Clc01G04950 (gene) Watermelon (cordophanus) v2

Overview
NameClc01G04950
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus cv. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationClcChr01: 4620865 .. 4625138 (+)
RNA-Seq ExpressionClc01G04950
SyntenyClc01G04950
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGCATCAGAACTCCTCTAGTCAACTGACAAATCATACTTTATATTCAAACAGAGTGATAACAAAGATCGAGGTATATGAAGAACTACTGTTTTAATGTTTGTCCAGATCTCTGTATATTTTGCTTTAAACATCTCCTAGAGGTGAAATCGATGTTGAAGATTGATGTAAAACCTTAGATAATATGTTGCTGGATTTTCCAAATTCATGTACTTGGAGAGATGTTTTGGGGCCGCTTTCTCTTGAGAGTTGACTTACATTTAGATGAGATAGATATTCAATTTCTTTGTATTTCCATTTTGTTTGAGGTTTTTCAAAAAAATTGAAGCTACTCCACCTTCCAACCCAAGTTTTTCTTCCATATAAGTACAAAAATAATTAATAAACCCAATGAAAATTTTCCACTTCTCGATTATGTGAATCGGTTTTGAGATTTATTTGATTCAAATTACTGAAGTTTTCCTTTATATGGCCCAAAAATGAGTAAGTCTTCATGTCTTAATGCAAAAAAAATTCTCTCATTCACTCGATATTGAATTTCTTGTTGGGAACTTGCTTCAATTTCTCTTGAAATACTATCCATTTAATTTTTGTATCTTTTTTCCAGCTTGAGATGGATTATTTGGTGTAAATTTGATTGTAAATTTGTGTAAGATCAACGTATTCTCATAACCAATAATAATAATAAAAAAAATTCATAATCAAATTAGTCTGAATCCTCCGCATTTTATGGGTATTGTCTTGGATCATAATGTTAGTGACGTTTGAATTGAGGTCAGACAAATTTTATCACTAAGAATTCATCCATCTAGGGCTCAAAAGGAGAAATTTAAATAAAAGTGTGTTCGGATTCACTTTTGAAGTGTTTAAATATGAAAATGATATTTTGAAACAGAAAATGACATAGTTAACCCATTTTGAATGCCAAAATGAATACCCCAATTTTTTTAAAAAAAAAATGGTAAATTTACCTTTTGCTAATGTCATCCACGTGAAGTTACGGTATTACTCTTCCTTTCTTGATATTTTTTTATTTTTCCTCTTTTTCTCCAGCTCAGAGTTCCTGGTCTTTCACTCTCTCTTTTCTTCTTCTTCTCCTCACGTATTCTTCTTCTTCTCTAGCACGGCCACAAACTTCTCCGACACGATGAGTCCACATGAGCAGCTCCAACGTGACCAACTCCAGGCAAAGTGAGACCATAAAGAGCAAATGAGAGAGCGAGACAACAAGAGAGCAGAGAGCGGTATGTGAGATAGGAAAGAGATGAAGCGAGAGAGTGAGAGTGCAAGAGAGCATAGGGCATTCCACGTGCGTGAAAGTTTGGTTTTGATAATTTCACTTGAATTTGACATTGACAAAGGGTAAAAAAAAACCTCATTTTCAAAAAAGGGACAAATCTCATTTTTCTCTCTAAATTTGGATCATCCGCACAAATTCCCCAAGATCGTGGTGTATGGCAACCACCCAAAATGCATTAAAGTGAGTTTGAAATTTTGAAGGAAACACTAAAAACTAGATTTTAAAAAACGAAGGTTAAAATACCATTTTGATCGTGTACTTTGAAATTTGTTCAATTTTAGCTCATATATTTTTAAATGTTCAATTTTAGTCCATGTACTTTCAGTAAATCCTAAGTTAATCCCTTAAAGTTAATTTTTTTTTATCGAAATTGATTAAATAATAATAATAATTTTCATGTAAAGAAAAACAATATGAGAATATTTTTTTTCAAAATTTATAGTAAAAATGTTAGTAAAAAATAAAAAGTAATGAGAAAATCGACAATAAACTAGTAGCAGATACTAAATTTAAGATTTATTGGAGATATAATAACTAAATTTGAATAATTAAAAATATAGAAACTAAAATTCAACAAACTTCTTAGTATAGAAATCAAAATGATATGTTCCAAATAATAATAATAATAATAATATGTAATGTTTAAGGGGGAATCCTTCCAAATTTTGATGTTAAATAAAAATGACTAAAATATCCTCGAACTACCCTCCTCCCCATCCTTTCTCCCACATTTTGACCTAGCTACACTTCCCCTGTTCTCTCTCTTTCTCATTTGGCCAAGAATTTCTCACTCAGATAACATATGTGGCTTCGATTTGAGGTTAGTTGTTTTCCCTAAATCTTCTTCTTCTTCCTTAAGTTAGTTTTTGCTTAGATTTAGCGTTAGATTTGGATTGTTCTTTCTCTTTCTCTGCTGCGTTTCACTTTGATTGTTTTCTGGGTTATCCAATTTGAGCACACATTTATCTTTAAATTTGATTTTGCTCTGTTGCGGTAATGTGTTGTGTTGACTGCCGATGATTGCTGAGATGAGACATTCTTGATGACATTCTCTAACATTTCAATTTCTTGGAGATGTTTTCCATGATGTACCATATCTAAATTTACAATATTGTTAAAGTCCTCTACTTTGGTCTTCAACCAATGCTTTAATTTCCTTTACTGATTGTCGGATAGGTAACTCAAGTTCAGATGATGAGAGTCCATAGGACAGTTGTTGAAAAGATGCCCAACCTGCTGAATTGTTAAGTTCCATTTTGGTCATAGGCAAGTTCTTTAGCAGTATGAAGAAGCTCCCTGAATTGCCAATATCCTCTGAATGCACTTAGACTTGGACTTTGATTTTTCTTTCACCTTTCTTAATTCTTTTGTAAAAAGACTTGGTTTTGACATTTTTGGCAGTTGGAGCATTCAACATAGTTTGTAGTTGTAAATGTAGGTTTCTGTTAACCAAAGTATTAGATAAATATGTCTATCTACTTTTTTGATGATGTGAGGGTCCCCAAAAGCTCAATTTAAAGAAGGCTTCTACACTTTTTGACTCCAATCTTTACTCGTATTGCGATTTGAACTAAATATGACCACCAAATTTGGAGATGTTTGTGTACTAGAGTTCCTAATATCGATCAATTAGGAACTTTGTTTTTGTACTAGAGTTTCTAAAATTGCCAAAGTATTGCCCAATTCAAAGAAGGCTTCTACTATGCTTTTATACTTGTATTGCCAGAATATCAGTTAAATAGTTTGGAGATGTTTTTATACTAGAGTTCCTAAAATTGATCCATTTTTATTTGCTAGAAATGTCTATGAATATAGTTGCAAATAAAGATGAAACAGAAAAACAAATCAAGGCAATTTGAGATGATGTTACAACAGATTCATTCATTCAAGCTTGTGTTGTTGAAATTTTGAAAGGGAATAGACCAAATGGACATTTATAAGAGTTCAATGGCTCTCCTTAACTTTATAAGAGTTCATTCAAAAACAAATTTTGAGTTCAAGTCTTATGACGACGATGAGATACTACGACCTTCAAATGATGAAAGAACTCATGAGGACATTTATGAAGAATATGGAGGTTCAATTTGTGAAATTGAGATGGATGAACTATGCCATCAAATTGCACAACTTCTTATGTTTAGTCAATATTTTATTGTCTTGACAAAATTATTATTACAGTATGTCTTGTTGTCCGAGATCAAGTTGTCTTTTTATGATTATTTATTTAATTTCAAGATATATGTACTCTTAAAACTGAACTGTCCAAAAACATTATATTCTAGTACAAAAGAATAATGATATTAATGTTTGGTTTTAACTTCATTAGTTTCAAGTAATGTGCAGTTAATTTCAAGATATATGTTTCTCAATGAAATTAGTTCATAGTGTTCAATAATCTTTTGTGATAATTTGACATAAGTATAAGCATTTTTGGTGTATAACAAACCAAACAAGTTTATGTTTGTGAACTCTTATGAAAAATATGTAACCAAACACATAAGTGTTAAGATTCTAAATTTTTTTTTTCCACAGGCAATCCAAATGCACCCAAAGTCGGTCCAATGTCAAGGGAGCATGAAAACCCCCAAGCCCCCTTTGTCCAATATATAGCATCCTCAGAATCAGAGCTATGGTGATCACTATACTTGGCTCCAAATAGTTTCTTGGTATTTTGCTCCTCCAAGATCTTCATTTATCAGTCTTGTGCTTCTCTCTCCATCCTTTTCAACTGCCTTCTGAGTTCTTATTGTTTAATTCGTTGGTCTTCATTGCATATAAGGTCCTATGCTAGTCATGTCCTACCAGTGAGCTCGCCTGCTCCAACGCCATTGTGGCTCCTACCGACAATGGAATCGAAATCACTGTACGAATGATTCTTTTTTTGTGTATTTATCTAGCCTCAAGGTCGTGGTCGAGAGTTTGATTTTCTTGCCTCGCTTTCCCTTCTTCTCCATTCTTCAATTTTTGAGTTGTAA

mRNA sequence

ATGCATCAGAACTCCTCTAGTCAACTGACAAATCATACTTTATATTCAAACAGAGTGATAACAAAGATCGAGTCATGTCCTACCAGTGAGCTCGCCTGCTCCAACGCCATTGTGGCTCCTACCGACAATGGAATCGAAATCACTCCTCAAGGTCGTGGTCGAGAGTTTGATTTTCTTGCCTCGCTTTCCCTTCTTCTCCATTCTTCAATTTTTGAGTTGTAA

Coding sequence (CDS)

ATGCATCAGAACTCCTCTAGTCAACTGACAAATCATACTTTATATTCAAACAGAGTGATAACAAAGATCGAGTCATGTCCTACCAGTGAGCTCGCCTGCTCCAACGCCATTGTGGCTCCTACCGACAATGGAATCGAAATCACTCCTCAAGGTCGTGGTCGAGAGTTTGATTTTCTTGCCTCGCTTTCCCTTCTTCTCCATTCTTCAATTTTTGAGTTGTAA

Protein sequence

MHQNSSSQLTNHTLYSNRVITKIESCPTSELACSNAIVAPTDNGIEITPQGRGREFDFLASLSLLLHSSIFEL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Clc01G04950.2Clc01G04950.2mRNA