
Clc05G13420 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGAGTATAAACACTTTCCACAAGCTTCTGGACTTCAAAAGAAGAACGTTACCGTTCGATTGCCTTCGTTCTATTTCTCCCTTCAGGAGATCGAGAGCGATAAGCAAAGAAGTCACTCAGTTAGCCGCGAAAAAATTCAGTAAGAACAAGGGGAATTGGAACTCCAATATTCATTTCGCAGTGTTTTCTGAAGTTGAAATGGATCCTGAAACTGCCCTAGAGCTTGTGAAGCAGGGTTCGACGATTCTCCTCCTCGACGTTCCTCAGTACACCCTCGTTGGAATTGATACTCAGGTTAATCAGATAAATGCATCTTTCTTTCTTTTCGGTTTCTTTCTTTAACAAACGTTGTAAGAAGTTTCGAGGAACTGAAAGCAGGAATAGACTTTTAGTCACACTAACCAAGCACTGATTGCTGTTCCTGCTATTGGGTGAAATTTGTGATCGCAATGTTTGATTCTGTTGGATTTGAATATCGATTTGTGATGAACGAAAAATTGATTCGATGTTACGTGTTACTCCTCTATTTCCAGTCCTTTTTGTCTGATATTGGTCGAAATCTCTATACACTTTTTGTTGGGTTGGCGGAAAAGCCCCTTTTCCATAGTTCTAGCCGGTAATAGTTTAAATTTATTCGGTGAATGTTGTTTTTTGTTTTTGTCATGGGACTGTGTATATTAGTCCTCCATTTCCGATCATTGATAGAAAAGTCATTATATATAACCACCAAAAGTGTTTCATTGGGCTGGCAGAATTGCCAATTAATGAGCCGGTTTCATAGTTTTAGCCACGAGTACTTAAGATATTTTAAATTAAATCTTGTATTCGATGTTTCTCTTTGTTGTGAGCATTATTTCTTCTCACCTTGTATTCCTATCATTTTTAGCTGAAAACTGGCCAAAACCACTGTACATTTTTTGACTAGTTGGTAGAAAAAGCCTCGTTAGGAGCTGAATTCATGGTTTTTATTGGCTAATACTTATAATAGTATTCATTGATATTGTTGTTTTCAATGTTTATTTTTGTTGTGGGCAAGACTTATTCTCTTGATATATCATACTGGATCTCCTATCATTTTGAGAATGAATTGCCCAAAACCACTGCATACTTTTTGTTTGGTTGTCTGAAAAGCCACATTATGAGCTGATTTCATAGTTTTAGCCACCAATACTTATAATTCTCTTGACTAAATTCTATTTCAATGTATATTTTTGCTGCTAGCAAGTCTTATTCTCACCAGTCACCATGAATGAAGTTTTTGGTCATTGCCTTGTGAGCATTCAGTGGTAGGGGAAATTCTATTCTAAAATGGAAAATTGAAATAGCTTCACATTTATTTTGATCAATTTGGAGTAAATATTGCGGTCGAGTAATTTAATTTAATTTATTTTAATTTATTTAGATTGACTAATTAGTTGTTTCTCTTCTTAAGATGTTCTCTGTAGGGCCTTCTTTCAAGGGTATAAAGATGATTCCTCCAGGACCTCATTTCCTTTATTACAGCTCGTCTTGCAGGTGTTGTATCATTAATCAGGTTCTGCAGATATGTCTATTGTATTGTGGCGAACTATCACATACATAATGCTCTCTATGTTGTCATATTAAATCAGTTCTCATACAGATGCATGTCATATGATGCATCATACATTTCATTATTACCGCTCATGGATCATTCATTTTGTTATTACTGCTCATGTCCTCCCATGACTTGTTTAGCCTTGCATCCTGCATCACTTTGATAATTGCGTGTCTAATTCTAACTTTATATGACAACATTTTAGCAACTTAATGCATTGTATGTTGCTGATTAATTAGTTTCTGTAGATACCTATATACGCTCAACAATCACATACTATTAAATGCTATATTTCTTCTAGGCTACTAAATGTTGATGTCGATGGAAATATTGAAGTCCTGGTTTAATGGAAATTTTGATGTCGATGGAAATTTCGGAAAACTTTATGGAAACCGATCGAAAGTGATGGAAATTGTTATAACTAATTAGTTAATGAAACTTTGATTGTGGCTTAATTAGACTAATAATCATTTCTATAAAGTAAGACAACTTTTAGATGTATATTGTAAATGTATGTGTAAATGTAGATGCAAGATCAGAAATTTAAGAAAGAAATGGAAAAATAATTACAATATAATATAAAATATTGGTAATTAATTACAAAATCAAAGGAGACATGAAATATTTGCATACAAAATAATTATAAATTTGGGACATATACAGTGCACCCACCGTCTCCTTTATGAAATGCTTGTCAACTTCAATGTGCTTTGTCTTATCATGTAGAATTGGATTATGAGTTATAGTGATAGCAACCTTGTTATCACAATAAACCCGTATAGGTGTCTTTTGAGACACTTTCAGTTTTTCCAGTATTCTATTAATCAATATACCTTCACAAATTCCATTTGCTAAGGCTCTAAATTCCGTTTTTGCGTTACTCCTGACTACTAGCTCCAAAAGTTTAAGCTAATGGGTGAAGGAAAATTTAATCTTATATGTCATCTAATATTTCCCCGCACTTATGGACTTGAAATATGAAGAAGACCCAACAAGTGGAAATCAATATTAATTGGGGAGGAAACAACGTAAAAAACAATGTAGGGCTTGAACACAGGACCTCCCTAGATCACCTGCTCTGATACCAAGTTGAAATTGAGAAGAAAATAGTGTAGGATTATTCTTCTATATTTTTGAGTCAAATACAAGGTCTTCTTTATATAGAAGAAAGACCAACTACAAATAAGGAAGAAATCTTACAAACATAAATGATGAATATACACATAACAAATATTCAACATTACAAGAGATAAAGGAAATCCAACAGATATGCTATGATGTTAATCAAGCTATATAGCTACTTGGTTTGAGACTGTACTTGAACTTGATAGTTAACTTCTTGTAAAATTCCTCTGTAATTTTTCTGTTTGTTTTGGTAGGATTTCTTGTCCTTTCTCGTGCATGATTTCTCTTACTATTATAGTCCTTGTTTTCTATGTAAAAATGAGATGACATTATGACATCAATTATTGACCCTCGTGTTTCTGTAATGTACTTAACTCTTTATTTATTAGTCCATCGTGTTTGATGAGAAGACAATGACTAAAAGCACGTGGGAGATCACAAGATTTATCGAAAGGCCATCCAATTGGTCCAATACAATAGAAACAATCCTATTGTACTTTGAATGATTTATGAAAAAAGCCTTTTGGTCTATAAGTTTTGAGTCTAGTTTCCATTGGTACCTAAATGTTTAAAGATTACACTTTTACTCTTGAGATTTGAGTTTATTTTCCATTTGGATGACAGGTTTTAAAATGTTACATTTTTACCCCTCAATTTCGAGTTTAGTTCTCATTTGGTCCTTACATTTTAAACTCTTGCACTTTTACCCTTGAGTTTTTAACAAGTGTTCACTTTTTGTTACTAACATAACATAATCTTTGGTAGGAATTCAATAAAGGTGGGGTGGGATGGGGGCAAGATTGGGGCTTCTTGATTTATTGTGGGATCAAGGTTATGGGTTTGGAATTATTCATTCCTTGTTTACTTATTTATATTCTAGGAAGCACGACAGAGTGTGCATGTAGACACGTGTTAGACATGGATACATGTGGATGCGCTTTTGACATGTGTCTGAATTAAATATTCATTATTTTCTAATTTCGGACATAGTCAGATTTGGTGGGACACAACCTAGACACGTCGGAGATGGCCGATTAAAGAATAAGAAAACAAAAAATAGGAAACAAAATTAAAAATATTGTGGCTCACTGCAGGGAGAAAAGGAGTTGGTGGATCAACGGGTACCAACAACCTTTATTTTCCATTGCCAAACACTTGGACAGACCTGTGAAGGGAACGAAGAATATGGAGGAAAATGGAAAGTATCCTCGAAATTTGGGAAGTTAGTAAATGTAGAATTATTGTCCTTGAAATATAGAAAAGTTTTTTCTATTATTATTATTATTATTATTATTTATTTTTATAAGAGACAAATTTCATAGAGTTCATGTCCCTCTACTCCAATTTGCGGATGATATGTTAATTTTTCTCAAATATGATGTTGAGATGTTACAAACTTGCGCAAAACCATTGAGCTTTTTGAATGGTGCTTTGGTCAGAAAGTAAACTGGGATAAATCAGCCTTGTATGGGATCAATATAGATGACAATGAAGTTAGCTCCGTTGCTGCCAAGCTGAATTGCAAGATCGAAAAATTGCCTATAATGTATCTTGGTCTACCATTAGGCGGGTATCCAAAGAAGGAGTCATTTTGGCAGCCAATTCTCGATAAAATCGAAGGAAAATTGAATAAATGGAAGAGATTTAATCTGTCAGAGGAGGTAGACTGACCCTTTGCAAATGAGTGCTTTCTAATCTTCTCACATACTATATCTCTATCTTTCATTGGCGGAAAAGATAGCCTCATCCTTGGAAAGATCAATGAGAAGCTTCTTTTGGGAAGGTCATAAAGGGGGAAAATTGAACCATTTGGTCAAATGGAAGGTAGTTATAGAAGACCAAACAGATGGGGGCCCTAGTTTGGGAAGTTTGAGATCAAGAAATGTAGCCTTGCTATCTAAATGGGGGTGGCGATTTTTAAAAGAATTAGAAGCTCTTTGGAGTATGGTCATAAGGAGTATACATGGTTGTGGTCGTTCCAATTGGCATACAAGTGGAAACGTGAATGTTAGCTTGAGAAGTCCGTGGATCAGCATTTCAAGACCATGGTTAAAAGTTGAAGCTTTGGCTGAGTTTAGAGTTGGAAATGGGTGTAGAACAATGTTCTGGCTTGACCCTTGGATTGAAAAATTGCCTCTTAGCTCGAGGTTCCCAAGGCTCTTCACATTGGTTGACCTCAAATGTACAGTGGCTGATTTTTGGGACCCGAGCACCTCCTCATGGGATATTGCTTTCCGAAGACTGCTAGAAGAAGAAGAAATTGTAGACTTTATGAATCTCATGGTAGCAAT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BLAST of Clc05G13420 vs. NCBI nr
Match: XP_038906837.1 (protein AAR2 homolog isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 667.2 bits (1720), Expect = 1.0e-187 Identity = 349/441 (79.14%), Postives = 355/441 (80.50%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G13420 vs. NCBI nr
Match: XP_011660184.2 (protein AAR2 homolog isoform X2 [Cucumis sativus] >KGN66901.2 hypothetical protein Csa_007489 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 666.0 bits (1717), Expect = 2.3e-187 Identity = 348/441 (78.91%), Postives = 358/441 (81.18%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G13420 vs. NCBI nr
Match: XP_031745004.1 (protein AAR2 homolog isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_031745010.1 protein AAR2 homolog isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_031745014.1 protein AAR2 homolog isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 656.0 bits (1691), Expect = 2.3e-184 Identity = 348/456 (76.32%), Postives = 358/456 (78.51%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G13420 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q08DJ7 (Protein AAR2 homolog OS=Bos taurus OX=9913 GN=AAR2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 127.5 bits (319), Expect = 3.8e-28 Identity = 95/284 (33.45%), Postives = 136/284 (47.89%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G13420 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9D2V5 (Protein AAR2 homolog OS=Mus musculus OX=10090 GN=Aar2 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 126.3 bits (316), Expect = 8.4e-28 Identity = 91/279 (32.62%), Postives = 136/279 (48.75%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G13420 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9Y312 (Protein AAR2 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AAR2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 125.2 bits (313), Expect = 1.9e-27 Identity = 91/277 (32.85%), Postives = 132/277 (47.65%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G13420 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q4R7D0 (Protein AAR2 homolog OS=Macaca fascicularis OX=9541 GN=AAR2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 124.4 bits (311), Expect = 3.2e-27 Identity = 90/277 (32.49%), Postives = 132/277 (47.65%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G13420 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5R5N9 (Protein AAR2 homolog OS=Pongo abelii OX=9601 GN=AAR2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 120.9 bits (302), Expect = 3.5e-26 Identity = 89/277 (32.13%), Postives = 131/277 (47.29%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G13420 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0M0D1 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G633380 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 679.1 bits (1751), Expect = 1.2e-191 Identity = 357/461 (77.44%), Postives = 377/461 (81.78%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G13420 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C5D7 (protein AAR2 homolog isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496849 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 678.7 bits (1750), Expect = 1.6e-191 Identity = 352/441 (79.82%), Postives = 366/441 (82.99%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G13420 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C5Z9 (protein AAR2 homolog isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496849 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 651.0 bits (1678), Expect = 3.6e-183 Identity = 341/441 (77.32%), Postives = 355/441 (80.50%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G13420 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J1Z2 (protein AAR2 homolog OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111481964 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 648.7 bits (1672), Expect = 1.8e-182 Identity = 339/434 (78.11%), Postives = 352/434 (81.11%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G13420 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FAE8 (protein AAR2 homolog OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111442270 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 645.2 bits (1663), Expect = 2.0e-181 Identity = 335/434 (77.19%), Postives = 351/434 (80.88%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G13420 vs. TAIR 10
Match: AT1G66510.1 (AAR2 protein family ) HSP 1 Score: 466.5 bits (1199), Expect = 2.4e-131 Identity = 247/440 (56.14%), Postives = 301/440 (68.41%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G13420 vs. TAIR 10
Match: AT1G66510.2 (AAR2 protein family ) HSP 1 Score: 466.5 bits (1199), Expect = 2.4e-131 Identity = 247/440 (56.14%), Postives = 301/440 (68.41%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G13420 vs. TAIR 10
Match: AT1G66510.3 (AAR2 protein family ) HSP 1 Score: 396.7 bits (1018), Expect = 2.4e-110 Identity = 212/396 (53.54%), Postives = 261/396 (65.91%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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