Clc02G09770 (gene) Watermelon (cordophanus) v2

Overview
NameClc02G09770
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus cv. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationClcChr02: 14256863 .. 14260246 (-)
RNA-Seq ExpressionClc02G09770
SyntenyClc02G09770
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR
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ATGGGTATTGCATTTCCCTCTTTAATTGTTTCTCCCAGGTTTATGGCATCTAGATGTATTTCAGCATCAAGCACCCATGACAAATAATTATTTCCATTGATGTCAAGGGGTGCAAATTCTATTTTTGTAAGATTTGCCATGATAACACTATCACAAAGAATTATATTTATATTAGTAATTTAATATATACTAAACATGCAAAACAACATGTAACTTACTAATTATAATAAAGAGAGAATGATATACCTTTAGAACCTACCTTCAACGGAAAACGGCAAGAGCTCGTGCTGATAATGTGTTGTAAAATTGAGGAGCAAAATGACAGAAAAACGGGAGCATGAAAATCGAGAAATTAGAATATTAAAACAATAAAATAATAAAATAATATAAAAGTAATTTAAAATAACCAAATTAAATAAAATAAACTTAAAATAAACTAAAATAAAGAAAGTGGAATTTTATGGAAAATGAAAATTCAAATTTCACCGATCTTTTCTCTTCTTTTCTCTCCAATGTGTGTATTATAATATCCACCAAAAGCCAGCATTTCATGACCACTAAGAATGTATCTTTAAGAGACACATGACCACTAAGCTTGACTACATAATGTACCTCTATTACAAATATAATATTTATAATATATACCTTAATGTTTTGTTGGGGGCTGGGCCTGAGTTGACAACTTGACCGCAGCGTTAACCGGCCCAATACCTCGGGTTAGATTCGGGGCTCCGAATCGACTTCTCCGTATACAAAACGAAAAACGCAACTTTAGGTATTCCATTCTTCTTGCGATTTTGCCTTGATTTCCACCGGCTTCTGCTTCTGCTTCTCCTTCTGCCTCTGCTTCTTCGGGAAAGGTGAGCTAATACTGTTTCTGAAGCACCGTTTTTCCTCATTCCTATTATTTGTTAATAACTCAATATTAGATTTTTGCAATCAAGTATTTGTCCCGATTCTCTGATTTTTGTTGTGCGATTGATCCCTTTTTGTTAGTTTATGTCCCAATTTTCTCCTTCGGATTTGCTGGAACCGATAATTGTTTCTGGGGTGGGGTTTATATGATATGTTGTTGCGTTAGCTGTACTCCTCTCTATTCGATTGAAAAATTTTCATGTTTTCTACTAGATGGATATCGTTGATTATTATTATTATTATTTTTAATGATTCTAAGTGCGTTTTTCTTTTTTAAAAAAATCAATTTACAAACTCCTAACACTATCAATGCTTTATTGCCTCTATAAATAGTAGCCGGTTGTGTTACTTTGGGAGCCGTCAATTGCCGCCCGCGGGCGATCCCTCTTTGTGCTCTTCGACTTAGGCCAAACCCTCTTGATATCTAGCCATGTCGTCCAAGCAAGGTACGATCTGTTACCTTATGGTTCTGGAAAATTTGGGCCTTTTTATTTCTGTCTCATCTTGTGTTTGGTAGTAGTAGTATATAATAGACTGAATTAGAATTCCCTATTTTACCGATTAAAATCGTGACTTTGAGAATCAAATGTGTTGTTTGTTTTTATAGGAGGGAAAGCAAAGCCTCTGAAGCAACCCAAGGTTGACAAGAAAGATTATGACGAGGTTTGCTTTTAATTTATTATTTTATGTATCTATGCTTTAATTCTAGTTTGTTCCTACTTTTCATTAGGTTAAACTACCATTTTGGTCAATGTAATTTCATTCTATTTTAGTTCAATCCCTTTTCTTACAATATATCTTAAAAGTAAAGGATTTCATTGAACTTTCAAATCAGTGACCGGCTTAGCTAGCCCACTTTCAGGCTCTCATCAAAATTTCCCTTCTTCTGAGAGGAGAAAAGAATATTAAAGTTGATGGTAGTTTTTTTCGAACCTTTTTTCTGTTCTAATGGTAAGCACCATTATTGTCCATTCCATTCACCGGTGGGAGGGGAGTTCGAGCTAAAATTATGAATGGTTGCCCTCACCTGAAATTGCTATCTTTTCCATTCATTGGCTATTTTTAATTAATGGTTGCTTGGTGAAGGGACAATGGGGGGAACTGTAACTCTCTCTACCTTAATTTGTTATGAAGAAATTCCTTTATGTAGTCAACTTAATAGCATGGCAAGGTGACTGGACTACTGTTTGAATTTTACTGTGTTTTCTCAACAGGTTGATCTCGCCAATATTCAAAAGAAGAAGGAAGAGGAAAAGGTGAGAACTTGAACTTTAAAGTTTAAACTGTCACATGATATTTTTTGTTCTGGTCCATCGATTACTATAATTTTGGGGAGTTTGATGTTATACAGGCTCTCAGAGATCTTAGAGCAAAGGCTCAACAGAAGGGGACCTTTGGAGGTGCTGGGCTAAAAAAGAGTGGGAAAAAATGAGTTCCCACGCAATATATATAGAGATTACTTGAGCTGAAATTGCATACATCTGATGTGTTTCTAGTCAGTTGATTGTATGACATGTTATCCTCTGCATAAAATTGAATAACGTGACGCAGTATGCTTTCAGACTTTCTTGTTTGGTTGTGTGTAAAAGCGTGGAAGATAATGTTATGTGGCCCTTGTTTCTGGAATGGATATTGAATGATTATAGAAGTTGGAGGCTTGCAATATTCTAAATTATCTTAGGCCAAAATCTTATTGAAATTAGGGATTTCTACGCTATTGTTTTCTAGATTCCATTCATTTCATAAATAGTATAATGGATTACAAATTTTCATTAATGTTGGTGTTTATTTATCATTAAGTTCTAATCCATGATTTTTATAAAACAAAAATAAATAAATAGATCATTTGATCTCTCCCATGCATGGCCTAGAAATTTGTGTATTGTCCATTAATGTTTTTTTTTGAAAAAAATAAAAAAGAGAAAAATAGTCAGAATCCCTTTTCTTTCTCCTTGCTTGTAAATCCTAAATCATTTCTTCCTAATACTCTTTTTTCTTTTCTCGGCAATGCTTATGCTGTTTGCTCAGTGTCTTCGAAGATCGAAGATCCTTTTTCACCATGTGCAGTTGTTGGATTTTTGTTTAATTGTTCGAGCTCTGTTCTGGATCTTCGTTCTAGCTCACTCGATTGATGAGCTCTGTCGACCTTCATGAACAATTCCATCCAGTGTTTGTTTCCGATTCTTGATATGAGCTTCAGCTTCGTTGGCCATCGTCGTGTGAATGGTTGATCATTAAGCGTTAGTTCAAACATCCATCTTTGTTCAAGTGTTCGAGCTCTATCGTGGATCTCTGTTCTAGCTTTGTGTTCTGCTCGCAGTATATAATTCAAAATCTCAGTTTATTTCAAATAACTAATATATATGATCGATTTGATCAATGAATTTGAGGTTCCAAATGGATGAGCGATTGATCTATGTGTATTTGTATATATATTTTTTTAATTTCAAATATATATGGGTTCATTGC

mRNA sequence

ATGGATTCGGGGCTCCGAATCGACTTCTCCGTATACAAAACGAAAAACGCAACTTTAGGTATTCCATTCTTCTTGCGATTTTGCCTTGATTTCCACCGGCTTCTGCTTCTGCTTCTCCTTCTGCCTCTGCTTCTTCGGGAAAGTAGCCGGTTGTGTTACTTTGGGAGCCGTCAATTGCCGCCCGCGGGCGATCCCTCTTTGTGCTCTTCGACTTAGGCCAAACCCTCTTGATATCTAGCCATGTCGTCCAAGCAAGGTACGATCTGTTACCTTATGGTTCTGGAAAATTTGGGCCTTTTTATTTCTGTCTCATCTTGTGTTTGGTAGTAGTAGTATATAATAGACTGAATTAGAATTCCCTATTTTACCGATTAAAATCGTGACTTTGAGAATCAAATGTGTTGTTTGTTTTTATAGGAGGGAAAGCAAAGCCTCTGAAGCAACCCAAGGTTGACAAGAAAGATTATGACGAGGTTGATCTCGCCAATATTCAAAAGAAGAAGGAAGAGGAAAAGATCCTTTTTCACCATGTGCAGTTGTTGGATTTTTGTTTAATTGTTCGAGCTCTGTTCTGGATCTTCGTTCTAGCTCACTCGATTGATGAGCTCTGTCGACCTTCATGAACAATTCCATCCAGTGTTTGTTTCCGATTCTTGATATGAGCTTCAGCTTCGTTGGCCATCGTCGTGTGAATGGTTGATCATTAAGCGTTAGTTCAAACATCCATCTTTGTTCAAGTGTTCGAGCTCTATCGTGGATCTCTGTTCTAGCTTTGTGTTCTGCTCGCAGTATATAATTCAAAATCTCAGTTTATTTCAAATAACTAATATATATGATCGATTTGATCAATGAATTTGAGGTTCCAAATGGATGAGCGATTGATCTATGTGTATTTGTATATATATTTTTTTAATTTCAAATATATATGGGTTCATTGC

Coding sequence (CDS)

ATGGATTCGGGGCTCCGAATCGACTTCTCCGTATACAAAACGAAAAACGCAACTTTAGGTATTCCATTCTTCTTGCGATTTTGCCTTGATTTCCACCGGCTTCTGCTTCTGCTTCTCCTTCTGCCTCTGCTTCTTCGGGAAAGTAGCCGGTTGTGTTACTTTGGGAGCCGTCAATTGCCGCCCGCGGGCGATCCCTCTTTGTGCTCTTCGACTTAG

Protein sequence

MDSGLRIDFSVYKTKNATLGIPFFLRFCLDFHRLLLLLLLLPLLLRESSRLCYFGSRQLPPAGDPSLCSST
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Clc02G09770.1Clc02G09770.1mRNA