Clc05G02780 (gene) Watermelon (cordophanus) v2

Overview
NameClc05G02780
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus cv. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationClcChr05: 1876652 .. 1880047 (-)
RNA-Seq ExpressionClc05G02780
SyntenyClc05G02780
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGTCAAAAGAAGGCCTTGTAAATAGCCTTATTTGACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATGTTTAGCTGAACTAAATTCATTGTACTAACTTGAGCATCAAAGAAGTGAAGTAAGCTCGACACCACATTTATAATATCTTACGCATGTTAGCTCGTAATATCTCAAGACCACGCTATAGAGAAGCGGGCTAGAGGCCAGTCCATGAGAGGTCCACAGTAAAACCCAACACAAACGAAATTTGAGAGCCAACATACTTCATTCAATGGTCACGGTATCACTTTCTTATATTATTAGATGATATATTTTTTTTAGTAACGAGATTTGAACTCCATAGTTCGTGATTGGTAGCATGTTCATATGCCAATTGAACTGTAATGATTTTGGTTCATTAGATGATATATTCGAATCACAGTCTTGCATTTTAAATTCAAACAGTATAAATTATAATGAGTGAAATACATATATTAAGGAAATCGTTGATATTTTATGATTTGTGAAATAGAGTTTGGACACAAAGAAAGCAGGAAACAAATAGGTAATTAAACAAAAACAAGAGATTTGTGACCCATTCCATTTTAGTTCACTTTAAATTAAAGTAAAGACAAATAATAGGAAAAGCCATAAATAGCCGGACAATAGTTTATTGAGTCGGTTAATGTTAGCTTAGTTTAGATTCTAAAAGTTGAACTATTTTAAGCATATCAAATGCTCTAAATTACAATTTTGAGAATATTATTTTAAATAACAAAACGATTAAAAATATTTATAAGTAACAGTAAAATATCACAGTCTATCTGCAATAAATTACGACATACATATGTGTAGACAATAAGATATTGTTATATTTGTGAATATTTTGGTTCATTTTTTATATTTAAAAATAATTCTATAATATATTTATTTTTAAATTAGTTAAAAACAATTATCCTATCGATTTTTGTTCTCGTTATTTCATCTCATACAACTACTAAAAATTAGATGCAAAATTTAACTAAGAGATAAACACAATAGTAAAATGATACAAAGTGAGTAGAAACTTAAAAAAAGGAAAAATGTATAAATTAACCACCCATATGATAATTTTTTTTAATACCATATAATTACAACTAAATTTCTAAAAATATATATATATATATAGTTTAATTGACATCTGACCATGAAATTGTAGTTTGAATTTTCCAACTCTTGTTATACTCAAAAAGCTAAACATTAATGCATCTAAATTTGGTACGAATGTGTAGATTTGAATCCATTATATTATATAATTGGTAATATTAAAAAGAAAAAAACAAAGACCACATTTCATTTATCTAAATTGAGGCTTTAAATCCCCTACCTGTGAATTAGAGAAACATTCACACATTTTTTGAATTCAAATAAAAGAAACAACCATCTTATGGTTTATTACATAAGAGTGATTAAACTACAAATTAGTCCCTTGAATTTGAATATTTATAAAATTTTACAGGTATAGGAAATGTTAACTATTCTATAAATTAATTTAAAAAAAAATTAATGGATATAAAATTAAAATGAAAATTGCAAGTGCACACTCTTATTCTTGTTAAAATTAAAAGTTAGACAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAGATGAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAGTTATTTTCAATTATATAAAAATAAACTAAAATACTAACAAATATGATAAAATTTTACTGTCTATCTACGATACACTACTACCTGTATCTATATAGTAGTCTATCGTAAATAAATTATGATATTTTACTATTATTTATAGATATTTTAAACAATTTTATCATTTTAAAAGAAAAAAAAATGGAGAGAGTAAATTATAAAATAGTTAATATTTAACCTTAAATTAACAGAAAAAAACCTAAAAAGGTAGAAGCAGAAAAACAGCGGAAGCCGAGATTTAGAAAAGGCAGAGTTTATGTTTATTTATTTATTTATTTATTTTTTGTTGTTTTTGAAAAAAAAAAAATTTTTAAAAGCGCACACCTCCTCCCTGGCCTACGTTGTTAAAGTAAAAATTGTTTCAATTTTGTATTTAAGCAAAAAAAAAAAAATGTTTGGATTTTAATTTTTGACTCGGCAACAAATCCAACGGGCGGAGCCTCATAAAATAGCTCCGTAATCTTCCTTCCCTCTCGCGCTCAATTCGCATCCTTTCTCTCTCTTCCATCCCCGCTAATTTTCTCGACGACCTCTTTTCTCAATTTTCGCTTGGTCGGAGCTGCGAATCGAAGACGAAGATTTCCAGCCTGACTTGATAATCCGGCTCCACAATCAATTTTTCGGTTCCATCTCCTTCTCTCTTGCAGCTTCATCTTCATTTCCCTGCACCAACAATGCCTGATTCACTCTGATTCTCTCACATCCTTGCATTCGATTGTTTTCCGCTTCATCTGTTTTGGATCCTTCATATCTCGTATGTATATTTTCTTTTTGTCAATTGATCAATGTGCAATGCATTTGTGGATGAATGTCGTGGCACCTGATTAAGCTTGATCTATTCATTAGTGTTGTTTCCATAAGGTCAATCTTAGACAGAATTGATGTTCTTGGTGAATTTAGGAAATGGAATGTTTCAGGTGCTACTGGCATTTGTAATATACGTGCAGAGATCTTGTGCATTCTTTTTGAAGCTAGATCTGCGACCCCGTTTAGAATAAAGATTTTCTTGATCGAGTCAAATTAAAACCACTAGCTTTCTGACCTGACATTCTACTTGGTTCTCCGAAAATTGAATTAGGTTGAATACAGGGAGACGATTGGAAATCATTTTCTATTTCACATAGTTTGCTTGCGATGGAAGTATCTTAAGTCCTACTAGCTGCATGGTGGCGTCTATCTTTTTCTATTTCCTCTCAGCAGGAGTTCATTTTTCTGAGAACGCTGAATAAAGGCGTCAATTTGTGTCTGTCTTTTAGTCTGTCTCTCTGAAATTAGTCTGAGGGTTCTATCTTTCCGTGAAAATCTTACTAAGAATGCCAGGTTGGGTTTATTTTGACTGACCTGCCTGATGAATGTTTCGATGAATTTCACGTGGAAATATATCTATATAACCTATTCTTCTAGAACTGCTATGCGACGATGATATTTACAAATTTTATTCTATACAAATGTTTGTATCTGATGAATTGCCATTGGTGAAGTATTTTCTTAAGAGATATCTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTCTTTCTCCAAACCATTTTTAATTCAAAATATTATTTTCTTATGGTGATAATTACTTATCGAAAAGAAAGGTCAAGTTAGAAGAGGGAATTCTATGGATTGAATAGTATGTGTATTGAAGCGGATCTATTGCTGTACTAAGATAAACCATTTCTCTCTTGTAGATGGCGTTTGCTCTACAAATATGAATAAGTAA

mRNA sequence

ATGTCAAAAGAAGGCCTTCTCGTAATATCTCAAGACCACGCTATAGAGAAGCGGGCTAGAGGCCAGTCCATGAGAGGTCCACACTTCATCTTCATTTCCCTGCACCAACAATGCCTGATTCACTCTGATTCTCTCACATCCTTGCATTCGATTGTTTTCCGCTTCATCTGTTTTGGATCCTTCATATCTCATGGCGTTTGCTCTACAAATATGAATAAGTAA

Coding sequence (CDS)

ATGTCAAAAGAAGGCCTTCTCGTAATATCTCAAGACCACGCTATAGAGAAGCGGGCTAGAGGCCAGTCCATGAGAGGTCCACACTTCATCTTCATTTCCCTGCACCAACAATGCCTGATTCACTCTGATTCTCTCACATCCTTGCATTCGATTGTTTTCCGCTTCATCTGTTTTGGATCCTTCATATCTCATGGCGTTTGCTCTACAAATATGAATAAGTAA

Protein sequence

MSKEGLLVISQDHAIEKRARGQSMRGPHFIFISLHQQCLIHSDSLTSLHSIVFRFICFGSFISHGVCSTNMNK
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Clc05G02780.1Clc05G02780.1mRNA