Clc04G11455 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCTAATGATCAGCTAAAGCATTCTCCATCTCAGTTTTCCCAAATCTTCCATTTTCTCTTCTTACTTATTGGCTTCTCCTTTGGAATGGCTATCAGTTTGAACCTTAAGAGCTTCTCATCCTTTAACATCCACCTCCCTAACTTTTCCTTTCCATCTTCACCATCAACAACACTAGTGTTTATCAGACAACAGCAGCAACAAACTCCAGCCTCATCGTCACCCCCACCACTTCAACCGCCGTCGTCGTCACCGGCGTCTCCTTCTTTGGTTGACTTTGACAATCAGTTACTCGAGGCGAACGTAGAGCCGCCTCTGATGCATAAAATGAGTGATGATGAGGTGTTTTGGAGAGCATCCATGGTTCCAATGATAAAAAAGTTTCCATATGAACGTGTGCCAAAAATTGCTTTCATGTTTTTGATAAAAGGGGCATTGCCTTTAGCTCCTTTGTGGGAAATGTTCTTCAAAGGACATCAACATTTGTTTTCAATTTATGTGCATACTCATCCATTGTATAATGTTTCTTCTTCTCTGCCTCCAAACTCTGTCTTCTATGGAAGAAGAATCCCAAGCCAGGTCAGGTTATACCTATTTTAATTTTTTTTTTAAAAATCTCTTGATCTCTAAATTAAGGCAGTATTTATTTTGACTAAAATTTCCTTTTAATTCTATGATTGTATGATTAGGTTAGGGTGAATATTTGATCTTTTTTAATTAAATTGCGAGGAAGATATTTAAATCTCTGACTTATTGATTATAATTTAATAACTAATTGAGTTATGATTAGGTTCACAACGAGTGCACTTTACACACATTAAGGTTTGATATAAAAAATAATTTTTAGAAAACAAAACATACAAAGTTGTATAGTTAATTTTAACTTTTAAATATAACAAAATGAGTCAAATTATTTACAAATATAAAAAAATTTTACGCTCAAGGCCTATCGTTGATAGACAGTAAATTTTATTATTATTATTATTTTTGTTTATATTTGTAGATAGTTTGATATTTTTTCTATTTATAATAATTTTTCTATTATGCATTTTACAATAAAAAAAATCAATAAATAAAGTATGCATGTTTATGTTTTTGAAAAATTGGTAACAAAAAATATTAATTTTTTAATATTTATATAATCTAGGAAGTGTTTTTGGGCTTCTCTCTAATCCTTCTCACCCAATTTTGTACCGAGTCCCTCTGTACTTTATTGTTATATCAATGAAATGAGTAGTGGAATATGATGAGAGTGTTAAAGAATCTGTCAATCTAATTGAGATATTCTGGTGCACCTATACTAACATACGTCGTATCTTTCTAAATAAAATTTTTCTTTTAATAATAATTTGTAATTTAAAAAAAAAATTCAATGGCTATATGGTTTTAATTTTTTTTTATTATTTATTTTTATTTTTTATTTAAACATGAGTAACAATATTAAAGAGAACACTACTAATTTATGTCATGCTTAATTGTGAAAAAACAACTAGATGCTAACTCCATCATTTTTTTATAGGATGCGTTTTTACATTTTCTAATTTTATATATATGCTACCATTGTCTCTAGTTCTAAGAAAGCTATGAAACTTTGCACTTTGAATGAACATAGGCAGTGCAATGGGGAAGACCCTCCATGATCGACGCCGAGCGCCGTCTTCTAGCAAACGCCCTTCTTGACTTCTCTAACGAAAGATTCGTCCTCCTCTCCGAAACTTGTATTCCTCTCTACAACTTCACAACTGTCTACAATTACCTCATTAATTCTCAACACACCTTCGTTTCTTCCTACGACGATCCTCGAAAGATCGGCCGTGGTCGTTACAACCCCAAGATGTTTCCCATCGTGTCGATCGCTGACTGGCGAAAAGGATCGCAGTGGTTTGAAGTTGATCGAACGGTAGCCGTCGAGATAATCTCCGACAAAACATATTACCCTATCTTCAGAGACCATTGCGGGCCACCGTGTTACATGGACGAGCATTACATTCCTACGTTGGTTAACATTGTTTTGCCGGACCGGAATTCCAACAGAACCGTTACATGGGTTGATTGGTCCAAAAACGGTCCGCATCCCGGCAGATTTGGGAGGCGGGAGATCTCGGTCGAGTTTTTGAACCGGGTTCGGTTTGGTTTCAATTGTACTTATAATAATGGAAACGGCACCGTTTCTCCATGCTTTCTGTTTGCTCGGAAATTCATGCCGGATTCTTTACAACCTCTGCTGAAGATTTGGCCATCTCTGTTGGAAGGTTTGGTTTAACCTTAAATAATAATATAATGTTGGTAAATTCTAAATTATTATTCAATATTTTTACACAAATTGATGTAATCTTGATTTAAACTATATACTGAAGAATGATACGAGATACACAAAAAAATTAGTTTCTTTGCTCATTTTTTCTTTGAATTTCATTTGTTTATGAGACCCTTGATTATTAAATATAAATATATTATTTAGATTTAATAAATATCAACTAATACATTTATCATTGAAATTTTATGTTATGTTAACTATTTATTATAAGATTTTATCATTAATTCTAATTAATTTATATTTATTTAACTGTTTTATTATTAAATAAAATAATTTAAATAGTGTTTAATTAAAAAAATATTCATTTATTGATATTTGAAGTGATTGAATGATTAAAATTATTTATGATTACATTAATTGTTCTCCTACATTTTCATTAAATAATTATTTAGTTTGGATTTCTATATACTAGTAAATCAAACACATTAATTTAACTTTCAAACATTAATTATCATACATATCCAAACACAGACATTAATTATCTCAAACATTTAAAATCCAGACATTTGAATTCTTAACATTTAACATCCATACTTATAATCTGCGATTCAAACGGCCTTAGATTATTCAACATAGTACGTAATAATATAATGCATTCTAAATATTATTTTTATGTCGTTCCCTAATAATAACAACATAACTATCATTTGTAACAAACTTAAAGAGGGGGAATAACGAGAATTTAGAGCAAACACTACTGATAGAGGGTGATCTTTAAGCCAAATTTTTGTTACTTCTAATATATATATATTGAAGTGTCACCATGTAGTTGACAAAGAGAGTTTTTATGGACTGGATATGCAGTTGTATGATGAAGATTATAAAGGGAGTCAATAAAAAGACTAGAATTCGTTTAGGTAATGGTATTTTCCAATTAGAAGGTCTCAAAATATGGAATTTTGCTTTAGTCCAAAGAGGTTGAATGCAACCTCAGGCATTTTGGTTGTATGTCTCCATAGAGAGTTACTGCTTCAACAAGTTCAATAAAACATCCAAACTGAAGTTGAAATAATTACCTTCGCATTTGCTAGAAATTTGTAAAAATAACCGACCCATTTTCACTATGTGTTGTCAATTTTATTTGGTAATATTGCATATATCAATTTCTATACCATATTTAGAAATTAATTAAATAATATTATATGTGATCGATCTCAGAATTTTTGTCAAAATGAAATATATTTAGTTAAGCCATAATTGACATGTTTATTCTTTGTCTTGAGATCGAAAGTTCAAAATTCTATACCTAAGATTTATTATATTTAAAAAAAATGAAAAAAAAAAAATCAAGAGCTAGGATTCACACAAATTCTTAGACTAGGGATCCAAAACTTCTTACTCGTATGATGTTGCCAATTTTGTTTTTTTTTTGTTTAGCAGATATCATATTCTTAGCTATTTTAAGAAACTTAGAAATCAATTAAATAATATTACAAGGTGACAAACTACAAAAAAAAAAAAAAAAAATTATTAATATATAATATGCTAGATGAATACTGAACTATTAACTTTAAAATTAGAATTGATATCGTATATACTTAGTTATGTTTGGATCCACAATATATATGTTTAAGTTTAATATGTATACCATGTCAAAGTAAATATGATTCAATTATCCTATGATAGTGGATGGACCCTAGAGATATATATATTAATTATTGACAAACTTTATTTCGAATATCTAATTTTACAACCGCCAAACTGGCCATATCTTTAGTCAACGAGAGAATAAGATTATATAAAAATGATGATAGTAAACGTGTTGACACAAATAATACTTCACTATGTTACTCAACCTATGGAAAAATAAAGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTCTTTCTTTATTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTTTAAAAAATTTGTTTTAAACACGTTCCAACTTCTTATTTAAGAAGAATTTTGTTTGCATTATGGACCAGTGAAATAAGCCAAAAAATCCAATATATATATATATAAAATAAGATAAAGATAATATTTAATCCTGACTTATTTGCGATTAGACAAAATTCATATCCTAATTTTTATATGATTAAGATAAACGCTAGATCAAATCTTTTGTATAGCTCTATATAAGGTAATTTAAACTTTTGACTTCTTTTACAATTATAGTATTTTCGTTCTGATTTTGGTATCGAAACTCTTTTTATTTGTTTTGTAAGTATTCTCTTCCCCAAATTACAAATTTACTATTGCCATTACGTGAAAGTTAGGTGCATTTTTTTCAATCCAAATTTGGATACCAACAATTTAGATGGTATTAAAATAATGACTAAATATAAATAAGGGCAAACTGCACTTTTAGTCCCTGAGGTTTGAGCTTAGTATCTATTTGGTCCATGAAGTTTCAAAATGAACACTTTAGTCTCCGAGATTTGAAAGATGCTTCTAAATGGTTTTTGAATTAATTTGACTATTAGTTGGCTAATAGAAAAGTGACATGGAGTGTCGAGTGGGCACATTTTAAATGAATGGGCATGTTTAGTTAACAATTTTAAATGAGGCGGCCATTTGTAGTACTTTATTTTTTAAAAAATTCTATATTAGGTGGATTTTTTTTCTCTTTCTTTTGTTTCTCTCCTCCCCGGGGACTAAAAGTGCAAGATTTAAAATGTTGATATTGACGAGAATATTGAA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ATGGCTAATGATCAGCTAAAGCATTCTCCATCTCAGTTTTCCCAAATCTTCCATTTTCTCTTCTTACTTATTGGCTTCTCCTTTGGAATGGCTATCAGTTTGAACCTTAAGAGCTTCTCATCCTTTAACATCCACCTCCCTAACTTTTCCTTTCCATCTTCACCATCAACAACACTAGTGTTTATCAGACAACAGCAGCAACAAACTCCAGCCTCATCGTCACCCCCACCACTTCAACCGCCGTCGTCGTCACCGGCGTCTCCTTCTTTGGTTGACTTTGACAATCAGTTACTCGAGGCGAACGTAGAGCCGCCTCTGATGCATAAAATGAGTGATGATGAGGTGTTTTGGAGAGCATCCATGGTTCCAATGATAAAAAAGTTTCCATATGAACGTGTGCCAAAAATTGCTTTCATGTTTTTGATAAAAGGGGCATTGCCTTTAGCTCCTTTGTGGGAAATGTTCTTCAAAGGACATCAACATTTGTTTTCAATTTATGTGCATACTCATCCATTGTATAATGTTTCTTCTTCTCTGCCTCCAAACTCTGTCTTCTATGGAAGAAGAATCCCAAGCCAGGCAGTGCAATGGGGAAGACCCTCCATGATCGACGCCGAGCGCCGTCTTCTAGCAAACGCCCTTCTTGACTTCTCTAACGAAAGATTCGTCCTCCTCTCCGAAACTTGTATTCCTCTCTACAACTTCACAACTGTCTACAATTACCTCATTAATTCTCAACACACCTTCGTTTCTTCCTACGACGATCCTCGAAAGATCGGCCGTGGTCGTTACAACCCCAAGATGTTTCCCATCGTGTCGATCGCTGACTGGCGAAAAGGATCGCAGTGGTTTGAAGTTGATCGAACGGTAGCCGTCGAGATAATCTCCGACAAAACATATTACCCTATCTTCAGAGACCATTGCGGGCCACCGTGTTACATGGACGAGCATTACATTCCTACGTTGGTTAACATTGTTTTGCCGGACCGGAATTCCAACAGAACCGTTACATGGGTTGATTGGTCCAAAAACGGTCCGCATCCCGGCAGATTTGGGAGGCGGGAGATCTCGGTCGAGTTTTTGAACCGGGTTCGGTTTGGTTTCAATTGTACTTATAATAATGGAAACGGCACCGTTTCTCCATGCTTTCTGTTTGCTCGGAAATTCATGCCGGATTCTTTACAACCTCTGCTGAAGATTTGGCCATCTCTGTTGGAAGGTTTGCGACGGCAGCCGCACATGGCGGAGCCGACGGCGAAGGTCCTTCAGGGCGTTCAGTTTCATCAACTTAGTATCCTAATATCTCACTTTCTTGTGTTTGGGTTAGGATTGGTTATTGGGATTAGTTTTAATTTCTCGGTTAGTGGTTTATCTTCGACTTTTCAGCTTAGCCAGTGGCCGGTTACTCCGCCGACGCTACCGGCGGGGGTGGTGGGGTTGAGGGAATTTAGGAGCTCAAAAAGTGTGGGCCAGGAGATGAGAAAGTTGCCGGGGAAGGTGGCGTTCATGTTCTTAACGAGAGGGGATTTGCCGTTGAGGGCACTTTGGGAAAGATTTTTCAATGGAAATGAAGGATTATACTCAATTTATGTGCATTCTCATCCTTCTTTCAACGGAACTTACCCAAAAAATTCCGTCTTCTATGGCTGTAGTATCCCTAGTAAGGAAGTTGAATGGGGTCAGCCGAGCATGATTCAGGCAGAGCGACGTCTCTTAGCCAACGCTCTTCTCAACTTCTCTAACGAACGATTTGTCCTCCTTTCCGAGTCTTGCATTCCCGTCTTCAATTTCACCACCGTCTACAATTATCTTATGGGCTCGGCCCATGTCTTCGTCGAGTCCTACGACTTACCGGGCCGTTTGGGCCGCAACCGGTACAGGCCCAAAATGAAGCCCACAATCACCAAGGCCCAATGGCGGAAAGGCTCTCAGTGGTTCGAAATGGACCGACGGACGGCAACGGAGGTGGTGGCGGACCAGAAGTACTTCCCACTCTTCGAAAAGCACTGCCGCCCGGGTTGCATTTCGGATGAGCACTACTTGCCGACGATGGTGGGTATACGGTTCGGGGAGAGGAATTCGAACCGGACTCTGACTTGGACTGACTGGTCGAAGCAGGGGCCTCACCCGACCGGGTTCGGGAGCGGCAATGTCACGGTTGGGCTTCTGGAAAGTATAAGGAACGGCAGCACTTGCGAGTATAATGGACAAAGCACTAGAATTTGCCATTTGTTTGCGAGAAAATTTATGGCAAGTGGTTTGGATCGGCTGCTGGAAATTGCTTCACAAGTCATGTTCATCCCTTGA MANDQLKHSPSQFSQIFHFLFLLIGFSFGMAISLNLKSFSSFNIHLPNFSFPSSPSTTLVFIRQQQQQTPASSSPPPLQPPSSSPASPSLVDFDNQLLEANVEPPLMHKMSDDEVFWRASMVPMIKKFPYERVPKIAFMFLIKGALPLAPLWEMFFKGHQHLFSIYVHTHPLYNVSSSLPPNSVFYGRRIPSQAVQWGRPSMIDAERRLLANALLDFSNERFVLLSETCIPLYNFTTVYNYLINSQHTFVSSYDDPRKIGRGRYNPKMFPIVSIADWRKGSQWFEVDRTVAVEIISDKTYYPIFRDHCGPPCYMDEHYIPTLVNIVLPDRNSNRTVTWVDWSKNGPHPGRFGRREISVEFLNRVRFGFNCTYNNGNGTVSPCFLFARKFMPDSLQPLLKIWPSLLEGLRRQPHMAEPTAKVLQGVQFHQLSILISHFLVFGLGLVIGISFNFSVSGLSSTFQLSQWPVTPPTLPAGVVGLREFRSSKSVGQEMRKLPGKVAFMFLTRGDLPLRALWERFFNGNEGLYSIYVHSHPSFNGTYPKNSVFYGCSIPSKEVEWGQPSMIQAERRLLANALLNFSNERFVLLSESCIPVFNFTTVYNYLMGSAHVFVESYDLPGRLGRNRYRPKMKPTITKAQWRKGSQWFEMDRRTATEVVADQKYFPLFEKHCRPGCISDEHYLPTMVGIRFGERNSNRTLTWTDWSKQGPHPTGFGSGNVTVGLLESIRNGSTCEYNGQSTRICHLFARKFMASGLDRLLEIASQVMFIP Homology
BLAST of Clc04G11455 vs. NCBI nr
Match: RXH77290.1 (hypothetical protein DVH24_023564 [Malus domestica]) HSP 1 Score: 795.8 bits (2054), Expect = 3.3e-226 Identity = 426/823 (51.76%), Postives = 525/823 (63.79%), Query Frame = 0
BLAST of Clc04G11455 vs. NCBI nr
Match: KAA8542728.1 (hypothetical protein F0562_023880 [Nyssa sinensis]) HSP 1 Score: 784.6 bits (2025), Expect = 7.5e-223 Identity = 409/747 (54.75%), Postives = 516/747 (69.08%), Query Frame = 0
BLAST of Clc04G11455 vs. NCBI nr
Match: XP_038894509.1 (glycosyltransferase BC10-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 772.7 bits (1994), Expect = 3.0e-219 Identity = 375/409 (91.69%), Postives = 388/409 (94.87%), Query Frame = 0
BLAST of Clc04G11455 vs. NCBI nr
Match: KAF4395376.1 (hypothetical protein G4B88_010840 [Cannabis sativa]) HSP 1 Score: 770.8 bits (1989), Expect = 1.1e-218 Identity = 382/724 (52.76%), Postives = 491/724 (67.82%), Query Frame = 0
BLAST of Clc04G11455 vs. NCBI nr
Match: KVH97644.1 (Glycosyl transferase, family 14 [Cynara cardunculus var. scolymus]) HSP 1 Score: 751.5 bits (1939), Expect = 7.1e-213 Identity = 383/724 (52.90%), Postives = 498/724 (68.78%), Query Frame = 0
BLAST of Clc04G11455 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q65XS5 (Glycosyltransferase BC10 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=BC10 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 179.5 bits (454), Expect = 1.5e-43 Identity = 107/308 (34.74%), Postives = 164/308 (53.25%), Query Frame = 0
BLAST of Clc04G11455 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A498I2A4 (Adaptin_N domain-containing protein OS=Malus domestica OX=3750 GN=DVH24_023564 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 795.8 bits (2054), Expect = 1.6e-226 Identity = 426/823 (51.76%), Postives = 525/823 (63.79%), Query Frame = 0
BLAST of Clc04G11455 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5J5BJE6 (Uncharacterized protein OS=Nyssa sinensis OX=561372 GN=F0562_023880 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 784.6 bits (2025), Expect = 3.7e-223 Identity = 409/747 (54.75%), Postives = 516/747 (69.08%), Query Frame = 0
BLAST of Clc04G11455 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A7J6HJE3 (Lactamase_B domain-containing protein OS=Cannabis sativa OX=3483 GN=G4B88_010840 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 770.8 bits (1989), Expect = 5.5e-219 Identity = 382/724 (52.76%), Postives = 491/724 (67.82%), Query Frame = 0
BLAST of Clc04G11455 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LVS2 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G042430 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 751.5 bits (1939), Expect = 3.4e-213 Identity = 361/408 (88.48%), Postives = 380/408 (93.14%), Query Frame = 0
BLAST of Clc04G11455 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A118JXU9 (Glycosyl transferase, family 14 OS=Cynara cardunculus var. scolymus OX=59895 GN=Ccrd_000274 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 751.5 bits (1939), Expect = 3.4e-213 Identity = 383/724 (52.90%), Postives = 498/724 (68.78%), Query Frame = 0
BLAST of Clc04G11455 vs. TAIR 10
Match: AT1G68390.1 (Core-2/I-branching beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase family protein ) HSP 1 Score: 392.5 bits (1007), Expect = 7.8e-109 Identity = 211/396 (53.28%), Postives = 267/396 (67.42%), Query Frame = 0
BLAST of Clc04G11455 vs. TAIR 10
Match: AT5G11730.1 (Core-2/I-branching beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase family protein ) HSP 1 Score: 380.9 bits (977), Expect = 2.3e-105 Identity = 174/306 (56.86%), Postives = 226/306 (73.86%), Query Frame = 0
BLAST of Clc04G11455 vs. TAIR 10
Match: AT5G25970.1 (Core-2/I-branching beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase family protein ) HSP 1 Score: 375.9 bits (964), Expect = 7.5e-104 Identity = 173/300 (57.67%), Postives = 219/300 (73.00%), Query Frame = 0
BLAST of Clc04G11455 vs. TAIR 10
Match: AT1G10280.1 (Core-2/I-branching beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase family protein ) HSP 1 Score: 370.5 bits (950), Expect = 3.2e-102 Identity = 172/301 (57.14%), Postives = 222/301 (73.75%), Query Frame = 0
BLAST of Clc04G11455 vs. TAIR 10
Match: AT3G21310.1 (Core-2/I-branching beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase family protein ) HSP 1 Score: 363.6 bits (932), Expect = 3.9e-100 Identity = 173/310 (55.81%), Postives = 222/310 (71.61%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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