Clc03G03200 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGATTATTGTTTATGCAGATGATGAAAGAGGGTTTGATTATGAAAGAGATGGGGAAAAAGGACCAACTCATTGGGGAGAGCTTAGACCAGAATGGCATACATGCAAGGCTGGGTTAATGCAATCTCCAATTGATCTATTGCATGAGAGAGTTGAAATCATTTCACACTTGGGAGACCTTAAAATCAACTACAAATCCTCTAATGCCACGCTCAAGAATAGAGGCCATGATATGATGGTAATTATTAATTATCAAATATGAAAGTGATTTTCTTTTTCTTCTAAAATAATTTTTGATATCATGTTTTTAATCTTGACATGAAAATTTCGTATAAAAATGTATACAAAATAAAATATATTAAAATTAATTTTAAATAATTAAAAACATGTTCTTGAGTTATTTAAAATAGGAAAAATAAAACCTTTTTGATCATTAATTAAGTTTTGAGTCTCGTTTCCATTTGATCTCTAGGTTTCAAAATGTTATTATTTTAGTCCTTAAGTTTTGATTTTAATTTCAATTTAGTTCTTTAGATTCAAGATGTTATAATTTTACCTCTGACATTTGAGTTTTATTGTTTCAATTTGGTTTCTAAGTTTCAAAACTTAACTTTTAATAACATTAATTTTTCACTAAATACTCACTTTAATCTTTAGCGTTAAAACATAAGTAATTTTAATCCTTTTAGAATTACTTCCAACTTTAGATTATGTATAATATCTACAATACGCATAAAAGGAAAGTATTTGTGGTTATACAGATGAAATGGGTGGATGGAGGTGGATACATGGAAATGAATGGAACTCAATATAAACTAAAACAATGTCATTGGCACTCACCTTCTGAGCACACCATTGATGGCAAGAAGTTTGAGCTTGAGGCTCACTTAGTCCACGAAAGCTCAAACGGCATGGTTTCTGTCATCGGAATCCTATATCAGATTGGAGAACCTGATTACTTCTTATCAACGGTGAGTTTAATGCATAATCAGGTTCATCTCTTTGATAAACAATTTGAATTTTGTTTTATGTTTTTAGATTCATTGAATTTAATAAATATGGATTCTACATATGTATTTTCTCAAAACTACTTTTAGATTCCGTCATCTAAATAGTGCAAATTAAAACCAATTTTTAAACTTTCAATGTATCCAAATTTGAAATTTGAAATATTAAAATAAAACAATTATATTAAAAAAGAAAAAAAAATTACTTGAATAACTATAGTATTTCATGTAATATAGTAATCAATTCATTTTTTTTGGTTAAATTTAAACATGTATAATATAGTATATAATTAAATTATATGATATTGTATTGTAAAATAAATAATTATACCATTGTTTTTAAACATAAAACATGTTTATAAATTAATTAATAATATTTCATATTAAATCTAATATTTAGTAGGTAATCCCAAATAATCTTATGATTTATAAATATATTATATCAAACACATTTTAAATCATTGTTTAAATGAAATTCACTTTTTAAACGTGTTATCAAACATATGAACTTATATCGAGAATATCAAATATAATTGTGCTTCTCATTCAATTTTTTTATTTTTAAATTTACGTTTTCGACGTGATTACCAAACAAACCCTAATATTGGGAAAATTATAATTCACATTGTTTCAATCTTATTGTATATCAGATTGAAGATCATTTAGAACTGGCCTCAGATACCCATGAAGAAGAGAGAGTAATGGGAATAATTGATCCAAATATGTTGAAGATGGGTAGCAAACAATATTATAGATACATAGGCTCACTTACTGTTCCACCGTGCACCGAAAATGTGATGTGGACTATGATTCACCAGGTACATTTCTTGAATATATATTCCTTTTCTATATTTGTGAGTGTGATAAAATTCATACTATTGATATGATCTATCATTGATAAACTTCAAAAGCAAAATTTAAATTTTGCTATATCTGCAAATATTTTGGATCTGATTGTTATATTTGCAACTACCCCTAATTATTAATTGCAATTACTAATTTTAGTCTTGATTTCCATAGGTGAGGACTGTCACAGAAGAACAAGTGAAATTGCTTCGAGTAGCTGTCCATGATGTAAGTTAGAATAATTAATTGAGATGTCACGATATACCTTTTTTTTTCTTTCTATATTATAGATAAATTTAATAATTTTAGAAAACATATATTATAGATTATTTTTTAATACAACAAATAGAGTAAGAGAATTTGAGCCAATGACAGATTCAAGGTGTGTTTGGTTTCACATTTCAATTGTTTAATTTTGAAAATAAGTCATTCTAGAAAAAATTGTTATACTTAGAAACTACCCAAAATAACTTTTAAAATATTTCCTAAGTTTCTTTTAAACATGGTTATCAAAAGAGTTTAAATAATACTAATTTTTTTCTCGTCAATTTAAAAAGGCCCTTAATTAAGATTTGGAGGCTCGAGCACCCTCAATTTGTTATTTATACGTACTACTTATTATAAAAGAAAAAAACAATCTAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAGACTTCAATGGTTTAACCGCCATTGGTGTATTTTTATGAAATCTTCTTCGAATTTTAGGAGATAACACATGTTAATTACCGCTATTATATTCATTTGACACATATATTTATAGATTAATAATGAAAGTACTATCATATTGAATATAAAAATTGATAATTATGTAAGACTCGGTTAGATGAGCATTTGATTTTTGATTTTGAGATTAAACACACAAATTTTATTTTAGATGCTTGTTAATCAAAGGTTTGATATGTGAAAGCAGGACTCGGATTCTAATGCAAGACCGTTGCAACCAATCTATAATCGAACAACGCAACTCCAAAGATCGAAAGAAAGTGAAGAATGAGGACAAAAAGTTTATATATTTATTTACATTATGAAGTAGCCCTATTTTAATTTTCTCACAATGTATCCATTTCCCAATAATACTATCCCAATTTTCATATATAAATTTTGTTTGGGTTAACCTATTATTTTGGTTGTTTGCTTTCCGTTCTATTTTAGTCTATATATTTTTAATAGTTCAATTTTAGTTTTAAGACTTTAGACTATTTTGAAATATAACAAAATGAGTCAAACTATTTATAAATATAGAAAAAATTCAATATCTATCAGCCATAGACTTCTATTACTTGAGCGATAGACTGCAATAGACAATAAATTTTTTTTTATATTTTTAAATAGTTTGATATTTTTTCTATTTATAATAATTTTCCTAATACTTATGATGAATTTTAAATGCAAAATTGACTATTATATAATTTAACACTTCTCCTCAGTTTTGTGCTTGAAATATGAAAAAGACCCAACAAGTGGAAATAAATATAGATACTATGTTAAGTTGTCAATTGACTCAAAAGCTTAAGCTAGTGGGTGAAGACAAATTTAATATTATATCATTTAACATGGTAGGGAGTCATTTGTTCAAGCCCTTGTATTGTTATTTCTTCCCCCAATTAATATTCATTTTCACTAGTTGGGTCTTCTTCATGTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAACACACTATCAAAGAAGGCTAAAATTGCAAAAGGAAATTGCTTCCACTACAACCAAGACGGGCATTGGAAGAGGAACTACTTGAAACATTTACCAAATAAGGTAAATGTGATTTACTTGTGTTGGAAACCTCTTTGATGGAAAATGATGATTTTGTTTGGATAATTGATTTATGGACCACTAACCATGTTTGTTTATTTACAAAGAATTAGTTCCTAGAGGCAACTGGAGGCTAGAGAGAAGATGATAAGAGTTGGGATTGGGGAGGTCGTCTCTGTTGTGGTTGTGGAAAGGGTTAAATTAATCTTTTCGAAATCTTATTTATTGTTAAACAATATTTATATATATTTCAGAAGAACTTAATTTCTTGTTCATATCTTTTAGAACAATATTTTTCAATATCATTCTCTGTGAATAAAGTGTTTATTTTTAAGAATGATATTTGAAATTTGTTCCGTGACATTAAAAAGTAATTTGTGTGTGCATCGTTAGCATATGTAGGAATCTAATATAAAAATATCTACACAATATAGACTAAATGAAAGGAAGACAAGCAAGTAAACACCATGAATTAATATTGCCACCCAATACAACAAAAATATTATTATTACTGTTTTTTAGTAGATATTATTACTTTTTTTTGTCGTTGTTGTATGATAGAAAATTTCTTAACACAAGTGTGTATGTGTATATCTCGCATTAATGCTCCATCTCAATACATTGAGATCTAAACTGAAGTTGAATCATTCTGTTGTTGAGAGGCTGTAAAGGTCTCGCATTAGTGTTTGAATCCTGAAGTTTAAATTTTACCATACCATATTGTTACGAAATTGGAAAAATAAAAAAATACAAAAAAGATTAAAAAATAGAGAATTAACACACAAATTTATATGGTTCACTAACAATGTGTTAACTATGTCTACAAAGTAGAAGAATAACAACTTTATTAGAGAAAATGTTACAGAAGACATAATAGTAACCTATCTAAAGTTAAAGAGTTTATACAGGTGCATTCTTCTAAACCCTATAGTCATAATCGAAAATAATTATAAATAATTAAATATGTTAAATAAGAATTTTACTTTTGGTTGTTAAAACGCCAGATAATAGATTTAAGGTATTTCAACCGGCCATATAATTCAAAATATAAGAAAATTTATTTATAACAATAGTTGTAAGATCAATTATAACACATATTTGTAAAGAAACTACTCTCAACTAATGAAGGGTATACATTTAGGGTTCAATTTTAATAAAATTTAATGTTTAAATGTTAAAATTTAAAAGTTAAAAGTTAAAATTTAAATGTTTAAATTTATTTAATCCACAAAAAGTACTTGAGTACAAGGATAAAAATAAAACTTTTATTGAAATATTTGTAAATGTGTTCTCATTGTACAGTAATTGGAAATATATTACCTTAATTTAAAAATTAATTGTAAGTACAAAAATTATTAT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MIIVYADDERGFDYERDGEKGPTHWGELRPEWHTCKAGLMQSPIDLLHERVEIISHLGDLKINYKSSNATLKNRGHDMMMKWVDGGGYMEMNGTQYKLKQCHWHSPSEHTIDGKKFELEAHLVHESSNGMVSVIGILYQIGEPDYFLSTIEDHLELASDTHEEERVMGIIDPNMLKMGSKQYYRYIGSLTVPPCTENVMWTMIHQVRTVTEEQVKLLRVAVHDAQPLRELDSLGCDQIKNDPLNRDISSCSRNRWPSIFQEQLFSSATEREPFNAEPPRSALISSYVTPVDFFYKRNHGPIPLVDDIERYSVSINGLIESPKELFMKDIRRLPKYNVTATLQCAGNRRTAMSKIRTVKGVGWDVSALGNAVWGGAKLADVLELVGIPKCSYSTEKGGKHVEFVSIDRCKIERNDFDCYGYQVQEEKGGPYKGSIPLSQASNPKADVLLAYEMNGETLNRDHGYPLRVVVPGVIGARSVKWLDSISIIAEECQVGNLKYKLGSSPQEIAVRYPNSLHTENTQTLPNNKMKGNPWLFERAVSPQVSPHSPKISPPHTESQNPFHGPHKYDIPSAGSPGFFMQKDYKMFPPSVNWDNIDWSTRRPQMDFPVQSVICSLEDVDHIKPGKVRVSGYAVSGGGRGIERVDISVDGGKNWIEATRYQKIGVPYVADSPSSDKWAWVFFEVTLDVLRNTEIVAKAVDSAANVQPETVEEIWNLREDQKEFDYNKKGEKGPSHWGNLKREWHNCKTGRMQSPIDLLHNRVRIVSHFTDLRIDYKPSNATLRNRGHDIMLKWGDRAGYMEVNGTQYFLKQCHWHSPSEHTINGRRFALEAHLVHQSQTGNVAVIGILYNIGRPDHFLSKVRTVAPEQVKLLRVAVHDESNTNARPLQPLNKRNIQLRIKSNINGGGE Homology
BLAST of Clc03G03200 vs. NCBI nr
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BLAST of Clc03G03200 vs. NCBI nr
Match: XP_022939080.1 (sulfite oxidase-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 637.9 bits (1644), Expect = 1.3e-178 Identity = 327/447 (73.15%), Postives = 338/447 (75.62%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G03200 vs. NCBI nr
Match: XP_008462789.1 (PREDICTED: sulfite oxidase-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 635.6 bits (1638), Expect = 6.7e-178 Identity = 325/447 (72.71%), Postives = 338/447 (75.62%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G03200 vs. NCBI nr
Match: XP_004139441.3 (sulfite oxidase isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 635.2 bits (1637), Expect = 8.7e-178 Identity = 325/447 (72.71%), Postives = 339/447 (75.84%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G03200 vs. NCBI nr
Match: KAG6578371.1 (Chloride channel protein CLC-b, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 634.8 bits (1636), Expect = 1.1e-177 Identity = 325/453 (71.74%), Postives = 340/453 (75.06%), Query Frame = 0
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Match: Q9S850 (Sulfite oxidase OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SOX PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 559.7 bits (1441), Expect = 6.1e-158 Identity = 278/447 (62.19%), Postives = 318/447 (71.14%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G03200 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8L817 (Alpha carbonic anhydrase 7 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ACA7 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 282.0 bits (720), Expect = 2.5e-74 Identity = 125/217 (57.60%), Postives = 171/217 (78.80%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G03200 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P07850 (Sulfite oxidase OS=Gallus gallus OX=9031 GN=SUOX PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 277.3 bits (708), Expect = 6.1e-73 Identity = 167/450 (37.11%), Postives = 222/450 (49.33%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G03200 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q84UV8 (Bifunctional monodehydroascorbate reductase and carbonic anhydrase nectarin-3 OS=Nicotiana langsdorffii x Nicotiana sanderae OX=164110 GN=NEC3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 258.5 bits (659), Expect = 2.9e-67 Identity = 123/218 (56.42%), Postives = 166/218 (76.15%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G03200 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4HUC4 (Alpha carbonic anhydrase 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ACA5 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 255.4 bits (651), Expect = 2.5e-66 Identity = 121/229 (52.84%), Postives = 166/229 (72.49%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G03200 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FLM7 (sulfite oxidase-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111445089 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 637.9 bits (1644), Expect = 6.5e-179 Identity = 327/447 (73.15%), Postives = 338/447 (75.62%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G03200 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CHS9 (sulfite oxidase-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103501076 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 635.6 bits (1638), Expect = 3.2e-178 Identity = 325/447 (72.71%), Postives = 338/447 (75.62%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G03200 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1BX38 (sulfite oxidase isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111006477 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 633.6 bits (1633), Expect = 1.2e-177 Identity = 325/447 (72.71%), Postives = 336/447 (75.17%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G03200 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LSD8 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G120460 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 632.9 bits (1631), Expect = 2.1e-177 Identity = 324/447 (72.48%), Postives = 338/447 (75.62%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G03200 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K347 (sulfite oxidase-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111489633 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 630.2 bits (1624), Expect = 1.4e-176 Identity = 324/447 (72.48%), Postives = 337/447 (75.39%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G03200 vs. TAIR 10
Match: AT3G01910.1 (sulfite oxidase ) HSP 1 Score: 559.7 bits (1441), Expect = 4.3e-159 Identity = 278/447 (62.19%), Postives = 318/447 (71.14%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G03200 vs. TAIR 10
Match: AT3G01910.2 (sulfite oxidase ) HSP 1 Score: 438.7 bits (1127), Expect = 1.1e-122 Identity = 223/376 (59.31%), Postives = 252/376 (67.02%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G03200 vs. TAIR 10
Match: AT3G01910.3 (sulfite oxidase ) HSP 1 Score: 327.0 bits (837), Expect = 4.7e-89 Identity = 166/292 (56.85%), Postives = 188/292 (64.38%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G03200 vs. TAIR 10
Match: AT1G08080.1 (alpha carbonic anhydrase 7 ) HSP 1 Score: 282.0 bits (720), Expect = 1.7e-75 Identity = 125/217 (57.60%), Postives = 171/217 (78.80%), Query Frame = 0
BLAST of Clc03G03200 vs. TAIR 10
Match: AT1G08065.1 (alpha carbonic anhydrase 5 ) HSP 1 Score: 255.4 bits (651), Expect = 1.8e-67 Identity = 121/229 (52.84%), Postives = 166/229 (72.49%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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