Clc03G15040 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAAAAAAAAGAAGTGAAGATGGCTATGAAAAAAGAAAGCTATATAAATATTATTGTCTTCTTCCTTAACTTTGTATTTCTTCTTCCTCTTGTAGTGGGACAAGAAGATGATAATTACACAACCAAACGAAGTGACTTTCCTGATTACTTTGTTTTTGGTACATCCTCTTCGGCTTACCAGGTGAAGAATTTTGTATAACTTTCATTATAAATTTGCCAAAATCCAAACAATGAATGTGGCTTTCACTCTTTTTACTTTGTTGCTTTCTTTTCTCCATCAGTATGAAGGTGGTGTTGAAACAAGAGGAATAAATAATTGGGATGTCTACACTCACAAATACTCAGGTCCTTTCTGTGTTTTCTTTAATTACCTTTACATTGTTCTTCAATTTTTTTTCTCTAATACAAAATTCTCATTGTATTCTTGTACTTATGTTTGAAATCGGATCAAAATTTTGTTGGAAAAAACTTCTTACTACTACTACTGTAGGAATGAATAGAGAAAATTAAAAGAAAGCAATAAAACTGGAAACGCAGGAATTAATGTGGAGAAACTCCAACTCGAAGAAAAAACCATGGGCCAAAAAAAATCTACTATGTGAAAAGTTTTTACAATCACACAGAATAATTTTCCCTCCCAACCCAATTACAAGAGCACTCTCTCAAAGCTTTTATACTACTCCCACCATTTAATTCTACTCTCACCTAGAGAATACATAAGTAAATTTAATTAGATTTAGCACACCTAAGATTAAAGTATTTCTAATTGGGACAATTTGAAAAACCAAAGATATAGGCTCTTTTTATTATTGTGTTTGGAGCCCACTTTCTTGAACCTTTCCAATGTGAGACGATTGCACTTCTAATATTTTGCTAAAATCCTACGAATTTCACATTATTAAAAATGAAATAGGAAGATCATGGGGTTTATATAAAGTGTCAAATCACTGATTGACCAAAAGGTTTTTAGGTTAATCAGTGACTTAACATGGTATAAGAGGAAAATGTTTTGTGTTCGTACTCTTAGTCTTTAAAGCTTAAGCTTTTGGATTATAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAATAGTAATTTATGATTCTTATGAATAATGACAATATTAGAATCCGTTTGCTGCTTTTACTTTTAGTTTTTTACTCTAAAACATTATACTTGTTTATTTTGTAATTTTCTTAATATTTTTTCAACTTTCTGAAGGACAGTTTTTAATTTTTAGCCAGAGACTTTACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCTTTTAAGAATTTTTTATTTTGTAAAGATATGTAAATTTAGAGATTTTTTTTAATAGATATCAAAAACAAAGAAACATATATCAAAACACGCATAAAACTTTTAATATATTTTTAAGAAAACAAGAATGAAAGTATAGTTTAGATGTCTAGAGCATTACTTGGTTTCTAATTTGGTCCATGTGAAAAGTGTAAAACGTTATATTTTACTCTCCCATGTTTGAACAATGTCCATACTATTAAACAATTTAATTAGGAATAAATGAAGAATTAATAATCTTAAGAGAAAATAATATAATAATATATGTGTATTTCACATCACTACTACGGAAAATAAGGAAAATTACAACCATTGATTAATAAGATTTAGCAAGAAATTAGGATCATTCTTGATCATACATATTAATCTAAGAAACACGAATGTACTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAAAATGAACCCATAACTCATTTTAGAAAAAATTACATTTTGTAAATAAATATTTTGACAGCAATGACTGAGTTGAAAGGGTATTAGCTTGATTGGGATGATTAAAAAATTATCCCACTCACATATTGTTAAACAAAATTGAAATTAAGGGACTACAATATTTGATGTAGTGAAAACATATGTATCAATTAAATAACTATAATTTTATGGAAAAATTATTGTAAATAAAAAAAATATCAAAATATTTACGAATATAGAAAAATTTCATTATCTATCAGCAATTGACTGTAACGAACTTCTATCGCTTTAGAAATAGAAGTCTATTGTGGTCTATCACTAAAGTGATAGAAGTCTATTTATTGTTGATAGACAGTGAAATTTTTTCTATATTTGTAAATACTTTGGTTTATTTTGCTATATTTGAAAACAAGTCTAATTTTATTATAAATAATATTTAAAGTAAATGCAGTAATATTTTTTTTTTTTGTTTGATATTTAATTGAGATTACTAAGAAAATATAACAAAAAAAGAAAGTTATATGTCAGACTATTGTGTTATTTTTATTTAGAAAAGGGTTAAGATGTGTCCATCTAATAATTTTTTAATTCAAAAAATCGTTCAAATATTATCATCAATACAACAAGATTATATAGAAGGGAAAAGAAAAAAATAATAATTGATATAATGTTTAGGGTAATGCTTTTAAATAGCAAATTGTTGAAAATATTTTTAAAAATAATAAAATGTCACAGTCTAGATTGATAGTGATGGATGATAGTAGTTTATTAATGTCTATTATTGTTTATAACAATATTTTGCTATATTTATAAATAAATTGAGTCACTTTGCTATATTTTAAAACAACCCTAACATTTATAGTTTACAGAGAGAATTGTAGACCGTAGCAATGGAGATATAGCTGTGGATGAAATCCATCGTTACAAGGTGCGTAACATGCTAACTATAATTATTATAAAGGAGTATTGTTTTTAAGATGTGATTCGGGTAATTTTGAGATAGGAGGAGGAAATTACATTTTATATATTTAATTAATTTAAACATAGGCCGCACAAATTTAGATTTTTAATTCATTATTTTTACGAAATTCAAACATAAGTTAAAGAAATACATATTATTGGGTTATAAATCTTAAACACAAATCTTCCAAAAATCAGCATGACTCAATTAGCATATAAGTATACTAATGACTATGAAGTCTATGGTTTGAATCCTTCTACCTCCAATTGTACTAATAATAATAATAAAAACCTCTCAAACAATTGAATCATTACTCTGTAAAAATAAGCTTTAGTATGACATGAACGTGTATTAACAATTTTGAGACCTTAGGTTCAATTTCCTTACTCCAAATATGTATGCACAATTCATTTTTTTTCAAAAATTTAGGTTTATCTACTTTCTATGTCAAGTTTTGAAAACTAAAAATAATAATTTTTATTTTTATTTTATGTTTTTTGGAATTTGGCTAAGAATTCACCTCTTGTACTAAAAAAAAATATGCAAGGTATTGCAAGATGAGCTTAATTTTCAAAAACAAAAAATAAAAGACAAACACCAAATTTAACGGGGCCTAATAATTTAAAATGTGTGTAGGATAGCTTCTCCGAATGATTTTAGATAATACAAAATGTTTATAATAGTCTTGACAACTAAAAAGTAATTTTAAAAACTTTAACCAATTTATTCCAAGAAATTTCTTTGAGATAAATTATCCAAAATAAAAAAAGATAATTATGTTGGATAGCACTTTTAGAGATAATAATTAAGTGTGCGTTTGGAATATATTTTTAAGCGTTTAATTTAAAATATAAGTCATCTTACAAAAAGAGCTTTTTATGTGTATTTTAAATGGTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTATCAAAAGTGTTTAAATAAAAGTGAGTTTTTGAAAAACATTTTTTTTCTTAAGTCAATCCAAATGGGCCCTAAGAGCATAACAACATTTTAAAAAAATTGCAAATATAACAAAATCTATCGGTGATAGAGTCTATCACTGATAGACTCCTATCAGTAATATTGTCTATTACTAATAGACACCTACTATTGATATGATACGCTTTGATGGCAGAATCGAAATTTTGCTATATCTGTAAATTCTTTTGCATTGTGCTATAGCTGCAAATATTTTGAATATGATACTTGTAAGCAATTAACTAAAAATCTTAAAAACATGCCAAAAACACAATTATTTGTAATTTAGATAATTACTTTTGAATATGAGTTACTTTCAAATACAACAAAATGAACCAAAATAATTACAAATATAACAAAATGTCACTGTCTATCAATGATAGACATTGGATAGACTACTATCATCTATCCCTGATAGTCACTGATAAACATAGATAGATATCTATCAATGTTTATCACTAATAGATTGTGACAATACGTTATATTTTTAAATATTTTCAACAGTTTTACGATCTAAAATAATTTTTCTTTGAATATACAGTGTAACAAAAAAAAATTGTTATTTAAAGTAAATTTTGTTAAAAAAAAAATGAAAGATATAAAAATATATTGTTAAATTATAACCACAAAAAAAAAAAAAAAACCAACCTTGAATATTCAACATTTGTTTAAAAAATATCGCTATTCCTTCCAAATTTTCAACCTGATCTTTTATATACATTTTTAAATTACCACTAAAAACAAAACCATTTTCAATGACGCATAAAATATGTTGCTGAAAGCTAAAATACGCTACTAAACGTATTAACAACGTGTAAAGGTGTGTTGCTGCATATATTGCATAGTCGCGTAGTCATAAGTTTTAGTGATAAATTCCTCGCGCGTTACTAAAACTTAACATTTAGTGACGCTTACGAGTTGCTGAAAGTTTATTTTTAGTAACGCTTAGTATGCTGATATTTGTATAATCTAGTGACATTGTAAGCTTGTCTTTAAAAGTGTGTTTTTAGCACATTAATCTAGTTCAAAATGATTCAAAATGGGCTAAATACTTACCAAACTTACCCAAACAACCCCAAAACCTTGATAGTTGGCTTTAAATTAATTTACAACATTTAGTAATGGTCTACCACCTAAATCTTACCGGAAAGAGTTTAGTTCTTTGCTTAAATGAGTACAAAGGTGTCCAAAACTAGTATTCACCTACAATAAGTAGTTCTCAAGTGTTAGGGGACAATTCTAAAACAAATTAATAGAGAAGCGTGGGAACAAGTCAACATGCTATACAATATCCCATCATCACTAG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ATGGCTATGAAAAAAGAAAGCTATATAAATATTATTGTCTTCTTCCTTAACTTTGTATTTCTTCTTCCTCTTGTAGTGGGACAAGAAGATGATAATTACACAACCAAACGAAGTGACTTTCCTGATTACTTTGTTTTTGGTACATCCTCTTCGGCTTACCAGTATGAAGGTGGTGTTGAAACAAGAGGAATAAATAATTGGGATGTCTACACTCACAAATACTCAGAGAGAATTGTAGACCGTAGCAATGGAGATATAGCTGTGGATGAAATCCATCGTTACAAGGAAGATATTTCCCTCATGAAAGAAACAGGTTTTAATATTTACAGGTTCTCAATTTCTTGGACTAGAATATTCAGAGATGGAACCCTCAAGGGAGGTATCAACAAGGACGGAGTCGATTATTACAATCGTGTCATCGATGAACTCATCGCAAATGGCATCCAACCTATGGTTACACTTTTTCATTGGGAAGTTCCACAAGCTTTTGAAGATGAATATGGAGGCTTCTTGAGTTCTCGAATTGTGGGAGATTTTGGAGAGTTTGTTGATTTTTGCTTCCAAGCATTTGGAGATAGAGTTAAACATTGGATCACTTTGAACGAACCAAATACTTTCGCCATAAACAGTTATGCAACCGGAACTTATGCACCAGGTAGATGTTCAGAATGGGAGTTTCATAATTGTCTTGGTGGGAATAGTGCCACAGAGCCGTACATAGTTGGTCACAACTTAATTCTTGCTCATGCTCGTGCTGTCAAAATTTATCGAGAAAAATATCAGGGAATACAACAAGGTGCGATTGGCATCACAGTGTTGTCAGATTGGTATGTTCCATATTGCAAGACCGATAACGCAAACATAGAAGCTGCAAGTCGAGCTGTTGATTTTCTTTCTGGTTGGTTCTTCACTCCAGTTGTCCATGGGCACTATCCAGAAAGTATGATATGGCGTGTAGGAGATAGATTGCCAAATTTCAATGAAGAAGAAAGAAGTTTTATTAAAGGAAGCTTTGATTTTCTTGGAGTGAATTATTACACATCTAATTATGCAGTAAATAATGAGCAACCTGTTCAACGTCCATCCTACCTTACTGATTCTGGTGCAATTTCTTTAAATGTCCCACAACTTGGCCCAAAGGTGAATGCATCCTCTTGGCTTGCCGTTTATCCACGGGGATTGAGAGATACGTTATTGGACATTAAAAGAAAATATAATGATCCAGTTATCTACATCACAGAAAATGGATATTATGAATATAACAATTCTGATGTTAGAGAACTAATTGATGATATGGATAGAGTCAATTTCTATAAGGAACATCTCTACTATCTTCATCAAGCAATCGAGGAGGGAGTAAGGGTAAAAGGATTCCTTGCATGGACATTATTGGACGATTTTGAATGGCAAGCTGGATATACAGAGCGCTTTGGCCTCACCTATGTTGATTTCAATGACAATTTGAAAAGAACTCCTAAGCTTTCACTAAAATGGTTCAACAAGTTCCTCAAGACTTGA MAMKKESYINIIVFFLNFVFLLPLVVGQEDDNYTTKRSDFPDYFVFGTSSSAYQYEGGVETRGINNWDVYTHKYSERIVDRSNGDIAVDEIHRYKEDISLMKETGFNIYRFSISWTRIFRDGTLKGGINKDGVDYYNRVIDELIANGIQPMVTLFHWEVPQAFEDEYGGFLSSRIVGDFGEFVDFCFQAFGDRVKHWITLNEPNTFAINSYATGTYAPGRCSEWEFHNCLGGNSATEPYIVGHNLILAHARAVKIYREKYQGIQQGAIGITVLSDWYVPYCKTDNANIEAASRAVDFLSGWFFTPVVHGHYPESMIWRVGDRLPNFNEEERSFIKGSFDFLGVNYYTSNYAVNNEQPVQRPSYLTDSGAISLNVPQLGPKVNASSWLAVYPRGLRDTLLDIKRKYNDPVIYITENGYYEYNNSDVRELIDDMDRVNFYKEHLYYLHQAIEEGVRVKGFLAWTLLDDFEWQAGYTERFGLTYVDFNDNLKRTPKLSLKWFNKFLKT Homology
BLAST of Clc03G15040 vs. NCBI nr
Match: XP_022988066.1 (beta-glucosidase 24-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 796.2 bits (2055), Expect = 1.6e-226 Identity = 357/482 (74.07%), Postives = 417/482 (86.51%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G15040 vs. NCBI nr
Match: XP_022960671.1 (beta-glucosidase 24-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 795.0 bits (2052), Expect = 3.7e-226 Identity = 355/482 (73.65%), Postives = 420/482 (87.14%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G15040 vs. NCBI nr
Match: XP_023516690.1 (beta-glucosidase 24-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 790.8 bits (2041), Expect = 6.9e-225 Identity = 355/482 (73.65%), Postives = 418/482 (86.72%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G15040 vs. NCBI nr
Match: XP_023516686.1 (beta-glucosidase 24-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 778.5 bits (2009), Expect = 3.6e-221 Identity = 349/487 (71.66%), Postives = 417/487 (85.63%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G15040 vs. NCBI nr
Match: XP_038880765.1 (cyanogenic beta-glucosidase-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 655.2 bits (1689), Expect = 4.5e-184 Identity = 310/499 (62.12%), Postives = 388/499 (77.76%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G15040 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B8AVF0 (Beta-glucosidase 12 OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=BGLU12 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 543.5 bits (1399), Expect = 2.5e-153 Identity = 259/502 (51.59%), Postives = 343/502 (68.33%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G15040 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XKV4 (Beta-glucosidase 12 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=BGLU12 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 543.1 bits (1398), Expect = 3.3e-153 Identity = 252/477 (52.83%), Postives = 336/477 (70.44%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G15040 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XKV2 (Beta-glucosidase 13 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=BGLU13 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 532.7 bits (1371), Expect = 4.5e-150 Identity = 251/506 (49.60%), Postives = 346/506 (68.38%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G15040 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5Z9Z0 (Beta-glucosidase 24 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=BGLU24 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 529.6 bits (1363), Expect = 3.8e-149 Identity = 246/476 (51.68%), Postives = 325/476 (68.28%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G15040 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A3RF67 (Isoflavonoid 7-O-beta-apiosyl-glucoside beta-glycosidase OS=Dalbergia nigrescens OX=298683 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 511.1 bits (1315), Expect = 1.4e-143 Identity = 246/473 (52.01%), Postives = 320/473 (67.65%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G15040 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JG58 (beta-glucosidase 24-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111485420 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 796.2 bits (2055), Expect = 8.0e-227 Identity = 357/482 (74.07%), Postives = 417/482 (86.51%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G15040 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H894 (beta-glucosidase 24-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111461391 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 795.0 bits (2052), Expect = 1.8e-226 Identity = 355/482 (73.65%), Postives = 420/482 (87.14%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G15040 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JKM7 (cyanogenic beta-glucosidase-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111485436 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 647.5 bits (1669), Expect = 4.6e-182 Identity = 297/495 (60.00%), Postives = 382/495 (77.17%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G15040 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HBR5 (beta-glucosidase 12-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111461398 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 644.8 bits (1662), Expect = 3.0e-181 Identity = 298/496 (60.08%), Postives = 386/496 (77.82%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G15040 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H9T3 (beta-glucosidase 12-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111461405 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 617.5 bits (1591), Expect = 5.1e-173 Identity = 281/404 (69.55%), Postives = 339/404 (83.91%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G15040 vs. TAIR 10
Match: AT2G44450.1 (beta glucosidase 15 ) HSP 1 Score: 504.6 bits (1298), Expect = 9.2e-143 Identity = 239/474 (50.42%), Postives = 319/474 (67.30%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G15040 vs. TAIR 10
Match: AT5G44640.1 (beta glucosidase 13 ) HSP 1 Score: 500.7 bits (1288), Expect = 1.3e-141 Identity = 243/506 (48.02%), Postives = 328/506 (64.82%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G15040 vs. TAIR 10
Match: AT5G42260.1 (beta glucosidase 12 ) HSP 1 Score: 496.5 bits (1277), Expect = 2.5e-140 Identity = 244/503 (48.51%), Postives = 328/503 (65.21%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G15040 vs. TAIR 10
Match: AT3G60130.1 (beta glucosidase 16 ) HSP 1 Score: 495.4 bits (1274), Expect = 5.6e-140 Identity = 248/502 (49.40%), Postives = 331/502 (65.94%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G15040 vs. TAIR 10
Match: AT2G44480.1 (beta glucosidase 17 ) HSP 1 Score: 476.1 bits (1224), Expect = 3.5e-134 Identity = 233/476 (48.95%), Postives = 318/476 (66.81%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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