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Clc01G08540 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGATCAACGTAGTTTGGTTGGTAGAAGTGGTTGTTGCTGGAGTTGGCAGGCAGAGTTGCCATATTGAAAGTGTTTATCGAAATTGGTCGTTGGAGGCAGTCGTCATGAAGATGGTTGCCAATGTTGGTCACTGGAGGTGGTCGGGTCGAAGTTGGTCTCCAGAGCTAGTCGTCTAAGTCGATCGTAGGAGGTGTTCACTGGTAATGGTTATCGCCAAAGTAGGTTTATGGAGGTGGCTATCGTCGGAGGTAGTTGCCAGCAACTATGGTGGAAGTGAAGTAGAGGATTAATGAGAGTATTTTAGTAATTTTATTATTATACAAATAAGAGAGAGATCATTAACTTTTAAACACTCAAAAACTTTTTTTTTCCTAAAAGTCTATTTTCAAGTGTTTCTTCTCTCAAACCAACTCATTGCAAATACTCAGTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGTTTAATTTGAGTGGTTGTCAAACACTCTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATAAACACTTAAAAAGTTAAACCAAATGCACTCTAATTATGTATATATACCATAGGTTGTTGCATCTAAAGTGACCATTACAAGAAGGCAAGGTTGTGCATTTTGCTAAGATATTTATTATCGTTGGAAAAAGAGAAGGATCAAACAAAATTAGGTATTCTAGTTATTGAAGACATCAAAAGCAAATTTGAGAGAAAAATGAGTAAGCAAACTCTCATCAAATTGAGTTGGACTGTGTTATATAAAATTTATCTCTGACTTTGGTTTAAGGCTATACTCTCCAAATTCATGAAAGTAGTCATCTATTTTCCTAGTCAATATTAAACATTTAAATAACTTAAATCAACAAAATGAGCATAGCTATACTGACATATAGATATGTAAACTACCAAGAAGCCTGTGTGGTTCCAATCTTTTTATTTTATTGTACTTAAATAATATATAAATATATATATATATATATATATATATATACTTAAATGAAATAGTAAAAAGAATGTAACTTATAATGAAGTTGAAGATGTTCCAAACTTTATATAGTGGTGGATGTGGATGTGATGGTTCCATCACCAAGATTCCTTTAAAAAGAAGATAGTGAATAGTCTTGTTTAAAAAGTGCTTCAAGAGAGACTTGGGTAATTAAAGCTCGAGACCACCTTTGGTTTAAGAAGCAAGTGAGTGGCAAGAGATGAAGGTGGGATTAAGAATTTAATGCATTCTACTATACCTAATTGTCAACTTGTTTCAGTTCTTTCATGGAATATCCTCAAAATGTTTGAACTAATTTATAATTATTTCACCCTTTTAAAAACTAATTAAGAAAAATTGTCTTATTTGACATTTAGTCAAGGCTTCAAATATTGATGTCGATATCGATATCAAGATTTCAATTTTATAGATATATCGACGACATATCGATATCAACAAATACTTTTGGAAGTCACGAAATTTATAAAAATTTATTTAGATTGATAATTAAGTTTCTTCTTACTCTCAAACTAAGTTATGGATGTTGTTATTAGTATTTCTTATCTTATTAGGGACCAAATAGATAACATTTTTATGTTTTGCGAGCATTTATAAAAGATATATACGATGTCGAACACTTAGATTTATAGATATATCGATGAATTTATCCAAACATGTCAAAAGATATTTTAATTTTTGTAATCCGTCACTTTTCTTTATAAACATACTTTATCGATATTTTTCAGTTGTAATAAAATATCGATCAATCGCTTGTATAAGTGTCAAAATAACATATGAATTGTCGAACCAATGCACTGAAATTAAGATTAAAGTTCATATTATTCTTGTAGTATTACAATTAAAACAAACTAATGTTTTCAAACTTTGAAACCCTAGAGTGGTTTAGTCATATTTCAAATTAACAAAATAGGGGAAGTGGGAATTGAAAAATATTTTATTTTTGGAATAAATGTATATGCTTTAATTAGTTGGTTTTTTTTAGTATAATAAGAATGAATAGAAGAACTAAATCACATACCTTTTAGTTGTTAATACATCCGTACTTTGTCCTTTAACTAAATTGAATTATGTTTTTTTTCTTTTTCGTCCTTATAAAAAGTAAAATTTCATTAATAAAATTTTATGACATTTGGGTTATCGAGTTAAATTAACATAATTCATTTGAGAAGCTAACCTGATGCTATGTTTTTTTTCTCCCTTTTTTATTACAACATTTATGGGGAAGGGAGATTGAACCTCTCACCTCTTAGAACGGTAAAGTCCATGTTCATTTACTGCAGCTAGCTCCTTTGGCACCATGAGGTAATGTTAAGGACGTATATTTATTGATCAATAAGTGCAAATATTTGAATCTTCACCCTAATCTAAATTGTGTTGAATAAGTCATTGATCTACTCGGCATGTTTAAAAAAAAAATTATGGACCTACTTGATACTAATTTAAAAGTTTAGAGTCCTATTATACATAAAATTCAATTTTATATTTAATAGGTTAAATTATTTTTAAAATTTCAAATAAATTAAAGTTCTATTATACAAAAAATTAAAAATTAAAAAGACCTCTTAATCATTTTTAAAATTCAAAGTCCCTTTTAAGTAGAGTTTGAAAATTCTAGAACCTATTATCAAAATTTTAAGATTCAGGTACCTAACAAGAAAAAAAAACCTTGTAATTTAACTTTTAAAAATTTAAAATAAAAAAAAAATATTTATTATTTTTTTTTACTAAAAATATAATTTAGTTTTTTTTTTTTATAAATATATATAAACTCTGGGCAAGTTTCCAAATGATTCTAAACTTGTTAAACAAACTTTTTATATTTTTAAAATCAAGATGAAGCATCTTTTAATGGGATGAAACATCTTTTAATGACTTAAAAATAATTTTGATGAAATGAAAATTACATTTAAAATTGTAAAGTTAAATATTATATTAATTTTGATCGATTAAAAAACATGTTTTAAATTGATTTTTAAACATGCCAACATCAGTATAACTCAACTGAGATGAACTTGTATCAATATTGAAACTTGTTACATAGGAATCTTTTATAATTGGCAATTAAGTTTTTAAATCCAAAGCAAACACAAATCTAAATCTTTTTATAAGACATATTTTTTGTTTTGAGGGTAGTTAGAAATTTGAATCCACAAGTATGAAATCCCATTTGGTTGTACTAAAGAAAAGCACTTATAAGCAATGTCTAAAATATCTATAATGATGGACATTTCGATAAAATATGATGGTACTAGATATTTCAGAGAAAAAAATTATGAAAAAAAAATTTAATTAGTAAATAGGTTTAAATATTACTTTGATCTCTATACTTTTGACTTTAGCTCATTTGGGTACTTATACTTTCAAAATGTTCATTTTGGTCCCGATACTGACAAAAATTTTAGTTTGGTCCCTATACTTTTAATTTTGGTTCAATTTGGTTCTTTACTTTTAAAAAAGTGACAATTTTGGTCATTTCCATTTTTAATTTCAAGGGATCAAAATGACCCACTTTTTGAAAGTTCAAGGTCCAAAATGGACCCAAATTTGAAAGTACAAAAACCAAAATTAACATTCTGAAAGTATATGAACAAAAATGAACCCAAAGCTGAAAGTGTAGGGACCAAAATGAAAATTTTGAAAGTTAGAAATCAAAATGAACTAAAGCCAAAATTACAAGAACCAAGTAGCATTTAAGAGGCCCGTCTGATAACGTATCGTTTCCTGTTTATGTTTTTCATTTTTTAGAGAAACAGACTTGTTTGATAACTGTTCTTGTTTATTGTTCCAAATTTTAAGAAACATCTCTAAAAAATAGGCAAAAATTGAGAAATAACAAAAATTAGTTTATTCTGTTCTTGATTCTATTTCCATTTTACCATTCCCTAAAATAATTACTCTCAGCTTTTGATGTATTAATATCAGGGGGTCCATAAAAATTAATTTTATTTTGCCAGTCATAGATTCAGAAAACAAGAAATAAAAACGAAAAACAGGAAACAAGAAACATAAGAGTTTGATAATGGACCTAAACCCTGTAAATAACATTTCATGTTCCTAAACAAATTAGCGTATATGAAATTTAATAGTATGTGCAGGAGTTGTATCGGAGTTAACGGCACTGGGAAAATTTTTGTTTGTGGTGTTCACCACCGCAACGCCGCCGCGTTCGTAATTTGGAAAGTCGTTGAGAGTTACGACCGAGGTTTTTCCATAGTCCCACCATTAAGCAGCTTTGATTCCCTTTGTTGAAACTCAGCAGACCCTTTTTTCTCTTCTCCATTTCTGCTCACACATTTCTGTTCTCTTTTAGCTTTTTTATCTTTTCTCCACCTGGGTTTTATTCGTTAATGCGGCTACAGTTTCTCGAAAACTAATAAGAGATGCTAGCTGTAAAGGGGCCGATTTCACGTATTTTCCAAGGGGCAAGGCACTACTCTTCTGCTCCTGAGACCATTCATAGATCCCTCATACTTCTAAGAAGGTACATACTCTACTTCTGTTTGTTGTTCTTTTGATGCATAGAGTATAGAAAGATAATCGATGTTTTTTTGTTTCTCTTGGTATGTGCATGTGATTTTTTTCCAGTGTGGTGTTTGGCGATTGCTGTTTGATTAATGGGGCGTTGAGTTAGTTTGTGGTCACTTGCCTCAATTGAGTTTTGAAACAACATTCTTTGGCTCGGTTTACATAACTGAAATTGGAAGCAATGGATGAGAATGGAAATATATGGTCCCACTTCATTCCCTTTCACGGTGTTTACCAAAACCAGGAAGACAATAAAATGTGAGACTCACTCCAAATTTGTGAATCTCATTCTTATGCCGAGGTAACTCGGCAATGTGGGGTGCCAAGAAAGCTCATAGAGTATTAAATTCTAGTTGGGTGGCCACCATGGATTGAGCCATTTTCTCTAAGTCATTGATTAAAAACCCATATCCCCTTTTTGACCACTAGGCTAACCCATGATTGTTGACCCATCTTTGTTTTCTCTCACTTGTTTTGTAAT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Match: XP_008465076.1 (PREDICTED: dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial-like [Cucumis melo] >XP_008465085.1 PREDICTED: dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 611.3 bits (1575), Expect = 7.5e-171 Identity = 319/405 (78.77%), Postives = 329/405 (81.23%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G08540 vs. NCBI nr
Match: XP_004149869.3 (dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial [Cucumis sativus] >KAE8648368.1 hypothetical protein Csa_023070 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 610.5 bits (1573), Expect = 1.3e-170 Identity = 319/405 (78.77%), Postives = 327/405 (80.74%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G08540 vs. NCBI nr
Match: XP_004135637.1 (dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial [Cucumis sativus] >KGN66114.1 hypothetical protein Csa_007583 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 603.2 bits (1554), Expect = 2.0e-168 Identity = 318/417 (76.26%), Postives = 331/417 (79.38%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G08540 vs. NCBI nr
Match: XP_008450702.1 (PREDICTED: dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 601.3 bits (1549), Expect = 7.8e-168 Identity = 316/417 (75.78%), Postives = 330/417 (79.14%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G08540 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P32746 (Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PYRD PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 542.0 bits (1395), Expect = 7.3e-153 Identity = 279/398 (70.10%), Postives = 306/398 (76.88%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G08540 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XKC8 (Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=PYRD PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 537.3 bits (1383), Expect = 1.8e-151 Identity = 279/402 (69.40%), Postives = 308/402 (76.62%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G08540 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O35435 (Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial OS=Mus musculus OX=10090 GN=Dhodh PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 300.8 bits (769), Expect = 2.8e-80 Identity = 175/372 (47.04%), Postives = 228/372 (61.29%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G08540 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5E9W3 (Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial OS=Bos taurus OX=9913 GN=DHODH PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 298.9 bits (764), Expect = 1.1e-79 Identity = 173/367 (47.14%), Postives = 225/367 (61.31%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G08540 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q02127 (Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DHODH PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 298.9 bits (764), Expect = 1.1e-79 Identity = 175/378 (46.30%), Postives = 229/378 (60.58%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G08540 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CN25 (Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103502776 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 611.3 bits (1575), Expect = 3.6e-171 Identity = 319/405 (78.77%), Postives = 329/405 (81.23%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G08540 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LYK0 (Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G571860 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 603.2 bits (1554), Expect = 9.9e-169 Identity = 318/417 (76.26%), Postives = 331/417 (79.38%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G08540 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BPU7 (Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492202 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 601.3 bits (1549), Expect = 3.8e-168 Identity = 316/417 (75.78%), Postives = 330/417 (79.14%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G08540 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IBF5 (Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111473123 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 598.6 bits (1542), Expect = 2.4e-167 Identity = 313/405 (77.28%), Postives = 324/405 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G08540 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CIM2 (Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111011933 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 598.6 bits (1542), Expect = 2.4e-167 Identity = 310/405 (76.54%), Postives = 324/405 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G08540 vs. TAIR 10
Match: AT5G23300.1 (pyrimidine d ) HSP 1 Score: 542.0 bits (1395), Expect = 5.2e-154 Identity = 279/398 (70.10%), Postives = 306/398 (76.88%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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