
Clc02G25860 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTGTGATCCGCCTAAAAAATTTGCCGCATTTGTTTTTCCTCCCTTCTAGTAGGAGTTGCAGGCAACCTCACGGGATCTCTCTCCTTCATTTCTCTCGTGTGCAACACCAAGAAGGCGATATAGTGCCATAGACATTTGATAGGGGGAAGAACACTTGGGAAAGTAGGCAGTTACTCTCTTTTCTGATTGTTAGGCACAAGACGATGAAGCAATGGAGAGGCTTAAATTCAGAATCTCTTGCAACCTTATGGGTATTGTGCACAGCTCTAGCTCTAGCTCCAGCTCCATTTGTTGGATCGGTCTCATCTCCAAAGCACCAATTTCGTGGAATTTCTCCCCAAGGTTCGTCGCTTTCCATCTCTCTCCCAAATCTACTCAAATCTTCAAATCCTTCTAGTTTTCGAAATATTTCTGGACACTGAGAATCAGTACGAATTCGGTATCTAAATGTAGATGAGATGTATTACAAGTCGTCGGACATGATCAAATGTAGAGACGGTTCCAACAAATTTTCCAAGGCTCAGCTTAACGATAACTACTGCGATTGCCCTGATGGCACTGACGAACCTGGTATTGATTCCTCTCTCTCCTCTCTCTGTATTTCCTTCTGTTTTTTTCAATTCCTTAGGCCTTAATTTGCCTCAATCTTATACGTATTTAGTCTTTACTGGCATCTGAGTTGGTTCTTGGATTGTTATAGAAATTGCAGAAACTGCTATCGTTGCTTCCTGGCGTATTACGACTCACTAGTACCTTCGTTAGCTATTAGGGAGTGCAGTTTTTATTGTTCTTGACAGTATGCGTGTTCGCGGGTTTCCATTTCCCTCTTCATCTAACCTCCAGTATAACTTTGGGCGAAGAAGCAAAAATATGATGTGGATTTGCAATGGGGTTTCGTTTTGGTTTCTTAACGAGTTATCAACAGTTTTCTTGCATATTTTGTTAAATTGAATCCGTTTGATGTGGGCTGGTTTTTTGCATTGTTTATTGTTTATCATTTGCTCTATAAACCTTCAATTTTTCGTAAAAGGTCTTCAATCGTTTCAAACTTTCATGCGTAGTGATGACATACTTTCATGATTGAAGGCACATCTGCATGCCCGAATGGGAAGTTCTATTGTCGAAATGCAGGGCACGTTCCACTTTTATTGTTTTCTTCAAGGGTGAACGACGATATATGTGGTAAGTTACTTCTCGACGACAGCATCTCTCCATTTTGTAACCTTTAATCCTTTTAGAATTCTAGTGTCTATTACAGTATTGATCCTGTAAACGCATGCACCGACACACCCTTAGAAAAAACCTAAATGAGTTAGAAGTTCAAGAGCAGATTTGCGTATGGATATCCTAGCAGAATATTTTCTAGGTCTCAGGTGTGATTTTTCTGGCTTTTTTAGCTGCAAATTCCTTTCTTATTATTTATGACACTAAACTTTGCGTAAACCCCTGCTGTTAAGGGTTTTAAGATGCTATTTTCATTTTATCAATGAGAAGTTGTTTTTATTTATTATTATTATTATTAATTTTTCTTTTAATTTTAAATATGCTATTATCCTTTGAGTTCTTTTAATACCATATATTGTAGGGTGAAGCATTGGTGCCAATATTGAACATGGGGATCTTGAAGCATATTGTAACTTTGTTCATCCTCAGAGCTTGCCCGTTTTGTTTATTTCATTCTTCTAATAAAATTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTCTTCTTCTTCTTCTTTTGAAAAGGAAACGATATCTTTCATTGATGTAATGAAATTGTCTTTTCATACTACCCCCGACCCACGTAACCACACAGAAATTGTGAACATAGAAGGTCAAGGAATCAGAAGAGGATATTTAATCTATATTTTCTTATAATTTAATTCAAACTTTTGTTGGTGGATGATTTTACAATATATATGAATATTTTCCCTCTTTTTGTATTATTATGATTGTTTGATCCTCTTGTGTGTTTGTTTTTATATGTCAATTACTTGCAGATTGTTGTGATGGAAGTGACGAATATGACAGCAAAGTCAAATGCCCAAATACGTGCTGGGAAACTGGGAAAGTGGCAAGAGATAAATTGAAGAAAAAGATTTCAACCTTTGAAGAAGGTGTTAAAATTAGAAAACAAGAAGTCGAACAGGCAAAAATTGCAATAATCAAGGATGAGGCAGAGCTATTGAAGTTGAAAGATGAGGAAAAAGTATTAAAAGGACTCGTTGAACAACTCAAAGGTCTAGTCTTGTGTAGTCATCTTTACTTTTACGATCTTGTTTTTCCATTATAAGTCATTTTCATCATCATGACATGGAAAAAATTTTATTGATTAAAATTTCTTGGCATTGCCTATTAGGAGTTTGGTTTATTTTTTTGGGGATAGATATATTTTTTATTTTTTATTATTATTTTTTTTATATCCGTGAGTGTCCAACCTAACTTAGGCGCACCTCGACTAATCTCACGGGATGACCCGTCTGACCCTACAATATTTGAGTGTCAAAGAAACTCATAGGAAATTAATTTCTAGGTAGGTGGCTACCATGGATTGAACCCTTGACCTCTAAAGTCATTTATTGAGACTATGTCTCCTTTTTACCACTAGGCCAACCCATGATGGTTGTTTCATATCCTTTTCTTAAAAAAAGATTTAATTGTTTCTAAAAAAATGAATCAAGCCTTTTAAATTGGCTGGCACATTAACAACCATTAACAACTGAAATTTAACACTTATCCACATGGTAAAACACATACCTGTGGGAAACTAAAAGAAGACAACACTAAATAGTCAACCTAGAATAGTAAGGAAAACCTGTGAAGAACCCTATATCAACTCTTCCCCACCAAGAAAAATAACTCGACCATGAGTTATGAAGATAAATGAAAATTATCAGGGGCATGATAAGTAAACATATCTGCAACATCGAAAATGGAGCTAATGTTCATAGAGGTAAGGAGACCCACTTTCTAGGCGCTATCCCCAAACTTCTCCAGAATGGTCAATGGGCCATGCTTCTTGTTAGTAAGTTTATTTGATGATCCAACAGGGAGGTGGGATTTGCGAAGAAAAACCATGACTGGATCACTAGGTTGAAGCATCGATGATCGTTTGTGGGCACTTGAGCTTGATGGATCCATCGCCCTCTAGGAAATCTATTTTTTCATCTTTGTGGAAGGTGGAAATTCCAAGGTTAAGTTCTTTGTGTTGCAAGTTATTCATGGAAGAGTTAATGCTCTTAGTGACTTTTGAGAAAATTGCCTTCATTGTTGTATTCTTTATTGGAGGGTGGAGGACAACCATAATCATATTCTCTGGAACAACGACTTCATTTGGGCTATTTGGAGTTATTCTTTTGAGGGGTTTGATTTTCTGTTTGTCCATCATAGGGATTTCAACTAGATCATCAAAGAGTTCTTTCTCCATTTGCCATTTCAGAAGAGGGGAAGATTCCTACGGCACGTCGACGTTCGTGCTTTGTTGTGGGGGTTGTGGGGAGAGAAATGATAGGATTGTTAGAGGGGTGGAGTGGGGTAGTAGGGACTTAGGCCTTTTCTAGATTTTATTTGTTTCTTTGGGCTTTGGTGTCAAATTCTTTTTGTAATTACTCTTTAGGTCTTATTTTGCTTGATGGGACTTCCTTTCTTAGGTGGGAACCCCTCTTTTTGTGGACTTGGCTTTTTTTTTGGATGCCCTTGTATTTCTTTCATTCTTCCATTAGAAAAATTTATCCCTCATTGAAGTTTGTGGTATTTAGATGAGAGAAATTCCTCTTTTTCATTTAGAAGTTGTTTGAATAAGTAATTGTGCTTTTCTTTTTGGTTAAGTAAAGAAGTTATCATGGAATACTGAAGGCCTTGTACATCGTTATAAAAAAGCCAAGGTTGATGTTATCCAAAGAAGCCAAGGGTGTTGAATTTGTTTGTTGTTTGTTTAAAACATGTTGGGGGTAGAAGTCGGTTTGTTTTTCATTGATATTTTGGAGCGTGTTGGTGAAGATTTCTTTTTGGAAGGCCATCAAATTTTTTGGTTAAATGACTTCTAAAAAATCTCCGAGTGACAGGAGGTTAGGAGTTGGAGCAATGAAGTTTGGAATTAGGATTCTCAGTGTCGAATGTGTCTCTGTTAGTATCCACGATTTTAAATAGAATTTTTCTGTATACATATTGTTAAATCACCGATTCACCCAACAGTTTAAGTTGATGGGTGAAGGTAAATTTAATATTTTATCAACACTCTAACATGTATGTAATTACGAATTAATCTTGAGTTGTTATTAAAACCTTTTTAAATATGAAGGTTTTTTTTTAAGAAAAATACTTGGTCATCTATCTCTTAATAATTAATTGGAGAACTCTCTCTCTCTAATTTCACGGAACAACCCACCTGATCCTACAACATTTGAGTGTCAAGGAAACTCGTAAGATATTAAATCTTAGCCACCATGGATTGAACCCATGATCTCTTAGCCATTTATTGAGACTATGTCTCCTTTTTTACCACAAGGCCAAACCCATGATGGTTTAATTGGAGGACTCTTCCCAAGTCCTAAAATCAAGTCCCATTTAGGCCTTTAACCTTCTTTAAAGCTAACCCAGTCCCAAAATCAAAGAAATTCAATATTTAGTGAAGCGACCTCATCAATCCCATTGATTTATTTAAGTCCTAAGGTCATCATTTGGCCATTCCACCTTCATGTGCATGTGCTAGTGCCACATATGTCTTCATCTTCTTCAATTTCTGCCCTCGTCCACTTCTTCATCTTCTTCACTTTTTGCCCTCATATTCTTCTCCCCAATTTCTTTTGGCTTTGATTTCAAATTTCCACTCATGCTTCAATCCCTAGCATGTGCTGTGATTCAGGTGAGTCAAAAGCCATGCCACTCTTATTCTTTTTTAATCAGATTGACTCAATGTGTTTCGTTTCTTACAATTCAACATAAGAAACAACAGATACATGTTATTTC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BLAST of Clc02G25860 vs. NCBI nr
Match: XP_038901581.1 (glucosidase 2 subunit beta isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1139.4 bits (2946), Expect = 0.0e+00 Identity = 604/643 (93.93%), Postives = 621/643 (96.58%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G25860 vs. NCBI nr
Match: XP_038901579.1 (glucosidase 2 subunit beta isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1134.8 bits (2934), Expect = 0.0e+00 Identity = 604/644 (93.79%), Postives = 621/644 (96.43%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G25860 vs. NCBI nr
Match: XP_008449902.1 (PREDICTED: glucosidase 2 subunit beta isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1082.4 bits (2798), Expect = 0.0e+00 Identity = 577/643 (89.74%), Postives = 601/643 (93.47%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G25860 vs. NCBI nr
Match: XP_008449901.1 (PREDICTED: glucosidase 2 subunit beta isoform X1 [Cucumis melo] >XP_016900767.1 PREDICTED: glucosidase 2 subunit beta isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1078.9 bits (2789), Expect = 0.0e+00 Identity = 574/643 (89.27%), Postives = 598/643 (93.00%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G25860 vs. NCBI nr
Match: XP_011653519.1 (glucosidase 2 subunit beta isoform X4 [Cucumis sativus] >KAE8649423.1 hypothetical protein Csa_021644 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1068.1 bits (2761), Expect = 2.9e-308 Identity = 573/647 (88.56%), Postives = 599/647 (92.58%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G25860 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FM96 (Glucosidase 2 subunit beta OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PSL4 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 594.7 bits (1532), Expect = 1.2e-168 Identity = 345/638 (54.08%), Postives = 457/638 (71.63%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G25860 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A2WNF5 (Glucosidase 2 subunit beta OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=OsI_01383 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 558.5 bits (1438), Expect = 9.6e-158 Identity = 326/631 (51.66%), Postives = 431/631 (68.30%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G25860 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5NBP9 (Glucosidase 2 subunit beta OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os01g0276800 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 557.4 bits (1435), Expect = 2.1e-157 Identity = 326/631 (51.66%), Postives = 430/631 (68.15%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G25860 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P14314 (Glucosidase 2 subunit beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRKCSH PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 206.1 bits (523), Expect = 1.2e-51 Identity = 188/609 (30.87%), Postives = 284/609 (46.63%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G25860 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O08795 (Glucosidase 2 subunit beta OS=Mus musculus OX=10090 GN=Prkcsh PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 204.1 bits (518), Expect = 4.6e-51 Identity = 183/620 (29.52%), Postives = 278/620 (44.84%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G25860 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BMH4 (Glucosidase 2 subunit beta OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491639 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1082.4 bits (2798), Expect = 0.0e+00 Identity = 577/643 (89.74%), Postives = 601/643 (93.47%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G25860 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BP18 (Glucosidase 2 subunit beta OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491639 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1078.9 bits (2789), Expect = 0.0e+00 Identity = 574/643 (89.27%), Postives = 598/643 (93.00%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G25860 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L0B4 (Glucosidase 2 subunit beta OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G268010 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1062.8 bits (2747), Expect = 5.8e-307 Identity = 572/650 (88.00%), Postives = 600/650 (92.31%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G25860 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DLT2 (Glucosidase 2 subunit beta OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111021230 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1058.9 bits (2737), Expect = 8.4e-306 Identity = 572/649 (88.14%), Postives = 603/649 (92.91%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G25860 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DK57 (Glucosidase 2 subunit beta OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111021230 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1054.3 bits (2725), Expect = 2.1e-304 Identity = 572/650 (88.00%), Postives = 603/650 (92.77%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G25860 vs. TAIR 10
Match: AT5G56360.1 (calmodulin-binding protein ) HSP 1 Score: 594.7 bits (1532), Expect = 8.6e-170 Identity = 345/638 (54.08%), Postives = 457/638 (71.63%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G25860 vs. TAIR 10
Match: AT2G42390.1 (protein kinase C substrate, heavy chain-related ) HSP 1 Score: 159.8 bits (403), Expect = 7.1e-39 Identity = 77/126 (61.11%), Postives = 93/126 (73.81%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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