Clc03G17770 (gene) Watermelon (cordophanus) v2

Overview
NameClc03G17770
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus cv. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationClcChr03: 30140324 .. 30149352 (+)
RNA-Seq ExpressionClc03G17770
SyntenyClc03G17770
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
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mRNA sequence

ATGAAGTGCAATGCGACAAAGTTGAGGATATTTAGATTTGAGAAAAACCCACATCGGCTAGGCAAGCAGCAAGGGAACCTCCGATTCTATAAATACACGACAATGGCTTACGTTCAAACATACTTACCTGGACGGGGTCAATGGGCGATCAGCAAGGTCCATGGCCTAGAAATTCACCATGGAGGGAGAAGAGAAGGAATTAGACTGTCGTCTTACTTTTTGTTCATCATCTGTTTGAGACTCAAAGCTTTCCAATGTGGGGTTTTGTTTTCAACCAAAGAGGATGGGGTTACTTTGAATGAGATTGGCCTCATTTTCAGATATGCTCTTGTGAGACATCCGTCTATTGTATTGTATCATCAGATTGTGCTTACCAAATTGAGTGATATTACTGTCAGAGCCTTCTTTTCTGACACCAAATCTTATTCCAGGTTGAGACATGGGATCTATATTCTTCATCATGTCTATATAGAGATGGAAGTCGAAAGCATATTTGAAACTGAAGAGAATAGAAATTGCTTTCAACTAGGAAAGGGCCCCATGATGTCGCTTTGGGGAGAACAGGGGGTCTACATGCTTAATCAAGGCGAGTGGAATTACTATCAGAAGCTTCCTTTTTGTGGGATTTTCACTCCAAAAGGATTACATCTGAAACATGTAGAAAATCTTATGATTCGCTCAATTGACATAAAGTTGTATTATGATAAAGTTCGCTCAATTGACATAAATTATATTATGATAAAGTTGTATTATGGGAGCTTGATCATAGGTCTTGACTCCCAATCCTTCATCATAAAAGTGATGTTTAAAGCTTTGGGATGATTCTATGTGAACTTCGAAGTAGATCCAGTAGTGGTGTCGGGTGCGGATAATTTTGAAAACATGGCTAAATGAAGTTTGAATGTTGATGTCGATGAGAATATTGAAGTGCCAATTTTGCATAAAGATGGAATTCAAAGAGAAGAAAAAAGTATAAAATTTTGTATAAAGAAGACGCTCAATCTTTACTAAGTGTTAAATACAAAGCATGACTGATATTGTTGATGAAGACAAAAGAGTTGCATTTATGAATGACGATCAATGACAACTGCAAATAGAAGAACAACAGTAAAGATAACAAGCTCGAGTTGATTGCTTCAAAAGTTTACTTCAAGCTCGACCACCTAGTTGCAACATTTGAAGGACTGCTATTGACTTGTCGGAGGTCTTTGTAATCAAATAATATTTATAATTACAGATCAAGATCGAGTTGATTTGCAAGAAAGCACGAAGATTAGTTTCTCAAAGTTAATTCTTTAGTTAAACCGGTTAATGAGGAGGTTGTATTTGAATTGGATGATGAGACAAAAGAGCTAAATAAAAGGCGTTGTTCCTTTGGAAGGTAAACAAAGAAGATGCCTTTAGTTAAAGGAAGAAGAATTCTCCAAATTGTAGGTATGGTCATGGAGTATTGCTCAATCTGTTCAAACACATAGCCTACTTAACTGGTAATGTTG

Coding sequence (CDS)

ATGAAGTGCAATGCGACAAAGTTGAGGATATTTAGATTTGAGAAAAACCCACATCGGCTAGGCAAGCAGCAAGGGAACCTCCGATTCTATAAATACACGACAATGGCTTACGTTCAAACATACTTACCTGGACGGGGTCAATGGGCGATCAGCAAGGTCCATGGCCTAGAAATTCACCATGGAGGGAGAAGAGAAGGAATTAGACTGTCGTCTTACTTTTTGTTCATCATCTGTTTGAGACTCAAAGCTTTCCAATGTGGGGTTTTGTTTTCAACCAAAGAGGATGGGGTTACTTTGAATGAGATTGGCCTCATTTTCAGATATGCTCTTGTGAGACATCCGTCTATTGTATTGTATCATCAGATTGTGCTTACCAAATTGAGTGATATTACTGTCAGAGCCTTCTTTTCTGACACCAAATCTTATTCCAGGTTGAGACATGGGATCTATATTCTTCATCATGTCTATATAGAGATGGAAGTCGAAAGCATATTTGAAACTGAAGAGAATAGAAATTGCTTTCAACTAGGAAAGGGCCCCATGATGTCGCTTTGGGGAGAACAGGGGGTCTACATGCTTAATCAAGGCGAGTGGAATTACTATCAGAAGCTTCCTTTTTGTGGGATTTTCACTCCAAAAGGATTACATCTGAAACATGTAGAAAATCTTATGATTCGCTCAATTGACATAAAGTTGTATTATGATAAAGTTCGCTCAATTGACATAAATTATATTATGATAAAGTTGTATTATGGGAGCTTGATCATAGGTCTTGACTCCCAATCCTTCATCATAAAAGTGATGTTTAAAGCTTTGGGATGA

Protein sequence

MKCNATKLRIFRFEKNPHRLGKQQGNLRFYKYTTMAYVQTYLPGRGQWAISKVHGLEIHHGGRREGIRLSSYFLFIICLRLKAFQCGVLFSTKEDGVTLNEIGLIFRYALVRHPSIVLYHQIVLTKLSDITVRAFFSDTKSYSRLRHGIYILHHVYIEMEVESIFETEENRNCFQLGKGPMMSLWGEQGVYMLNQGEWNYYQKLPFCGIFTPKGLHLKHVENLMIRSIDIKLYYDKVRSIDINYIMIKLYYGSLIIGLDSQSFIIKVMFKALG
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Clc03G17770.2Clc03G17770.2mRNA