Clc04G11805 (gene) Watermelon (cordophanus) v2

Overview
NameClc04G11805
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus cv. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationClcChr04: 25365688 .. 25369543 (-)
RNA-Seq ExpressionClc04G11805
SyntenyClc04G11805
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS
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CTACTGTTGAATGGACTTCAGTAAGGCCTTTCCTTGGCGCCAAAGCATCTGCCGAACCATCATGGCCTCGTCCCCGTTTTATGCTTCCATCAATAATGGCTTCTTCAATCGGTTGAGTCTGTGTGCTTTTGTTTTTTCCGATTCGATTGTTCTCTGCTTTTGTTCTGTCTTGAACTTGCGGTTATTTATTGCGTTCCTGATTCAGAAATCTATTCGTTTGTTTGACTCATGATCAGTTGGAAGTTTGTTGATGATGGAGATGATGGACACTGCACACCGTGGGAAAGTTCAGAGAGGAGAGGACGCTTAAAGGTATAGTACGCACTCTACAATGTATAATGCTGATTATTTTTTGGTTTTCATTTTTAGAATTCTTAATTCGTCTATTTAGTTTTGATTTTTTTTGTATATTATTTATTTATTTATTGAAATCGACAATATGAAAGATATCTGTCGCTTCACATGTATAGGCTATTGACCATTGGGTATTGGAGTTGTTAATGCATTGTCGACGGTCGATCAGTGAATTAACTCTTGTGTAGTTACTGTAGATGCTTTCTCTTTCTTGAACTGTAGCATGATTAAGATTTCTTGAATTTGAAATGCTTGTAGTTGAAAAAGTAATACTAGAAAGAACCTTTGAGCTGAATTGGTTCTATCATCTATATAACAAGATTGATTGATTCTTGGATGTACAGCAACTCTGCTAGTGTTGATTTCCTTTTCAGTTAATAACGATTGTAGTTGTGATGATTTGCTGTTTGATATGACTAGTTTCCCTTTATTGATGCCAATTTACGTTGATAATCTCTGTTTGAGATTAAATTATTATGGGTGATCCAATATGCTCTTCTTTTAAATTAGTACCATGACCAAAGTCATTAAGGAGTGGTTCGTAGGACGATTAATGTTGCAAGAGGTGCACAACATCTTTTGATTCAGTCTCATTATCGTTCTGTATTACAAAGAAGTAAAGAATAGGGGATGAGAAAACTGCTAGAATTCATTCTCTTCTTTTCTTTCTTTTTTTGTTTTTGTGTGCAGTGTTGTAATTTGCTAAATTATCGTACAGCTAAATTTTTTTCTCCCCCTCTACTGTCAGTTTTTCTTCCTATTTGGGTTTACGAGTTTTCACATTTTCTATCTCTTCCCTCTGAACTTTTCAGTTTCCATTTTCATGGTTTGCTTTCACTCTGGTGTAAAAGCTAGGAGCTGTATTCAACCATCCACTAGCCTCTATTTCCCCAAAAAATTATCTAAATCGGCTATAGTGGCTTGCAAGCCTTGTTTTTAATCTCTTTGGTGCTTATCTTTAACTTCTCAATATAGTTTCTGTGAAGGAGGTTCAGGCTGAGACTGGCTATCGAGAAACTGGCTTATTTATGTTAGTTAACTTAGAGATTCTATATTGAATCACTGATGTTAGCTCCTTGAGTTCCTTATTTGCTTCTATTGAAGTTATTATTATTTTCCTCTTACCATTAATATCTAAATCCCCTCCTCCCAAAAAAATGTTCACGCTTTTCTGTACATTGGTGCACAGTTTGTATTTTCAGAATCTAATGAAGTTTGTTACAGAGGAAACAAAAGAACAACGCCCTTCATCTCTTTGTTCTTGGTCTCAGAATGCCCTTCATCTCTTTATGCACCATACCATCCATCTATTATGTTTAACATGTATGCGTTTAAGTTCATCCCCTATCATTTGTGTTAACTACGAAGAGACATGAGCATCAATCATCTCTTACATTTGCACATTGCTTCTACTTGTACTAGTTGGATCTCTATTCTCAAAGAGTGGTATTTCCTGGTCCATGTCCGTAGATACTTTTGATCTCCTATTTATGTTACTTCGGAAAAGGTAAAGTTATTTGGTATAGAACACTCAGCAAGATATTTCTATGGAATATTTGCCTTAAAAAGAACTGGAGAAACTTTGAAGACAAGCATGGGGAATGTTTTTGGAGTTCCTTAGCTTGTTCACTTTGTAATTTGCTTGTGCTTTTCTCTTGATATAGGTTTCTCACACTATTTTTCTTTCTTAATACTAATTCGAGGCCTTTTCTGTGACCCATCACCTATGTAGGCTTCAAGGCAAGTGTGGCAAGTGTTTTCGTAAGAACATTTTTCAATGGTTTAATCCTTATTGTTGTTGTAACTTCTAAGTACTTCAATGAAGAGGATCTAATAATAATTTTGGGTACTTTTTATTTCATCAAGAGTATTTTTAGAATGAGCGATGTCTTTTAAATTTTTTTTTTAGAAGGATAAATTTAAGGTAGCAAAAATATGATTTAAATAAAATAAAGTGTGAATAGGGAACAGCGAGATTTCCTTGAAGAAAATTTGTAAATCACTTGGAGAGAAACTAGTAATAGGTGTTTTATCCTGTGAACATTTTCATCTTAATGTGAGACTTGTTTTATGATTAGATGGTTGGCTTTGGCTGCTACATTCAGGAAGATTATGCAGCATCTGGACATTACCATTTCGAACCTATGGTAATATATTTTTACTCTGTGTTTAACCATTTTGTCAATACCTGTCTATAATCTCCGTGCTGATCCATCCATTCAACGTCCGCAGGCGTTTTGCTACCCTCTTAGGATCCTCATCTTTTCAATGTAAATACCGCCAAAACCTTCAAAAAGAAGTCAAATTTTAAAAATGAATATATTTTATATAAAAGTTATATGGAAATTTTTTGGAAACTATTTTCAAAATAGTTTTCTGTTTTTAAGAATAAAAATTTATAAAAACGTGCTTGGATGACTACTTTTTAAAAGTAATTTTCTTTTATTATTGTATTCTCTTATCACAAGTAATCTCTTTTTTATTTAAAAAAAAGGTGAAGTAATTTTTTCAAAATTGCAAAACATGTGAATAGAGTTATGAAATATTAATCATAACTCATTCCATCAAAACTCTTCTTAAGTAATGTTTAAATGAAAAATTGAAGCCGAAATGAGTGTAGCTCAACTAGCATAGTGCTTGTACTATCAAATTCGATATCAAAGATTCGATTTTCCTACCTAACATATTGTAAAAAAATAAAAAAAAAGAAAACTGTTCTAAAACAATTTTCCAGAGTCATCTAATGAAACTACCGCCATAATTTTTAGAAATCATTCAATTATTGATTATGTCTTTTGAATTTTCTCCAGCAAGGTTCTGTGAGAGTGAAATGGAGCAATGCAGTACTGCAGTTGTGTGGACCGAGTGGAAGAAGCATTGCCTGAGCAGCAGAGAATGTTTGCAGGAGGGCACATGCAATAATAATATATGTGGAGCCCCTACTCCTAGTACTTGAGAGCCAGAGCTTGATCAAAATTTAGAGAGTTAACTAAAGGAGTTTAACAGAACGACTTGGGAATAACAAATCAGTTTCCAGTTTCTGGTCTTGTACGTTTCCCTCCTGAAATGTTTTGTATCAAACTATTATTATATTATTAATATATATTCCCTTGCCTTTTATGCTCCCTGACTCGGTTGTTTTTTCCTTAACACAGTCAATCTGCTCTTGAATTGTGCATTTCTGATCATGCGCTGATCAAGCTTGAGTTACGTCCTCCAGTTGAGATCCAACTACATCATTACAATGAGTTCATCATCGCTCGGTCAAAGAAATAAAAAAGGGTATGGGAGTTTACAGTTCATCATCGCTTGCTCATGTTTTTACTTTATTGTTTTTGTCTCTTTCTGTTGAGTGGATTTTATCTTTTAGCTTCCCAGCTTTATCATACATGAGTGCAAGTAGTTAGAATAGATAACCTCACTACCTGCATTCTAACGAGATTTTGAACCATACAGATCAGCAGTGGAGTCAAAATGCCATAATGCAGTTGAACGCGACTAA

mRNA sequence

CTACTGTTGAATGGACTTCAGTAAGGCCTTTCCTTGGCGCCAAAGCATCTGCCGAACCATCATGGCCTCGTCCCCGTTTTATGCTTCCATCAATAATGGCTTCTTCAATCGGTTGAGTCTGTGTGCTTTTGTTTTTTCCGATTCGATTGTTCTCTGCTTTTGTTCTGTCTTGAACTTGCGGTTATTTATTGCGTTCCTGATTCAGAAATCTATTCGTTTGTTTGACTCATGATCAGTTGGAAGTTTGTTGATGATGGAGATGATGGACACTGCACACCGTGGGAAAGTTCAGAGAGGAGAGGACGCTTAAAGGCTATTGACCATTGGGTATTGGAGTTGTTAATGCATTGTCGACGGTCGATCACAACTCTGCTAGTGTTGATTTCCTTTTCAGTTAATAACGATTGTAGTTGTGATGATTTGCTGTTTGATATGACTAGTTTCCCTTTATTGATGCCAATTTACGTTGATAATCTCTGTTTGAGATTAAATTATTATGGTCTCATTATCGTTCTGTATTACAAAGAATGTTGTAATTTGCTAAATTATCGTACAGCTAAATTTTTTTCTCCCCCTCTACTTTTGTATTTTCAGAATCTAATGAAGTTTGTTACAGAGGAAACAAAAGAACAACGCCCTTCATCTCTTTGTTCTTGGTCTCAGAATGCCCTTCATCTCTTTATGCACCATACCATCCATCTATTATGTTTAACATGCTTCAAGGCAAGTGTGGCAAGTGTTTTCATGGTTGGCTTTGGCTGCTACATTCAGGAAGATTATGCAGCATCTGGACATTACCATTTCGAACCTATGGCGTTTTGCTACCCTCTTAGGATCCTCATCTTTTCAATTCAATCTGCTCTTGAATTGTGCATTTCTGATCATGCGCTGATCAAGCTTGAGTTACGTCCTCCAGTTGAGATCCAACTACATCATTACAATGAGTTCATCATCGCTCGATCAGCAGTGGAGTCAAAATGCCATAATGCAGTTGAACGCGACTAA

Coding sequence (CDS)

ATGATCAGTTGGAAGTTTGTTGATGATGGAGATGATGGACACTGCACACCGTGGGAAAGTTCAGAGAGGAGAGGACGCTTAAAGGCTATTGACCATTGGGTATTGGAGTTGTTAATGCATTGTCGACGGTCGATCACAACTCTGCTAGTGTTGATTTCCTTTTCAGTTAATAACGATTGTAGTTGTGATGATTTGCTGTTTGATATGACTAGTTTCCCTTTATTGATGCCAATTTACGTTGATAATCTCTGTTTGAGATTAAATTATTATGGTCTCATTATCGTTCTGTATTACAAAGAATGTTGTAATTTGCTAAATTATCGTACAGCTAAATTTTTTTCTCCCCCTCTACTTTTGTATTTTCAGAATCTAATGAAGTTTGTTACAGAGGAAACAAAAGAACAACGCCCTTCATCTCTTTGTTCTTGGTCTCAGAATGCCCTTCATCTCTTTATGCACCATACCATCCATCTATTATGTTTAACATGCTTCAAGGCAAGTGTGGCAAGTGTTTTCATGGTTGGCTTTGGCTGCTACATTCAGGAAGATTATGCAGCATCTGGACATTACCATTTCGAACCTATGGCGTTTTGCTACCCTCTTAGGATCCTCATCTTTTCAATTCAATCTGCTCTTGAATTGTGCATTTCTGATCATGCGCTGATCAAGCTTGAGTTACGTCCTCCAGTTGAGATCCAACTACATCATTACAATGAGTTCATCATCGCTCGATCAGCAGTGGAGTCAAAATGCCATAATGCAGTTGAACGCGACTAA

Protein sequence

MISWKFVDDGDDGHCTPWESSERRGRLKAIDHWVLELLMHCRRSITTLLVLISFSVNNDCSCDDLLFDMTSFPLLMPIYVDNLCLRLNYYGLIIVLYYKECCNLLNYRTAKFFSPPLLLYFQNLMKFVTEETKEQRPSSLCSWSQNALHLFMHHTIHLLCLTCFKASVASVFMVGFGCYIQEDYAASGHYHFEPMAFCYPLRILIFSIQSALELCISDHALIKLELRPPVEIQLHHYNEFIIARSAVESKCHNAVERD
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Clc04G11805.1Clc04G11805.1mRNA