Clc01G19700 (gene) Watermelon (cordophanus) v2

Overview
NameClc01G19700
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus cv. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationClcChr01: 31870208 .. 31873596 (+)
RNA-Seq ExpressionClc01G19700
SyntenyClc01G19700
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR
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ATGGGAAGCACTTCCATGAAATTCCTGATGTTGGCGCCAAGCGCTTTCCTGGATCACGATGGTTTGTCCTTTTCAACAAAGGCATTTGAACAATTTTGGGACAATAGCCATAAACTCGATTTTGTACTCGTTGCGGGATGTGACTGAAGATGTTGATTTTCAACATAACCGTGAGCCTAAAAGTTCACAATTTTGTTTTTAACAAAAAAAAAATTAATAAATAAACAATAAATAATTTTGGTACATACAATTGATTTAGTCCCATTGATAAACTGGCTAAATGTCGTATTTACTTATAAATTATAAAGACAAATGGTTATACAAACCAAATTATTGACAATTAAATTCCATAAACTTTTCACCATAGCACTCAATTACAACATGTTGAAATTCAATGACTATTATCATAGAATTGTTACACATCAACTAAAATATTATTTTTATAAAAGTTCAAGAAATAACAATGATTTTTTAACTATATTAAATGATATGTTTGGGTGGAAGTAATTTTAAATTACTTTAATCATTTTCAAAACTATTCAAAAAAAAAATATTTTTAATTATTTACAATCAATTTTAATAGTATGAAATATGTGTTTAAAAAAGTAAACTAAATATTAAAAGAGTGATTAAATGTGTGTGATTTTAAAGATGACAAAGTAATTTTAACAATTTCAAAATGTCTTCCAAACACTTAAAATAAAAATATTTTGGAGTAAATCTTAAATGGTTAAAATCAATTTTTTTTTTTCCATTTAAAATCACTACTAAACATATTTTTAACCTTAATTCATGCCATTAAAATTGATTTTAAAATATTAAAATTATTTTTTATTGATTTTGAAATTGATAAAATTATCACTTACAAAAGTTTCAACCTCTAAAAAGACAAATTTTGGTTCCTAAGCTTATGTTTATCTGACTTCAAAAAATTTATTTCCTAGTTTCCTTTTTCCTTTTTTTCTAAACCCTATTTCACCTTCAGCCACCACTTCCCAACCATAACCACCAGCCACTGCACCCGCCCCGCCGCACGCCGCCATTCGCCCCACGACGCTCATTTCTCAGATCCCGAAGGTATCCCTTGCAATCACACTCAGCCTAAGCTTGTCCCAATCTCTCCCTGTGGTAGCACAATCTTCAGTCGCAAGCCCCAATAATCCCTCCTCTCTGTTTCGTCTTCTCTCTCGATCGCTCCCCTCAATCTCACTCACTTGGCCTACTTCAAGGTTTGTCCTCTCTAGGTCTTTCTCAGTTATGATTGCTACAATCTCGATTGTATATCCATATATTGCTCAATATATATCTCCCATAGCCTCAAGATGTTATTCGATTGTCTAATATGAGTAAGTCAGTAACTACTTTTTTCCAGCAGTGTAACGGGGATTCGATTTTTACACTCGCAGTTTTGTTTATTATTGATGTATAAACGTTAGTTAATCTGCTGTTTAATGACGTTTTTCTTGCACGAGTATTGTGGTTTTTTCTAATTGAAGTAATGGCTCTTTTCTTTCTTGAAATTGCGGGTATTCTATTTGCAAATCTTCTGTATGTAGAGGATTATCAGCTGTATACCTTAGTTTCGGAATATTCAAATTGCTTGAGATATGAATAGTAACTTGTTACGGACAACTTTTGTTTGGATGGCTTTATTATTGTTGAAGCAGCTTCTTTACTTTGTCTGAATGTGATGTGATTTCAATTACCATAGTATTCACCTTTGCATTTTGATGATTCCCTTTTCTCTTCATTTCGATAAACTTCTATCTTTTATTGACGTCGCAAGGTAAGCTCATTACATTTGTCTTTTTCTATAAATGATCCTTTGCCAGTGTTCTCCTATATATTTGCTATACTTCTGTATATCAATGAGATTCAATTTTCTAAGCTTTGTGTTCCAATCCTTATCTTGAAGCTTCAGCTACCACATCATCTTTAAAAGCTGAGTTTTAAATTTTATATCAGAATCAGAGTCTAAACACTACCTTGCTCCTGTGTTTTTTCCTTTTCCCCATTCTTGAGTGAGTTTCAATCTTAATCTTGAAGTTTCATCTACCACAGGGCTCTCTTAAAAAAGCTCAATAAGGGCCATAGGTATAATAGACTTAGAGGGAATGAGTTTTATTCACTGTCGCCACCTACTTAGATTTGATACTTTGGGGGTGTTTGACCTACCGACTTCATAAGTTGATATTAAATAACTCAACTCCACCAACTTTAATGGTGTTCACTATTAAAGTTTGCACATTTATCTAAGAACTCCATCTTCTTCCCCTCTTTCTCTCTTTTGCATATTTATCTAGGAATTCAACTAAACAACTCTACATCCTAAACCTAGATTTCCTAACTCCAACATATTAACTCTAGATGTCAGATACCCATATAAGTTTCTTTGACACTCAAATGTTGTAGTGTAGGGCATGTTGTCCCATGAGATTAGTCAAGGTGTGCAAGTTGGCTTGGACACTAACGGATATTATAAAAGAAAATTTATTTACTTATGTTGTGGGGCGTTTGGATGGGAATTTGGCAACCATATTGATGGTTTGTGGGGAGTGTTGATGCGCTCTATAGCAGCTAGCCTTGAGGACCTTTAGAGAGTGATAGGTGGGTCAGATGGCTCATCATTGTGGAGTATCTATCTCATCAGGTTATCATTCTCGTCTATATGGGGATCAAGATAATTGGGTGAGATGGGATGAGGAGTGACTGACGAGATGATGGATTATCTTGGTTCTGCTAGTTTATCTCTTTATATTTTAGATTCACTCTGCTAAATTTATCTCAACCTAATAATACATCTTTCAAGTCTGGTGGAGATTTGATAGGGTTTTGGAGCAGAAAATCTTTAACCAAATGCCAATCACATGGACAGTTTGAGGGTGCGTTGATGGGTTCACAGCAAACAGGTTGGTTTCTATATATACCATCGAGGAGTGATGAGAAATTGGTGGGTTGGGTGCTTCCAGGTTGTCGAATCTCTCTAATCAGGTCGATAGCATTTTATAGTAGAAGTTTATAAATTCAATTCCACTTGATGCTAACTAGCAACTATCATGGGGTTTTGAACCAATAATCTTGTGAGATTTCAAGTGATTGCAATTATTTCCTGCCCATTCTTCTTGGCTCACCAAATTATAATTTTGGTGATGTATTTTGAAAGTTCATTTCCAGTTACAGTTTTAGTGCAATACATAACAAGCCTATTGACAATAAACTTTGCTGCTTGTTTAATGTTAACCATTTATATCTCTTCTGTTTCCAACATATATGAGTAGACTAAGTACTTGGCAAATTTCATCTTACTAGGTGAACAGGAACTATAATGGAGGCTAAGTTTTTCCGGTTCCTGAAGATTGTGGGAGTTGGTTACAAAGCCAGAGCTGAAG

mRNA sequence

ATGGGAAGCACTTCCATGAAATTCCTGATGTTGGCGCCAAGCGCTTTCCTGGATCACGATGCCACTGCACCCGCCCCGCCGCACGCCGCCATTCGCCCCACGACGCTCATTTCTCAGATCCCGAAGGTATCCCTTGCAATCACACTCAGCCTAAGCTTGTCCCAATCTCTCCCTGTGGTAGCACAATCTTCAGTCGCAAGCCCCAATAATCCCTCCTCTCTGTTTCGTCTTCTCTCTCGATCGCTCCCCTCAATCTCACTCACTTGGCCTACTTCAAGGGTTTTGGAGCAGAAAATCTTTAACCAAATGCCAATCACATGGACAGTTTGAGGGTGCGTTGATGGGTTCACAGCAAACAGGTTGGTTTCTATATATACCATCGAGGAGTGATGAGAAATTGGTGGGTTGGGTGCTTCCAGGTTGTCGAATCTCTCTAATCAGGTGAACAGGAACTATAATGGAGGCTAAGTTTTTCCGGTTCCTGAAGATTGTGGGAGTTGGTTACAAAGCCAGAGCTGAAG

Coding sequence (CDS)

ATGGGAAGCACTTCCATGAAATTCCTGATGTTGGCGCCAAGCGCTTTCCTGGATCACGATGCCACTGCACCCGCCCCGCCGCACGCCGCCATTCGCCCCACGACGCTCATTTCTCAGATCCCGAAGGTATCCCTTGCAATCACACTCAGCCTAAGCTTGTCCCAATCTCTCCCTGTGGTAGCACAATCTTCAGTCGCAAGCCCCAATAATCCCTCCTCTCTGTTTCGTCTTCTCTCTCGATCGCTCCCCTCAATCTCACTCACTTGGCCTACTTCAAGGGTTTTGGAGCAGAAAATCTTTAACCAAATGCCAATCACATGGACAGTTTGA

Protein sequence

MGSTSMKFLMLAPSAFLDHDATAPAPPHAAIRPTTLISQIPKVSLAITLSLSLSQSLPVVAQSSVASPNNPSSLFRLLSRSLPSISLTWPTSRVLEQKIFNQMPITWTV
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Clc01G19700.1Clc01G19700.1mRNA