Clc03G00380 (gene) Watermelon (cordophanus) v2

Overview
NameClc03G00380
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus cv. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationClcChr03: 311222 .. 317305 (+)
RNA-Seq ExpressionClc03G00380
SyntenyClc03G00380
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAGTAACGTTTTGAAATTAAGGAATGAAATGTAATTTAAGGTTTGAAACTAATTTATTTTGGAAAGGGTGAATGGGTAAAATAATTGTAAAGGGATTTTGTGTGTGGAATGGAGTTGCAAGTGTCCATGGTATTTCCTTTTAGAAATCTATTTTTGACCAAGGAAAAAGCTACCTTTCTTTATGGTATTTAATTCCCCCTTTGTTATTATTATTATTATCATTATTATTTGTTTTTCTTCTTCCTCAATTTTCTCATTCCTCCTCTTCTCCCAATTTATTACTCAATTTTCTTCTATGTTCCCAAAAGTTGTCCCCCACTATCCTCTTATTTCTGATTTTTAGTATAAATAGAGGAAGGATTGAAAGGAAAGGGGGAGGGAAAGTTTAATCAACCCATTTGGAGAGAGGAGCATAAGTTGGATAAATCTATAATCCGTTGTAAAGTTCCGGCGACTTCAATCAACCCATTTAGAGGAATAACCATTTCAAATCTAACGTGGATAGAAAATCGACCCAAATCACAGATCCGGTGAGGCATTGCCGACCATCTACGCTCCCACAGATCTCTACCCACCGACGGAAATCAGCCGGAGTTGCAGATCTGGTCGACACCGACCCACCGCCGCGCTATATCCCGGTGCTTCACGGCGGCGAAGACGACAGCTATTCAAATTATAGAGGGCTGGTCTTGTGAAGGAGAGAAGAAGAAGCAAACGAAACGAAAGGTACACAAGCTGGTCCCATTTTTGTTACTTTGCAAATCCTAAAACTCTCAATTTAATTTTATTTTAGTTTGGAAGTGTTTGTTTATTTGGATTCGTAATTGCAACGTGAATATCAATTTGATTTCTATCAAAGGAGATCGTCGGTCAGTCGAAGTCAATTTTGAGCTAAAATCGGTTCCAACCACCGACATATCAATTTTGGTCGATTGGTTGCGGCTTGTTTTTGGAGGTGGGCGGTGCCGGCCGACCGACATGCAGTCGGTCGGTTTGGGTGCGTCAGCAAATTTTAAATAGAAAAGAAAAAAACAAGAACTTATTTTATTTTAAATTTTATTGTCAAAATTCAAATAAAAATATGGACAAATATCAATTTATATCTCTAAACTTTGGAAATTGTATCAATTTAGTAGTATTCTCTTTTTGAGATAATAATACTAGAAGTATATGAAATTTCTCTACAAATTCGATGATGGAATATTATGAAATATACTTTTCTAATTTTCTTGAGTGAGGAAATTATCTTCCATCCAAGGTAAGTTCCAAAGTTTTTTTAATGGTCTCGAGCCACTCATAGTTATTAATTCATATTTGTTACTAGATGTGAATTAATATTATTGAGACATCAAAAAATAAAACACGAAAATATTGTCTTTTAAGACAAAGGAATAATAAGATAATTTTAAAATAAAATGTGGTATTTGTTTCTGGAAATGAGTGTTGTAGGGGTGCTAACACTTTTCCTACACTTAATCGACTCTCGAACTTTAAATCTAGTTTAAAAAATCGTTTATATTTTAAAAAGGTGACCAATCACATCCTAAACATGATTGATTGCATCACTTCAAACCTCTCACCTCGAAAGAGACTCCTAGGGTAGAATGTCGGTCGCTTCATATCAAGATGACATTACGACAATAGCAACTTTCTTATTGATACCGAGTCACCATAGAAATTGCTCATCCCTATGCCCAACAACTATGACAATCAAGACAACTTCATCAGTGTAGACCACAATTTGGAGTGTTTCACTATTGAATCACGAGACATATTCTCTTAGCTTTTTCTAATTTTGACCACTGAGGAATTGGGTAATGAAAGCATGAGCCAACTGACTTTTGCTTAAGCTTGTGGAACCATTTTTGCATAGGTCCAACAAGTATGAACAAGAAAATTCAGCACTTGAATGCTTCTCAGACTATATAAAGCTCCATCCATGATTTCAAATTGTCTAAATGCTCCACTAGTCTTTCGAACTGTTATAGGCTTTCATTAATGGCAACTTAAACTTCAGAGGTACCTCTTCTTGCATAATTTTGTCGATAAATGATGGATCTACTTGATCTAGCAGATTTTCCAAGTTCAACCCCTTATGATCTTGCATTTGCTTCATAACCCCCAGATGGTTCTGGATCTTTTGCAACTCAACTACCCACGACCGATTATCAACCTCTTCATCTCCCATGGGTTGTATTTTTCGCTTCTGGTTAATGAGCTCTTGCATATTTGTGTTCAAGTTAGACCGTTCTGATCGACCAACATTTTGGGCTCCAGATTACTCGTGGGGGACTCGTGATCTTCAGCCTATGTTTTTCGTACAATTGTTGGCCCATATAGTTTGCATTCTAGATTGACGGTTGATAGTTAGTTGCTTCCTTAGGTTCGGATGCGTTGTCCTTTTGTCATTCCCTCCTAGGGTGAAACTCTCAACCGTTCATCATGAGGATTCCCACGGTTCTCAAAGTGGTCTTCCAAGGGTCATCCAAGGTCCCTCATGTGACTCATAAGCTCTACATCGGTCCTCTGAGCTCACTTTAAGCTCTCTCCATGGGTCATCTGAGCTCCCTTTAAGCTCATTCTACGCTTTGCAATAGGTCCTATGAGCTGATTTTAAGCTCCCTTTAGGCTCTTCCCATTGATCCTTTTAGTTTCATTGAGCTCTCCTCATAGGTCTTCTGAGCTCCCTCTAAGCTTATTAGGTTTTTTCCATAGGTCATTTGAGCTCCCTTTAAGCTCACTCTAGGCTTTCCCCATGGATTTTATGAGCTCACTCTAGGCTCTTTCATAGGTCCTCCGAGATTCATTAGTCTCCCTTCATAAGTCTTCTGAGGTCACTCTAAGCTCCCCATGGGTAATCTGAGTTCTACCAGACTTCCTCATGTGTCCTCTTAGCTACACTAAACTCTCTCTATGGGTCCTTTGTCTACCTCAATAAATCTACCCATAACACCAATAAGGAGAAATTATGAAATCCATGTATATAGGAGAAAGTATGCACATACCTAAATTAACATTCTAACCAATAATAATAATAAAAAAAAAAAAAATGAAAGTGGTCCCAACATTGCCACATCATAAAATTCTACATTTGCAATTGGATATGAAAATGACTAGCCATTTGTAAGCCGAAAGTGATGACACATTCACACATGTCCAACACTTACGTGGAGAGCCCTATAAGCGACAACGTAGCCTGGTTAGCTTCGACACGACCACACGTGTTGTCACGTGATTTGTATGCAATAACTGTAAACCACGTACCTTACCCTCTCTCTGCAACGGCCCCACGCGTGATGACTTTTGATCTTTTTTCTTCCTTTGTATAAAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAATTTCCCAGTTTCTAGTTTTTTTCCGTTATTTTAGTTTGATTAAGAAAAACCAAATTAATATGTAAAAACAACCAACCGAAATTCGGTGGCTTTGACGTATGTATGGATATTTAATTTGATTTTCTCTCTTTAAATGCAACTGCCATAGATTGGCACTGCCCTTTGAAGCTAAGGATGAAAATAATTCCCAACATAAATATACATTATAAATTTTAATTAGTTAAGCAATTATCACATTACTATTTGTCTTTCTAAGTCCAAACTGTTTGTGTTCCTTCCATTGATTTGTGTCCCTTTTAAATCTTCCCTAATTCAACTATTCTCTTTAAAGTTTTAACAAATACTCCAAATTTATCAAAAGAAAATAAAAATACTAACCCACATATATATTTTTCTTTTTAAAATTAGAGATCAAAACAAAATAAATTTAAAACTAAATTAGGATTATAGTAAATGTTAAATGAGGTTTTGCTCCATGCTAATGTCCACGGAGTGGGGCGGAGATAAAGAAGCCTTTTCCGTCCTTGCAAAATTTTTCTTAGTGATCGGAGTGGGAATTTCGTATAAAAAATTAGCAAGGATCGGGTTCCCATAGAAAAAATTGCCCATTTGTTATTTATTTATTCATATTTTAACAACTTTTAAATTTATTCTTAAACTTAATAAAATTTTATATATTAAATGGGTCACTTCCGGATTCAACGACCATGCTTACACCATCGGAAACAGAAGTTCTCTATAAATATCCAAAATTCAATTCAATTTCCTCTCCTCGCTTCTTCGACATCAAGATTTTTTCCTTCCTATTTTTCGCTCCATTTTCATTCTTGTTCTTCGCGATTCGGGTTCTTGTTTTCTGCATTCGCGACCTTTCTCTATCTCTCTCAAGTTCTTCCTTTCTCTCTGTTTCCCTTCTTTGACCTTCTTTCCTTTTTTTTCCACTCGCTTTCTGTTTCTAATCCCCGCCGACTCATAATCTGGCCCTTCAACTCATAACTCTTGTTGGGGGGTTTTTCACTTCTGTGTTTTTCCCATCTGGGTCTTCAACTTTTCCCCCCTTTTAATCGTTTTTTCTCTGGCTTTTTGAAAGTGGATAATTGCTAGGTGAATTCTCTTTTGTTGTTTATTGATGTTGAATCTGCATTTTCCCGGCACCTGCTTATATTTCGGTTTTGTTTTGAATTTTTCCCATTATAGCTCTCTTGCGTAGGTTACTTCCTTGTATTTATTTTTAAATTTCTTCTGTTCATTGGGGTTTTAACTTTTTCACGACGCAAGATTTGTTAGTAACCAAACATTCGGTTTTAAAAATGCTTGCGTAATTTACGGGTCTTAATCAATTGATACGTCTATTTTACATGTTTGGATTGGATGGATTCTAGGCTTTTAGGTGCCTGAATTAATTCTGGTATGACTTTGTCCCGTAGCGATTTGAGTTTATGGAATTGAAATACGTTTTTAATCTTTGGGGTTTATATGCAATTTGGGTTCTCTACAAAATTTCCCTGATTTTATTGTGGAGTTCATTTCATATAAGGTTGAATGACAGCTCTTATGTTTGTCCTCTTTCTTTCTTAATTTGATTGATTGGTTCAGTTTCATTTTTCCCATTTGCAAAATCAGATTTCATTTACACTGTTCCCGATTGATTTGTCTCTTGAGTTTCTTCTTATTAAATTGGTGGGACATTCACTTCTTTATTGCCACTTTTTGATATTTTATATAATAATTGAGCTCCATTTGTCACCTTCTTTCAATTGGGTTCATCGATTATCAACTGTTTATTGTAGCCCCAACTGTAAAAGTCATGTTTCTTTTTTATGTTTGGTTGCATTTATTGCCCTTCCATTGAAATAGCAACCAAAGTCTTGTTTTTAGTATTTTACTGCATCTATGCCCTTCGGGAAAGTGAATCTTCATTTCTTTGTCCATTTGTTTATTTCTTCAATTGCTTCTATATAACATATGGTAGTGTTTCCTCTTTACTCTGTGGTAGATTTTGCATACTTTTTTTTAAGCTCTTCTACTACTTCCTGCTCTTCAGCAACTCTGTTTTAACACTCTTTTAATATTCTACATTGCAAAAGGATTGGTTAGTTTTCTCCAGTTTTAGATCTGTTTTGCTATCTTGCTGCTACGTACATTATGTATTCTTTACTTCCTTAAGGGTTTTTTTTTATGTAAACTTATCATCACCGTTTCTGTTAGTCGGTTACTTGAGATTTTCTTTCGAGATGAACTTTATTTCCAGAAAAATATTGCTTATTAGATAGTGTCAGAGCTTTATGATATTTAAAACCTTGCATGTCTTTTTGTGGTAGCTGTTTTGTTTGTTGTATGTTCTGTACGGCCACCTGAAGTTTTATTGCTTCCTCTGTAATAAAATAGGAGCAGAGTTCTTGTGTAGATGTTGAAATTGACGCTCTATCATTCAACCACGAGATATGTGATTTTGCTTTTATAATTATATTTATTGTCCCAAAGCTTTTTTCTTAACTGTACGAACCACACTTTTCAGGTTGGTCATCTTCACGATTTTTTTTCAGATTGGTTGGAAGATGACAAGGTACTGGCAGAAATAAGATTGGCTCTGTTAACCGTTTCTCGATCTGAATGCTTATTGATGTTTATAGCAACAAACTTCTAAAGTCTTCTTTTATGATGATTTTTTCAGATGTTTTGTGCTTGA

mRNA sequence

ATGAGTAACGTTTTGAAATTAAGGAATGAAATATCTCTACCCACCGACGGAAATCAGCCGGAGTTGCAGATCTGGTCGACACCGACCCACCGCCGCGCTATATCCCGGTGCTTCACGGCGGCGAAGACGACAGCTATTCAAATTATAGAGGGCTGGTCTTGTGAAGGAGAGAAGAAGAAGCAAACGAAACGAAAGGTTGGTCATCTTCACGATTTTTTTTCAGATTGGTTGGAAGATGACAAGATGTTTTGTGCTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGAGTAACGTTTTGAAATTAAGGAATGAAATATCTCTACCCACCGACGGAAATCAGCCGGAGTTGCAGATCTGGTCGACACCGACCCACCGCCGCGCTATATCCCGGTGCTTCACGGCGGCGAAGACGACAGCTATTCAAATTATAGAGGGCTGGTCTTGTGAAGGAGAGAAGAAGAAGCAAACGAAACGAAAGGTTGGTCATCTTCACGATTTTTTTTCAGATTGGTTGGAAGATGACAAGATGTTTTGTGCTTGA

Protein sequence

MSNVLKLRNEISLPTDGNQPELQIWSTPTHRRAISRCFTAAKTTAIQIIEGWSCEGEKKKQTKRKVGHLHDFFSDWLEDDKMFCA
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Clc03G00380.1Clc03G00380.1mRNA