Clc06G09100 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAGGACTTCGAAGAATCAGGAGGCTCTAAGGATTCCCTGAATCAAGCTGTCGCAAATTGATATGTAATGGTGCACATTATGAGCGAGGGTTGGGCTAGCCCTCTCATCAGATTCATGAGAGAATTTGAGTTCCTCCATTCATTTGAAGAAAAAAACAGACAATGTTGGAGGAGAGAGAGTTAAAAAGAAGGGAAAGATGTGGAAATGAAAGCTTCGAAGAGAGAGAAAATTAACTCTAACACATCAACCTAATTTTTACCGTTAAACTAACCAAAAACTTAACCAAGAGGACTGTTTTTGAGCTTTTTAGAAAGTATATAAACTGAAATGGGATATTTATCATAATGTAGGAACCTAAATAGAATTAATATGTATAAGGACATAAACAACATTTTAACCATTTATTTTTTAAAATAATTAAAAAATTATATTTGTTTGTGTGTGGAACTTGAGAGGAGAGAGAAATTAAGTCCATCCTAATCATTGATTTTTTTTGAAATGGTACTTTAATCCGAAACCAAAACATAAATGGGCCATATCTTAGAATAACCCGTTTTTAAGGGTTCCATTTTCAGTTTCCTCCCCAGCTCCTATGCCGATTGCGATTTCCCTTCCCTCAGCCTTCGACAACCGACAGCGTCCTCTGCAGAGTCCTTTGTTATTTTGCTCCCTTACCGTCAATTTCCTCCAGTCCGTCGATATCCCTCACGACGTCTCTCTCATCCAACCGGTCGATTTTCAGTGGCAATGGGTCCTAACTCCAAAGGTAAGTCTTCACTCTTCCGTGTCTCTCGTCTCCCTCAACGTCTTTTCTCTGTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTAGATCTTCATTTCTGATATCTCACATTCCGCGCCTCAGGCTTAGCTACTCTTCAGTGTGAGGTATGTAAAATTGTAACTCCAATGTAAAAGAAGTTTATGTGTTTATATGTGTTTACCTGTTGGTGGTTGTTTTATAAATTTTATGAGATTTTAGTTATTAATTTGTAGATAAATTTAAGTATTTTAGATTATTGAGGAAAAATAAAATAACAACCTGTGACCCAACCCAACCGGAATTTGAAGTGTTGGGTTGGTGATCTCTTCGGATCATTCGGGTAGCCAATAGGTTGGTCCAAAAACTTCCTCAACCCAACCTATGTACACCTATTTGCTCTTAGATTTGGATTACATGCACAACTTTTTTCTAATTTTAAAAGCTAACCTGCAGGTTTGAGTACGTCAGCAAATGATTAATCTTTTCCTGAGTGGCAACTCTTCCTGAGTCATGCCTGCTATAAAAAAGGTAGTCCAAAGTCTTATTTCCGTTATTATTGTTATTATTTTTTTTTCATAAGAAGTCTGTAGTTTTATTGTTTTTTGTTAATTGATCTTTGCTTATGTCTAGTGTCTCTTGTTCCATTCCTATTCATGTCATAGAGAATAGAAGGCGATCTTTAATATCTTATTACCAGTTTACTTTTGCATCTTCTATTCTTGGTTTAGCTTGAAGTCGACATATAGTAGAGTACATACTCTCTATAATATGTTCATGGGCTTATGGTCCTCTGCCTTAGCAAATGGTGTCTGTAATGATTCACTATCATTGGTTTAGTTGGGAAAATTTGTCTTTTTGAAGAAATTTATGCATCATGAAGTAGATGAATTTGTTATATGCAATTGATCCTAGATGTCTATACCACATTTATCTTATTTTTATTATTTTCTGTTCATATTTCATTAAATATACATTAAATAGTCTTTTATAACTGAGACTTGAAGATTCTTATCTGGCTTTGTTAACTGAGGTTGTGTTCTGAGATTCATGTATTTCTATGGCCTTTAAATCTTATAAGCAGGAATAGTAAGTAGTAGTGATAAAAATACTAAACGAATGTTCAAGTAGGGTAGGATGTTGTAGATAGACAACAGTATCTATAAAAGTCACCCACAGGATAGAAGGGTGAAGGTTGGATCCATAAAAAACTTTAATCTAGGTTTTATTTGTTTTTCTTTTCTTCAATCTGGTCATATTGTTTTCGATATTTCCTTGTTAAGTTAGCCTGTAAGGTTTAGAGATTTGCGACTTTTTTATTGCCTAAAAACTAAGTCAAGTTCTCACTCATGCCGTTTCCCATTTGATTAGAATTCTGAATGCAGTCGGATTGGGAATGTTTTCCACAAGTTGATGAGGCAGATTGGAAATCCAGTTGATTTTGAACTTCCTGATTGGTTTAGCAAATGGAAGCCTATGCCATATACCTTCATTAGGCGTAGTATCCTTTACTACTTTTTTCTTATTTCTCCTTTGAACTGTGTACTTTTTTCTTTCTTTTTGAAGTGTGTACTAATTTGTATACCTTGGACATTTTCTTATTGAAGTACCTTGCATTAACAGAATTTGCTTACCTTGGATACAGTAAACTTGTAAAGTAGCCCAGGGAGGAGGGAACTTCTCCTTTGATAGGTCTCACATTTTTCATTGTTATAGGTTGTAACTTAAGGGCAGAGTATGGAAAGATTAGCAAATAATGCGATTAACCATTTCACTATAATGTTATTGGCTGAAAGCATGCATTGCATTTTATTTGTCTGGAATCCCGTGAAATGTGTTATATTTACTATATATCTTTGATTTTTCTTATCTCTTTTTCTCTCCATTATCTTCTGTTTGTTGATGTTGACAAATGTTAAGATGTCTACCTCACAAAGAAATTTAAAAGACGGGTTGAGGATGATGGGATATTTTGCTCCTGTAGCCCTACACCGGGATCTCCTGGTGTCTGCGATAAAGATTGCCATTGTGGGTAAGCAATTTGCCCTTAAGGTGCTTTGGTACCATGGCTGATAGAATTCTTTTTTGTATTTTTGTCTTTTCCTTTTCTTCATCCGTAACTTTAGAAAATTTAGCTTGTAAATTACTGCCCTATCAACGAATATAATTTGGGGTGTATTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAGGTCAATTTGACTATAAAAAACACAAAATTTTCAGTGATATTTGAGAAGTTATGAACTAAAATTTACAAAATAAACATATCAACTAAACTTCCAAACCAGAACTTATCAAAGCACAAATTGAAAAGGTAGAAGGAAGCAGTTCAACAAGTAATAATTTCAGAAAAGGAACAACTACTTTGACAATCTTAGTATAGAGCACAACATGTATACCTTGATTAGAACAGAGCCTTTGATGCATGGGGTACTTTTGTTTTCGAAAGGTACCTTATTTCTTTCAAGCCAAATTCCCCAAATCTAAGATTTTAACATAGTTGACCCATAATACTCTTGCTTGCCTTTCCTTTAGAATTGCGGCCACAGAGGAGAGTGAAGTTAATTTTTGCCCTGAAAATAGCTAACCCAAGAATAACAAAAATCTGAAAGGAAGCATTCCACAATTGCTTGCTTTTATATAACAATGGAAAAAGATATGATGACAATTCTCTCCCACCTTCAGACAAAGTGGACAGCACCTGGGATTTTTTTTATTGACATTCTGGACATTTTAGTTGAATATTGTTAACCGTATTCAAAATTGAGGAAATACAATCAAGTTTATCCAAGTTTCCATCACCTTCTATCTTCCCTCCTAGAAAGGGATCTTCATTCTAATAGCTCAAAATCCTGCAATATTCACTTCATCTTTTAAATCTCTTCTAAGTTCTAACTGAATCTTTCCAAAACTTTTTCCAGCACTTTGAGATTTTCGTTGCAGTGAAAGCACAATTCATTCTCCTTTTCAAAATGATGCAATGGAAGCTTTAGAACGTTGGCCCTCTGTATGTGCCTGGTTTTGATTTTGTCCTTGATGTTTAAGTTTAATTTTACCCTCAACCTCGTGATCAGTTACAAATGGAACCTTCAGTTGCAGTCTCCATTATTATTGTAACTTTCAAAATGTTTTAAATTGAAGCCAAAATAAATATATAGTGCACTTCACGTCAGTAGGCTTCAATTATGGAAGTTTTCCCTGTGCTAGGTACTTTAATAGAAGTTTCTAACAAAGTGTTCTTTGGAAAAAAAACTAAAAGATAGGGGTAGAGTTAAAACTTTTTAAACATTAGTGGCAAATTGAAATGCTACATAGAGCAAGGTATTCTTGTATAATTTTGCCCAGAAAAGAAAAAAGAAAAAGAGAAAACGAAAAAGTAGTTATGATTTTTTGATTGAAAAGGGACATAATATTCAAGTGTGAGATGGTAAGTTGTCCCACTAGAAACCCGATGCCCTTTTGTAAATTCACATTTATGTTCTTTGTAGCCAAGCTTGTCAATTTATGTGTAAGGGCTTGAACCTTGTTCATGCATTAATTTTGTGTGCATTTGTAGGATGCTGCTGTCTAGCTGTTCTTCAGGCTGCAAGTGTGGGATTTCATGTCTGAACAAACCATTTCAGCACCGGCCTGTGAAGAAGATGAAACTGGTTGAGGTACTGTTATAAAAACTTTGATAAAATATCGTATGAATTTGTCGTAGAATCCGTTTCCTTTTCTCTTGAAAAAGAGGATTTTTGTTAACCTTTAGTCTTATTTGACGACCTGTTTGGTTTCAAAGCAACTATGTAAGTTGTGTATTCTTTTAATAACTCTGCTTCCCTTTGTTCCCTTGCTTGTACATGGCAATTAAAAAATTATGCATCTTTTTTGGATGATTTGTTGAACTGGTTTGTTGTAATGGGAGGTCCTTTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTCTTTTTCACTTTTCCACTTCTGTATCTTGTTTGTACCTTTTCATTTTATCAATAAAATGTATTTTTCTTGTTCATAATATTAATCCATGCTATATGATGATAGGTTTTTGAAACCCACCTCTCAACTACACATTTTATTCCATGAATTAAAAATCCATAGACAGAGCATTCTTCATATAAATGCAAGTATCTGTTATCCACTTGCTCAGGAAAGACTGTGAGTGGAGATGATTGTTAGAGAG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Match: XP_011649104.2 (histone-lysine N-methyltransferase ASHH3 [Cucumis sativus] >XP_031736657.1 histone-lysine N-methyltransferase ASHH3 [Cucumis sativus] >XP_031736658.1 histone-lysine N-methyltransferase ASHH3 [Cucumis sativus] >KAE8651775.1 hypothetical protein Csa_006285 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 660.2 bits (1702), Expect = 1.2e-185 Identity = 326/415 (78.55%), Postives = 334/415 (80.48%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G09100 vs. NCBI nr
Match: XP_022928934.1 (histone-lysine N-methyltransferase ASHH3 isoform X1 [Cucurbita moschata] >XP_022928935.1 histone-lysine N-methyltransferase ASHH3 isoform X1 [Cucurbita moschata] >XP_022928936.1 histone-lysine N-methyltransferase ASHH3 isoform X1 [Cucurbita moschata] >XP_022928937.1 histone-lysine N-methyltransferase ASHH3 isoform X1 [Cucurbita moschata] >XP_022928938.1 histone-lysine N-methyltransferase ASHH3 isoform X1 [Cucurbita moschata] >XP_022928939.1 histone-lysine N-methyltransferase ASHH3 isoform X1 [Cucurbita moschata] >XP_022928941.1 histone-lysine N-methyltransferase ASHH3 isoform X1 [Cucurbita moschata] >XP_022928942.1 histone-lysine N-methyltransferase ASHH3 isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 656.0 bits (1691), Expect = 2.3e-184 Identity = 323/409 (78.97%), Postives = 328/409 (80.20%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G09100 vs. NCBI nr
Match: XP_023550958.1 (histone-lysine N-methyltransferase ASHH3 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 655.6 bits (1690), Expect = 3.1e-184 Identity = 323/409 (78.97%), Postives = 328/409 (80.20%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G09100 vs. NCBI nr
Match: XP_022969811.1 (histone-lysine N-methyltransferase ASHH3 isoform X1 [Cucurbita maxima] >XP_022969812.1 histone-lysine N-methyltransferase ASHH3 isoform X1 [Cucurbita maxima] >XP_022969813.1 histone-lysine N-methyltransferase ASHH3 isoform X1 [Cucurbita maxima] >XP_022969814.1 histone-lysine N-methyltransferase ASHH3 isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 652.5 bits (1682), Expect = 2.6e-183 Identity = 321/409 (78.48%), Postives = 327/409 (79.95%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G09100 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q945S8 (Histone-lysine N-methyltransferase ASHH3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ASHH3 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 439.1 bits (1128), Expect = 5.9e-122 Identity = 228/412 (55.34%), Postives = 267/412 (64.81%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G09100 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9M1X9 (Putative histone-lysine N-methyltransferase ASHH4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ASHH4 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 322.8 bits (826), Expect = 6.2e-87 Identity = 178/406 (43.84%), Postives = 222/406 (54.68%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G09100 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q949T8 (Histone-lysine N-methyltransferase ASHR3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ASHR3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 176.8 bits (447), Expect = 5.5e-43 Identity = 100/279 (35.84%), Postives = 134/279 (48.03%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G09100 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: E9Q5F9 (Histone-lysine N-methyltransferase SETD2 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Setd2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 107.8 bits (268), Expect = 3.1e-22 Identity = 82/284 (28.87%), Postives = 113/284 (39.79%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G09100 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9BZ95 (Histone-lysine N-methyltransferase NSD3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NSD3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 107.5 bits (267), Expect = 4.1e-22 Identity = 83/279 (29.75%), Postives = 112/279 (40.14%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G09100 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1ESV1 (histone-lysine N-methyltransferase ASHH3 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111435694 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 656.0 bits (1691), Expect = 1.1e-184 Identity = 323/409 (78.97%), Postives = 328/409 (80.20%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G09100 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HXC5 (histone-lysine N-methyltransferase ASHH3 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111468902 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 652.5 bits (1682), Expect = 1.3e-183 Identity = 321/409 (78.48%), Postives = 327/409 (79.95%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G09100 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DQU5 (histone-lysine N-methyltransferase ASHH3 isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022963 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 652.1 bits (1681), Expect = 1.6e-183 Identity = 320/412 (77.67%), Postives = 328/412 (79.61%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G09100 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E1H1 (histone-lysine N-methyltransferase ASHH3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496934 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 652.1 bits (1681), Expect = 1.6e-183 Identity = 323/410 (78.78%), Postives = 330/410 (80.49%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G09100 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LNH5 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G149450 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 651.4 bits (1679), Expect = 2.8e-183 Identity = 324/415 (78.07%), Postives = 332/415 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G09100 vs. TAIR 10
Match: AT2G44150.1 (histone-lysine N-methyltransferase ASHH3 ) HSP 1 Score: 439.1 bits (1128), Expect = 4.2e-123 Identity = 228/412 (55.34%), Postives = 267/412 (64.81%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G09100 vs. TAIR 10
Match: AT3G59960.1 (histone-lysine N-methyltransferase ASHH4 ) HSP 1 Score: 322.8 bits (826), Expect = 4.4e-88 Identity = 178/406 (43.84%), Postives = 222/406 (54.68%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G09100 vs. TAIR 10
Match: AT4G30860.1 (SET domain group 4 ) HSP 1 Score: 176.8 bits (447), Expect = 3.9e-44 Identity = 100/279 (35.84%), Postives = 134/279 (48.03%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G09100 vs. TAIR 10
Match: AT1G77300.1 (histone methyltransferases(H3-K4 specific);histone methyltransferases(H3-K36 specific) ) HSP 1 Score: 103.2 bits (256), Expect = 5.5e-22 Identity = 75/259 (28.96%), Postives = 106/259 (40.93%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G09100 vs. TAIR 10
Match: AT1G77300.2 (histone methyltransferases(H3-K4 specific);histone methyltransferases(H3-K36 specific) ) HSP 1 Score: 103.2 bits (256), Expect = 5.5e-22 Identity = 75/259 (28.96%), Postives = 106/259 (40.93%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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