Clc05G12800 (gene) Watermelon (cordophanus) v2

Overview
NameClc05G12800
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus cv. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationClcChr05: 10781757 .. 10789835 (+)
RNA-Seq ExpressionClc05G12800
SyntenyClc05G12800
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGTGTGCTTGCGCTACTGAGGATAAGGTCTGTCTCTTTCAAGTCATGAGTTTGATTTCCTCTCCTTGATTTTTTTTTTTTTTCAAACATACGCATATCTAACAAACAAAATTGATGGATTAAACCAATATATTGGCTGTTTTGAATATTTGTTTTCAGTATTAAATCATTTTAATAGTCTTTTTATACCAAGAGTGATGGGTTCGAACTCATCCCAACTTTAACTTTAATCTTAAATAATACAATGCTTTAATGAAAGGATACACCTTTTCTCAAGAGATACACCCAAGAGTATTATCTGAAATATTTTTTTTGACAAAAATAAAATTAATTTTTTGTATTTTGTCAATATATTATTTTTATTTCTGATAGGCGAGTACATTTAAAATATTAAATATTGATATTATTTTATCACTATAAAAAGTTAAAAACAAATATATAATTTTATAATTATGTATATAAAAGGAAAAATGTTGCAAAAAAAAAAACTTTGATTTTATTTTTGAAAAAAATATATAAAATTGAAAAGTGATCAAAATTATTTTGATTTTTAAAAACAAAAAGCAAAAACATAATTATCTAGCCTGCTTTTAGTTTTCAACTTCTAGAAAACAAAAAACAAAAAACAATTAACAAACACGGTTTTTCGTAATTTACTTTTTACAAAAAAAAAAAAAAATAGAAAATAATTACCAAACAAGTTTTTCATTTTTTGGCAGAAAACCAAAAACAGTTATTAAACAAATATGTTTATTGTTTTTTAAAAACTGAAAAAAATAAATAGATTTTAAAAAACAAAAAACAAAAAAACAAAATAGTTATCAAATGGGGCCTTAATTTTTTGTTTAGCCCTTACAATGAGTAGCAATTTTAGGATTAATAATGAAATGTATAGCAAGATTTTTAAAGAACTGCAAATATAGTAGAACCTAATGGTGATGGACTCCTATTAGCGATATGATCTATCCTTTAAATAGGGTTGTATTAGGCTCCTCTTAGCGATATAATCTAATTCTTGATAGACTCTTAAAGTTGAATATAATTTCTGCTACATTTGCAAATTCTTTTACATTATGCTATATTTGCTAATATTTTGGGTTTGATGTTATATTAGCAACTGTTGGTCTGATTGTTATATTAGCAATTGTCCCTTATTTTAAGTGGTTTTGTGTTTTTGTTCGGATCCATATTGACTCTTCTCGTTTGGAACTATCTCTTTATTTGTGAGAGCTTTTCGTCTGTGTGTTTGGTTGTTTTCTTTGTCGTTGGTTTTTTTTCCTCTCTCTTCTTGTTGTGTTTTGATTATATCATGATTTCATGCTATTATAATTTGGAAATTTTGAATTATCCTTTAAATAGGGTTGTATCAATCAAAATTTCTAACTAATCATTATATTGATTTATACTCTAAATTTTTATAGATGAATCAATTATTAGATCCTTCATTAATTATTTGTGGCTATTTTCAATTGATTCTATTTAGGATGGACTCAAACCTAAATAAAATTCTTCTTCGGCCAAAATCCTACTAAAAATATAACACCCAATAAATATATATATATATATTTGCACTTTTTTTTACTAAATGGAGAAAACTATTATTAGAGAGGAGATGATGTAAAACCACTCAAATAAATATTCATTTCATTTCAACATTTTTTTTATAATATACACAATAATACTTACATTTATAGTCTTATACAAATAGGAATGGCAAAAAAACCCCTACCCGAATCCTCAGTTTGACCGGGGACGGGGGTCAAACCGGGGTCATTACCCGGGTACCCGTCCGGGGACGAGGCAGGGATGGGGAGGGTATCCCCACCCCATCCCCGACCCGACCTCGACCTCGACCTCGATTAATCCTCGACCCCGCGAGTTAAGAGTCTTTCGATCAATAGCAAATTTGATCTCGCCATCTCACTCTTTCACTCTCGCTCTTGCTCTAATAAAATTTGATATACATTATAAATACCCCAAGCCCAAAGTTCCAAACCCTAATTTTGTCGTTCTCATTTTATGTTTTTAACATAAAAGTCGAGTCACCGTCTTTAGTGCCTCTCGCTCAGTGTCGTCGATCAGTTACAATGCCGTCTTTAGTGCCTCTCTCTCTCTTGCTCCCTCTCCTAGTGCCTCTCTCTCTCGCTCCCTCTTCGGCTCGCTCAGTGTCGTTCATCTTGCCGATCGTCGCTTAGTGTCGGTCTCGCTCTTGCTCCCTCTCCGGCTCACTCAGTGTTGTTGTCGCTTGTGTAGTCGTGTGTCCCATCTCGCTCTCTCGCACTCCCGTCCCTCAGTGTCGTGGGCCGTGGCGTCTCGTTCTCCCTCCCTACGGCTGCAATTGCTATGCAATGTTCACTGCCGAGGTTTGTGCTAACTGTTCTAACTCCAAATTCCAAAATAGTTTTTATGCAATACTGCAATTGTGTGCTTGTGCTACTGCCTACTAGTGTGTTGTTGTCTGTGTACTTGTGCTTGTAATTTTTTTGCTATGCTAGGTTCATGTTGACTGTTATGCTCGTATAATTTGTTAGGTTTAAAAAAACAATGTCTACAGATAAAGATTCTAATAGTCCAAATATAACTCCAATTCCAAGTCCAACCATAAATTCAACTCCAACCCCAAATTCAACTCCATGCTCTTCAAATAACGATAATTTGATTATTGATGATTGTGTTATTTTGGGTGAGGGCTCTGAGAAGAGATCTTTTAAGAGGTTTATATAATTTCGATTAGGAAGCTGCAAAAAGAGCATTAGCTAGGATGATAATCAAACATGAATATCCTCTCTAGTTAAGCATGAAGGTTTTAGGGAATTTTGTAAGCCCACATCATAACAAACTTCATCCGAAGACAATAAAGGCTTTGATGTGCGCTCAAAATTGGATTATGACTGAAGTTTTGACCGGTATGTTAGCTTGTTTATGTTGTTTAACCTATATTTCTTATTTTATTAATTAATATAATAACATTCTTATGTATTAATTATTATAAATATGTGACAAAATAAGGTACTATGACGGGAAAAGAAATGGTTAAACATTTAGCAATTGTTTTAGAAGATGTAGATGACTCTGATGGCTTGGTGGGTGGTGACTGAGACATGGATGCATTGGTAAAGAGAGAAGAATGAATTAGAATTGGCAAAGAGAGAAGGACGAACAAACTTATGATTATTGTTGTTGTATAAGAAATTCGAATTCATTTTACTTCAAGTTTTATTTAATCTGTGTTGTAGACTTATTTTCATTGATTTCTCGTGTTTGATCTTCTAAAACTAATGAATCTCCCTCTCTCAGTCTCGCTCTCTCTCTCCCAGTCTCGCTCTTTCGCTCTCTCTTTCTCAAACTCTCTCTCTCTCTGTCTCAGACTCTCTCTCAGTCTCGCTCTCTCTCTCTTAGACTTTCTCTCAGACTCGCTCTCTCTCTCTCTCAGACTCTCTCTCTCAATCTCGCTCTCTCTTAACTCGCGAGGACCCGTCTCCCAGACAGGTAATCCCTGCCCCCGTCTCCGCTTAAAATAGGCGGGGATGGGGACCCCCGCCCCGCCCCAGCCCCGTTGCCAAACCTATATACAAGTGATGTGATGTATGTATGTATGGGCATATAAAATATAACCATTTGAAACAATCCCCAATTTCGTTTAATGGTAAAAAAGATCATTTATTAAAAAAGTACAAGGGGAAAAATTGAAAAACGACAAAATATATTAACTTGAGACAATCAACCATTTGTTTAATAATAAATTCTTTCGCTGCTTTAATAATAGCAGAAGGTCTAAGGTTTGTTGAGCATTTGAGTTTCAAAAACATCTATGTTCTTTTAAATTTCTCTTTCTATATAATGAAGAAAAACTATAATATAATTGGACTTTCAAGTTAGTACTCAATCAATAAAAATGTATGATATGATTCTTCATTTTAGAAGATTAAATTTTTTATTGTTATTTTTATTTGATTAAATGGGAAGCATCAAATTAGGTATATCCTAGGTTGCACCTACTTATTGTCCTTATTTCTAATGCTTAATAAGAAAATTAAGATATTCATTGAACTGGTCAACTTCATCAATGAATGATGTTGACACTTTTTTACAACTTTTTTTTCGAAGTTCATTTTCTTCCTATCAACATTTGTTCGAACTCATGAATTGCGAAATTAAATTTTTAAATAAAAAAAAAATTAATAATAATAATTTGTTTACAAAATTACCAGCGTATGCAATATGGAAACAACACATTGATTGAAAAAAAAAGATTTCACTATTACTCAATCGACTTGGACAAACCTACCATATTAAAAGGGAAAAAAAATATATTTTCACCTAAAAAATATTAAACCCATAAACTAAAGCAACAAGTTATTATTTTTCTTCCAGAGGTTATACATACGATTCAAACGTTGATCGAGTAAGGGTTACAACAAAATATCTGGCGTCTCAAAATTTTTCCACCCATCTCCTTCTTCACGTAAGATTTCGAAAAGAAAATTTAATTCGTTAAAATTAACTTGATTTTATTGTTTCGTAGTTAAGTGTTACCATTCTAATTTTTATCTTTTGATATTTTCTTCGAATGCATAAACTTTAATTCTCAAATTTTATGATTTTTTTGAATGATCGGCCTTTAGGGTTGTTAATCTTCTTGGATCATCGGCCTTTGGGCTAGATAATCTTCTTGGAAAATTGGTCTTTGGACTTGATGATCTTCTTGGAGGATCTTTGAACTTGTTGATCTAATTGGATTTGGATCGCCCTTTGACTTGTTGATTGACTTGTATAAGCTTTTGGTTTATAAATCGATTTGGATCGGCTTGTTGATATGTTTGGATTAGCCTTTGGTTGTTTGGATCGACATTTGACTTCTTGATCGATTTAGATCGCCCCTTGACTCTTATTGATAAGTTTGGATCGACCTTTGACTTGTTGATCTATTGACTTTGATCTAAGGGCTATCGAGTTTGTCTTGAGCTTGTTCTCAAATTAAGGTAGATTAGTCTTCAATT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mRNA sequence

ATGTGTGCTTGCGCTACTGAGGATAAGGAATGGCAAAAAAACCCCTACCCGAATCCTCAGTTTGACCGGGGACGGGGGTCAAACCGGGGTCATTACCCGGGTACCCGTCCGGGGACGAGGCAGGGATGGGGAGGTCGAGTCACCGTCTTTAGTGCCTCTCGCTCAGTGTCGTCGATCAGTTACAATGCCGTCTTTAGTGCCTCTCTCTCTCTTGCTCCCTCTCCTAGTGCCTCTCTCTCTCGCTCCCTCTTCGGCTCGCTCAGTGTCGTTCATCTTGCCGATCGTCGCTTAGTGTCGGTCTCGCTCTTGCTCCCTCTCCGGCTCACTCAGTGTTGTTGTCGCTTGTGTAGTCGTGTGTCCCATCTCGCTCTCTCGCACTCCCGTCCCTCAGTGTCGTGGGCCGTGGCGTCTCGTTCTCCCTCCCTACGGCTGCAATTGCTATGCAATGTTCACTGCCGAGTATCCTCCTCCTCCCCTCTCGATTCCGACTACGGATTGGCCTGTAAATCTGTTATTAGCGCAGCTGTTGATGTCAGGATAGACAAGTAG

Coding sequence (CDS)

ATGTGTGCTTGCGCTACTGAGGATAAGGAATGGCAAAAAAACCCCTACCCGAATCCTCAGTTTGACCGGGGACGGGGGTCAAACCGGGGTCATTACCCGGGTACCCGTCCGGGGACGAGGCAGGGATGGGGAGGTCGAGTCACCGTCTTTAGTGCCTCTCGCTCAGTGTCGTCGATCAGTTACAATGCCGTCTTTAGTGCCTCTCTCTCTCTTGCTCCCTCTCCTAGTGCCTCTCTCTCTCGCTCCCTCTTCGGCTCGCTCAGTGTCGTTCATCTTGCCGATCGTCGCTTAGTGTCGGTCTCGCTCTTGCTCCCTCTCCGGCTCACTCAGTGTTGTTGTCGCTTGTGTAGTCGTGTGTCCCATCTCGCTCTCTCGCACTCCCGTCCCTCAGTGTCGTGGGCCGTGGCGTCTCGTTCTCCCTCCCTACGGCTGCAATTGCTATGCAATGTTCACTGCCGAGTATCCTCCTCCTCCCCTCTCGATTCCGACTACGGATTGGCCTGTAAATCTGTTATTAGCGCAGCTGTTGATGTCAGGATAGACAAGTAG

Protein sequence

MCACATEDKEWQKNPYPNPQFDRGRGSNRGHYPGTRPGTRQGWGGRVTVFSASRSVSSISYNAVFSASLSLAPSPSASLSRSLFGSLSVVHLADRRLVSVSLLLPLRLTQCCCRLCSRVSHLALSHSRPSVSWAVASRSPSLRLQLLCNVHCRVSSSSPLDSDYGLACKSVISAAVDVRIDK
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 13..40

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Clc05G12800.1Clc05G12800.1mRNA