Clc02G05990 (gene) Watermelon (cordophanus) v2

Overview
NameClc02G05990
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus cv. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationClcChr02: 5661262 .. 5666741 (+)
RNA-Seq ExpressionClc02G05990
SyntenyClc02G05990
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGAGTTCTGTGTCAAAAAATGACCAATCTTTAAAGCCAATTAAGGATATCGATGACGAATTTGTGCAAGAGGTTGGAAGGAAAGCAGTGGAGCACTACAACGAATCGAAGGTAAACAATAACCATGTCAAGTTCAAGCGCGTGGTGAGTGGTCTGAGTCGGAGTGGTCTTTTACCCACGGTTGAACAGTCATATGAACTAGTTGTAGTAGTTGAAGAAGATGATTATAATAGTTCATATGTTGCGAAGGTTAATGTCATAATACTATCTTTTAAGTTCCCTCCAACCTATAACGTCATAGCTTTCGAGCCTATTCTCGAGTACAAAAAGTAATAGAACAAAGTTTGGGTGCATCTAAGACTAGCTACATTGAGTGATATCACATGATAGACTGCATAAAGATGAGTATAGTCTAAGATACATGCATCCAAGTTGTTAATGAAATATATTAAAATAATGAATAAAATAAGATAGGTGGACTTCACTTATCATGTATGTCTTCTATCAATGAATAAAATAATGAAAGTTATCGACTTATAGTTGTCGTACATCCAAATGTAAGTGGTTAATTTCTTTGTCTCCTTTTAATTTGTCTCTAAGTTTTTAAAACTTAATTCACACTCCAATTACAAATCATAGGATATGAAGTTTATTATGGTTGTATATTGCGTATGTTAATATGAATAATATTAAGTAGATAATTTGGGCCGTTTCTAATCTTTCAACACCTTCCATCTTTGGATAAAGTTAATAAGTTAGTAGTATAGTATTAAATTTCTATCGACGTGTCGATAATATTTCCACGCTTCTATGGGTTTGACATTGATGTGAGGGATAAATCGATGTTTCCATTATATCGGAGAAAAAATCATAGTACATAAAAAATAAACAACAAAATGACACTAATGTAAACATAATAATATAAATAATAGATATCTTAAATTGTTTAAAAATCGTAAAATGTTTATTTACTAATTTAAATTTATTTTTTTGAATTTTTTTCTTTTTAATAATTTTTTCATAAAAATGCTTACACGTCTAGAGAGCCTAATAACAATGATCCCAACACAAATATGAAATCTTTCCTTTCCAACAACTAGTTTATATCAACTACTAAGCATTTCACCACACACTCCTCAACAGAATATAGATCACAATATTTGAACAAGTCATAAATACTAAGTGAGATAAACCATGCAAGTTTCTAATTACAAATCCTTCAAAACTAAAGCTAGCCACCCTCAATAAAAACAATGTGGAATTATTACATGTAAAGGTTAATTGATATGCAACCTATGCGCAATCAGTGGCAAACTTCACTCCAATACGCTCATCGAACTCAAATGCTACCTAGCGGAAAATTTTGAGAAAAGAATGAGTTAAAAAGCCAGTGAGTGATGTGGATTTATAAGAAATTATTTTAAGAAGAAAATATGTTACATGCTCAATTGAAATTTTAAACTTTGTAAAATAACAGAAATCATGAGCAATTTCAAGACCCGAGATAATTAAAATACATAGAAATTTCGTGATAGTAGTTTTGGAAAACATAGCAATAATTTGGTAAAAATCATCACAAAATCTATATTCAAATCTTTAGTCATACTGGCATAAAGAAATCTTAATATGCACATTGCAGAGCAATCTCTAGCTATATTATGCACCGAGTGATGGAAATACCGGATTGACATGACTCATAATCTTGAAAATCAATAATTTCATAAATACACTCGGTTGGGAGAATGATCTATTTCTGCTAGCTCATTACTCAAATACATTGTATTTCAAAAAATTGAATTACTAGAAGAAGCGTGGTCAACCACTACACATAAATCATTATGGGGGAGTCAGATAAAATTGTCATCAGCCACGAAATATCCTTGTCTTCAATAATCCTAATCAGATTCGTACTATTGGAACCATCCATATACATTGTTAATTGTGAGATATACATAGATTGCCAGAGGGAAAAAGCTTACCTTAGATATATTCAACAAATTGTTGAAAGGATGAATCTAATGGAATATATGTCTCAACAACTCAAAAATCATGATAATATGTAACGACCCCAAATCCTTGAGGTAAATTCTCCTAATAAATTAAATTAAGTCATTATGCATAAAAGGGAAATTGTATTTATTTATATGCATTTATGTATTTATTTAGGTTAAGTAGAAAGTTTCAAAATTTGCATTTATGTGATTAGAGAATCTTAAGTGGAGTTAAGTAAAATGTTGGGATTGGGTAGAAGATAATTTTATTCTCACCTTATTGTTGGGGCAAATGGAATAAAATAGATAATTTTGGTAGGAGTGGGGTTGAAGAAACAAAAAGGAAAAAAAAAAAATTGGAAATTATGGTTTAAGGAGGGAGAGGGATTAGGGTTTAGTTTAAACCCACCCTCCTCGTTTTCCGTGCAGTCAAAAAGAAAAGGAAAAGTGATGTGGAACTTTTGTGTGTTTACCGCAAGTGTACGGGTCAAGTTATAATATAAAACGGTTAAGTCCGAGTATCGTTTCCACTAGAGATCCAATTGGGAAGGTTTAAGTTATTTAGCTATTCTAGAATTGAATCAATTTTATTTGAGGATTGGAATTCAACTTTTGTTTTTTTTGGGAAAAAGAAAAATCAAGCAAGAAAATATCAAAGGGAGAATTGCAAGAGTCAAAGAGAGTTCTAGGGTTTCAAATCCTTGTTTGTTTCATCATGCAAAATTATGGATTTCATGGATTTAATTCTTATGCCTAAGTCTAGAAACTTAATTCCAAGTTATCTTCTCTCAAAGACAACTCTTTCTCATGCAACTTGATTGATAGTTAATCTCTTAAAACCAATACAAAATTACATGGCATTAAAACTAGTCTTTAGCAACTTTCATTGTAAACCTAACTACTCTCGTGATAGATTAACAACGATTCATTGTTATAGATCAAATTAAACATATAATCTCTCGATTCATACATCTAATCTAACATGTGAAGGTGGCCAATCTTCAAGAATTAAACACAATAACAATGAAAAGCATATTTATTTGAACAAAACCATGAGTTTACAAAATTATCATGAGTTTACAAACAATTCATCAAAAACCCTAAAACCAAAGAGTTTAGCCACTCATAGCGTAAAGCAACATATTGATAAAAAAGAATCAAAGAAAGAGTGTAAAGAATAGGGAAACTCTACTGAAAAGAGGTTCTTGATTGAGGCAGCACTATCACGAACTCTTTGGCTCTCGCGTCGGACTTCGAAGGGCACCAAAACTATCTCGAACTCTTTTCCTCTTCCTTGCGGCTAACTCACTCTTGGAACTCTAGCTTAATTCTCACCTTTTCGAATCGTTCTCTTGTTCTTCAACTTTCTTGATCTTCTTGATATTTCTTCCCCTCTTTTTGGCTGCTGAAAACCCCTAAATTTATAGAGTTTGGCTGCCCAAAATTTAACCTAAAATACAAAACTTGCGTTTAAATTAACGTTGGCGCCGCGGCGCTAGGGTTGCGGCCAAAATTTAGTTGCTCTCGGGTTTTAGCGCTGCGACGCTGTCTTGCGTTCTTCAAGGATGCGTTGAGGCAGCGCCTTCCCAGCGCCGCGTTGCTACTCTGCGTCCATGCTGATGCGTTTCTGCTTCAGCGCCGCGGCAGCGCTGCCTTAGCGCCGCGGCGCACCATGCGTTTCAAGCAAGGATGAGTTTTTCAGCACTTTTTCTCCATATTCTTGCTCGGTTTTGATCTTTCAGTCGTTTCTTCTAATTTTCCTCATTTTAACCTGAAAATCACTAGCAAACAAGTGAAATCTAATATAAAACTCCCTTAATTTGAGAGAATAATAAGCATTTTTCAAGTGCTTATCAAAAAGCCATTCTCTCTCTCTCTCTGCCGCCGCCTCTCTCTCCTCTTTTCCTCCCCGCCGCCGCTTCCAATTTCCTCTGCCCCGCCATCTCTCTCTCGCTCCATCGCCGGCAGTTTCCGAAGGTTGCACGTCGGGTGTCGCTGGATTCTCGCCCTGAGTGTCGCTGTCGGCCTCTCGGCTCTCGCTGAATCTCATTCTCCTGCTCTCACTTTCTCCCATTCGCCTCACGGTCTCCCGCGTCGAAATCACCCTCACGCTCTCGGGCTCTCGCTGTCTCGCTGGGTTCCGCTCTCTAGCTCTCCCGCTCGACTCACGTTCCCGGCGCCCGGTATCACCGCAAGCCGTCGGACTCTCGCTGTATCGCTGCCTCCCACTCTCTCGGCTCTCGCTCTCTCGCTCAAATCTCGCTTCTCGCTCGGGTTTCGCTCTCACTCGGATTTTTGGCTCTCGGCAGCGGTTCCTTTCTCGTCCGACCAGAACAGTACCCTTAAGTGAGTATCTCAAACCTGAGTGGGTTAGTTGCTTATTTTTTTTGTGAATATTTGGGAATTTCGAATTAATTGGTACATCTTAATAGGTGTTTGGCGATTGTTTTAGTCCGTAGGATCGGAGGAAGCTACGAGTTGGATCACATTCGGGTAAGGACTCTCTTGAACAAATTTTAGGTTGCTTATGATAGACTAGACTTGTAGGCTAACTTAAGTTGGGGGAATTTTATTCCCAGTTTATTCAGGAGTTGATACAAGAGTGGCAGTGTGGTTATTTGATGGATCGATCCTCAGGTAAGTGATCTTACTACCTGAACCGCCTTCGGGCCATACGTTTAGTTGCCATGAAGTAGTAAATTACCAAAGCCCTTATGATATAGCATGCTTGTATGAGATTCCCATGTCTAAAAGTTGTATGTGCCTAATAATGCATAAGCCTATGCCATGATATGTTATGAATAGTATAGTATTTTAATGTATGAATCCATGGAATGGAATGAGTATGAATTTGATTGTTTATGTTTCATGAGTAGAGTTGCCTCCCCTATATTGGTTGAGTGTCCACAGGAGGTTGTGTTCCTTCGGGATCACTAGAGGATGTGCACCTTCGAGTTCACTAGAAGTTGTGTTCCTTCGGGTGCACTAGAGGTTGTGTTCCTTCGGGAT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mRNA sequence

ATGAGTTCTGTGTCAAAAAATGACCAATCTTTAAAGCCAATTAAGGATATCGATGACGAATTTGTGCAAGAGGTTGGAAGGAAAGCAGTGGAGCACTACAACGAATCGAAGGTAAACAATAACCATGTCAAGTTCAAGCGCGTGGTGAGTGGTCTGAGTCGGAGTGGTCTTTTACCCACGGTTGAACAGTCATATGAACTAGTTGTAGTAGTTGAAGAAGATGATTATAATAGTTCATATGTTGCGAAGGATGCGTTGAGGCAGCGCCTTCCCAGCGCCGCGTTGCTACTCTGCGTCCATGCTGATGCGTTTCTGCTTCAGCGCCGCGGCAGCGCTGCCTTAGCGCCGCGGCGCACCATGCTGCTTATCAAAAAGCCATTCTCTCTCTCTCTCTGCCGCCGCCTCTCTCTCCTCTTTTCCTCCCCGCCGCCGCTTCCAATTTCCTCTGCCCCGCCATCTCTCTCTCGCTCCATCGCCGGCAGTTTCCGAAGGTTGCACGTCGGGTGTCGCTGGATTCTCGCCCTGAGTGTCGCTGTCGGCCTCTCGGCTCTCGCTGAATCTCATTCTCCTGCTCTCACTTTCTCCCATTCGCCTCACGGTCTCCCGCGTCGAAATCACCCTCACGCTCTCGGGCTCTCGCTGTCTCGCTGGGTTCCGCTCTCTAGCTCTCCCGCTCGACTCACGTTCCCGGCGCCCGGTATCACCGCAAGCCGTCGGACTCTCGCTGTATCGCTGCCTCCCACTCTCTCGGCTCTCGCTCTCTCGCTCAAATCTCGCTTCTCGCTCGGGTTTCGCTCTCACTCGGATTTTTGGCTCTCGGCAGCGGTTCCTTTCTCGTCCGACCAGAACAGTACCCTTAAGTGTTTGGCGATTGTTTTAGTCCGTAGGATCGGAGGAAGCTACGAGTTGGATCACATTCGGGAGTTGATACAAGAGTGGCAGTGTGGTTATTTGATGGATCGATCCTCAGAGGTTGTGTTCCTTCGGGTTCACAAGAGGTTGTGTTCCTTCGGGTTCACCAGAGGTTGTGCTCTTTTGAGTACATTAGAGGTTTGTGTTCCTTCGGGATTACCAGAGGTAAGAGTTTCCTTCAGGGCTCTAGAGGTAAGGGAAAGAACGTGCTGGCGAATGACAAGAAGAATCCTTGATGGCATCACGGGACCCATAGTAGCTTCCGCTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGAGTTCTGTGTCAAAAAATGACCAATCTTTAAAGCCAATTAAGGATATCGATGACGAATTTGTGCAAGAGGTTGGAAGGAAAGCAGTGGAGCACTACAACGAATCGAAGGTAAACAATAACCATGTCAAGTTCAAGCGCGTGGTGAGTGGTCTGAGTCGGAGTGGTCTTTTACCCACGGTTGAACAGTCATATGAACTAGTTGTAGTAGTTGAAGAAGATGATTATAATAGTTCATATGTTGCGAAGGATGCGTTGAGGCAGCGCCTTCCCAGCGCCGCGTTGCTACTCTGCGTCCATGCTGATGCGTTTCTGCTTCAGCGCCGCGGCAGCGCTGCCTTAGCGCCGCGGCGCACCATGCTGCTTATCAAAAAGCCATTCTCTCTCTCTCTCTGCCGCCGCCTCTCTCTCCTCTTTTCCTCCCCGCCGCCGCTTCCAATTTCCTCTGCCCCGCCATCTCTCTCTCGCTCCATCGCCGGCAGTTTCCGAAGGTTGCACGTCGGGTGTCGCTGGATTCTCGCCCTGAGTGTCGCTGTCGGCCTCTCGGCTCTCGCTGAATCTCATTCTCCTGCTCTCACTTTCTCCCATTCGCCTCACGGTCTCCCGCGTCGAAATCACCCTCACGCTCTCGGGCTCTCGCTGTCTCGCTGGGTTCCGCTCTCTAGCTCTCCCGCTCGACTCACGTTCCCGGCGCCCGGTATCACCGCAAGCCGTCGGACTCTCGCTGTATCGCTGCCTCCCACTCTCTCGGCTCTCGCTCTCTCGCTCAAATCTCGCTTCTCGCTCGGGTTTCGCTCTCACTCGGATTTTTGGCTCTCGGCAGCGGTTCCTTTCTCGTCCGACCAGAACAGTACCCTTAAGTGTTTGGCGATTGTTTTAGTCCGTAGGATCGGAGGAAGCTACGAGTTGGATCACATTCGGGAGTTGATACAAGAGTGGCAGTGTGGTTATTTGATGGATCGATCCTCAGAGGTTGTGTTCCTTCGGGTTCACAAGAGGTTGTGTTCCTTCGGGTTCACCAGAGGTTGTGCTCTTTTGAGTACATTAGAGGTTTGTGTTCCTTCGGGATTACCAGAGGTAAGAGTTTCCTTCAGGGCTCTAGAGGTAAGGGAAAGAACGTGCTGGCGAATGACAAGAAGAATCCTTGATGGCATCACGGGACCCATAGTAGCTTCCGCTTAG

Protein sequence

MSSVSKNDQSLKPIKDIDDEFVQEVGRKAVEHYNESKVNNNHVKFKRVVSGLSRSGLLPTVEQSYELVVVVEEDDYNSSYVAKDALRQRLPSAALLLCVHADAFLLQRRGSAALAPRRTMLLIKKPFSLSLCRRLSLLFSSPPPLPISSAPPSLSRSIAGSFRRLHVGCRWILALSVAVGLSALAESHSPALTFSHSPHGLPRRNHPHALGLSLSRWVPLSSSPARLTFPAPGITASRRTLAVSLPPTLSALALSLKSRFSLGFRSHSDFWLSAAVPFSSDQNSTLKCLAIVLVRRIGGSYELDHIRELIQEWQCGYLMDRSSEVVFLRVHKRLCSFGFTRGCALLSTLEVCVPSGLPEVRVSFRALEVRERTCWRMTRRILDGITGPIVASA
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableGENE3D3.10.450.10coord: 10..85
e-value: 1.6E-5
score: 27.0
IPR000010Cystatin domainCDDcd00042CYcoord: 15..50
e-value: 1.42053E-4
score: 38.9944

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Clc02G05990.1Clc02G05990.1mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
molecular_function GO:0004869 cysteine-type endopeptidase inhibitor activity