Clc05G08020 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCAGTGACACATGAAGATCTTCTACCAAGTCGAAAGAGCTCTGAATTAGGCAGCAAAATGGGGACTTTCCTTATGATTTTGACCATCCTTTGTGGCCTATGTTGCTTCATTCTTTGCCTCATTGCTGAGTCTACTCGTTCCCAGGTACGAAACTCGTCGACCCTTTTCACGAAACCATGGTAGTTGAATTAAGTTGAGCTATGTTCATTTTGTTTTCTACTTATAACTTAATTTTGAATGCTTTGCGTAATTTAGAAGACCTTGTGTCCATGTATGTCAGGACGTGTGTAAATGTATATGTCATTGTTCTTGTTTCTCTCTCCCTTTTTTTTGTTGATATATATGACAGATATTTATAATTAATTAATTTATTGCAAAATGAGTTTAACTCAATGGTAATTAACTTAATTTATGTTCATTAATTATCTATTTCGAGTCTAAACGCATGTAATTTTGCTTCAACATTGTGATCTTGTGTTTTTTTTGACTATTTGATGTTGATGTGATGTTTTTGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAAGTAGTAGTTTTAAAGATATATCAAACAATTAGGCAAAAAATATAGTTTTTTTTTTTTTTAACATGTGGAGTAGGGGATCATACCTTAAACCTCAAGAGGTTAATAGTACAAATTCATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTAAAAAAAAAAAATACAATTTGGGTTGGTAGGTACACGCCCAAATATCTTCACTAGGTGAACATATTCTTAGTCCCATCGTCAATTATGTTATGCTCATGTTGGCCGAATGTATAATTTTAATCTAGTAATATTAACCAGGTAGGGTTGCTCCCTCCTAAAAAGCTAATTAAGTAAAGCTTTGTTTTCTTTTATTAATATATAAATCGAGTCTAGATAAGTTTTGTGATTGATTATGGTGCAGAAATATTATGATCGTAGAGGTATATATTGATTTTTTTCGTTTTAATCATGGTAGAACATTGTCTGCATTCCTAACGATTTACATTATGTTTCATTGGATTTTGATTTTTTTGTTGGTACGTAGGTGATATGGAGGGGTATGGATGAAAATAATAAGAAGGGAGAAAAGAGATGCTCGTACAGCGGCAGCGGGAAGACACCGCTGCTGTGCACGGCGAGCTCGTTTCTCGGGATGGCAGTGATAATGGTGGTGCAACATTTGTATGTGTTGATTGCAGTGAGTAAGTCACCGCCTCCTGCTCTCATTTCTTGGGATCCTTCTTTAGCAACTTCCAAATCTCTAACCTTTCAAGCTGCTTTCTTCTTCGTTTCAACATGGTAAATAATCAACAACTAACCACCTTCATTTTCCATTTATTTCCTTAATTATTTCCTCAAACTCTCCCATTTTCAACTTCACTCTTTTGCTTTTGTTTTACATCATACTTGTAAAAGATTAAATAAACCCTACTTTAACTTTACCATAACTCAATCATCATCTACTTTGTAAGTTGATTGGATTACATAACATGAGATTTCATTTTAAAATTAATTAACAACCGAAGAAGTAATAATGTATCTTATAATAAAGATTGTGAGGTATTCTTTTCTTTCTATTGTGCGCTCCTCCTTAAGATGAATAATGTTTGGGTAAACCTCAAACTCCACTCATCTCCATGCATCCTCTTCAATCTTAGAGAAGAAGAAAGAATATTACAAAATATATTTTTTTAACATAAAAACTTGAGTGCAGTGCAATCTAAACAACACCTAATGAAAGGTTGATATATGTCAATTTTCTTTATGCAAAGGCAAAGGAAGTATGAATTAGGTGAAACTTAGGTTGCCATCTAACTATTAAATTAAACATTTAGGTGAGCTGCTCAAAGATTGATGCAGCTTGGTGTACCTAACTATTTTTCTCTCGAAAATAGTGCGTTTTTAAATTCACTATTCTTGGTAGAATCTTTTTTATTTTTATTTTTTTATACTAACTTTTCGTTTGGGCTTTATGGCTTTGTCATCTCATAAACCAATTGGCGATTATTGAAATAACTCAAGTATCTTATAAAGAATGTGAGCTTTCATGTGATTTGACATGTGGTATCAAAACAAAAAACAGGAAGTGTAGCGTTCAAAGACTTGTAATGTCGTTTCCTTTGCAATGTTGAAAAGAATATTATTATATTATTACCATAACCCATTAAAAAGAAATTTGAGTTGAATATTTTGAAAATGGGTGATTTACAATGACAGGATAAGTTTTGCAGTGGGAGAAATTTTGTTGTTAATAGGATTGAGTGTGGAGTCGGGGCATTTGAACAACTGGTCAACTCCAAGAGAAAGCTGCTTGGTGATCAAAGAAGGTTTGTTTTCAGCTGCCGGAGTTTTTCAATTGGCCACGGTCTTCCTCGCCGCCGGCCTCTACATGACGGCGGTGCGAGCACAGAGAATGTTTGAAGAGCAAGAAAATGTGAGAAGAGAGGTGCTGGAAAGTTACCATATCCACAGTTCCCCGCCACGGTCGTCGCCGCCGCTGCAGCCAATGCCGCCGATTGCAAGAGAAGACCCTGTAATCAGACATAGCCACCACCATCAAGAGACTCCCCTTTTTTCCCTGCTTCAATCTACTGCCCCTTTTTGCAAGCTCTCTGCTTGAACATTTTTTTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAGAAATTTGTATATAATAGATTTTGATGGTTGTGCTTTTCAATTCTTCTTTTTGTATGTAATTTCAAAATGTCTATTTTTCTAGTTTCTTGTGCTATTAAAAAACCAATGAAATTTAACTTGTTTGTAAAATCTTCACACAATGATTAGAAAAAGCCCAAAGGTTGTGGAGGATTTGATTGTTTTTGTGTAATTAATATTTTTAATCTCACTAATACAATAATATTTTTTTTAATTTGCGAGAGAGTTTTTCTTGCTCAAAATGTTTGGATGAAGAAATTGTTGACCAAAATGCTGACATATGAATTTTTATTGGCATAATTGTCTATCGACAAGTATGTCGTGTCAAGAAAAAGTATAACATGACATCCCCACCATATGATGGTAGAGTAAATATCGATGCAATGATATACTTTGTCAGATACATTTGTAGTTTGAGTTACTTTAAAACACTCTTGGTTCACTTTAGGCATGCACTTTCTAAGGTTAATGATGGTATGAAATAACCTAAATTATTACCCACAAAAAAGCACCAAATAAGAAAATAGAAATTTTATCCCTTTTAAGCCCTTTATTGAACTTCAAGAACCACTATCAGTAGATACACTACAGTATTCCTGCAATTTTAGATTTTAAAAAATGTAATATAATTCATTTGGACAACATATATGTTTGTGTGTATATATATTTTGTAATAATGTGTATCATAAATTTAATAAAACCATTAAATTATAAATGGCAGGATATAAAGATTTTTTAATTAAAAATTACATGATTCAATTTGGTACAAAAGAAATATCTATAGTTTCGATTCTCGATTACCAATTGAAAAAATCAGAAAAAATTAAACTAAATCAAATTTTTATTATTATATTTATACAACATTTAAATTAGGGGTAGTTTGTATATATCAATCTAGTCTAAAATATTAACAGATATAGTACGATTAAAAATTAATAAATATAATAAAATTTGGATTTACCTCTCAAAATCTAGCGTGATAAATAAATTTGGATATATTAAAAAAAAAATTGATATATTGTAAAAGCATTAGAGTACCAACCAGCAACCCATAAGGGAGGCCCAAATGGTAGGCCACGTTGAATCCCCATTAATGCTTTACTTAAAAAAAGGGAAACCCTAATAATGACATCTCATGCTCTCAAGGCCCCCAACTTTGTTTTCTTTTGCTATATTCTCCCATGTGTCTCTTCTCCCATGCTTTTTTTTTTTTTTTTTCTCAAACAAGAGGCCTCTAACCTCCCTCCCCCTCTCTATTTATTCATCATCTTCTTTGAAGATTCAAACATCCAACCCAACACCCACCCACGTCGCTACCGCACCACTTCGCCCACACCCATCCATCAGGTCTGTTGTTTGCTATGTTTGTCACACGTTCACATAGACGTTTTTCAACTTATTTACAACTTTCTAACCCTCTACACCCCATCATATTTTTTTTCTTTTTGACTAATTCTCTCTCAAATTTTCCGCTCCTAACAAACCGATATGAAACGATTTACGACGGTTTGGTTTTAGAATTGAAATTGAGGTCTTTTTGGTATTTGTTGGTTCAACCAAACTAGAAATTGATATATTCTATTCGGTCTATGGTTCCACTCAAAATCGGACCGTGTAAATCCGTAACTAGATCAACTAGATATAACTTTTGTTTCGAACCCATTAACAAAAACATGATTTTTTTTAAATAAACACGATCCCTGTGTTTAGATGTAGCTTAACATATGAAATCTAACTTTTTTTTTTTTTGTTAATTAAATTGTAGATTTAGTTCATGTGGTTTTGAGACCGTTAGATTTAAGTCTATAAAACATCATAAATAGTCTATATAGTTTGATAAAATTCTCATAAATAATTCCTACTACAAAGAATATTTATTAAATTTTTATCAAATCATAAAGACTAAATATTAATTAAAAAATAAATGATAAAATTTTAATTTTCTCCAAACCGTAGAGACTAATACAATTTAATAAACCTTTTTTTTTTGTTAATTCTCAAAATTTGTCCCATATATCCATCTACAATTTTTCTTTTTTTCTAGCAAAACAAAAACCTATTATTCTTTTCAAAGTGTATTTCAAAGTGGTATGCCTATATATACATGTCAAAATATATTAACAAATAATAATTTAATAAGATATAGTAAAAATGATAAGTTTTTTCGTTGGAAAGAAATTTTGATAAAAAAACTTCAAATTTATCTATTTGATAGTGTTCAATAAATTATAATTGAGGTTAAAATTGAAATCTAAATATATATATTTGATAAATTTGATAATAAAAAAACTTCAAATTTA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ATGGCAGTGACACATGAAGATCTTCTACCAAGTCGAAAGAGCTCTGAATTAGGCAGCAAAATGGGGACTTTCCTTATGATTTTGACCATCCTTTGTGGCCTATGTTGCTTCATTCTTTGCCTCATTGCTGAGTCTACTCGTTCCCAGGTGATATGGAGGGGTATGGATGAAAATAATAAGAAGGGAGAAAAGAGATGCTCGTACAGCGGCAGCGGGAAGACACCGCTGCTGTGCACGGCGAGCTCGTTTCTCGGGATGGCAGTGATAATGGTGGTGCAACATTTGTATGTGTTGATTGCAGTGAGTAAGTCACCGCCTCCTGCTCTCATTTCTTGGGATCCTTCTTTAGCAACTTCCAAATCTCTAACCTTTCAAGCTGCTTTCTTCTTCGTTTCAACATGGATAAGTTTTGCAGTGGGAGAAATTTTGTTGTTAATAGGATTGAGTGTGGAGTCGGGGCATTTGAACAACTGGTCAACTCCAAGAGAAAGCTGCTTGGTGATCAAAGAAGGTTTGTTTTCAGCTGCCGGAGTTTTTCAATTGGCCACGGTCTTCCTCGCCGCCGGCCTCTACATGACGGCGGTGCGAGCACAGAGAATGTTTGAAGAGCAAGAAAATGTGAGAAGAGAGGTGCTGGAAAGTTACCATATCCACAGTTCCCCGCCACGGTCGTCGCCGCCGCTGCAGCCAATGCCGCCGATTGCAAGAGAAGACCCTATTCAAACATCCAACCCAACACCCACCCACGTCGCTACCGCACCACTTCGCCCACACCCATCCATCAGGAATTTGATTATTCAAACAATGGAAGGGCAATTTGTTATGGTATTTTTGGTTGCATTTATTCCAATAATTTATGGCCAACATAATGTTACAATGGGTAAAATTGTGGTGGATGGAGCTACAACAATAGCAAAAACAGATGAGAATTATATTTGTATGACTATTGACTATTGGCCTTTTAATGAGTGCTCTAAAATTCCTTGTCTTTGGGATGGCAATGCATCAGTGCTCAATTTGAATTTGTCTCTTCCTACACTTACTAAGGCTGTGCAAGCTTTCAAGACTCTTAGGATTAGAGTAGGAGGTTCTTTGCAAGACAAATTAATTTATGATATTGGGAGCTTCAAGGGCAACAATAATTGTCCTCAATTTGCAAGGGACAGCAATGAAATGTTTCAAATTACTGAGGGATGTTTGTCTATGGAAAGGTGGGATGATTTAAACCAATTTTTTAATAAGACAGGGGCAATAGTGACGTTTGGCTTGAATGCATTATTGGGAAGGCATCCTACAATAGGAATGCTATGGGAAGGAGATTGGAACTACACCAATGCAGAGGACCTTATACAATACACAATTGAGAAGAACTATCATATCGATTCATGGGAGTTTGGTAATGAAATGGTTGGTCATAATAGTATTGGGGCAAATATTACTGCTGCACAATATGCAAAAGATTTGATCAAGCTTAGAGAAATCATTGATCGTTTGTACAACAAATCCCAACAAAAGCCTTTGATTGTAGCACCTAGTGCATTTTTTGATGTCCCATGGTTTGAAGATTTTGTTAACAAAACAGGTCCGGGCGTTGTCGACGTTTTCACCCATCACATATATAATATGGGTGCAGGGGATGACCCTAAGATAATCCATAGATTTGTTGATCCTAATTATCTTAGCCAAGAATCAAGTGTATTTCAACAACTTGAGAACATAGTTCAAATCCATGCCCCTTGGTCTGTCCCTTGGGTTGGAGAAGCTGGTGGATCCTATCGTGGTGGCAGTCCTAATATTTCTAATACATTTATTGATGGCTTCTGGTACTTGGATCAGCTTGCAATGGCTGCTTTGTACAATACCAAAGTATATTGTAGACAAACTTTGGTTGGTGGACATTATGGTGTTCTCTTACCCCATACTTTAGCCCCTTCACCAGATTATTATGGGGCACTTCTCTTTCACCAACTTATGGGTCCTGGTATTCTCAAAGTCGACAATAACGTCTCTTCTTATCTACGTACTTACGCTCATTGCACCAAAAGAAGAAGTGGTGTTACCATGCTTTTCATTAATCTAAGCAACCAAACAGAGTTCAGAATTGAGATTGAAAAGAAGATGAACGAGAGTTTGGCTAACAATCCAGCTCAAAGGGAGGAATATCATTTGACTCCAAGTAATGGGGGTATTTTCGTCATTTCGAAGAAAAAACAGCAGAGTAAAGAGATCCCTTTCTCTTCTTTCATCTCGCTTCCCCTGTCTTCCTCTGTTTCCGATCCAGATCTCTTTGGTATCAACTGGATGATGATGGATCCGAGTGACAGAGCTCAGTCTCCTGAAAAGGCCATGGGAGGGTTTCCTTCTTTGGCTTTCAGGGCAACGCCTGTTCTAAGAAATCGACCTCTACAAGCTTACACTCCCACCAACAATTATCGGAGACAAATCCCTTCCGATTCAATCCAACGAACTTCAAAACAACGTCCTTTCAACAACACTGAATCGCCTTCAAGAGGTAATCCTTTCCCACTTACTACTCCGGTAAAGGCTCCCAATTTGATTCACCTCCCCTCCCGTTTGTCTCTTGCTAGTCATAAACGTAGTGTGAGTCTTAAACCAATTGATCATTCATATATTTCTAGGATTCTATTGAGCAAGGATTGGTTTCTATTGTTAAACCACGAGTTTAAGGCGAAGAGGGTCGTTTTGGCTCCTGAATTTGTTGTTAGTATTTTGCAAAATCAAGACAACCCATTAAATGCTATTAGGTTTTATATTTGGGTTTCGAATGTCGACCCTTTACTCGCAAAGAAACAATCGATTCGAGGGATTCTTGGCCGCAACCTTTATCGAGAAGGTCCTGGCCGTCCGGTGCTATTATCTGTTGATCTGCTTCACCAATTTAAAGAGTGTGGCCTTGAAGTGACAGAGGAATTACTCTGTATATTACTTGGCAGTTGGGGTAGATTGGGTTTGGCAAAGTACTGTGTGGAAGTATTTGGGCAAATTGCGTTTTTGGGTCTTAATCCCACCACCAGACTGTACAATGCCGTAATTGATGCATTGATTAAGTCCAATTCGCTAGACTTGGCTTATTTGAAATTTCAGCAAATGTCATCCCATAACTGTGTCCCTGATAGGTTCACTTATAACATTCTCATCCATGGTGTTTGTAGGCTTGGGGTGGTGGATGAGGCACTTCGTTTGATGAAACAAATGGAGGGCTCGGGATATTTTCCAAATGTGTTCACATATACAATCTTGATTGATGGATTTCTCAATGCCAAAAGGGCTGATGAAGCCTTCACAGTTTTACAGACAATGAAGGAGAAGAATGTGGTTCCAAATGCAGCTACTATGAGATCCTTGGTTCATGGAGTTTTTCGTTGTATGGCCCCAGATAAGGCTTTTGAACTTTTGTTGGAATTTGTTGAGAAGAAGCAGCGTGTATCTCAATTGGTTGGCGACAATATCCTTTACTGCCTTTCAAATAATTCTATGGCCAGTGAGGCTGTCATGTTTTTGAGTAAAATTGGCAAGAAAGGTTATGTACCGGACAATTCAATCTTCAATGTCACCTTGGCATGTGTATTAAAGAAGCTAGACCTGAAGGAAACATGCAATGTATTTGATAATTGTGTGCAGAGAGGTGTCAAGCCAGGGTTTAGTACATATCTTACACTTATTGAAGCTCTGTACAAGGCAGGGAAAATGGAGATTGGAAACCAATATATGGATAGGATAATAAATGATGGTCTTATTTCCAGCGTATATTCATATAACATGGTCATTGATTGCCTTTGCAAAGGCAAATTAATGGACAGAGCATTGGAAATCTTTAGGGATCTGCATTATAAAGGTATTTCTCCAAATGTTGTAACTTATAATACACTTATCAGTGGCTATTGCAGAAATGGAAATATGGAAAAAGCTCAGGAACTTCTTGAAATGCTATTAGATTGTCATTTTAAACCAGATATCTTCACATTTAATTCATTAATTGATGGCCTCTGTCAAGCACATAAGCATGAGGATGCTTTTGGTTGTTTCACTGAAATGGTTGAGTGGGATGTCACTCCGAATGCTATCACATATAATATATTGATACGTTCCTTCTGTGCGATTGGAGATGTTTCTAGATCTACTCATCTCTTGAGAGAAATGAAACTTCATGGTATACAACCTGATACTTTCTCCTTCAATGCTCTTATCCAAAGCTACTTTCGAATGAACAGGGTTCAGAAAGTTGAGAAGCTTTTTGATTCAATGTTAAGGTTGGGTATACAGCCTGACAACTATACCTATGCTGCTATTATTAAGTCACTGTGCAAATTGGGTAGGCATGATGAAGCAAGGGAGATGTTCCTCTCAATGAAGTCTTGGAGTTCCTTCTACAGTGGGAAAAACAGAAAGTTCCATATAATGATCACGAATCAGCATAGCAGTGTTAAAGTTGGCTTGTATCTGCCTTTGCTTTTCTCTTTGCAGATAGGTGAGGAATTTGCTGTGTCTGGGTCTTGTGAAGATGCTGTCCTTGTGAATAGAGAATTTTCTGGACATCGGAACCCTGCTGGGTGCTGTTCATTGTCGCCTCCGCCAGCCATGTCGTTCGTTTCTTTGAAGAGTTTCACAGCCTCGCTGTTCGTTGAAGAGTTTTAG MAVTHEDLLPSRKSSELGSKMGTFLMILTILCGLCCFILCLIAESTRSQVIWRGMDENNKKGEKRCSYSGSGKTPLLCTASSFLGMAVIMVVQHLYVLIAVSKSPPPALISWDPSLATSKSLTFQAAFFFVSTWISFAVGEILLLIGLSVESGHLNNWSTPRESCLVIKEGLFSAAGVFQLATVFLAAGLYMTAVRAQRMFEEQENVRREVLESYHIHSSPPRSSPPLQPMPPIAREDPIQTSNPTPTHVATAPLRPHPSIRNLIIQTMEGQFVMVFLVAFIPIIYGQHNVTMGKIVVDGATTIAKTDENYICMTIDYWPFNECSKIPCLWDGNASVLNLNLSLPTLTKAVQAFKTLRIRVGGSLQDKLIYDIGSFKGNNNCPQFARDSNEMFQITEGCLSMERWDDLNQFFNKTGAIVTFGLNALLGRHPTIGMLWEGDWNYTNAEDLIQYTIEKNYHIDSWEFGNEMVGHNSIGANITAAQYAKDLIKLREIIDRLYNKSQQKPLIVAPSAFFDVPWFEDFVNKTGPGVVDVFTHHIYNMGAGDDPKIIHRFVDPNYLSQESSVFQQLENIVQIHAPWSVPWVGEAGGSYRGGSPNISNTFIDGFWYLDQLAMAALYNTKVYCRQTLVGGHYGVLLPHTLAPSPDYYGALLFHQLMGPGILKVDNNVSSYLRTYAHCTKRRSGVTMLFINLSNQTEFRIEIEKKMNESLANNPAQREEYHLTPSNGGIFVISKKKQQSKEIPFSSFISLPLSSSVSDPDLFGINWMMMDPSDRAQSPEKAMGGFPSLAFRATPVLRNRPLQAYTPTNNYRRQIPSDSIQRTSKQRPFNNTESPSRGNPFPLTTPVKAPNLIHLPSRLSLASHKRSVSLKPIDHSYISRILLSKDWFLLLNHEFKAKRVVLAPEFVVSILQNQDNPLNAIRFYIWVSNVDPLLAKKQSIRGILGRNLYREGPGRPVLLSVDLLHQFKECGLEVTEELLCILLGSWGRLGLAKYCVEVFGQIAFLGLNPTTRLYNAVIDALIKSNSLDLAYLKFQQMSSHNCVPDRFTYNILIHGVCRLGVVDEALRLMKQMEGSGYFPNVFTYTILIDGFLNAKRADEAFTVLQTMKEKNVVPNAATMRSLVHGVFRCMAPDKAFELLLEFVEKKQRVSQLVGDNILYCLSNNSMASEAVMFLSKIGKKGYVPDNSIFNVTLACVLKKLDLKETCNVFDNCVQRGVKPGFSTYLTLIEALYKAGKMEIGNQYMDRIINDGLISSVYSYNMVIDCLCKGKLMDRALEIFRDLHYKGISPNVVTYNTLISGYCRNGNMEKAQELLEMLLDCHFKPDIFTFNSLIDGLCQAHKHEDAFGCFTEMVEWDVTPNAITYNILIRSFCAIGDVSRSTHLLREMKLHGIQPDTFSFNALIQSYFRMNRVQKVEKLFDSMLRLGIQPDNYTYAAIIKSLCKLGRHDEAREMFLSMKSWSSFYSGKNRKFHIMITNQHSSVKVGLYLPLLFSLQIGEEFAVSGSCEDAVLVNREFSGHRNPAGCCSLSPPPAMSFVSLKSFTASLFVEEF Homology
BLAST of Clc05G08020 vs. NCBI nr
Match: XP_038897886.1 (putative pentatricopeptide repeat-containing protein At3g16890, mitochondrial [Benincasa hispida] >XP_038897894.1 putative pentatricopeptide repeat-containing protein At3g16890, mitochondrial [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1249.2 bits (3231), Expect = 0.0e+00 Identity = 607/677 (89.66%), Postives = 646/677 (95.42%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G08020 vs. NCBI nr
Match: XP_008438927.1 (PREDICTED: putative pentatricopeptide repeat-containing protein At3g16890, mitochondrial [Cucumis melo] >XP_008438928.1 PREDICTED: putative pentatricopeptide repeat-containing protein At3g16890, mitochondrial [Cucumis melo] >XP_016898969.1 PREDICTED: putative pentatricopeptide repeat-containing protein At3g16890, mitochondrial [Cucumis melo] >XP_016898970.1 PREDICTED: putative pentatricopeptide repeat-containing protein At3g16890, mitochondrial [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1177.5 bits (3045), Expect = 0.0e+00 Identity = 580/677 (85.67%), Postives = 617/677 (91.14%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G08020 vs. NCBI nr
Match: XP_011651073.1 (putative pentatricopeptide repeat-containing protein At3g16890, mitochondrial [Cucumis sativus] >XP_011651074.1 putative pentatricopeptide repeat-containing protein At3g16890, mitochondrial [Cucumis sativus] >XP_011651075.1 putative pentatricopeptide repeat-containing protein At3g16890, mitochondrial [Cucumis sativus] >XP_031738222.1 putative pentatricopeptide repeat-containing protein At3g16890, mitochondrial [Cucumis sativus] >XP_031738223.1 putative pentatricopeptide repeat-containing protein At3g16890, mitochondrial [Cucumis sativus] >XP_031738224.1 putative pentatricopeptide repeat-containing protein At3g16890, mitochondrial [Cucumis sativus] >XP_031738225.1 putative pentatricopeptide repeat-containing protein At3g16890, mitochondrial [Cucumis sativus] >XP_031738226.1 putative pentatricopeptide repeat-containing protein At3g16890, mitochondrial [Cucumis sativus] >KGN57153.1 hypothetical protein Csa_011752 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1177.5 bits (3045), Expect = 0.0e+00 Identity = 576/676 (85.21%), Postives = 617/676 (91.27%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G08020 vs. NCBI nr
Match: KAA0049533.1 (putative pentatricopeptide repeat-containing protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK16211.1 putative pentatricopeptide repeat-containing protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1177.2 bits (3044), Expect = 0.0e+00 Identity = 579/677 (85.52%), Postives = 618/677 (91.29%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G08020 vs. NCBI nr
Match: XP_023539285.1 (putative pentatricopeptide repeat-containing protein At3g16890, mitochondrial [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1163.3 bits (3008), Expect = 0.0e+00 Identity = 569/676 (84.17%), Postives = 612/676 (90.53%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G08020 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LSQ2 (Putative pentatricopeptide repeat-containing protein At3g16890, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PPR40 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 709.1 bits (1829), Expect = 1.1e-202 Identity = 331/601 (55.07%), Postives = 450/601 (74.88%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G08020 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8L608 (Heparanase-like protein 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g61250 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 503.8 bits (1296), Expect = 6.8e-141 Identity = 238/485 (49.07%), Postives = 322/485 (66.39%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G08020 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FF10 (Heparanase-like protein 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g07830 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 490.0 bits (1260), Expect = 1.0e-136 Identity = 228/483 (47.20%), Postives = 323/483 (66.87%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G08020 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FZP1 (Heparanase-like protein 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g34940 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 398.7 bits (1023), Expect = 3.1e-109 Identity = 196/456 (42.98%), Postives = 278/456 (60.96%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G08020 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LRC8 (Baicalin-beta-D-glucuronidase OS=Scutellaria baicalensis OX=65409 GN=SGUS PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 349.7 bits (896), Expect = 1.6e-94 Identity = 180/475 (37.89%), Postives = 285/475 (60.00%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G08020 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3AXI6 (putative pentatricopeptide repeat-containing protein At3g16890, mitochondrial OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103483881 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1177.5 bits (3045), Expect = 0.0e+00 Identity = 580/677 (85.67%), Postives = 617/677 (91.14%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G08020 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L5W1 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G165700 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1177.5 bits (3045), Expect = 0.0e+00 Identity = 576/676 (85.21%), Postives = 617/676 (91.27%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G08020 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7U127 (Putative pentatricopeptide repeat-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold209G001400 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1177.2 bits (3044), Expect = 0.0e+00 Identity = 579/677 (85.52%), Postives = 618/677 (91.29%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G08020 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F885 (putative pentatricopeptide repeat-containing protein At3g16890, mitochondrial OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111441755 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1157.5 bits (2993), Expect = 0.0e+00 Identity = 565/676 (83.58%), Postives = 612/676 (90.53%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G08020 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IIL6 (putative pentatricopeptide repeat-containing protein At3g16890, mitochondrial OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111474300 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1153.3 bits (2982), Expect = 0.0e+00 Identity = 563/676 (83.28%), Postives = 610/676 (90.24%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G08020 vs. TAIR 10
Match: AT3G16890.1 (pentatricopeptide (PPR) domain protein 40 ) HSP 1 Score: 709.1 bits (1829), Expect = 7.6e-204 Identity = 331/601 (55.07%), Postives = 450/601 (74.88%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G08020 vs. TAIR 10
Match: AT5G61250.2 (glucuronidase 1 ) HSP 1 Score: 503.8 bits (1296), Expect = 4.8e-142 Identity = 238/485 (49.07%), Postives = 322/485 (66.39%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G08020 vs. TAIR 10
Match: AT5G61250.1 (glucuronidase 1 ) HSP 1 Score: 503.8 bits (1296), Expect = 4.8e-142 Identity = 238/485 (49.07%), Postives = 322/485 (66.39%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G08020 vs. TAIR 10
Match: AT5G07830.1 (glucuronidase 2 ) HSP 1 Score: 490.0 bits (1260), Expect = 7.2e-138 Identity = 228/483 (47.20%), Postives = 323/483 (66.87%), Query Frame = 0
BLAST of Clc05G08020 vs. TAIR 10
Match: AT5G34940.2 (glucuronidase 3 ) HSP 1 Score: 398.7 bits (1023), Expect = 2.2e-110 Identity = 196/456 (42.98%), Postives = 278/456 (60.96%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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