Clc03G12650 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCTGAACTTCACAGCATTCCCGTACGAACCAACAGGCGAATGCACAAGCAAGGACGACGAAAAAATATCCGTATGGGATGCCATGTACACCACCCGCTGCTGCCGCAACGCCCTCAACGCCGCTGCCAAGGCTTTAGCCCTAAACCTCAATGCCGGCAACGCCACCACATCCCTATTTCTTTCACAGCAGCAATGGGAGAACTGCAGTGGCCCCTTCTCCCGCCAGCCCTCCGTCTCCCTCGAGGGCTGCGGCCTCCAGAGTTTGTACACCGGCGGCAGCCGCTGCTCCACGCTCCTCTTCTTGCCTAAGCTCCTGCAGAGCAAAGTTTACGAGGCGGCGGTGCAGAACTGCTCTGGGTTTGCAGCGGCGGAGTTTGATGGGGTTTGCGGTGGCTGTTTGGCTGCGGTGGCGGAGGTGAAAAGGGCAATGATGGATGATTTTGGGGTTAGGGGTGATGATCAAAATGAGAATGGTGCTTGTGGGTTTGCTGCTGTTGTTGCCGTTGCCGCTGGTAGGATTGGGAATCGCTCCGATTTTGACGGCTTATTCCAATGCTTGCCGGCTTTGGACACTTCTAGTAAGTTGTTGCATTTTTCTAAAAGAAATAAAATTAAAAATATAGTTAAATTGTAAATTTGGTAATTTGTAATTTGATGTTATTAATTTGGTTTATTTTTTTTTAATTTCTTAAACATTTTGATATTTACGGTACGAATGGTTTTAAATAATTTGTTTTTATAGATTGAAAGCCTTTTTCTAATCCTGTTTCTTTTTTGTTTGGCTCTAGTATCAACTTCCGGCTACTTCAAAATCAAAGGTACGTATTATGGAATTGGCATTATTAATTCTGTATGTATTCTTCTTTTCCATAAATATCCAAAGTTTCATATCATCAAAAGATTCACCAAGAAAAGAATTCAAATTACCATTTATATATGTTATTTTTTATAAAATATAAGTGCGTTGTCCTTTAAAGTTGGGTTGAGTTGAGTTGGAATGTCTATGTTTGTGGTGTTGAGTTGAGTTTGTGTTTTGGATGCATACTTATGTTGGGTATTTGGTGCAATTTTTCTAAACAAACTGGTTTTATATATTTTTTTTTTTGCTTTTTTTTTCTTTTTAATTTCTAACTGTACCACCCATTGGAATAAAATTTTTAACACTAAAAATGCTTAATTTTTTCTCATTCTTAAAACATAACAAAATCATACAAAGTAAACATATAATAAACATAAATTTGGATTGCAATTTTTCAACATTCAATCATGAGTTAGGGTATTTGGTGCAATTTTTTTTAAACAAAATTGATTTTGTCTTGGATTTTTTTTCTTTTTTTTTTGCTATTTTTTAAAAATTTCAAGCTATACACATAATTTCCTAAAATTTTAACGCAAAAGAATGTTTACTTTTTTTCCCATTCTTAAAACATACCAAATTCCTACAAAGTAAACATATACTTACACAAATTTTGGATTCAATTTTTGAACACTCAATTACATAACATTTTTTTTCCACTCTTAAATACCAAACATATGCCAAATAAATGAAAACTTTTCACAACTGCTTAACCCTCAGTCATGAACACTGAAGAAACTTAAAAGTTCAATGAAATTTTTGTTTTTCCTTTTTGAAAAATGTAACATATCTTCACTACACAATTTAAACATTTAATTGCATAATAATTTTATTCACATCCCTAAAGACATGTCATGTTCCTATAAAATGAACATTTTCTCTACTCCCCAATTAACCTTCAATTTTTAACTAAGTTAATTTTAACTCAACCATAAATATTAATTAAAAAAAACCAATTCTTATTATTTTTTTTTTGTCCATCTGTAAAATATGAATTTCAATTTTTATGGTTAATGGTTTTTTTTTTTTCCTTTTTTGTGCAAACATTTGATTCTTTACATTTACACTAATACAAAAAAATAATTTTTTTTTGTGCATCGTTTTTTGCAAACATTATTTTGTTCAATGGTTAGTTTTTATGGTTAAGTCTAGTTTACCACTTACAAATGAAATACTAGAGTCCACGAAAATGTCTATGTATATAAATGCTTACAAAAGAATAACACTTAATGGGGGTTTTCACCGAAGTTATCGTCGGAGGTGATTGTTGAAACCCGAATTTGGTCATTAGAGTTAGTTGCATGAATGTGATAATTAAAGTTGGTAGATCAAACATAAAAGTTGATTATTTTTACCAACTCAACATAATTATGGTAGTGAAACAAACACCTCCTAGAAGAATACGTATTTTTATGTCCCTAGATATGCAATAATAATAGTAGTGTGGTCTAGCGGTTAAATTGGCGCGCTTTTAATTTCCGTCCTCGTGTTCTAACCTTACCTCAAGGCAATTGTTATTTTCTCCTTTTTACTTTTCCTTTTTATTATTATTTTTTATTTTTATACATCTTAATATATATTATTTTACTTCTTAACTTTTAAATTACAATGAATTTAATTCCATTTTGATTTTTCTCTCCTACACAAATATTTTTGAATCTTTACAAAATTATTTTATGAATATTGATGGGATGATATATTTTTTTTATGTATGTTGGTGAATAATTCTCTAAAAATTTATAATAATTTTGTAATTAGTATTATTTAATATAGATATTAAATATCAGACCATTTAAAATTACATTTTTATGAATCTTAAATTACAAAAGTTTAGTCCCTATATTTCAAAACATTTTAACTAATAAATCCATAAACTTTCCATTTGGATATAGTCTCTTAAAAATGTTTAATAAATCTATATTAAGTATTTCACTTTTATATCTAATAGATATTAGAAATATTAAAAATGTTTTGAAAAGAGATCGTCCTATAAAACAAGAAAAGAGAAAAAGTTTTATATCTATTTGGACCTTAATTTTTAAATTTTGTAATTAATTGATAATGCTTAATTGTATATATTAAGCACAAAGTTAAATTTAATGTCTAATATAACATTTAATTTTTAATGTTTTCAAATATGTAAGACACTTATTAGATGCAAAATTCATATTTTAAGAATCTATTAAAATAAAAAAATAAAAATTTAGAGATCCATTATACATTTTTGTAAAGTCTAGAAACTATATATAAACACAAATTTAGAAGCTCGGACTAATCCTCTCACCATATGTAATTGTGCCCCTCACAAGAAGTTATAGATCCACCACCGCTTTAAATAGAGTAGTTATTCTCCCTTTTAGCGGTTTAGAAAAAAAATAGGAACTTTAGACTAGAGAATTCACTAACTATTAGTACTCCCTGAGCTCCTAAAGGGTGAAAGATCCTTGAAGACTAGAGCTATTTGATATAAGAAACATTCTTGTCAGACTTGAGCTTGAAAAACATACAAGGAGTCTATCTCTAGAGTGAAACATACCTCCTAAGCAAGAGAATTATTAGAAAATAATATAGGAATAAACATGAAAACATGACGCATGGTTTAAAAGTCATTTCAAGTTATTTATAATTGCATTGTTCTAGTCCTTCAAATAATTTCCTACCATTCTAAAATTTGACAGATTCAGTAGCAAAGGCCATAGTGGCAGCCATAGCGGTCGTGGTGGTTCTGCTACTCATCGTCCTCCTAGTAAAGCACGCTAGCAAGAAGAAGAAGAAGAAGGCTAAACCATCGGCCTCAAACGACACATCAATGTGGTCGGGACTGTATCGGTTTGCAAAGGAGGAGATCGATAGGGCACTTGACTTCGGGAGCGAGAGGACCAGCCTAGGGAGGGGCAGCGCCGGGCAGGTGTACAAGGGGATACTGCCCAGCGGACAGCAGGTAGCCATTAAAAAGATATTCCAGAGCAACACGTCGGATTCATTCATTAGAGAAGTTGAAGGGCTGTCTAGGGTTCGCCATCCAAATTTGGTGTGCCTCTTGGGGTGCTGCATTGAGAATGGGGAGCAGTATCTTGTGTATGAGTATTGTGAGCAAGGCAACCTGGCTCAACATCTCTTGAGTAAGCATTACCTTCTCTAATTTCTTTCATTATTTTTTTAATTATCTTTTTTATTTTCTTTTAAGAAAAATTTTGTTTTTCATTTCTTTAATTTCATCAATTTAAACCTCAAATTTAGTAGATTATATCAATTTCAACTTTAAACTTTCAATTTCTTCAATTTACACATTTGATTAAGTCTCATTAGAATTAAAATTAATACAATATCTCAAGTTTGAGGTTTAAATTGTTAAAATTGAAAGCTTACAAAATGTTAAAATTGATACAATTTGTTAAATTGATAATTAAAAGTTTAAGATTAAAATTGAAAAATTCTTGAAAAAAGATCACAAATGATGGTATAATTTTGTACATAAATTGGATTGCATTGTTGCAAGATTTCGTTTTCAGTCAAAATTAGTGATTTATTGACAGAGTGTCATGGTACAAAATTGTTGGGACTACAGCAAACAAAACTATATATTTTAAAATTTAAAGTGAGATTAGGTAAATGATAATTAATTGACTTGATGTTGAAAGTTTCATCCTATTAAATTAATTTTTGTAACAGACTTTATTATTTATTTATTTATTTATTTTTAATAATATAATGAGTTTAGAGAGTTTTAGATTGTTTATGCATGTGTTCAAATCTAAAAACGAATGTTTTGGGAAAAATATATAAACTGTTGAGGAAATTTGGAGTTTGGGAGTATATTGATGAATAATAACCCAAGTTAGGTAAAATATAATGTGGATGTTTCAGGAAAAGACACAGTTCTAACATGGGAATTAAGAGTAAAGATTTTGAGAGATTGTGCGCTTGCACTGAGGTATCTCCATCTACGTGTTGATGGCTGCATTGTCCATAGAGATATTAAGGTAACATCTTAATCTCATTCTAATTTCTTTACGTTTTAAATCTTACAAAAGTAATTTAAAATTTAAACACACCGTTGGATATTATTTTATTTTTCACTTTCCAAAACTCTGTTTCTTTTTTAATTTTTTCCAATAATATTTTTCATGTTTTTG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BLAST of Clc03G12650 vs. NCBI nr
Match: KAA0038318.1 (cysteine-rich receptor-like protein kinase 1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 931.0 bits (2405), Expect = 5.3e-267 Identity = 464/542 (85.61%), Postives = 499/542 (92.07%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G12650 vs. NCBI nr
Match: KAG6588290.1 (Cysteine-rich receptor-like protein kinase 3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 884.4 bits (2284), Expect = 5.7e-253 Identity = 437/543 (80.48%), Postives = 488/543 (89.87%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G12650 vs. NCBI nr
Match: KAG7020852.1 (Cysteine-rich receptor-like protein kinase 3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 883.6 bits (2282), Expect = 9.8e-253 Identity = 437/543 (80.48%), Postives = 488/543 (89.87%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G12650 vs. NCBI nr
Match: XP_022927539.1 (probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g49770 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 877.5 bits (2266), Expect = 7.0e-251 Identity = 438/551 (79.49%), Postives = 488/551 (88.57%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G12650 vs. NCBI nr
Match: XP_023003119.1 (probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g49770 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 873.2 bits (2255), Expect = 1.3e-249 Identity = 436/551 (79.13%), Postives = 486/551 (88.20%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G12650 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LT96 (Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g49770 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g49770 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 206.1 bits (523), Expect = 1.2e-51 Identity = 137/384 (35.68%), Postives = 204/384 (53.12%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G12650 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8GZ99 (Leucine-rich repeat receptor protein kinase HPCA1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=HPCA1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 204.9 bits (520), Expect = 2.7e-51 Identity = 137/392 (34.95%), Postives = 206/392 (52.55%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G12650 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LMB9 (Cysteine-rich receptor-like protein kinase 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CRK1 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 201.1 bits (510), Expect = 3.8e-50 Identity = 123/340 (36.18%), Postives = 190/340 (55.88%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G12650 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9CAL2 (Cysteine-rich receptor-like protein kinase 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CRK3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 200.7 bits (509), Expect = 5.0e-50 Identity = 128/332 (38.55%), Postives = 192/332 (57.83%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G12650 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SA25 (Wall-associated receptor kinase-like 8 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=WAKL8 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 198.4 bits (503), Expect = 2.5e-49 Identity = 112/302 (37.09%), Postives = 178/302 (58.94%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G12650 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7T626 (Cysteine-rich receptor-like protein kinase 1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold270G001880 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 931.0 bits (2405), Expect = 2.6e-267 Identity = 464/542 (85.61%), Postives = 499/542 (92.07%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G12650 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EIA4 (probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g49770 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111434334 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 877.5 bits (2266), Expect = 3.4e-251 Identity = 438/551 (79.49%), Postives = 488/551 (88.57%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G12650 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KSD4 (probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g49770 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111496822 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 873.2 bits (2255), Expect = 6.4e-250 Identity = 436/551 (79.13%), Postives = 486/551 (88.20%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G12650 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DDZ1 (probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g49770 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111019897 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 866.3 bits (2237), Expect = 7.8e-248 Identity = 437/552 (79.17%), Postives = 483/552 (87.50%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G12650 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BA67 (cysteine-rich receptor-like protein kinase 1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103487474 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 746.1 bits (1925), Expect = 1.2e-211 Identity = 379/418 (90.67%), Postives = 393/418 (94.02%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G12650 vs. TAIR 10
Match: AT5G49770.1 (Leucine-rich repeat protein kinase family protein ) HSP 1 Score: 206.1 bits (523), Expect = 8.5e-53 Identity = 137/384 (35.68%), Postives = 204/384 (53.12%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G12650 vs. TAIR 10
Match: AT5G49760.1 (Leucine-rich repeat protein kinase family protein ) HSP 1 Score: 204.9 bits (520), Expect = 1.9e-52 Identity = 137/392 (34.95%), Postives = 206/392 (52.55%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G12650 vs. TAIR 10
Match: AT1G70530.1 (cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 3 ) HSP 1 Score: 200.7 bits (509), Expect = 3.6e-51 Identity = 128/332 (38.55%), Postives = 192/332 (57.83%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G12650 vs. TAIR 10
Match: AT1G16260.1 (Wall-associated kinase family protein ) HSP 1 Score: 198.4 bits (503), Expect = 1.8e-50 Identity = 112/302 (37.09%), Postives = 178/302 (58.94%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G12650 vs. TAIR 10
Match: AT1G16260.2 (Wall-associated kinase family protein ) HSP 1 Score: 198.4 bits (503), Expect = 1.8e-50 Identity = 112/302 (37.09%), Postives = 178/302 (58.94%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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