Clc05G14440 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGTGTGCCGGTTGTCTGAAATGACGTGGGCAGTGTTTCAATTTTACCTTCCAAGTCATAATGGTCCAAGCGACTTGCTTGTTTCCTTTAATATGTAGCTCCATCGATCTGCACGTCACGTACTCTCGATCACAGAGCCACCGGAGTCTTTCTTCATTGCAATGGATGGGTTGCTGCCGTTCTCTTATCAGCCGCCGGAGCCGATTCCATTACGTCGAGTCTATGCCAATGTTCTAAACTATGTACCAGGCGGCCGTTTTCACCATTTCTCGGATTCTTCTATGCGAAGGTCATGCGCAGCACTAACACCTCTTCTTAGCGTATTTCCCCACCATCTTAAGCCCACAAAACTCGTCCAAGGTTATTTCTCTCCTTGTATTAGAACTAGAATCAAACCTGCTCTCGTTCATTCTCCTTTGCTGGCCGGTGACGGCCATGGGTGTGGTGGAAACAACAATGGCGGTTGGAATTATTCGAATCCTTTTGGGGGTTTTGGATGGTGGCAAAATGACGGTGATTCTCCTCCATGGTCAGACAATGCCTTCCTTGCCTTCTTCTTTACCTCCGTTCTGGGTTGTTTCTGCCTTTTTCAATTGGCAGCAGCGGTAGCACGTAATGAAATGAATTATGAGTCTGTTTGGGAAGTAAAAGGAGGTAAGCGAATCCGCCTCATTCTCGATACGTTTAGGGATGAGTTCCATGTTGCAACTGGCATGCCGTCGTCTTCGTTATCCTTTTCCTTTGTCAATTTTTGGCTTCGTTGCAGCGATGTATTCAGGCGTTTGATGCTTCCGGAGGGTTTTCCAGACAGCGTTACCAGCGACTATCTGGAATATTCTCTTTGGCGAGGAGTCCAGGGGATTGCCAGCCAAGTTAGTGGGGTCCTTGCAACTCAGGTGCCCATTTACGTTCGTCTATGGTTCCTCTTTCCTGTTTCTCATCCAACAAAAGAATAATTGATTGCATTTTGCTTGAACCCCTGCTGGGATGCAGGCACTGCTTTATGCTGTTGGATTGGGAAAAGGAGCTATTCCGACTGCTGCCGCAGTGAATTGGGTACTGAAAGATGGATTTGGATATCTGAGTAAAATTTTACTCTCAAAATATGGACGGCACTTTGATGTTCATCCGAAGGGGTGGAGGTTGTTTGCTGATCTTCTGGAAAACGCTGCCTATGGGATGGAAATGATAACTCCCGCATTTCCCCTCCATTTTGTCATGATCGGTGCTGCTGCTGGGGCTGGACGATCTGCAGCCGCCTTGATTCAGGTTATTGGAAGTTGATACGTAATTTACACACGATACTAGAAGTTGTGCCTCATTCCCTGTGTTTGTTGCCTTATATTTATGTATTTAATCTGCTGATTAGTTTTTTCGAATGCGTAGCTTAATTTGATTTAGATAGTGAAACGCAGAAGTATTAAGTGAAACCAATGGATGGGCAACTGTCTTAGCTTTTGGTAGGTTGTGGAGAATTTTGGTTACATGCAACGAGAAGAAGATCATGACAACAGATGTACTAGAGGGAGCCTTCTCTTTAACAATCAAAGTGGAGAACAAGTTTGGGTTTCAAATGTTTATGGTCCTTCAAATTATAGAGAAAGGAAGGTGTTTTGGGAAGAACTATAGGGAGTGTCTTTGGAGATGTCTTGAGAGATAATTATAGACGTCCCAAAAAAACAAGCCCAAAATGAATTTTTCCTTTTTTTTTATAATTTTTTTTGAAAAAGGAAACGACTCTCTCCATTGAAATAATGAATTGAGACTAATGCTCGGTTTACAATATGGGATACAAGAGCACAAAGGACCTAAGGATCAATGAGTGCACCCGAACATCGCAACTAGATTGACACCTCTTTAGTACTCTCATCATCTCCATTCAAAAGCAACCAAGGGCCAATTAGTAGTACAACAATACAAGATAAGATAATTCTTCGAATACAATGGCCAATGGGGCAATTCAAAACAAGAGATTACAAACAAAATACTACTACCACAAATAGTGGAGTACTAACACTACTGCCATGGACAATACAACCAAAAGTCTACAGCAGCCACAACCAAGACTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAATACAGAATTCCATAGGAAAGCAAAAACTATTGAGCTGGAAAAATGAACGCTTCCAATTTAGACTAATATCTTAGATTGAGAAATCTGCAAAATCTTTGGAGAGAGCACACCAAGAGGATGTGTTGAGCTAAGTATCTCCAATCGATCTAACCAAGGCGTTGACTTGTCGTGAAAAACTCTTTGGTTCCGTTCAAACCAAATTTCTGCAAGCAAGGCTTTGATTGTGTTATTCCATAGTAGTTTTGGGGTCGGCTTAAGAATTCCACTGTAAATCCGTCTTGTCCAGGGGCTTTATTCTTCCCTAACAACTTCAAGGCGCTTCTAATTTCAACTTGATTAAATCTTGCCACAAGCATAGAGTTTTGAACTTCTAAAACAATAGGCCACTACAGGTTAAGAGGAATAGATCTTGTACCCATGCTTTTAGAGTAGAGGGATTTATAAAAACCCAAAATAAGATTTTCAATTTCTTGAAAAGACTTCCCTGGAAAGACATTTTGTTTGAGCTTCCTACTTTTTCTAGTTTTGTTCGGTGTGTTGTGGGGGATGGTAAGGACACGTATTTTTGGGAGGATCAATGGGTGGGGGATAGTGCTCTTTCTTTTGTCTTTCCGCATCTTTATCACTTATCTTCCTTTAAAAATCACCTGAGCTTGGATTTCTTACTTTGGTCTGAGAACTCTGTGTTGTTTTCCTTTGGGTTCTGTCGCCATTTGTCCAATAGGGAAACAATGGAGGTAGCCTCTCTTCTTTCTTTCTTGGTGGCGTGCATCTTTAGGGAGGGGAGAAGGAATGTCCGCATTTGGAGTCCAAATCTCAGTGAAGGGTTTTCTAGTAAATCCTTCTTCAGATTGTTACTGGGTCCCTCTCCCATTGGGGAGTCGGTGTTTGATGTGATTTGGAGGATTAAGATTCCTAAGAAAGTCAGATTTTTTATTTGGCAAATCTTGCTTGGTTGTGTGAACACTCTTGATAGGCTTCTTAGGAGAAGAACTTCGCTTGTGGGGCCTTTCTGCTGTATTCTTTTTGGAGGAAGATCTGGATCATCTCCTTTGGGACTGTCAGTATGTGAGGATGATGTGGAATCTCTTCTTGTAGGAGTTCGATGTTAGCTTTGCTGGACAAAGAGATGTTTGTGCGATGATCGAGGGGTTCCTCCTCCATCTGCCTTTTAGAGAGAAAGGCCTTTTTTGTGGTTTGCTGTGGTGTGTGTGGTTGTTTAGGACATTTGGGAGGAGATGAATGATAGAGTGTTTAGAGGTAGGGACAGGGACCTTTTTGAGGTTTGGTCTTTGGTGAGATTTCATGTGTCCCTTTGGGCTTCTGTTCCGAAGCTTTTTTGTAATTATTCCTTAGGAAACATTTTACTTAGTTGGAACCCCTTCTTTTAGTTGGGGTGTTTTGGTGAGCTGGTTTTTTGTATGCCCTTGTATTCTTTCATTTTTTTCCTCAATGAAAGCAGTTGTTATTATAAAAAATATTTCCTGAAAAGACTTAGTAGGAACTCCTTGGTCATTGATCAACTTTGAAATCAGATTCTTCCTTTTCCTTGCTGTTAAGAATCAGTGAAAGAATCTTGTATTTTTATCTCCCAAACTCAGTCAACTTAGCTTACTTTTTTGCATTAAATTCCTTTCTTCCGTGCGATAAATAGAGAACAATTCGGCTTTCAAGGCCAGCCTCCTATCCACTTGAAGTAATTTCAAAATTTTCAATAATTAAGTCTAATCTTCCAATTTCTTCTAGCAAATAAACTTCCTGTCTTCGTTGTCTTGCCTTAAAGTCTGTATTCCAGTTTTTTAGCACTGCTTTTAGATTTCTTAATTTGGAGGTGATAACAAAGCAGCCCACCTTTGGGGATGGCCAATACTCAGATCTTTCAATAGTTCTGCAACACTCTTTATTAAGCAACCAACTATTGCTAAATTTGAAAGGGGTCGGACCCCATGTAAACGAACGGGCTTCAAGCAGGAGGGGGAAGTGATTTGAGAATGTTTGAATTTGCTTTGCCACTTAAGGTTTTCAAACACCTCATCGCAATTATTAGAGACAAAAAACCTATCAATGGGAGAACATGAGACCACAACACCTTTACCAGACCAAGTCGCCCGTTCGAAAGAGGGATTTCCAGCAGCTTCATATTCGCAATAAAACTATTGAACTTCCTCATTCCTCTTGTTAATCTACCCAAGGGAAAATGCTCCTGAGGTCTTCGAGTTATGTTAAAGTCCCCTCTGAAACACCAGGGCTCCATACAATAAGCTGAAAGAGATAACAATTTTGGCCAAAGGTACTTTCTTTCTCTATAATTAGATGGTCCATACACATTTGTGATCCATCATATCTTCTTACAAATGGTTGTGCATTTAATAGATAAAGAATAACCTCCTTTGAGAACTTCAGTAACCGAGATTTTGCCTTCATCCCACATGGTTAGGATACCTCTAGATTTTCCATTAAGATTTGACAAAAGTCCACCCAGTGTCCTTCGAACTCCATAATGTTTTAATAAAATCAATATGGAAAGCATCTTCCTTTGATTCTTGGATCAAGACCATATCTTGATTTACTTTCGTCAAACATCTTCTTAGCGCCAATCATTTAGAAGGATCCCTAAGCCCTCTTGTATTCCATGAGATGATCTTCATTTAGGGCAAATCAAAAGATCACTAGTACTCTCACAATGCTCACCCAAATTTAATGTCACAGTCTTCAACTATAGATAATAAGTTCTGTGGGATCTCTTTCTTGCTGAGAGGAGGACTTGAAGTATCCCCAGCCTTGTTGAACAACGGATCTTCCTCTGCTTGAAATAGCTGACAGATGTCTTTGCCAAACTCATCTACTGTCTCTCCATCTTCCTTTGGAATCACCTCTGCATCAGAACTATCAAGCTCATC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MEPPESFFIAMDGLLPFSYQPPEPIPLRRVYANVLNYVPGGRFHHFSDSSMRRSCAALTPLLSVFPHHLKPTKLVQGYFSPCIRTRIKPALVHSPLLAGDGHGCGGNNNGGWNYSNPFGGFGWWQNDGDSPPWSDNAFLAFFFTSVLGCFCLFQLAAAVARNEMNYESVWEVKGGKRIRLILDTFRDEFHVATGMPSSSLSFSFVNFWLRCSDVFRRLMLPEGFPDSVTSDYLEYSLWRGVQGIASQVSGVLATQALLYAVGLGKGAIPTAAAVNWVLKDGFGYLSKILLSKYGRHFDVHPKGWRLFADLLENAAYGMEMITPAFPLHFVMIGAAAGAGRSAAALIQAATRSCFYAGFAAQRNFAEVIAKGEAQGMVSKSIGLMLGITLANRIRSSTSLALGCFSIVTLIHMFCNLKSYKSIQLRTLNPYRASLVFSEYLLSGEVPSIKDVNNEEPLFPAVPFLNTRLACDEPKLGLLSAEAKESAANIEKRLQLGSKLSDVATSEEDVLELLSLFNKENYILSEHRGKYCVMLKESASPVDMLKAVFHVNYLHWLERNAGITARNASNDCRPGGRLKMSLEYVEREFNHVKYDGELAGWLTDGLIARPLTNRICECHVAT Homology
BLAST of Clc05G14440 vs. NCBI nr
Match: XP_038881395.1 (protein root UVB sensitive 1, chloroplastic [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1187.2 bits (3070), Expect = 0.0e+00 Identity = 581/611 (95.09%), Postives = 597/611 (97.71%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G14440 vs. NCBI nr
Match: XP_011651345.1 (protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8650562.1 hypothetical protein Csa_009558 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1139.4 bits (2946), Expect = 0.0e+00 Identity = 564/611 (92.31%), Postives = 577/611 (94.44%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G14440 vs. NCBI nr
Match: XP_008449956.1 (PREDICTED: protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1119.8 bits (2895), Expect = 0.0e+00 Identity = 554/610 (90.82%), Postives = 574/610 (94.10%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G14440 vs. NCBI nr
Match: XP_031738101.1 (protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1091.6 bits (2822), Expect = 0.0e+00 Identity = 545/611 (89.20%), Postives = 558/611 (91.33%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G14440 vs. NCBI nr
Match: XP_023528607.1 (protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1044.6 bits (2700), Expect = 3.3e-301 Identity = 524/614 (85.34%), Postives = 558/614 (90.88%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G14440 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7X6P3 (Protein root UVB sensitive 1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RUS1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 627.9 bits (1618), Expect = 1.3e-178 Identity = 342/566 (60.42%), Postives = 416/566 (73.50%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G14440 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q84JB8 (Protein root UVB sensitive 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RUS3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 175.3 bits (443), Expect = 2.2e-42 Identity = 129/439 (29.38%), Postives = 221/439 (50.34%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G14440 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q91W34 (RUS family member 1 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Rusf1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 171.0 bits (432), Expect = 4.2e-41 Identity = 111/338 (32.84%), Postives = 174/338 (51.48%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G14440 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q93YU2 (Protein root UVB sensitive 6 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RUS6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 169.9 bits (429), Expect = 9.3e-41 Identity = 115/412 (27.91%), Postives = 193/412 (46.84%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G14440 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q96GQ5 (RUS family member 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RUSF1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 169.9 bits (429), Expect = 9.3e-41 Identity = 132/452 (29.20%), Postives = 213/452 (47.12%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G14440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BP56 (protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491686 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1119.8 bits (2895), Expect = 0.0e+00 Identity = 554/610 (90.82%), Postives = 574/610 (94.10%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G14440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F2S0 (protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111441619 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1038.5 bits (2684), Expect = 1.1e-299 Identity = 520/604 (86.09%), Postives = 551/604 (91.23%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G14440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F1U0 (protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111441619 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1033.9 bits (2672), Expect = 2.8e-298 Identity = 520/605 (85.95%), Postives = 551/605 (91.07%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G14440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J7M2 (protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111482094 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1029.6 bits (2661), Expect = 5.3e-297 Identity = 514/604 (85.10%), Postives = 551/604 (91.23%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G14440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J7Y8 (protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111482094 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1025.0 bits (2649), Expect = 1.3e-295 Identity = 514/605 (84.96%), Postives = 551/605 (91.07%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G14440 vs. TAIR 10
Match: AT3G45890.1 (Protein of unknown function, DUF647 ) HSP 1 Score: 627.9 bits (1618), Expect = 8.9e-180 Identity = 342/566 (60.42%), Postives = 416/566 (73.50%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G14440 vs. TAIR 10
Match: AT1G13770.1 (Protein of unknown function, DUF647 ) HSP 1 Score: 175.3 bits (443), Expect = 1.6e-43 Identity = 129/439 (29.38%), Postives = 221/439 (50.34%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G14440 vs. TAIR 10
Match: AT5G49820.1 (Protein of unknown function, DUF647 ) HSP 1 Score: 169.9 bits (429), Expect = 6.6e-42 Identity = 115/412 (27.91%), Postives = 193/412 (46.84%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G14440 vs. TAIR 10
Match: AT5G01510.1 (Protein of unknown function, DUF647 ) HSP 1 Score: 154.1 bits (388), Expect = 3.8e-37 Identity = 112/408 (27.45%), Postives = 193/408 (47.30%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G14440 vs. TAIR 10
Match: AT2G31190.1 (Protein of unknown function, DUF647 ) HSP 1 Score: 153.7 bits (387), Expect = 4.9e-37 Identity = 86/249 (34.54%), Postives = 139/249 (55.82%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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