
Clc01G09700 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAAAAGGGAATATATTGTGGGAGGTAACTGTAACAGTTGCCGCTCACATCTATTTTAATCGTCTCTCCTTCTATCTAATACTTTCTTGTTCTTAGGCTATGTCAATATAACCGTCGTTTCCTCGCCTGTTTAGAATATAGGGACAAAGGTGATAAATCACACAAATGCTTGTATTTTATCGTACTGTAGTCTCGCCGAACATTTCTTGTTCTTTTTGACGACTTGTTGCTGAATTATTGTATATGAATAAGATAAATCGCCACAATCGGTTTTCCTCAACGACGCTTATGTCGTGACAACTTTTGCTAATTTTCCGATAACAGCTACAGTTGATAGAAGAAATAAGAAATTAATGTGAGTGTTGAGGAAAAGAGATTCCTTTATGTGCCAAGATTAGAATGGTAACAGTAAAAAATCACACGAGTTTATAGCGTCAAGTGTAAATCTAAATATAGTGAAATGAGTACGTGGGTGTCGTCCTCATGATTGGCATGCTACTTGGTCGAGTATTGTAGTTACCAGCCGCTTGTCTTATCTTGAGAACCTAACAGAAGAAGTGGAATTTATCTACAATATACCTAAGATGTACTTAGTCGGATACAACAATGCGAGAAGACACTTCAGAGCATACCTCATGTATTGGAACAACATTCGGCCAACTGAATAACACAAACAAAATTTTTGTGAACTTTGAATGCTTACAGACGCCATAGGTAGCTGGTCAATGTTGTCCTCTCTCGATCTCGACGCGTTCAACCCCGCTGCTTTTTTACTTGGAAGCTCCAACTTATGCGTCCAGCTGGTCCAATTAGATCATATTATCGTCCAAATCGTCGATGTCGTTCTAATTGGTCAAAATCAGACAAAGCCATCAAATATAGACGCGAGAGCACCAAAATACATTGCAAAATTGTGAAAATTGTGATTCATTCGTGGAAACGTTCCTGTGTCGACCGAAAATTTCAAAAGTTTTGTAGATAAGTGATAAACGATGACGGTTTTAAAATGTCATCAGAAGGAGCATTTGATGGCAGTTCTGGACCTTTTGGGTTGCATGCAAATATAATGGGATTGCGCTTTGGATGGCCATTAACAGCGCCGGAACTGTTTACGAAAATAAAATTAGACGCTTTTATATGGGTTTGGCAAAGTTGAGTATTAACGAATATGTTAAAAATCAGTTGTTAAACACACGTCGATTCTCACGCCTATTAAATTCAGTGACACGACCATTCAACAAGTGGTTAACACATTTGATTTATTTTAATAAAAAGAAAAGAAAGCCAGCACGTCGCTTTTGGAGACTTTGAAAACATCACCTGCAAACATCAACAACAAAATGTCAATTTTGGGTTGTTAGTTTTACTGCGAAAGCTTCTTGCCAAAAGGATTTCTAACAAATTTCGTACCTTTCTAGTTCCTCGAAAAACGAACATGTTATTTTTAGCTTTTATGCCAAGATGGTACCTTGCTTTCAATTGTGGCGGCAATGCTATATAAAAAGGAAGCAATAGAAGAATGAGATGGGCAAACACACAACAATAATGGTGTCAATTAGTTCTTGTAATGTGTTTTTCGGAGCTTGCGCTCTCATACTCCTTGGGCTGCACATTGCAACCTACCAAGCAGATGCTAAAAATTTTTTTGTAGACGACGGAGGCTTCCCTATTATCAACAACGTATTGAGTGACCCGAGTACAAAACATCCAAAAAGGCATATCCGTTTCTCAACAGGGAAACCCAAGAGGGTACCTGACTTCGATCCACCTTCCAGCGTGGGGATACTATCGAAAGAAGAGCGCACTACCCCGTCCGGACCGAGCCCAAGAACTTCGGACAATCCACCACCTCCTCCACCGCACGTCTCGTCCACCATTTTGCATAAGCAATCTAGCATCAACTTCGGAATGTTACCGAAAGGTGAGCGTATTCCTCCGTCTGGGCCGAGTCAAAGAACTTCAGACAGCCCACCTCCCCCACCGCATGCCCCATCCGTCATTTTACACAAGGAATCTGGGATCAACTTCGGAATATTACCGAAAGGCGTGCGTATTCCACCGTCAGGGCCGAGTACAAGATCTTCGGACTATCCGCCGCCTCCACCTCATGCTCCTTTCGTTATTTTAAAGAAAGAATCTAAGGTTAAATTTGGGATGTATCCTAGAAATAACCCTATTCCACCATCTGCTCCAAGCGGACGAGTACCATCATGAGTGCCCCGACCAGCCTCGATTTTCGTCGCAACCCCCATCAATCAAGGGTTATTTTTACTGCTTTTAATGCAAGTGTTACGGCTGTAATTTGGGTCAGCCCCCTTCAATTTCACCGATACGAAAAATGGGGGTCTAAAAGTTTATGAAAAGGGAATATATTGTGGGAGGTAACTGTAACAGTTGCCGCTCACATCTATTTTAATCGTCTCTCCTTCTATCTAATACTTTCTTGTTCTTAGGCTATGTCAATATAACCGTCGTTTCCTCGCCTGTTTAGAATATAGGGACAAAGGTGATAAATCACACAAATGCTTGTATTTTATCGTACTGTAGTCTCGCCGAACATTTCTTGTTCTTTTTGACGACTTGTTGCTGAATTATTGTATATGAATAAGATAAATCGCCACAATCGGTTTTCCTCAACGACGCTTATGTCGTGACAACTTTTGCTAATTTTCCGATAACAGCTACAGTTGATAGAAGAAATAAGAAATTAATGTGAGTGTTGAGGAAAAGAGATTCCTTTATGTGCCAAGATTAGAATGGTAACAGTAAAAAATCACACGAGTTTATAGCGTCAAGTGTAAATCTAAATATAGTGAAATGAGTACGTGGGTGTCGTCCTCATGATTGGCATGCTACTTGGTCGAGTATTGTAGTTACCAGCCGCTTGTCTTATCTTGAGAACCTAACAGAAGAAGTGGAATTTATCTACAATATACCTAAGATGTACTTAGTCGGATACAACAATGCGAGAAGACACTTCAGAGCATACCTCATGTATTGGAACAACATTCGGCCAACTGAATAACACAAACAAAATTTTTGTGAACTTTGAATGCTTACAGACGCCATAGGTAGCTGGTCAATGTTGTCCTCTCTCGATCTCGACGCGTTCAACCCCGCTGCTTTTTTACTTGGAAGCTCCAACTTATGCGTCCAGCTGGTCCAATTAGATCATATTATCGTCCAAATCGTCGATGTCGTTCTAATTGGTCAAAATCAGACAAAGCCATCAAATATAGACGCGAGAGCACCAAAATACATTGCAAAATTGTGAAAATTGTGATTCATTCGTGGAAACGTTCCTGTGTCGACCGAAAATTTCAAAAGTTTTGTAGATAAGTGATAAACGATGACGGTTTTAAAATGTCATCAGAAGGAGCATTTGATGGCAGTTCTGGACCTTTTGGGTTGCATGCAAATATAATGGGATTGCGCTTTGGATGGCCATTAACAGCGCCGGAACTGTTTACGAAAATAAAATTAGACGCTTTTATATGGGTTTGGCAAAGTTGAGTATTAACGAATATGTTAAAAATCAGTTGTTAAACACACGTCGATTCTCACGCCTATTAAATTCAGTGACACGACCATTCAACAAGTGGTTAACACATTTGATTTATTTTAATAAAAAGAAAAGAAAGCCAGCACGTCGCTTTTGGAGACTTTGAAAACATCACCTGCAAACATCAACAACAAAATGTCAATTTTGGGTTGTTAGTTTTACTGCGAAAGCTTCTTGCCAAAAGGATTTCTAACAAATTTCGTACCTTTCTAGTTCCTCGAAAAACGAACATGTTATTTTTAGCTTTTATGCCAAGATGGTACCTTGCTTTCAATTGTGGCGGCAATGCTATATAAAAAGGAAGCAATAGAAGAATGAGATGGGCAAACACACAACAATAATGGTGTCAATTAGTTCTTGTAATGTGTTTTTCGGAGCTTGCGCTCTCATACTCCTTGGGCTGCACATTGCAACCTACCAAGCAGATGCTAAAAATTTTTTTGTAGACGACGGAGGCTTCCCTATTATCAACAACGTATTGAGTGACCCGAGTACAAAACATCCAAAAAGGCATATCCGTTTCTCAACAGGGAAACCCAAGAGGGTACCTGACTTCGATCCACCTTCCAGCGTGGGGATACTATCGAAAGAAGAGCGCACTACCCCGTCCGGACCGAGCCCAAGAACTTCGGACAATCCACCACCTCCTCCACCGCACGTCTCGTCCACCATTTTGCATAAGCAATCTAGCATCAACTTCGGAATGTTACCGAAAGGTGAGCGTATTCCTCCGTCTGGGCCGAGTCAAAGAACTTCAGACAGCCCACCTCCCCCACCGCATGCCCCATCCGTCATTTTACACAAGGAATCTGGGATCAACTTCGGAATATTACCGAAAGGCGTGCGTATTCCACCGTCAGGGCCGAGTACAAGATCTTCGGACTATCCGCCGCCTCCACCTCATGCTCCTTTCGTTATTTTAAAGAAAGAATCTAAGGTTAAATTTGGGATGTATCCTAGAAATAACCCTATTCCACCATCTGCTCCAAGCGGACGAGTACCATCATGAGTGCCCCGACCAGCCTCGATTTTCGTCGCAACCCCCATCAATCAAGGGTTATTTTTACTGCTTTTAATGCAAGTGTTACGGCTGTAATTTGGGTCAGCCCCCTTCAATTTCACCGATACGAAAAATGGGGGTCTAAAAGTTTATGAAAAGGGAATATATTGTGGGAGGTAACTGTAACAGTTGCCGCTCACATCTATTTTAATCGTCTCTCCTTCTATCTAATACTTTCTTGTTCTTAGGCTATGTCAATATAACCGTCGTTTCCTCGCCTGTTTAGAATATAGGGACAAAGGTGATAAATCACACAAATGCTTGTATTTTATCGTACTGTAGTCTCGCCGAACATTTCTTGTTCTTTTTGACGACTTGTTGCTGAATTATTGTATATGAATAAGATAAATCGCCACAATCGGTTTTCCTCA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MKREYIVGDDGGFPIINNVLSDPSTKHPKRHIRFSTGKPKRVPDFDPPSSVGILSKEERTTPSGPSPRTSDNPPPPPPHVSSTILHKQSSINFGMLPKGERIPPSGPSQRTSDSPPPPPHAPSVILHKESGINFGILPKGVRIPPSGPNDGGFPIINNVLSDPSTKHPKRHIRFSTGKPKRVPDFDPPSSVGILSKEERTTPSGPSPRTSDNPPPPPPHVSSTILHKQSSINFGMLPKGERIPPSGPSQRTSDSPPPPPHAPSVILHKESGINFGILPKGVRIPPSGPNDGGFPIINNVLSDPSTKHPKRHIRFSTGKPKRVPDFDPPSSVGILSKEERTTPSGPSPRTSDNPPPPPPHVSSTILHKQSSINFGMLPKGERIPPSGPSQRTSDSPPPPPHAPSVILHKESGINFGILPKGVRIPPSGPSTRSSDYPPPPPHAPFVILKKESKYA Homology
BLAST of Clc01G09700 vs. NCBI nr
Match: KAG6603169.1 (hypothetical protein SDJN03_03778, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 331.6 bits (849), Expect = 1.0e-86 Identity = 216/433 (49.88%), Postives = 240/433 (55.43%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G09700 vs. NCBI nr
Match: XP_031744042.1 (proline-rich receptor-like protein kinase PERK9 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 291.6 bits (745), Expect = 1.2e-74 Identity = 196/414 (47.34%), Postives = 226/414 (54.59%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G09700 vs. NCBI nr
Match: XP_022967687.1 (actin cytoskeleton-regulatory complex protein PAN1-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 280.8 bits (717), Expect = 2.1e-71 Identity = 194/402 (48.26%), Postives = 211/402 (52.49%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G09700 vs. NCBI nr
Match: XP_031744003.1 (abl interactor homolog [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 238.8 bits (608), Expect = 9.1e-59 Identity = 167/381 (43.83%), Postives = 196/381 (51.44%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G09700 vs. NCBI nr
Match: XP_038882352.1 (uncharacterized protein LOC120073615 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 211.8 bits (538), Expect = 1.2e-50 Identity = 111/155 (71.61%), Postives = 121/155 (78.06%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G09700 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FLQ7 (Formin-like protein 20 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FH20 PE=2 SV=3) HSP 1 Score: 62.8 bits (151), Expect = 1.2e-08 Identity = 117/443 (26.41%), Postives = 155/443 (34.99%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G09700 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q84ZL0 (Formin-like protein 5 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=FH5 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 50.1 bits (118), Expect = 7.9e-05 Identity = 118/443 (26.64%), Postives = 144/443 (32.51%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G09700 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HRH7 (actin cytoskeleton-regulatory complex protein PAN1-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111467141 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 280.8 bits (717), Expect = 1.0e-71 Identity = 194/402 (48.26%), Postives = 211/402 (52.49%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G09700 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6P5RDM4 (formin-like protein 5 OS=Prunus avium OX=42229 GN=LOC110745147 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 207.6 bits (527), Expect = 1.1e-49 Identity = 176/423 (41.61%), Postives = 184/423 (43.50%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G09700 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6P5RC98 (formin-like protein 5 OS=Prunus avium OX=42229 GN=LOC110744709 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 199.9 bits (507), Expect = 2.3e-47 Identity = 170/403 (42.18%), Postives = 176/403 (43.67%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G09700 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A2P5WMU6 (Uncharacterized protein OS=Gossypium barbadense OX=3634 GN=GOBAR_AA28257 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 193.4 bits (490), Expect = 2.1e-45 Identity = 177/429 (41.26%), Postives = 202/429 (47.09%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G09700 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6P4LZB0 (formin-like protein 20 OS=Gossypium arboreum OX=29729 GN=LOC108455019 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 185.3 bits (469), Expect = 5.8e-43 Identity = 165/378 (43.65%), Postives = 189/378 (50.00%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G09700 vs. TAIR 10
Match: AT5G07740.1 (actin binding ) HSP 1 Score: 62.8 bits (151), Expect = 8.3e-10 Identity = 117/443 (26.41%), Postives = 155/443 (34.99%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G09700 vs. TAIR 10
Match: AT4G22505.1 (Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein ) HSP 1 Score: 62.4 bits (150), Expect = 1.1e-09 Identity = 125/427 (29.27%), Postives = 153/427 (35.83%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G09700 vs. TAIR 10
Match: AT1G68690.1 (Protein kinase superfamily protein ) HSP 1 Score: 44.7 bits (104), Expect = 2.4e-04 Identity = 73/260 (28.08%), Postives = 94/260 (36.15%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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