
Clc02G20760 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTGTATGTTGTTCGAGCAGACAACTGTGCCAAAATCTGGAATTCCCCAGCATGACGTGCATTACTGGGTGGGAGAAAATGCAAACAAGGTGCTCACTGTTCAACTATTTGTTTTTCTTCCCCCTTTTCTTTTTTGGGTTATAGAAGGAAACATTTGTACCAATGGTATCTATCAAATTACTAGTTTCATGAAGAGAGTAGGGAAATACACCCACTTGGCTAGTCCGAAAATCAAAGTACATGATATATACATTTGGTATCTTATAAACGCCTATGAATCGATGATCGGAACAGGGATATTGGACCTGTCTAAAGTCAGCGTTTCTTCTTTACCATATGATGCAGTATATCAGTTTTGGTGCTTACAATTTATATATGCATTTCCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATGTAAAAGTTGTTGCAAAACATCGATAACACGGTGATGCGTGGGTGTTCTGCATTAATAGGCTGATTCAGGTTTGGCATCAGACAAAGCTCTGGAACTAGATGCAGCTCTAGGTTCTTGTACTGTTCAATACAGGGAAGTCGGAGGGCAAGAAACGGAGAAATTTTTATCATATTTTAAACCATGTATTATACCTTTGGAAGGAGTATACTGCTCACAGCTTCAGCACCCCAAAGATCAAACATACCAAATCAGACTTCTAACCTGCAAGGGAGACCGTGCGGTTCATGTTAAGGAAGTAAGCAGCAAAAAGGGGCTATATTTTTAGTTCATTTAGTTATTTTAACAATGTTGTTAACTTGTATAAGCATAATCCATGTTACAGGAATCTACCCTATTGAGCTTACTTGGATTCATTTATATACTCATAAAGAAGTCTTTGTTTCTGTTATTGATGATGAGTGATGAGGATGTTTCTTGTCTTCATTTAATCTTATTCGTTCGGGCGAGATAAGACTAATTTGTATGTATCTTCCTTAGGTTCCCTTTTCTCGGTCATCATTAAACCACAATGATGTATTCATCCTTGACACTGCATCGAAAGTTTTCCTATTTAGTGGATGCTACTCTAGCATACAAGAAAGGGCTAAAGCTTTGGATGTTGCTCAGTACATTAAAGAGAACAATCATAGTGGAAGCTGCGACTTAGTAACTATAGGTAGGTGCATTTCTTTTTTCCCTCACAACAAAGCTGTGATTATCAACTATAGGTCGGTATATTTCTTTCTTTCCTCCTGTTTTCTATAAGTAACAATCAGCAAATTGTCATCTGTTGCTGTAGACGATGGAAAGTTTGTGGGTGATTCTGATGTTGGTGAGTTTTGGAGTTTTTTTGGTGGATATGCTCCCATTCCTCGTGATGTGCCTTCTGATCAGACACCATCTGATTCTTCAATTAAATTATTTTGGTTAGTTCCCTTTAACAATCTTTTCCTTCTCTGTTTAATGATTCTGATAAGTTTTCATCTATTTATCTCAGCAGAGTTTGTCCTGGATATTACTTGCTTAAAAACGAAAAAAAGGAAAAATATGGGGTGACGATTTATTACTATTAATGTTTAATATAATTATTATTTTAAATAGAGAAATAATTATAATATTAAAACCAATTGGTCTCTGAAAGCATACTCCTATGGTATATAACAAAGGTGAATTCTACTAGCCTCAATCAGCCGTTGCTCCAGTCAAGTTGCATTAACCTGAAAAGAAAAAGCATCCTACCTCCTCACGTTTTCTTTTCTCTCTTTTTTTTCCTAAATAAAAAAATTAAATTTGAATTGTGCCTAATGCTTAGTATATTCTTGTATGCAGGATAAACACTCAAGGGAAATTGTATCCGAAAGGATATGATATTTTGAACAAAGAGATGCTTGAGACAGACAAATGCTATATGCTAGATTGTAATTCACAGTTATTCGTTTGGATGGGGAAACATACCTCGGTTACGGAACGCAAGACATCAATATCAGCTGTAGAGGTGAGGGTTTCTTTTAGTCTTATTATGCTTCTATTTTCCAATCTCCAATGCAGACCTTAAATTGAAGGGAAGTGTTATATGCACAAACATAAAAAAGGCCGAGAGGCAATTTCTATTGGGCCCTAAAGAGGATTATATCGAGCACCTACTTTGGCATATTTCTGTCCTCTTTTTAGTTCTTGTACTTGTGTAGGAGAAAAGCTTGAGCATCATCTGTGCCTTTGGTAACAATTTGAACTTCCATCCATCATCTGTTCCATCTGGAAATATCTTATGCTTCTTCCAATCTTGTACTCTTTCACAGGATTTCGTTAGAAAGCAGGACAGGTCAACCGGGACCCACTTAACTTTCCTAACTGAAGGGTTAGAAACTGCTGCATTTAAGCTCTGTTTTGATGCTTGGCCCAACACCGTGGAGCCAAAACTATACGAGGAAGGCCGAGGAAAAGTAGCAGGTTTAGTTTGGATTGCACCATAATGGGGAAATAACTTAGCAAGCAACACTCCCGTGTTTAATTTTCTTTCATTATTTCAGCAATTTTCAAGCAACATGGCTATGATGTGAAGGAGCTTCCTGAACAAGACTTCAAGCCGTGCATAAACTTGCAAGGCAGGATTAACGTAGGTTCTCAGTGTAAACAAAGTTAGATTTTATGAGTTATGGCTGCTAGCCGTGTGACAAGTTCATGTTGGCGCAATGTTGAAATTTCAGGTTTGGAGGGTAGACGGTGATAGTATTACCCTTCTTCCAGAGGTAGAACAGACAAAACTTTTCACTGGAGATTGCTATATTGTGCAATATACATATCCTGGAAGTGGTAGGGATGAGAATATAATTTATTCCTGGTTTGGTCGCAGGAGTGTTATGGTAAGGACTATGTTGTAAAACAGTGTACATTGCATGCTTTTCATTTTTTTTTCCTTGGGAAGATTTTCAGACATTTATTAAAGAGAGAAAATTGTGCTTTACTTTGGGTGTCACATCTAGTTAACTTGTCATTTCACATCATTTTTAAAAGGCTAACACTGTTTTCATGCCTATTCACTCAAACTCAATTAAGTTGAAACCAAATCTATTTTATAATTAGAAAAAATTTCTATGACGAAGTTGAGATTGTCAAATGTTTCAAATTATCAAGGTAAACATTCTTTCTAATTAGAAATCCAAATATTAGCATGATAATAAAATGATAGAAGTTTGTCCACTCACAAAATGTGACCTTACTTCATTAAAGTTAGAGCAAGATTTAGTGAGACATTTTTCAAAACTAAAAAATAAGGAACATCAATGATAGGTATCCTTTATTTACTTATAGTTCTCCAATGAGAAATTACAACCTACCAATTCGAGAGGGTCACAATCTCTCCACACTAAGTTCAGACAAACCATGCACACTTTTTCCAGAACAACTATACATATATAACCACAAAACTAACAAAGGAAGTTATAACCCCCAAACACGAAATATAGAATTCAAATATAATAACTATTATTCAAATCTAATAACCACTAAAACAACTACTGTTCCTTGCCCTTGTCCTTCTTGCGCCTTCCAGCCTATACATTGACAATTGGAGGTTTAACAATCTGCTAGCTCATCATGACAAAAGCTCTTACTCATCTATGAATCCTAAGCAATTGTTTAATAATCTAGAATAAGTAAACCATTATGGGTTGGCCTGTTTGTAAAAAAGGAGACATAGTCTCAATAAATGGCTAAGAGGCTATGTATTCAATTCATGGTGGCTACCTAAAGATTTAATATCATACGAGTTTTCTTAACACCCAAATGTTGTAGGATCAAGTGGATTGTCCTGTGCGATTAGTTGAGATGCGTGAAAGCTAGCCCCGACACTCACGGATATAGAAAAAAAACAAAAAAGAATCCAGAATAAGTAATGGCAATATGAAGTAATATGCCATGAATTCCGTTGGCCTGGATGTTGAGAAGGCCAATAAAATGGCTTATTGGTCTTTTATTGTTATGGTTTTGGATAAAAAGGTTTTCTATTGCAGCTGAAGGAGATGAATTCAGGGGCGCATCTCCAATTTTCTTATTATATTATTATCAATGCTAAGCCACAAAGGAAAATTTGGAACTTCTAGAGGTCTGTTTCAGCTTGACTCATCTCTCCTTTCCTTTTTATTTAGGTGGCTGATTTCTTGGGTTGAATGCTTCAGAGGCAGTCAACTCAGAGTTTATTGAAGGTTCTAAATCTGAATGAGATCAAGTTAGTGTCTCCCATGTCTCATCTTAAATTGTCGATGACACAATGTAGTTTCCTCATATAGCTTAATTCAAATAAGGAGTTTCTTCTGAGTGGTTCATATATCTTAGTTGAAGTCAAGGAAGGGAAAACTATGTTTAGTACTCTCAATCACGGTGATATTGAATCTCAATAGTTGGTACCTTTTTCTTTTCCCCTTTTAGCAGTGATCATATAGTTCTTAGTTTTGGGGAATCTTTCTTCGGTGAATTGAATCTGAAATTACAGAATGGAATGAGTTCCTTCTCTGTACCTAAAGCTGGTTAGTTAGTGGTTATCAAAACTCTGTCCAGTGTGCCCATATACAGTCATATCTTCAAATCCCCCCGAAATATGTCATAGTAGTTGAAAAGATGATTAAAATCTTCATTTGGTGTGGTTATATTTATTGGCCATTGTTACGTTAAGAGCAAAGATGAATTTCCCCTTCATAGATAGTGAAGTTTTCCTAGAGAGCGAAGAGCTTATGGGTACATTGTCATCAAAAGTATTGGTCCTGCGACTGCAACCAAGTGCTTACCCTTGTACACAACTATTGTAGACCGAGGACTCTATTTCAAAAATGTAGAATAAAAATCTTGGAGCAGAGGTATACTATTAAAATTTGGGGGGATGTGTGGTACACAAGGATCCCATTAAGTTTATTGTGTTTAATACTCTATAACCTTGTTGATAGAAAGCAGGCTAGCATCAAGAGTGCTTGGATTCCAAATTCTAGATCTTGGAATCTAAATGCAGAAGAAATATGAACGATAGGTGGAGGATTTTCAGCCACACCGAAC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Homology
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BLAST of Clc02G20760 vs. NCBI nr
Match: TYK15419.1 (villin-1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1327.0 bits (3433), Expect = 0.0e+00 Identity = 663/824 (80.46%), Postives = 689/824 (83.62%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G20760 vs. NCBI nr
Match: XP_008464046.1 (PREDICTED: villin-1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1326.6 bits (3432), Expect = 0.0e+00 Identity = 663/825 (80.36%), Postives = 689/825 (83.52%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G20760 vs. NCBI nr
Match: XP_004143215.1 (villin-1 [Cucumis sativus] >KGN47088.1 hypothetical protein Csa_020762 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1325.5 bits (3429), Expect = 0.0e+00 Identity = 662/819 (80.83%), Postives = 686/819 (83.76%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G20760 vs. NCBI nr
Match: XP_038901594.1 (villin-1 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1312.4 bits (3395), Expect = 0.0e+00 Identity = 658/818 (80.44%), Postives = 681/818 (83.25%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G20760 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8L7Y9 (Non-specific phospholipase C1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NPC1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 815.5 bits (2105), Expect = 8.8e-235 Identity = 399/523 (76.29%), Postives = 447/523 (85.47%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G20760 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O81643 (Villin-1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=VLN1 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 740.0 bits (1909), Expect = 4.7e-212 Identity = 417/921 (45.28%), Postives = 545/921 (59.17%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G20760 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0J716 (Villin-5 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=VLN5 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 626.3 bits (1614), Expect = 7.6e-178 Identity = 348/828 (42.03%), Postives = 476/828 (57.49%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G20760 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q67U26 (Villin-3 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=VLN3 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 624.4 bits (1609), Expect = 2.9e-177 Identity = 348/861 (40.42%), Postives = 491/861 (57.03%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G20760 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0DKN3 (Villin-1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=VLN1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 623.2 bits (1606), Expect = 6.4e-177 Identity = 345/842 (40.97%), Postives = 474/842 (56.29%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G20760 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A5BX87 (HP domain-containing protein OS=Vitis vinifera OX=29760 GN=VITISV_028790 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1474.5 bits (3816), Expect = 0.0e+00 Identity = 795/1390 (57.19%), Postives = 923/1390 (66.40%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G20760 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CZ09 (Villin-1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold571G00640 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1327.0 bits (3433), Expect = 0.0e+00 Identity = 663/824 (80.46%), Postives = 689/824 (83.62%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G20760 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CKK6 (villin-1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103502027 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1326.6 bits (3432), Expect = 0.0e+00 Identity = 663/825 (80.36%), Postives = 689/825 (83.52%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G20760 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KC54 (HP domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G185860 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1325.5 bits (3429), Expect = 0.0e+00 Identity = 662/819 (80.83%), Postives = 686/819 (83.76%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G20760 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D3W7 (villin-1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111017031 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1254.6 bits (3245), Expect = 0.0e+00 Identity = 631/818 (77.14%), Postives = 663/818 (81.05%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G20760 vs. TAIR 10
Match: AT1G07230.1 (non-specific phospholipase C1 ) HSP 1 Score: 815.5 bits (2105), Expect = 6.2e-236 Identity = 399/523 (76.29%), Postives = 447/523 (85.47%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G20760 vs. TAIR 10
Match: AT2G29890.3 (villin-like 1 ) HSP 1 Score: 741.9 bits (1914), Expect = 8.8e-214 Identity = 385/767 (50.20%), Postives = 495/767 (64.54%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G20760 vs. TAIR 10
Match: AT2G29890.1 (villin-like 1 ) HSP 1 Score: 740.0 bits (1909), Expect = 3.3e-213 Identity = 417/921 (45.28%), Postives = 545/921 (59.17%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G20760 vs. TAIR 10
Match: AT2G29890.2 (villin-like 1 ) HSP 1 Score: 739.2 bits (1907), Expect = 5.7e-213 Identity = 418/923 (45.29%), Postives = 547/923 (59.26%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G20760 vs. TAIR 10
Match: AT2G26870.1 (non-specific phospholipase C2 ) HSP 1 Score: 612.8 bits (1579), Expect = 6.1e-175 Identity = 305/488 (62.50%), Postives = 373/488 (76.43%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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