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Clc01G02440 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGTGCATCGTCGCCACACGAGATGAACTTGAATAGAATTATCTTATACATCGATGGCTTAAATTTGCTCCTCAACCGTGTCGGCCAAATGGACCCATCCCAATTATGCAATCTCTGCTTTTCCATTGCCAGGTTTTGATTCAGTTACAAATAATTTAGGGTTTCCAAGTTTGTTAATTGTTCTTGTCGTAGAACTTCGCTTTGCATGCTTTTCTTGAAATGTTGTTAGTTGAGATGATTTGAGACTGGTAATACGAATACCTACTGTTGAGTAGTTGGTAGAAAATGGAGTGTTGTGTAGTTTGTTTGGAAGGCGGCATTTGTGTGGTTGGAACTTGGAAGTATTGTGTTTCAGCGTTTGTTTAGATTGTTCTCTTTGATTTGAAAATTTCCTGCTTTTTTACCCTGATGGAGGTGCGATGGGCGGATAGAATGTTGGGTGGGTTCATTTGAGAATTTTACTTCACTGTGATAGTGTCAAAAAATAATTAAAGAATCACATGGTTTTTAAGAGTGAAGAAGATGATTCTGAAAGTACTTTTTCTCGTAAGAAGAGATGCCTACACTGTCAATTTCTTCTTAAGGAGTAAGAACGTTTAAATAAGTGGTTTCAAAACTTTTGCACACTTCCTGTATTTTTGTTTTGAAAACTCAGTAGTTGCAAACAAGAGGAGCCAAACTAGCATACTAAGGGAGGCCATCTATATTAACACTGATTGTTTAAGGAGTATAGGAGGGAGCTCCTGATGTAAGAAGAATGGGGTCAATTGGTTAATTGGGCAATATTTTAGGTTAATTCCCTTTTTTACCCCACTTGTAATAAAACTCTATAAATAGGAGTCTTCCCCTCTCGTATGAGATGATTGTCATCACTTCAATAAAAGATGCAGAAGATTGATTCTTGGAAGATTATTCATTGAGAATACTTAGAATACATCAATTTGGAATCAAAGCGACCGCCTGGGCCAACGTTGACCGCCACTAGTGGAAGATCGGGAAACTCTTGGTGACGCCGATCACGAGAGGGAACTCTTTGAATGTCGTGCTCATTGCCAAAGAACCCACATATATTTAGGGGAACCTTTTAAAATTCGATTCAAGAAAGAAGAAAAAGAATCATCACAAATGAATTTTTACAACCTAAGAAGAATGTTCAAGGTTCAAAATTAATCTTTTGGTTATGAAACACGACCAAGAAAGGTTGATTCCTATTCAAGAAAATCAAAGAATTGGTCCTATACCTATTATGAGATGGATACATACTCAAGAACCTAACAAAATGACTACTTTGATCCTAGGAGAATATAAAGAAAAGAGCAAAAGAAATCCAATGTTCATTGGGAAAATGACCCAAAGTATAGAACAAATATAAAATCATTTACAAGAATTCAAGAACAGATTGATGTTGTATACTGAAGAAAAAACAAAGGAATCTCAATTAGAAACTTTTCAGATGGAAAATCTTATTGAGACCCATGTCATAAATGGAGGTGATTGGGACATAAATCATGCAAACGAAGTAGATGAAAAAGAAGAATGTGAAGATGTTGATTTGGAAGTAATATCAAGTGAAGAAGAAAAATCCAAAGAAGAAGATGGAAAAGAGGTACCGAACATCAAAACTCTAAATGTCGAGGTGGAAGTAAAAAAATTGAGGAAGAACGACACACCTATTGCGTTGGGAATTGATTACCATGTCAAAGAACTTGAAGTGAATGATGAAGTAGATGTGATTTTTGAAGGGTTCTCTTCGGAAGCTAATTTTTTTGTAACAGGTCCTATGATTACAGTTTTGAATGAGCTTGATGGAAGTTTCTTTTTTGGGTCTATGGCCAATGGAGAAGTTCATCTTTTGGTAGCATTGTTGGTTTTTATGTCTTGGATTTACCTCTTTGATCATAATATTTTTGTTCAAGATGTAGGAGGTTGGTTTGGCCATATTCTGTTGAACAAGTTTATTTTATTTCTTGATTGTTTCATTTTTTCTTTTCAAAACTCGAGGACGAGTATCTTTCTGGAGGGGTAGAATGATGTCAAAAGAATGGGGTTAGGTGTAATTGGGTAATATTCTTGACTAATTCCCTTTTTTACCCCACTTGTAATAAACCTCTAATTGGAGTCTTCCCCTCTTGTATGAGACGATTATTATCACTTCAATAAAAAATGTACAAGATTGATTATGGGAAGATTATTCATTAAGAATACTTAGACTACATCACGAGTGTTAGATTTATTATTTTAACGAATAGAGTTCTTGAGGTGGAAAAAAGAAAAAAGAGAAAGAAGAGGCCATGATCAACAATGGGGAGTGTTAGATTTATTATTTTAACGGAGAATTTGATGATGGACATATTACAACTCCTGTCAATGAGAGTTATGATGTCGGTTTTGCAAAACACAAATGGCGAGATAAGTTTTGGGGGAGAATCTCTAGGTATAGGGAGAATTTAAACCGAGAGAGAGCTATGTAGATTAAGTGATCAATAAAGAGTCGAAGTCCATAGCTTTATTCTCGAAGATGCGGTGATTATGCTCCAGCCAAGTCAACCATATGCTCCAATTGGACATGACTGGAAATTATGTACATTTGTTTGTCTCGAATGTTTTTTGTAATTATTGATTCTTACTAGAGTGAACAAAATTGGTTTTTTTGCTTTGTTTTTCTTAAATACTTTTTATGTACATGCTTTAGCTTCTGCTCATAACCATCAATTTATCATCTTCCTTGACTTTGCTTGATTAACATTGATAATACAGAAGTATCGACTATACAATTGCAAACAACATTGTTCCATCTAAAGCTCACAGTTTACCTAGTTTCATCAAACAGGTAATGTCTTTTATTCTAGATGTACATGAATTTCTGATGTTTTAAATCTATTTGTCCCTCAAGACACTCGCTTTCAAAGGCAAGTACATATTTACTCATTTCTGTTGGAATAAAAAGTACTACATTTTCTACACACACACACATACACATATATATTTTAATGAAAAAATTGTTGGTCTATTTTGAGCAGCAATTTAGGATGGTGTCATGATATGACCCTGGCCAATTGCAGGCTTTTTGGGCATAATTTACATTATTTGATTAATTTCTTGCCCCTAGAATGCCCAATTTCTGTCACATCACCTGTTTGGTTTCATTCCTTGTTCTTGTACAATCATGCAAAATGTTACACCTTCCCAAACAGTTTGGCCGTGTGATCTTCAAATTATGTTGCATTCTTGTTTTGGTTCTGCCTATGCGTTAGAGATCTTGGAAGGACATTCAATAGGTTGGGATTGGGATTGCAATTCCTATTAATTAGCTGAAACCTTAGCGTTTGTGGGATAAAGATGTTGGGCAAAGGCTTGTATTTGGATTTGGAAGATTAGTTGTTATCCTATCTGTATAATATGTAGATCGGGTTTTGGTCTCATGTTAAATGATTTTATATCAGTTATTCAGAATTTTGTATCCAGTTTCAATGTCTTTTCTATTATAAGTTTGCTTGAGCATTAGTTCACGTAGAATATTTATTTGTCCAGTTATGTCAGATGAAGCATTCTCATCGCTTAAAAGCAGCACTCATGGTACTCATGATAACCATCAAGGTATGTTTTTCTCATCTTTTACTTCACATTTGTTTATAATACAATGTTTTCTTTTTATAAGACTCAAGGTTTGATTAAATGTTTGTATGATTGAACCAAAATTTGTTTGAGATGAGTAGTAATCTGTTAAAAATAAGTAAAGACTTCAACAGCACTTGCACTTCCAAAGGTTGGAAGTTTGACGTTATTTAGGTAAGTAGCTTGCGAATGATGTGTATCTATGGAGTTTATAGTTGTAGTGTTGAAAGTACATACCATTAATGCTGAAGGTTCCTTACCTTCCATCAATCTTGCACTCAAGATTCATCCAAGAAGAATACTTTTACTGACCTACAAAATGGAAATCAAAATTTTCAGAATAGTAGAGGAAGAGGATGAGATTCTCAGAATAAAAGAGGAGGAAGGATCTGGAACAATTGTAAAAAACCGTGTCAATTGTGTAACAAGTATGGGCATACAATTTTAAAATGTCATTTTCTATCTCATCCTTCATTTCGTTGAATTGGTAATCAAAATGGAGGTTACAATGGGAATAACAATAATCATCCTCAGGCTCAGACCACTTGACAGAATTCCCAAATGTAAGCCATTGTGTTATATCCAAGTCTTGTAGATACAAATTGGTATCTGCATAACCATGTGACAAATATTTTAAAAAAATCTCAGTGAGCACCATTGTCAAAATGGAGGCTATATCCAGGCTGCAAGCAGTGTCTATTGGCCATTTTGGTTCTTCAACTCTTTCTATGCTTGATAAAAAATGAACTTTCCACTTACATAATCTCCAAAACGTGCCTAAAATTACCAAAAATCTCCTTCATGTGCCTAAACAAACTTCAGGATAGTAAGTGCTTGGTTAATCGTAAATAGAGATCTGGTTTGATAAGATGTTTAAGTTGTGTATCTGTTTGAAAATAAATGAAAGTTCATTGACAAATGAACCTAAGTTTATAAATCTTCACCTTCTGGTCAAGAGTTTACTTTATCTCATAAGGTAATCATGCAATACAATTTTGGACAGTCCTACTATCTGATTAGCTTTGATTGTCATTACATTTGAAGATATAATTGAAGCTCAAAAAGCTAAAATACTGGAAAAGGTTTACTTGCTTATAAAGTAAGAGACTTTTCCATCTTTGGGGTCAAACTGTCTTTGATATAGGCATTGGGGTCAAACTTGTAATTTTCTTAATTTTATCAAGTCCCTAGAGTGGTTATTTTTTTCCCCTTGCTAGTAACTTATGTAATTTATCTTCTTTTCTTTAAGCCTTACCTATTTACGCAGGTGGGGATTCTCCTTTCTGTACTTTTGAAATCAATAAATAATCTTTGTTAACTAACTACCCACCTCTCTGGGTATTATAAATGTTAAGTTCAATTGAAATAATCTTCTTT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MGASSPHEMNLNRIILYIDGLNLLLNRVGQMDPSQLCNLCFSIARSIDYTIANNIVPSKAHSLPSFIKQLCQMKHSHRLKAALMVLMITIKNACKAKWFSEKDAEELYSLANEIGNDFFGDTNIGQSNPLATISTVMERFFPRLKLGQIVASVEVKPGYGVYAIDFNILKTIQYAPQEKLRLFVAQKDNTETSACIISPPQVNFLVNGRGVNGRTNVYVDTGPQLPTNITHMLKLGSNLLQAIGSFNGHYVIAVAIMGTAPSPDSSVLQDHIQPVVSTVDSDSDIIEGPSRISLNCPISYTRIKVPVKGRSCKHLQCFDFHNFIDINSRRPSWRCPHCNQYICFLDIRVDQNMLKASRVIREVAENVTEVIISADGSWKAILENDHGDGRPLDDSLNHQKERAQEESTAPPDVLDLTEVDDDMDICNLETEDRKTCLDNKNQPVSSSLDISSGMNMNSLNQNLAAVLDDDFWSGIVTDGILTSSAGSDAPMGNSTPPPGFAGIMQSTVFTDVVPPVLNHGAGVPGHANFSSSAFYDQNNLQIQVPNSNENNQYGRMPLIARPVSRTPIAVQALPAQSQVAGQQYSSRTPIISSAPQVGQSIPINRDGLNTLSRDLERRQQFSRHHGDSHHATNLAPFHHPQTVQNRDSQDRSFTPGQSVQASTALRPSTGLLTDFQNPHLQQALNMRISHLRNQNSSSVRPSLPFSRPMSQAGGGYAYTAVTPNSQHARMVAASQRAEMMRQSSAMSLQNQTSRSAHSLQTTPDGLRRPAGEMRNVGVSPSVTMAPGSVDLSVEQNWQPVGRMRGSLSGRAYSDAYGVIIQPTQAAQSARLPSHLSPTQPSAPSTQAQRFSSVSYGSIYQVRKNFLRYFFIIPCPILSTAGAFGGRLLRRWRQREVWVADGIYSDIMLSWTPIEYEKEIASVMQLEHLRSSVRWGADFILRAHVSPTTLYTQVGDGNGDHQCWERPQDMDTPRTLYKITPNSPGTEAAAEAAAALAAASIVFHHVDANYSRSLLQHSKSLFQFADQFRGSYSASCPFYCSFSGYQDELLWAAAWVYKASGNSKYLSYILSNQGWSQPTSQFSWDNKFVGAQTLLAKELYKGKKNLSKFKIDAESFICMVMPGGSCSKIPTTPGGLLFLRDNSNLQYASSSSMVLFMYSRLLNKARVDGVHCGSKYFSSSQIKTFAKSQVDYILGKNPMKWSYMVGFGNKYPLQLHHRASSIPSIKVHSTKVGCNDGYSHYFYSNNPNPNVHIGAIVGGPNSNDQFSDLRSDHSHSEPTTYMNAAFVGSVAALVA Homology
BLAST of Clc01G02440 vs. NCBI nr
Match: XP_011654714.1 (E4 SUMO-protein ligase PIAL2 isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8647846.1 hypothetical protein Csa_000250 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1375.1 bits (3558), Expect = 0.0e+00 Identity = 701/851 (82.37%), Postives = 753/851 (88.48%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G02440 vs. NCBI nr
Match: XP_008437346.1 (PREDICTED: E4 SUMO-protein ligase PIAL2 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1370.9 bits (3547), Expect = 0.0e+00 Identity = 707/852 (82.98%), Postives = 758/852 (88.97%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G02440 vs. NCBI nr
Match: KAG6579533.1 (E4 SUMO-protein ligase PIAL2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1352.8 bits (3500), Expect = 0.0e+00 Identity = 694/853 (81.36%), Postives = 749/853 (87.81%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G02440 vs. NCBI nr
Match: XP_022928990.1 (E4 SUMO-protein ligase PIAL2-like isoform X2 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1346.6 bits (3484), Expect = 0.0e+00 Identity = 690/853 (80.89%), Postives = 747/853 (87.57%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G02440 vs. NCBI nr
Match: XP_022969988.1 (E4 SUMO-protein ligase PIAL2-like isoform X2 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1341.6 bits (3471), Expect = 0.0e+00 Identity = 687/853 (80.54%), Postives = 746/853 (87.46%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G02440 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P22503 (Endoglucanase OS=Phaseolus vulgaris OX=3885 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 606.3 bits (1562), Expect = 8.1e-172 Identity = 285/392 (72.70%), Postives = 338/392 (86.22%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G02440 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SUS0 (Endoglucanase 20 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At4g23560 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 553.1 bits (1424), Expect = 8.2e-156 Identity = 258/392 (65.82%), Postives = 319/392 (81.38%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G02440 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SZ90 (Endoglucanase 18 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At4g09740 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 537.3 bits (1383), Expect = 4.6e-151 Identity = 249/392 (63.52%), Postives = 312/392 (79.59%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G02440 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6ZA06 (Endoglucanase 20 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=GLU15 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 484.2 bits (1245), Expect = 4.7e-135 Identity = 227/386 (58.81%), Postives = 301/386 (77.98%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G02440 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SRX3 (Endoglucanase 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CEL2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 407.1 bits (1045), Expect = 7.2e-112 Identity = 206/399 (51.63%), Postives = 281/399 (70.43%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G02440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KMH4 (SP-RING-type domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G152190 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1375.1 bits (3558), Expect = 0.0e+00 Identity = 701/851 (82.37%), Postives = 753/851 (88.48%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G02440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3AUE1 (E4 SUMO-protein ligase PIAL2 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103482791 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1370.9 bits (3547), Expect = 0.0e+00 Identity = 707/852 (82.98%), Postives = 758/852 (88.97%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G02440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1ESZ6 (E4 SUMO-protein ligase PIAL2-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111435722 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1346.6 bits (3484), Expect = 0.0e+00 Identity = 690/853 (80.89%), Postives = 747/853 (87.57%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G02440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I2J0 (E4 SUMO-protein ligase PIAL2-like isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111469015 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1341.6 bits (3471), Expect = 0.0e+00 Identity = 687/853 (80.54%), Postives = 746/853 (87.46%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G02440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EMF7 (E4 SUMO-protein ligase PIAL2-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111435722 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1302.0 bits (3368), Expect = 0.0e+00 Identity = 675/858 (78.67%), Postives = 734/858 (85.55%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G02440 vs. TAIR 10
Match: AT4G23560.1 (glycosyl hydrolase 9B15 ) HSP 1 Score: 553.1 bits (1424), Expect = 5.8e-157 Identity = 258/392 (65.82%), Postives = 319/392 (81.38%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G02440 vs. TAIR 10
Match: AT4G09740.1 (glycosyl hydrolase 9B14 ) HSP 1 Score: 537.3 bits (1383), Expect = 3.3e-152 Identity = 249/392 (63.52%), Postives = 312/392 (79.59%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G02440 vs. TAIR 10
Match: AT1G02800.1 (cellulase 2 ) HSP 1 Score: 407.1 bits (1045), Expect = 5.1e-113 Identity = 206/399 (51.63%), Postives = 281/399 (70.43%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G02440 vs. TAIR 10
Match: AT5G41580.1 (RING/U-box superfamily protein ) HSP 1 Score: 395.2 bits (1014), Expect = 2.0e-109 Identity = 212/474 (44.73%), Postives = 299/474 (63.08%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G02440 vs. TAIR 10
Match: AT4G02290.1 (glycosyl hydrolase 9B13 ) HSP 1 Score: 384.4 bits (986), Expect = 3.6e-106 Identity = 189/397 (47.61%), Postives = 273/397 (68.77%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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