
Clc03G14720 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCAATTCCTGCTGTGCTAGTCATCGTTCCTCTTGGTCTGCTTTTCATCCTCTCCGGCCTCATCGTCAATGTTATTCAGGTTTTTGGAGATTCCCCTTCTGTTTTCTTTTCCTCTATTTATCATTTATTATGGGTGGAACTGCCTTTTTCTGATTCTGGTTGAGTTGCGTTTTCATTTTCGTCTTTGCAATGAAAAAGGTTGAGTTATTTTCGGAATGGGTTTCATAAGATGCATTTCGGATGGGGGGTTGATCTTTCCGAAATCCTGATATGTTGGACTTTAATTCTTGATGATTTCCGATTTGCAAATTAGTTATGAATCTAGATTGTTTGAATCTGTAGCTGCTTTTGCACCTACTGTAATTGAAAATGGAGATTGGTTCATGCAGCTAAGACCCCTTTGATTACCATTTTTGTTTCTTTTTTCATTTTTTTTATATAATTATATATTTGGTTTCTTTTTTTATCCTAATATATCAAGAAGTCTTGTCTAAGAATTTTAAGAAAGTGAAGACGATAAAATTGTGAGAAAAAGAAGCATAAATTTCAAAATAAGAAAACTAAAACTAAAATCATTATCAAACTAGGCTTCAAATTTTTGTAGTTTGTTGATCGTTGTAATCCGGAGTGTGTTTTTGTACTAAAAAATATACAGGTTACTGTGATTATTAGCACATTTGTAGCATATTTGGGAGTGATTTTGAATTGGTTAAAAACAACTTTACTCGAAAAATGCTTTTAATCATTCAAAATCAATTTTGATGGTACTAAAATGCATCTAAGAGTGTAAAATTAAACATTGAATTGATTTTGAGTGATTAAATGTATGTTTCAATGTGATTTTAAACATGACTAAAAGTAGTTTTGGCAATTTTAAAATCACAACAAAACATGGACTAGAATAAGATGGAATCAATTATTTCCCCTCCTGCATATTGTTAAGCTTCTGTCAATCGAAGCTGTAAATTTTATTGTTCTGGATTTTCCATTCTGATATTTGTATTCGTCCGCAACTCAGTCTTTTACTCCTTAACTGGATTTACATTTAAGCTTGAGGTTATTAAGTCTCGAGTTCTAAACCGGTGCTAGATTATGCAGAAAATATATGTTAAGCCTTCGTTTGGATTGCGTAGAAAATATGTTTGTTAAGCCTGTATTTGGTTTCTACGTTTTTAAGCCCTTAACTTAAATGGATGCATATGTGTGTATATAAAATTGTCTCATGTAATTCATAAATTGAACTTTCAGGCAGTTGTCTTTGTTCTTCTTCGACCCATTTCAAAGTGTTTGTACAGAAGAATCAACAAAGTAGTTGCTGAATTGCTATGGTTGGAACTCATTTGGCTAATCGATTGGTGGGCCGGTGCCAAGGTGTCACGGTTTCTTTAAAATATGTTTGGTTCTTAACATGCATCTCTTTGCTATTGCTGATACAAGTCTGATACTAGTTACCCTTTTCCTCAAATAATTACTCTTTTGTGGTGAACTTCTGAGATATGAACTTAGAACATCGAACTACTAATATTAACCTAGATACAAGATCATTTTCCTAATTAGGCCATTCCTTGTGAGTTGAGTTTGCTTAGGTTGTTTTTATTTTTCTCATTACAGGTTGAGGTGTATACAGATCAAGCAACCTTCCAATTAATGGGTATGATATTAGAAAGTACATGTCGAAAACATCTATGAGTTACAACTAGAACATGATCTCATACATACAAATTTACAGGGAAAGAACATGCACTTGTTTTATGCAATCACCGTAGTGACATTGACTGGCTTGTTGGATGGGTCCTAGCTCAGGTACTTTAAATTTATGGCCATCGGTTTTTGGATATTTTCATTCTTCACCCTTATGACAGTAGATTATGTTAAGATCAAGATCATATTGTTTCTTCACTGGAGCTTCTTGAGTAGTCAACTTAAATAGATTAGGTCAAGTCTATCATATGTTTCTTTTTTGTTTTTCTTTGATTGTTTCAAAATTTACCCTTCTTGTTGCAGCGTGCAGGTTGTCTTGGTAGTGCCTTAGCCATAATGAAGAAAGAGGCAAAATTCCTCCCGGTAAGTATTAACTGTATGGCATTTGCATTAAATGAAGCTATAAACCAACTTGTGCATTTCTTTCAGCTGCATTATATCCATAAGGGCTCACTTTAAGAGTTGCAGCCTGACATTTTGTGAATAAACAGATTGCATGGGAATCATAGAGTAAAAGTTAAACGTGCATCATTAAAGTTCTAGTAGTAATAAGAAGAATCATGGTTGTTAGTTACTTCAGATTGTTCAAATAAAAATCTCATTGTCTTTTAAGTATGTATCCCTCCCATCACTTGACTTCGTGATTTTTAGTTAGTTGGGCATAACCAACATTACTTGACTCAATTAACCTCTCCAGGATTTATTACAATTCTAAATGGTATTCTATCCTTGGCTATATTTTGCCTATTTACTTGGTGGAGCCCAAGAATGAATGTCTTTTTGTGGGGCTAATTTTTTCACATGAAAGCCTAAACTTCTAAACTCTTTTCCCCTCCTCTTGTGTAATTCTAGTTTCCACTAATAATTTATAGATTCTACTAGTTTTCCTATTTCACGGGTTCTCTTTATTTACCACTTTAAATAATGGCTGCAAAAATTTTCTTACCTAGTTGTCTGAAACACAAATATCAAATGAGCATAACTCAATAGTAATTGACATGAGCTTCTCCCCTTGAGATCGGAGGTTCAAATTTTCATATTCCCATTTATTGTAATAATAAAAAGAACACCGATATCAATATTTTCAGGGGTTTTTAGTTGTCAATGTTGGGATTCTGGGTTTGTTCATAATCTCTTTCAGTTCTATTAGTTGAGTTTCTTTAAGAATCTGTGTACTAACTGACAAAAGATATCATGCTACTGTTGCAGGTCATTGGCTGGTCAATGTGGTTTTCTGATTATATTTTTTTGGAAAGAAGCTGGGCCAAGGATGAAACCACTCTGGAGGTGGGCTCATATGCTTGCAATAATAGTTACTTTAGCATTTTGACTCACCCTTTCCCCTTCTTTTCTAACATAAAAGGATTTGTATTGCAGTCAAGCTTTCAGTCGCTCATGGATTTTCCCATGCCATTTTGGTTGGCACTTTTTGTTGAGGGAACTCGTTTTACACAACAAAAACTTCTAGCTTCTCAGGAATATGCTGCATCTAGAGGATTGCCTGTCCCTAAAAATGTTTTAATTCCTCGTACAAAGGTGAGTTGAATGTTCCTCTTCTATTACAAGTCGAAAGCTGGGATAAACACATTAAGTCTATCATTTTCCTTACTATCAGCCTATTATTTTCAGGGTTTTGTTTCGGCAGTGAGTCATATGCGTTCGTTTGTTCCGGCTATTTATGATTGTACAGTGGCCACTTCCCCAAAAGACCGCCCTCCTACATTGTTGAGGATATTTAGAGGCCAATCTTTTGTGGTAGGCCCACAAACCGTAAAGAATAATTATTGCCTGGTTGATAATCCGTATAACAAACATGGTTGAGGGGTTGGGTAACCATTTGATTTTAAAAAATTAAGCTTATAAACATTTCTTTCATTTCTGTGTTTTTTGTTTTATTATCTAATTTCTACCAATATTTTAAAAAATCGAGACAAGTTTTAAAAAGAAAAATAATTATAAATAGAAAAAATATTAAACTATTTACAAATATAGAAAAATTTCACTTCAGTGATAGATCGCAATACACTTCTATCACTGATAGACAGTAAAACTTTTCTATATTTGTAAATAGTTTGACTCATTTTGTTATATTTTGAAAACAACTCTTTTAAAAGCTAAAAAAAGTAGTTTTTAAAAATTTGTTTTTTGTTTTTTGAATTTGGCTAAAAATCCAACTCTCTCACCTAAGAAAGATGAAAATCATAGTAAAACAATTGAGAGGAAATAGGTTTAATTTTCAGAAACCAAAAACAGAAAACCAAGGTCCTGTGTGGTTACTATTTCGTTTTTTTATTTTTATTTTTGAAAATTAAGCCTATAGACACTACTTTCACCTCCAATTTTCTTCATTTGTTGTCTAGTTTTTACTAATGATTTAAAAACCAAGCAAAATTTTGAAAACTATAAAAAGTAGCTTTTAAAATTAAAAAAAGTAGCTTTTAAAATTTTGTTTTTGTTTTTGGAATTTGACTAAGAATTCCACCATTGTACTTAAGAAAGATGCAAATCATTGTAAGAAATGTGGAGGAAATAGGCTTGATTTTAAAAAAAAACCAAAAACAAAAAACGAAATGGTTACAAAATGAGGCTCAAATAGTTATCAAATGGGATGATGAACACTTGCATTGTTTCTCATATTATTTACTAATTCAAGATAATACTTATCCTTGTTCATGAAGACAACAATCACCTATTCATCTGTTTAATGACTGAATGGCTCTGCTCCTTTGGGGTTTGTGTTATGTTTGTTTCTGCTTTCCTGTTGCAACTTGCTTCAATGAAATATGTGCCGTTATAAAAGATGTGGTCTCCTTCCTAATGTGGAAGTCTTTCAATTCCTGAATCCTGGACATGGCCGAAGGTGTAGACTATTTTAATTCTATCTGTGTAATTAAAGCATTAAAAGATTCTTAGCAAGTGAGCAAAGATTTGAGCTGTGTTGGTTGTGTCGACAATAGTTCAAATGAACTGGGCTAGTTATCTAGTTATGTTGGTGCTAGAATAAGAGCATATTAAAACTTGATACTGTGATTTTAATCAATACTTACATTTGTATGAACAAACTGATTAGGTTTTGTATCTTCCGCAATAAAAAAAAAATTATACATCTAAGGTGTCCCCATTGCACAGGTAAAAGTGCAAGTCAAGCGACACGAAATGCAGGAATTACCAGAAACTGCTGACGGGATCTCACAGTGGTGTAAAGATCTTTTTGTTACCAAGGTATGGGGAATAATTGATATTATGACATACATATTATGATTGTCAAGAGAAAAATGTTGGAAGCAGCTT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BLAST of Clc03G14720 vs. NCBI nr
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BLAST of Clc03G14720 vs. NCBI nr
Match: XP_004139036.1 (1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase 2 [Cucumis sativus] >KGN66490.1 hypothetical protein Csa_007675 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 707.6 bits (1825), Expect = 1.5e-199 Identity = 359/376 (95.48%), Postives = 364/376 (96.81%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G14720 vs. NCBI nr
Match: XP_008450418.1 (PREDICTED: 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase 2-like isoform X1 [Cucumis melo] >KAA0056311.1 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase 2-like isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 707.6 bits (1825), Expect = 1.5e-199 Identity = 358/376 (95.21%), Postives = 365/376 (97.07%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G14720 vs. NCBI nr
Match: TYK18854.1 (1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase 2-like isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 705.7 bits (1820), Expect = 5.7e-199 Identity = 357/376 (94.95%), Postives = 365/376 (97.07%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G14720 vs. NCBI nr
Match: XP_022967645.1 (1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase 3-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 698.0 bits (1800), Expect = 1.2e-196 Identity = 345/376 (91.76%), Postives = 368/376 (97.87%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G14720 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9XFW4 (1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase 2 OS=Brassica napus OX=3708 GN=LPAT2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 499.2 bits (1284), Expect = 1.1e-139 Identity = 240/368 (65.22%), Postives = 295/368 (80.16%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G14720 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8LG50 (1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LPAT2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 498.4 bits (1282), Expect = 1.8e-139 Identity = 239/368 (64.95%), Postives = 291/368 (79.08%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G14720 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6IWY1 (1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase 2 OS=Brassica oleracea OX=3712 GN=LPAT2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 493.8 bits (1270), Expect = 4.5e-138 Identity = 242/382 (63.35%), Postives = 301/382 (78.80%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G14720 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SYC8 (1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LPAT3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 490.0 bits (1260), Expect = 6.5e-137 Identity = 236/364 (64.84%), Postives = 287/364 (78.85%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G14720 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q41745 (1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase PLS1 OS=Zea mays OX=4577 GN=PLS1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 486.1 bits (1250), Expect = 9.3e-136 Identity = 235/376 (62.50%), Postives = 301/376 (80.05%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G14720 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7URX8 (1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold2116G00200 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 707.6 bits (1825), Expect = 7.3e-200 Identity = 358/376 (95.21%), Postives = 365/376 (97.07%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G14720 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LXC0 (1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G613620 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 707.6 bits (1825), Expect = 7.3e-200 Identity = 359/376 (95.48%), Postives = 364/376 (96.81%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G14720 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BPU8 (1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492029 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 707.6 bits (1825), Expect = 7.3e-200 Identity = 358/376 (95.21%), Postives = 365/376 (97.07%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G14720 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3D5M2 (1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold204G00520 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 705.7 bits (1820), Expect = 2.8e-199 Identity = 357/376 (94.95%), Postives = 365/376 (97.07%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G14720 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HV27 (1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111467086 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 698.0 bits (1800), Expect = 5.8e-197 Identity = 345/376 (91.76%), Postives = 368/376 (97.87%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G14720 vs. TAIR 10
Match: AT3G57650.1 (lysophosphatidyl acyltransferase 2 ) HSP 1 Score: 498.4 bits (1282), Expect = 1.3e-140 Identity = 239/368 (64.95%), Postives = 291/368 (79.08%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G14720 vs. TAIR 10
Match: AT1G51260.1 (lysophosphatidyl acyltransferase 3 ) HSP 1 Score: 490.0 bits (1260), Expect = 4.6e-138 Identity = 236/364 (64.84%), Postives = 287/364 (78.85%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G14720 vs. TAIR 10
Match: AT3G18850.1 (lysophosphatidyl acyltransferase 5 ) HSP 1 Score: 147.5 bits (371), Expect = 5.6e-35 Identity = 84/266 (31.58%), Postives = 134/266 (50.38%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G14720 vs. TAIR 10
Match: AT3G18850.2 (lysophosphatidyl acyltransferase 5 ) HSP 1 Score: 147.5 bits (371), Expect = 5.6e-35 Identity = 84/266 (31.58%), Postives = 134/266 (50.38%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G14720 vs. TAIR 10
Match: AT3G18850.3 (lysophosphatidyl acyltransferase 5 ) HSP 1 Score: 147.5 bits (371), Expect = 5.6e-35 Identity = 84/266 (31.58%), Postives = 134/266 (50.38%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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