCAAACTTTTAAAGGAATTGGATTCGAATTTGAGATTCTTGAGGAAGAGCACTCTTTCATCAATGATAAAGTCCTCCACTTGCAAGAGAAGGTTAGCTTTTCTAGTAATGGAACTGAAAATCCCATATTTGTATTTTTCTTCCTGCAAACGATTCTAATCAACCGGTACTCATTCAAATGATCTTTTGATTTCTTCATCAACAAAACCTCCTCTCCTTTCCAATTTATAGGCATGAAATATTACTTTTGATAGTTGCACAAATTCACAAATTCAGGGTACGAGTTTAATTCTTAGCATCATTTTGTTCTATCTCTTTTTCCAGATTGATAGATATTAAATTGTGAACATCGTTTTTTAGTTTGGTAGATATCACTTTGTATTCTTCCAATCCTTTTGTCCCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCATTTTCTTAAAAACCTAATTACGTATTAGTATTGTTTTATGAAAATCCTCTATTCACAGTATCAGTGTGCAGTGTGGTTAAGATTCTTTATTATTCCTCTTAAATCTATATTATCAATGTTTACATTTTCCAATCATTCAATTGTATAAACGTGTATCTTGAGACATTGAAGAGAATTATAATACTCGTCTTGTCTCCTTGTTAATTTCAGGGAAAAATGTTGGAAGAAAGCATAGAGTTGATGAGAAAAGACGTTTCATTCCCATTAAGTTTGAACTTACTTGGAAAGAATTAGATATCTATGACTTTTCTCATAAAATTCCGATTAGCACCTTACGGGAAAAGTGATTTAACAAATTTCCTCGTAAGTTCTCTTCGCATCTACCTACAAAGTTAAAACCCACCATTCTTTTCATTGTGAAAGTCTAAGTGTCCAGTTTTTTACGATTTCTGCTAAATAATAGAATTTGTTGTTTTTTTTTTTAAAAAAACAACAAATTTGTTCATTTGATATCTATTACTTAGCAGAAATCGTGGTTTTTTTTTTTCAGAATTGATTCGACAGAAACTCAGGTTCAATATAGTTAAAGTCTTTCGTGCTTTTTTACACTCCTCAGAGAAATCACACAAAAACCCTCATCCAACATAATATTTCAGGGCAAATGGAATCTAAATAAATGAGGGTTTTTTTTTGTTTTTTTTCTTCTTCAGAGAGGAAGGGACGGAGGGGATGATTTGGTTAGAGGAAGTTTTAGAGGAAGGAGAGTGATGATTTTGGGAAGAACTAAAAGTTGAAAATAATGAGGACAAAAACGTCATTTCACATTGTGGGGTCCTCCACTAAAAAGCTCAAAAAGTTAGATTTTTACTCTAAAAACTTTTTTAGGTTAGAAATAGCAATTTCTTGAGCCTTTTTATAGATCCCAAGAGGTGGTGGTGGCTGCTGAAGATGAGGAGGCCATGAGCTGCCCTAATTTACAAGATTTGAGGAGAAAATCCCGAAATCAAGCCCACAATCAGATTTGAAAATTGAATTAGGCTGTGGTAGATTGCTATAGAAATCTGTTTTAATGCTGCAACAATTTGGAATCAACGAAGTTTTTGCAAAAATACACGAAAATTAACAAGAATCTTGTGAAATTCACTCTTTTTTCTCATTTTAGACTAACCATGCCATTTATGAATCTTTTGTTATTTTTAATCTTGATTTTTCTATGAAAAGGACTAAATGTATGAAATTTCCATAAAAAATCTTACCTTTAGAAGCTAAATAATTCTAAAAAATGAGAATTATCACGGGGACTCGATCCTCAAATGGGGATTCCCCGACCCCGACCCTAACTCCCCAAAATAGGGAATGGGGCGGGGACGAGGATCACAATTCCCCACAGGGACAAGGATGGGGAGTGCATCCTTGGCCCAGCCCCGTTGCCAACCTAATATGTAGATAAGGAGATATAGATCTTCAAAGTAAGATTCATGGCAAAAGGGTAAAACCTATTGAGAGAACTTAGACTATGGGTCAATTTTCTCACTCGTTGCCATAATAAAGTCTTTGAGCATTGTTTGATTCATTATTTCATATGACATATGTAAAATGAATGCTTAGATTCTTTTATGAAAAGAATTTAAAGAATGCATCTACACAAACAAACTGAGGAGTTCAACTTTCAAAGATCAAAAGTAAGGAATTTGTTGTATAGGTTTATTTGAGAAATGAATTAGATAATTAGAGATCTTTGAATACGAGGTTTGATAAAAGTTATTATAACCTATGACTTTGAACAAATATTAATGATCTTGTATAGACAAGAGAGTCGTTAACTGACAAGTGGATATTTCTCACGTTTTATGTTAATGATGTATTACTAATTATGAATGATGTAGGATAACATTAAAAAATTTAACTGTCTAACTAATTAAGGACATAACATTAAGTTTGTCTCAAACTTCTTGCATTTACAAAATGTTTGTCAAATATTCGATGCACAACTTCAAAGAATGACAATGTATCATTCAAATGTGATGTTAAGTCTAAGAAAGAGTATCCTAAGATACCTCAAGTGTTGAGGACAAGTAATTAATTATCTTCTCTTAGTAGGAGACAATTGATGCATAAATGAGGCCTAACATGCAATTGGTTAGTTATATCGGTTATATAAATGGTGTGACCATTGAGTAGAAAATTAAAAGTTGCTTCCGCTGCAATTCAAATCCCTTTAGTTATAGTAAATTAAAATGGCATAAAATGCCGAGTATCATCCTCGAAGATCAAATATCATAGTTATTATTTAACTAATTTAGAATCATGTCAATTTTAGCGCAGGATTGGAAACCAAACTTTCCTTTTGATTTTTTTTCTTCTTTTAAAACAATAATTAAAACTAAAGACAAGTGTGAAAATTCCAGAGCTAAAACATTTTAGGGTGTGATTTCATTAAATACACCATTAAGCCATACTGAGATTATTCATGGAGTCTTGTATAAATGCTTAAGTTTAGAAACTCAATTATGGATTATTTTCTATTAGAAACATTTTTTTCTCATGCAACTTAAATAATAACTAATTTTTTGAAACCAAATTAAGAATTATGGTATTAAGCAACATCATTAACAACTAACCTAACTATTTTTACAAGAGATAAATAATGATTTAATGCTATAGTTTTGGTTAAACATGCAATTCATCAAATTGAACATCTAACCTAACATTCATTGAAGACCAATAAGGATTAATGCATAATAACGTTTAAAATATAGTATTCAACAATATCCATGAAAGCACTCAATGCAAACTTAAATTCATAAGTAAAAAAATATATTATTCAACAATATCCATGAAAGCACTCAATACTAACTTAAATTCATAAGTAAATTCTTTAACAACCTAAAATTAAAGAGTTTAGTCACTCATAGCTCTCAAACATATATTTCCACACAAATTTGCAAGCCCAAATAGTAAAAAAAAATATGGGAAATGAGAAAAAACTACTGTTGAAGCGTTCCGTCATCACTTGAATTCTTTAAGAACTCCTTGATCTTCACCTCATGAACTCAAACGGCCTCCAAAATAGATCCCGCAAAAACTCACTTTAGGGCTCTGGAATTTCATGATGGAGGCTGCTGAAAAACCTTAGGATTTATAGAGGAAACTTCCCAAAAATGTTGAAATTGTCAAATAAGGAAAGCCAGTGTTGTGACGCTCTAAGGTAACGTTGTGGCGCTGCCTTGCTGAAAAGCTCGTAGATGCCAGGTTGTCGCACTATGCAATGCCTGATTTTGATGGTCTCGGGTTTTGGCGCCAAGGTCAGCGTCGTGGCACTACCCTATTTTCTTGACAACTTTGGCTTTTTCTCCACTTTGCCTTCGATGTTTGGCGTAGTTTGGTTCTTTTTACGTCCAACACTTGTTTTCTTAATAAATCTTTAAAAAACATTGGTAAACACATTAAATTTAATAAAAATACTCTAAATAAAAAGCAAAGAAAATACTTTTTAAATGTTTTTCAATGGTCTTATACAAACTCTTTGGATAAAAAGAAAAAATCGGAAATAGTTTATTTATATATAAGAAAAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAACTACTAGAAGACTTATCATAGACATGCTTAACGGAAATCTTCTATTAAGCTTTAAGGTTATTAATTTTATTTATTATTTATATAAATTTAAACTAAAAAAATCAACTAACTAACTGGTTTAAATAGGAGAAAAAAATTTGGAATTAATTTAAGTAAAAAAAAAAGGAAAAAAATACCTATTTGGATTATGGGAAATCTTCTTCTTTTAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTTACACCAATTCCATTTTTCTAATGCAATTAAGTTTAAATTGGAACCAAATCTAACGAAAAATGGTTCCAAATCTGAGCATAAACATATAAGTTACGAGTTTTTTTCTTTTTGAAAATGGTTCCGGGAAAATTACCATTTCGTTTTTAAAATTACTATTTTTATTTTTTAGATTAAAAAATAAATCTTACAAGTTACGGGAAAATCATTTTACATGAGATTAGGAACCAAATCTTACGATTCCAAATCTTAATGAAAAATGTTTTCAAACTTATAAATTTTTTAAAATTACATTTATTATTTTTTAGATTTTTATTTTATTTTATTTAAAAAAGAAAACCTTCAAAATTAAGGGAAAACAATATCTTATGAATTTGGTTCCAAACCTTAAATATTTTTTTTTCCCGAATGTTTTAAGTTTTGTTTATTAAAAAAAATAAAACATTTAGATCTAGTTGTCAATCATTTCAATCATTTCATTTTTTTGTTTTGTTTTTGAAAATTAAACATATTTTCTCCACATTTCTCAAAATGATTTGCATTTTTTTCAAATACAATATTAAATTCTTAGCCAAATTAAAAAATAAATTTTTAAAAGTTACTTTTTTTTTTAGTTTTCAAAATTTGGCTTGTTGTTTTAAACCATCGACAATAAATGAAGAGATTTGAA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mRNA sequence

ATGAGACCCATAGAGAAGCCCAGCAATAATGGCCAAGCTCAGATATCTGTTTGTGCATGTGGTTCTCCAAGTGCTTTTGCCAAACTTTTAAAGGAATTGGATTCGAATTTGAGATTCTTGAGGAAGAGCACTCTTTCATCAATGATAAAGTCCTCCACTTGCAAGAGAAGGAAAAACGAAGCCATCTGCCGGGAAAAGGAAAACCCCTACCTACGTATTGACCCTCAACACGAAGCGAAGACGGATATACCAGCTGAAACCTTTGAGCTTCAACAAAGGAACTGA

Coding sequence (CDS)

ATGAGACCCATAGAGAAGCCCAGCAATAATGGCCAAGCTCAGATATCTGTTTGTGCATGTGGTTCTCCAAGTGCTTTTGCCAAACTTTTAAAGGAATTGGATTCGAATTTGAGATTCTTGAGGAAGAGCACTCTTTCATCAATGATAAAGTCCTCCACTTGCAAGAGAAGGAAAAACGAAGCCATCTGCCGGGAAAAGGAAAACCCCTACCTACGTATTGACCCTCAACACGAAGCGAAGACGGATATACCAGCTGAAACCTTTGAGCTTCAACAAAGGAACTGA

Protein sequence

MRPIEKPSNNGQAQISVCACGSPSAFAKLLKELDSNLRFLRKSTLSSMIKSSTCKRRKNEAICREKENPYLRIDPQHEAKTDIPAETFELQQRN
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availablePROSITEPS51257PROKAR_LIPOPROTEINcoord: 1..20
score: 6.0

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Clc06G13275.1Clc06G13275.1mRNA