Clc05G16880 (gene) Watermelon (cordophanus) v2

Overview
NameClc05G16880
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus cv. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationClcChr05: 24981796 .. 24986251 (-)
RNA-Seq ExpressionClc05G16880
SyntenyClc05G16880
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGTTATGTTCCATCACTTCAACCGTTTGTTTTTCTCAGAGGTCAAAAAGCTTCTTAGCTTATTGCGCTGTTCATACTACCAAGGTGACTCATGAAAATTCTCTCAAAATTTTGTATCTTTATGGACCCGTCAGCTGCATTTCATTTCTTTTACTGTTAATATTGCATCAGGTCAGAGGTCGTTTCCAGTTTCAATAAGTGTAGTTTTTTCCATGTGTGTAGGCCCGTTAATCATCGGATGGTGATGGTATAGGGGGGAGTACAGCATAAGTGCACAAATATTTGACCCTTTTTGTAGACTTCCTCCTGCTATTTCCTTAAAAAATTATTTCTTTTATCTGTAACTGAACCTTAGTACTTAACCATGCAAAACCACAACACCTGTAGTTTCTCTTTGAAAGGAATGCCACAAGGAGTTGTTCAACATAGGAAACCAGGGAATCTGTGTCATATACCAGCTTAGACGAAACTCATTAAAAAAGCTCATTGTAGCTTCTATAAATGACCTGACTGCTGAAAAAAATATAGTTCACTTCTACAGCTCTCCTTGCAAAAACACAGCAGCTTGGAGACAAGCGAGACAACACAAAAACCTAACCTCCCGCCCCCCATTCATTTTTGTGCATTTTGACCATTAAACTACATTGGAGATGAATCTAAGCAAAATTGAGAAGTAATTGGTAGTGTAATGTCCTGAACCTCTCAAACCCAACCTATAAAGCACCGACACTCCTAAAGTGGCCAAGCGTCGGTGTCAGATACCGACACGTGCCTGACAAGCCAGCTAGTGTGTCCATTATTTTATTGTTATGTTTTATTTTTTGACACGCTAAGACACTCAAAGGACACACGAAGGACACGTGATTTGCTAAATTTAGAAAAGAAAAAAAGGAAAACAATGCACAACACACTACCTTGACCCATGTAAGCCCAATTTAAGCCTCCATTTAGCCCATTAAGGTTCACTGTTCAACCCATATTTTTTAAAATTCTAGGTTTTGACCACAGCTTCTCACAAATGACACACTAGGTCTCAAACTTATGATCAGCAGCTAGCTGATTCTTTCTTGTAGCATGAGGAAAATATACAGAAGGCTTATTTGATTCTAATTTGTAGTTTTGTTGTGTTAAACTAATTACTAACTTATTGGGATCTGAATATTGTTATGACATTGGTCATCTTCTCTATTGTTTTTTTATGAACTGTATGGTTATTTCGATGTTTAAAGGCAATATTTCACAATATGTCAAAATATGCACACGTATATTTACTGTTGTAAAAATAAATCAATAACGTGTCCCCAACATATCATGTCCTACTTTTTTGGAAATTGATGTGTCGTCTTGTCCGAGTTGTGTTGTATCTATGTCACATGTCAGTGTTTGTGCTTCTTAGTGCATGTTTGAGAGGGATTTTAAAATGGCTAAAATCACTTTTGTCATGTTTAAAGTCACTTCGAAATACGTCTTTAATCACTCAAATCAATTCATTATTTAACTATCACTGTTAAACATGATTTTCATACTAGTAGAATGGATTTTGAATGATTAAAAGCATTTTTCGAGTAATTTTGGAAATGACAAAAGTGATTTTAACCATTTTATAATCGCTTCCAAACATGTCATTAGAACCCAACAAACTGAATCTTGTATAGATCAAAAGTGGTAGCAGATATTCAATGTGAAGTTGCCATTGATTTAAAATTTTTGCTGCTTTCTCTAAGTGTATGTTTCCCTTATGGGATAGACTTCTAATCTTTGGATTTTTACCTCACTGTCTCACATTGATGTTTGTGAAGCCAGTTGATTCCCTCTCCAAAACAATTCTAGTTTAGAAGAGCTAAAGTCTAATTCGTTAGATTAGTCTATTATTCAAGCTAAGACATAAAAAGGTTGGTGCTTTGTGTTAAACGTGGATTATACAGTATTAAACTCTCAAAATGGACTCTGATCAAAGTCCGAAACTTCCAACCCAAAACTTCTCATTTTCTATGTTTAGTAAGTTAGTAACCAGAACTGAAATCATTTAGGGAAGAACTGCATTTCTCATTTTCTATGTTTTGCCACCGTTCTAGTAGGTTGCTACTTTTGTGGCGCACGTGGTCTTCAGGAATTAGTGGACTATATGGAAGTTTCAGTGTTGATATAGCATCCAGAAATCTTATAGGCAAGGGTATTAATGATCTATATGGAAGTTGCAGTGTTAATATCTGCTTACATTTTTCAGTTTAAAAAGTATAGAGTTGTTCAATAATAAATATGAAGAACTCAATCAGTTTCTTCCTTATTTATATATAGCTAGCATGTTAATTTAATTATAATTCTAAAATAACGTACACATGTCTATAATTGAGCTTATTCGAATTCCTAAATTATATTAGAATAAGCCCGTTGTGATCTCACTACATCCATTAAGTTCTGCAATGAGATTGAGGTAACTTCCTTGAGCTTTCTTAATGGAATAAATTGATAACTGAGGTAAGGTGACTGCAAATTTTCAGTTGATCGTGTCAACTGCCAAAGGAACTTCTGTACTCAACTTACGTTTGCTATGGGGTTGAGAAAACAGTGGACATGCTTGTGTATTTGAAATTTCAGGCTGGTCGCTTCAATTCCTTAGAGGTTTTCGCATGCGCAAGCACTTCACAACATGTCAAACTATTGACCATATTTGTGTTGCTGTCGTTATATTTTTGGTATTTAGAACTGAAGGACACAATTGTACAACCTATAACCTATAGAATAAATCTCTTTCAAGTAAGGTCATTATCGTATTTTTGGTTTTGTAATTGGATAGAGATGAAAAGATTTCTAAGACAAATTTGGTCACATTGAGATGGCTGGACTAGAGTTAAGATTTTTATTTTTATTTTTATTATTTTTTTTATTTTTTTAGTAGAAATTTTAAAGCGGTAGAAATTGTTTTCTTGAATTGCGACTTTGTATTGTTTAAGCTTCTTCCTTGCTACTGTTTTCTTTTTCTTTGAGTATATCTTATTCCCTTATTATCCTCTTGCATCTCGAGCTTTAGTTCTTGGTCAATATATTAGTGATCACTAGATTTTAGGCGATGGACATTGGACTCCTTTGGAAAATTTTCAGTTAAATCATTATCCAAACATTTGATTGCATCATGCCCTCTTGATAAGGAGGTATGTGGTTCAATGCGGGAGAATATCACTCAAGTTTTGGTTGGCCCATCATTATCCTCTACATCTCAACTACTATCGTTCAACACGGTCTTTAGATTGGTCAGACCAGAGCCGCTCATCTTCTTGCCTCATCATGGTGTTGTTTTCAATCCAAAGGTTTTACTGATTATTCCATTCAGGACATTTGTTATGCTTCCATTCGTTGCTTTAACATATGTAGCATTTGCATTATTCTCTTGTTATTTGGTATCTTATATTTTGTAGCATTAGACTCTTTTCATTATATCAATGAAAATCATGATTTCCATTTCAATATATATATATATATGATCAAACTTTTTAAAGTGTTCTGTTTCTAAACTTTTAATTTGACTATTGACCAAAATTATTTACTCATACTTTTTAAAGAGTTGAAATTGAGTTATTTCTTCGGAGCTCATCAATGTTATCCTATCTCTTTACCAGTAAGCTAGTAGTAAGTCCCTTTGATGTCGTTATCATCTGCCTAAGAGTGTGCTGTCTATTTCATTTTCTTGTCATGTTTTTCGTTTCATCTGATGTAAATCCTAAGCTGTGTTCTTGTTAGACTTCTTAAAAGCTATTGCACAGAAAAATGGAAGAAGATTCTCCAGACTCCATTATCTTAAATTCCAAATTAGTATCCCATCATGTCAAGGTTGAAGTTTATATTTTTTGTCATATCACTTGTAATCCTAAGTAGAGAGATATTTCTCTTGTTCCTGTTTAGCAGTTTGACTTGAAGTTCTCGTTCAACAAGTTTATAATAGCACGTACGTGCAAAGGAAATTGCTTGGAAAATTGCACATATTGCTGCTATGTCTTATCAGTTCCTGTGCTGCATATAGTACATTTGTCCTTTTACATAAACATATCCCTTGGTAGTGATTAGATAACAGTGTGAATTATTTTTTTGATCTTTTATGTACATAGAAGAGAATAGCATTTTTTACAAAAAATTCTCCTACTCCACCTTGTTTGAATTTTTGATGCACTTACACAGAATTATCATTTACTTCGTTTAGGTAGAAGTTCGATTGCCATTCCTACACTTTCTGTCAAGCTAGATTGTACAAAGGCATGAAAGGAATGTGAACTTACCTTAAAGTTCGACATCAGCATGGATGCAAAAAGCTTACCTGTGGTTCTTCAGATGGACTGAGTTGACTGCAAGGCTACAATGTTAGCTTCTCTGGAGAATCACGTCATATAAACAGGCTTTAATAGACCGTCTTTTTGATTTGGTCTAACATGATCCATCCGTTGCAGTGGAATGGAGATGCTGA

mRNA sequence

ATGTTATGTTCCATCACTTCAACCGTTTGTTTTTCTCAGAGGTCAAAAAGCTTCTTAGCTTATTGCGCTGTTCATACTACCAAGGAGGTATGTGGTTCAATGCGGGAGAATATCACTCAAGTTTTGGTTGGCCCATCATTATCCTCTACATCTCAACTACTATCGTTCAACACGGTCTTTAGATTGGTCAGACCAGAGCCGCTCATCTTCTTGCCTCATCATGGTGTTGTTTTCAATCCAAAGGTTTTACTGATTATTCCATTCAGGACATTTGTTATGCTTCCATTCGTTGCTTTAACATATGTAGCATTTGCATTATTCTCTTGTTATTTGCAGTTTGACTTGAAGTTCTCGTTCAACAAGTTTATAATAGCACCATGGATGCAAAAAGCTTACCTGTGGTTCTTCAGATGGACTGAGTTGACTGCAAGGCTACAATTGGAATGGAGATGCTGA

Coding sequence (CDS)

ATGTTATGTTCCATCACTTCAACCGTTTGTTTTTCTCAGAGGTCAAAAAGCTTCTTAGCTTATTGCGCTGTTCATACTACCAAGGAGGTATGTGGTTCAATGCGGGAGAATATCACTCAAGTTTTGGTTGGCCCATCATTATCCTCTACATCTCAACTACTATCGTTCAACACGGTCTTTAGATTGGTCAGACCAGAGCCGCTCATCTTCTTGCCTCATCATGGTGTTGTTTTCAATCCAAAGGTTTTACTGATTATTCCATTCAGGACATTTGTTATGCTTCCATTCGTTGCTTTAACATATGTAGCATTTGCATTATTCTCTTGTTATTTGCAGTTTGACTTGAAGTTCTCGTTCAACAAGTTTATAATAGCACCATGGATGCAAAAAGCTTACCTGTGGTTCTTCAGATGGACTGAGTTGACTGCAAGGCTACAATTGGAATGGAGATGCTGA

Protein sequence

MLCSITSTVCFSQRSKSFLAYCAVHTTKEVCGSMRENITQVLVGPSLSSTSQLLSFNTVFRLVRPEPLIFLPHHGVVFNPKVLLIIPFRTFVMLPFVALTYVAFALFSCYLQFDLKFSFNKFIIAPWMQKAYLWFFRWTELTARLQLEWRC
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Clc05G16880.1Clc05G16880.1mRNA