Clc03G06440 (gene) Watermelon (cordophanus) v2

Overview
NameClc03G06440
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus cv. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationClcChr03: 6136618 .. 6141262 (-)
RNA-Seq ExpressionClc03G06440
SyntenyClc03G06440
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGAATTTGGATATTTCCAAGACAACTACCAACGGTATGCTTGTACCATCGGCAAAAAAACGCATTTATGGCGCCAAAAATAGTGGCATCGGTGGAGAGTTTCAACAACTGTCGATGACAATAAAGGGCTGTCAGCGGAGGACAGATCTACCGACGCCACTATTATTGGAGTCGGTAGATCCTAAAATTTTTTTCCCATATCTCTCACACGAGACCCTGATCTCCTTCCTCTCTAATCCCTAATTTTTCCATCCCTCTTTCTTACGATCCTAGCCGTCTCCTCGATCCCTTCAACTCCACCGTCGTCTCTCTCTACTTCACCCAACCTGTCGTCCCCTAGTCCCCTCTCTCTCTCATCCACTGTCGACGCCCCCTTCTCGCTCTCCTTCACCCACCATTGCCGCCCCGTCCCCTCTCTCACTTAGCCAACCCACAGATCTGCCGGTTGCCGCTTCCTCCATCTCCTCCAACAAGATTCGTCCCTCCCTCCCTTTTCCTCCAAAATCATTGTCGCCATCGGTAGTGATTTACATTTGTGGTGTAGTTGTTTAGATTTATGGCTCGGTTATTTTTTTTTGTTTTGGCTGTTTAATGTTCAAGACTTGGGGATGTTATTGAAATTTTTTTTGGTGTAGTTTATATTTGTGGTTGATTATTGTTGTTTATGATTTTATTTTGTATTTTTATTAGAGCTTGTGGTTAAATATTATTAGTGATTCTTGTTATCTTAATTTTGTGGTTAATTTATAGTTGAAATTTTAGGTTTTTTTAGATGTGTGAATGTTGTTGATTAATATTATTGTTGTTTATATGTTGGACTTACCATCTTTGGTTGAATAATATTAAACCACGAATGTATGAATTTTAAGATTAAGGAATTGTTCCTAATTTGTATAATTAGAAAGATAAATTCTCATTTCTTCCTTTTAATTCTCACCAAAAGCAATAGATCAATATATTATATATTTGTCTTAAAAATGTGGGACAATAAATGTTAGTTGAGTTGTTGTTTAAAAATGGGAAGTGATGTTACTTGTTTTGAAGATGTGGGATGAAATGCATGTGGGTGTATGTTATTTTCTTAAGTTTGGTGTGAGAGTTTTTGTTTCAATTGGGTTGATATGTTTGTCTTAAAGTTGGGATGAGCGTTGTTTTATGGTTTATTTATAAGTTTAAATCCATATGTTGTATAGTTGTCTTAAAATGTGGGGTGATCAATGTCGGTTGAGATGTTTAAAGATGGGGAGAGATGTTATTTGTTTTGAAAATGATGGATGAAGTGCATGTGGTGTATGTTATTTGTCTTAGGTTTGTTGTGAAAGTTTTTGTTTCAATGTGTGTTGATAATGCTTGTCTTATAGTTGGGATGAGATGTTTTATAGGTTTACATGTTATTATAATTCTCCATTCAACGTGGGTTTAGTTTTTTTAAAAAAAAATTTATTGTCGTTTCAATATATTGTAGGGAAACGTTTATTACAAGTCTAGATGTTTTTAATATTTCAAGTTGTTCTTGTAAATATATATAGATGAAAAGTTGTTTTTATGCATATTGGTTGTTTTTTTATACTTTTTTGTTATCAACTATATCTAAACTTGGCTTTTGTTCTTGATTTTTGTTGTTTTATTGTTTTTCAAGGCTAACATTCAATGAAGATCACTTAGCAAGACAAACTTTTATTTTCGTAATTTTTTTTTAGAGATCCAAATCAATATGTCTGTTTTGAGGACCAACTTAGTATTTGTTAATGTAACTTTATATGTCAAACTTTTTTTTATGTGTTATTGGTCTTTTTTTTATTTTTTTTTATTTAGGAGTTATATCAAACCTTAGTAAGACGTTTAACACAATATTGAATGAATTTTCGTTAGTATTTGACATATTTTGTTTCCTATATTAGGTACAAATTGAAAATAGTTTATTTTTTTATTATAAAAAAATATAGGGATATGTCAGTGCCTTATAATTGATATGCCAACAGAAAAAACTAACTATCGGCATATAAGATCAGTCAACGCAACTATTTGGCATTAGAATATTCCACATTTGTCGATGAATATCTTCAATCATTGGCATTTAATAACTGTCGATGCCATATGTTGGCATCAACGTAGATACCCTATGCCGCGGGATACCGTCTTTGTTTCATTGGCATAGGTCGCATTCTATTGTCCTCCCCTTGTCGTCAACAAAGGCTGCCTAAGCCAACGCTTCTTTTTGTGTTGACATAGCCTTTACCGACTGACTTATGCCGACGGTTTTTGCGGACTCTTTTTGGCTTCGGCAAATAGTTTGATTTTTGTAGTGCCATTCTCGACAAACTTTAAGGATCACTATAATTTCTCTTTGATTTGAAGAGCTCTGGATTGACACTCATTCCTAATACCATGTGTCATGACATCGAGAAAAATCTCATATGCCAGACGTCACATAATTATAGATTCGAGAGATGACTTAATCTGTTGACAGCCAAAGTCAGCAATAACTATATACATATATATTTTATGTATAGAAAAATTAAATTCAAATTTTCAATCATAGTACCTAAATAATCAAATCTTTTTGATACAAAAATAATACTAAAATTTTGTACTACCACAAACGCTTGAAATGTATTGTTTGTATACGAAATATAACAAAAACAAATTTTTAACAAATTTCATAAGCACCATCCCCTCACTTGTCCATACAATCACCTCTATCATAAAACCAAGCAAACAATATAACATCCCACTCATAGTACATATAACACAATAACAATGTTCAAAGTGACACTCCTCACTTGACCCCACCCCCACCCTTTTAACTAATTTCAAGCATATCTAACACTCAATTAGACTTAGGATTAAAAAGTAACATAAGTCGAACACATATATAACTAAAACCATTAATATAATCCTCTCACTTGACCCCAATCCATCCCTTTTAACGAATCTCAAACATAACACTTGTAGCCACCCCCACACTCAAACACATTAATCTACCTATCACATTTATCATAAAACCAAGCAAAAAAGGCTACCATAACTATAGGTTTGTGAGGCTAAATATGTTGTTCGTTGAAACGAACGGTAGACGACCACGTTTTTAAGGCCGAAATATCAAAAGGCCAGAATAAATTTTGAGAAAGAGAGCATGCGCGGTGGTATGCTGAAGAAGAAGGGTGCATGTGCCTCGGGAGATTTCTGAAGTCTTTCGATTGTACATGCAGCTGAATCGAGAGTATTAATATCTCCTAATCATTTCTATATGGTGTTATCAGACCTTGGACAACTCTCAACGATTCTTATATATTGTCGGGAGATAATGCCTCTTCTAAACATCATTTTTCTGGCTATGTGTATAAAACATATGGAGAACATTTTTTTTTATTTCTTGTAGTAGTTAATTTTCACTCTAGACAAGAAACCATTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTAAAAATTGTTAAATTACAATACACTATTAAACTTTCAAGTTGTCGCATCTATTTGATTATTGTATTTTAATTTTCTATAACATATAATCTTAAGACATTCACATACACGAAATTGACAAAACAAACATAGTAATCTGAATGTTTTCAGACATTCTTAAAAATTATTCGTTTAAAAATAAACACAATAATCTAAAATATTGTGTATGTAGAATTTTAGACATATGAAGATTATAGATTTCTAGAAAAATAAATTACTCTTTAAAGTAGAATTACGAATATTATTGAAAAGAACCGGAGATAACCTCCAAATTAATGACAGAGACAAAGGGTAGGATGGAGACCTAATATCCCCATTGGAACAAGATAGAGAATCTCTCTCGTCTATGTGTGGTCCATTATTATAAATTTATTACACACAAATTCTAAAATTTCAAAGAAACTAAATTGTAATTTAGCAAATTTTAGGAGAGAGAGGATGTTAGGTTGTCAAAATATTTGTTGTGGACTAGGAGATCGTTGATCACATCAAATCAACTTGCCCGTTATGACAAAACTTTTATTAATTTTTTTTGTTTTTTTTTGTTTGTGGCTTATAATGCAAAAATATACCATCAAGCTTACCTAGTCCACAATCCATAAATCTCATAAATTTTATAAGATATATGAGATATTTGAGCGTAAGCCAAGTTCATCCATCTTCATGCATCTCCTATAAAAGAAAAAAAAACTTAAAGAATAGTTTGCCATATGGTAACTTATGATCATTAGAAAAATTCCTAGGTAGGTTGGAAAAATTTTACTATACCACAGTAGTATGAACAATTTTTCATTCTACTTCCACTTTGTCATGTCAATGTGCGTTTAAAAATAGATGGGTGATAGCACCTGAAATGTGTTATCTTCCTCATCTTAACTCGAGATCGTTGTACTATTTAATGTGTTAAAAATATTATTTTGTAGGTTTCGAGCACTTAACAGGTAGAACAGGGCATTAGCGATGAAATGGAGCTGAAAGGGACCGAAACAGAGTCCTATTGCATCAACTGGGAAAGAGAACTCCAGAGAGACCAAATTGCCCCTGAAGCAACAGCACAACAGCGCCACCTAGACGCCACAACAACTCTTTTTCCTGAGTGCATGATCTTTGGTGAAGTCTATAGCGCACGTAGGCACAACAGCGTCACACGCTCCAACAGGTTTATAAATTAA

mRNA sequence

ATGAATTTGGATATTTCCAAGACAACTACCAACGGTATGCTTGTACCATCGGCAAAAAAACGCATTTATGGCGCCAAAAATAGTGGCATCGGTGGAGAGTTTCAACAACTGTCGATGACAATAAAGGGCTGTCAGCGGAGGACAGATCTACCGACGCCACTATTATTGGAGTCGCCGTCTCCTCGATCCCTTCAACTCCACCGTCGTCTCTCTCTACTTCACCCAACCTGTCGTCCCCTAGTCCCCTCTCTCTCTCATCCACTGTCGACGCCCCCTTCTCGCTCTCCTTCACCCACCATTGCCGCCCCGTCCCCTCTCTCACTTAGCCAACCCACAGATCTGCCGGTTGCCGCTTCCTCCATCTCCTCCAACAAGATTCGTCCCTCCCTCCCTTTTCCTCCAAAATCATTGTCGCCATCGGTAGAACAGGGCATTAGCGATGAAATGGAGCTGAAAGGGACCGAAACAGAGTCCTATTGCATCAACTGGGAAAGAGAACTCCAGAGAGACCAAATTGCCCCTGAAGCAACAGCACAACAGCGCCACCTAGACGCCACAACAACTCTTTTTCCTGAGTGCATGATCTTTGGTGAAGTCTATAGCGCACGTAGGCACAACAGCGTCACACGCTCCAACAGGTTTATAAATTAA

Coding sequence (CDS)

ATGAATTTGGATATTTCCAAGACAACTACCAACGGTATGCTTGTACCATCGGCAAAAAAACGCATTTATGGCGCCAAAAATAGTGGCATCGGTGGAGAGTTTCAACAACTGTCGATGACAATAAAGGGCTGTCAGCGGAGGACAGATCTACCGACGCCACTATTATTGGAGTCGCCGTCTCCTCGATCCCTTCAACTCCACCGTCGTCTCTCTCTACTTCACCCAACCTGTCGTCCCCTAGTCCCCTCTCTCTCTCATCCACTGTCGACGCCCCCTTCTCGCTCTCCTTCACCCACCATTGCCGCCCCGTCCCCTCTCTCACTTAGCCAACCCACAGATCTGCCGGTTGCCGCTTCCTCCATCTCCTCCAACAAGATTCGTCCCTCCCTCCCTTTTCCTCCAAAATCATTGTCGCCATCGGTAGAACAGGGCATTAGCGATGAAATGGAGCTGAAAGGGACCGAAACAGAGTCCTATTGCATCAACTGGGAAAGAGAACTCCAGAGAGACCAAATTGCCCCTGAAGCAACAGCACAACAGCGCCACCTAGACGCCACAACAACTCTTTTTCCTGAGTGCATGATCTTTGGTGAAGTCTATAGCGCACGTAGGCACAACAGCGTCACACGCTCCAACAGGTTTATAAATTAA

Protein sequence

MNLDISKTTTNGMLVPSAKKRIYGAKNSGIGGEFQQLSMTIKGCQRRTDLPTPLLLESPSPRSLQLHRRLSLLHPTCRPLVPSLSHPLSTPPSRSPSPTIAAPSPLSLSQPTDLPVAASSISSNKIRPSLPFPPKSLSPSVEQGISDEMELKGTETESYCINWERELQRDQIAPEATAQQRHLDATTTLFPECMIFGEVYSARRHNSVTRSNRFIN
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 83..115
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 100..115
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 85..99

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Clc03G06440.2Clc03G06440.2mRNA