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Cla97C10G189490 (gene) Watermelon (97103) v2.5
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AACATACTACCAAAATGGTCTCCCACAGACCCTTCTCCTTCAGCTTCTTCTTCCTCTTCTTCTTCCCAATTTTGTTTAGGGTTTCAAATTCTTCCTTAGTTCCAGCAATCTACGTGTTTGGAGACTCATTAGTGGATGTTGGAAACAACAACCACTTGAAGCTCTCACTAGCCAAAGCCAACTTTCCCCACAATGGACTTGATTTTCCTACCAACAAGCCCACCGGAAGGTTCTCTAATGGCAAGAATGCTGCCGACTATATTGGTAATTCCCACTTTAAACCCTAATCTACGCTTTCTGATTTATGATTTTTCTTCTCTAAAAGATTTGGAGTTTCTATGTAACATTGAATTCCATTTATTAGGTCTTCAATAGAATTTTGAGTCTATGAGAATTATTGTGTTAGAGTATTGGTATAATATTAAATTTATTATAATTCATCGAGTTTAATTTTTGAGTTGACCGGTAATTTACTAACCCTAGAAAGAACTAGAAGGACGTAAAGTATAAAGATATTCTAACTTTAAATTTTGAAAAAGGATAAAGGGAGAAAAAGAAACAGCCAATCAGATAGTATTGTTGTTGGCTAGATAAATTACCATTGGTTTGCTTTTTTATTTTCATCACACATATTTATATATATCAACATATATTTGGATTTAATTTTTCCTTTTCATGCTATATTGGGTAGAATATCATTTTCATAAAGAAATTTGGTATTCAAACTTAATCAAAGTGTTGACCAATTAAATTATGCCATTGCAGTCCTTTCAAGAAAAGAAAAATATGACATTACAATCCTTTCAAAAAAATAAATAAATAAATAAAATTATGCCATTTCAACATCCTTACTATATAGTTTTTTCTTTAAAAAAATATGAGTATGAATGATATCTAATATAATATGAATCATGCTTCGACATATGTCACCTTTTCTCCAATAAAAATAAGGCGAGAAATTAAAAAAATTTATACGTGTAAATTAAAAACTTAGTTGAATCTATTTTTTTTATTATTTTTTATTTCTGTTAGCATATGTGAGTTGGGAGAATCAATTAAAATTTTCAAAGTTTATATAATATAAGTTTTTTATATTGATTTTGAGCTAAACTCAATTTAGCCATTTATTTATTGCTATTATTTTACTAGCATGATAATCAAATTAAATAAAGTTTCATGATCTATTTCTCATATTCACTCCTCGGCAACTATATTTGTATATAATTATATTGCTTTCCATAAAACTTCTTTTCTATTCAATCTTTTAATATTCATAATTTGGGATCTTTTAATCAATATTATAAATTTTATTACAAGAAATTCTCGGTCTTTTAATTTGTATTAGGAGATAAGTGTGTCTCTCTTTCAATGGAGTATTGACCATTATATGTACATCCAAACCCCAAAATAATACACCATCTTTAGATATGGCTACATAGGATCACACGTGTCCATGGGCAGTCAGTGTTAATTCTTTATGTTCATACCATACATTTTCAAGAAATATTTTAGTTACTGACCATCCCGATGAATAGCATTTTAAAAAATATAATAAAATCAACTTCTAACTTATTAGTGATCGACTCCACGAATTAAATCTAAATTTTGTTATTACATTTATAAATTCTTTTGTATTATGTTATATGTCTACTAGGAATGATGGCCAGTTCAGTTGTGTCGATTTTGAAACTAATAAAAAACAAAATTAGATAAACTTTTATGAAGAAGGGATCCAAACCGATGTCCAATAAAAAACAAAAATGATTGATTGATTTTTATTTGGTTTGGTTCTTAGTTTTTTATATTTTCTTTTTTTTTTCTTCTAAATTTTTATTTTTATTTTCACTCTTGTTCTAAATTGGTAATTTTTGTTAATTTTAAATTACAATGGGTCTATCTCTTTTTCATATAGATTGAAATTGTACTTTTTTTTTTCTTGACATTTTTTTTAAATAGAAAACATAAATGCTTCACAAGAATTGATATTTTTTTCTAAACAACAAATATATATTTACCATAATAATTAAAATATTAAATCACATCTAATATTATAGTTTATTTTTAAGGGTATATATCCATCCCTCGATTCGATTCACTTTTATGTTAAAAAGATGAAACCAAATTAGTGGATCGATTTGACTTTTTTATTTTTCATTTTTACCGTTAGATACTTTGAATCTAATTACTATATTTTTGACTCGCTTTTCCTGCTAATAATATTCCATTTAGTCTAAGGTTGAGTCTTGTATTATCGAATAATGAAATAAAAAAAATTAAAAAAAAATGGTATGCAGATATAAGATTTTGTGTGAAATTATGAATTTGATGTAATATATGAAATATTGAGCAGCTGAGAAGGTGGGGTTGCCGACTTCGCCGCCATATTTGTCTCTCATATCCAAGTTTAGAAAGATTATCAATACGACACCGTTTAAGACAGGCGTCAGCTTCGCTTCTGGAGGAGCCGGAATTTTTAATGAAACAAATAATCTTTTTGTAAGTACTCTTCCTCCAACATATATGAACACAAAATCTTCCATTAAATTGTTTTTACTTTTGCCTTTTATATATATATTTTTTAATTTTATGCTTATTTCTCATTAATTTTATACTACTTTTCTTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTATAATGGAAGACTTCAATTCTTTTTTTTAAATTTTTAAAAAGAAAAATAACTTCTTTTTTTCAAAATTTTAACTTGTTTTTTAAAATATTAATGAAATTGAATTAAAAAAAAGGTTTAGTTTGATAATTATTTTATTATTTAATTTTTTTTTTAAATTAAATTTATAAACACTACTTTTACCTATAAGATCTTTTTTTCTTTGTTTGTGCCAGCTTACATTTTACTCATGTTTTTAAAAATAAATTTAAATTTTGGTCTTGTTTGGTAACCATTTTATTTTTTGTTTTTGGTTTTTGAAAATTAAGGTTATTTTCTATAATTTTCTTACAATGGTTTCCATCTTTTTTAAGCACAAGAGTTGAATTATTATCCAAATTCTAAAATCAAAAACAAATTTTTAAAAATTAATTTTTTTAGTTTTTAAATTTTGACTTGATTTTTGAAAATATTAGTAAAAAGTAGATAACAAAACAATAAATTTAAAGATAGAAATAAGTGTTTATAGACTATTTTTAAAAACAAAAAACCAAATACTAACGCAATGAGGCTTAAAAAATTAGACTTTGATTTTAGAATTTAATCAATAATTCAAGTATTTCATTAAAAAAAATAAATAAATAAAAAATCATAAATAGTATGAAATTTAAGGGAAAAAATAACCATAAATTTTTAAAACACAAAACAAAAATCAAAATTGTAATCAAATGGTACTTAAATTATTACAAAACGGAGCCTATACTTAATAGGTGCTTGAATTTTGTACATTTAGTATAATGAATGTTTTCAACTTTTAATTGTGTGTTTTTTTATAAGTCATTTATATATTGAATATTGTGAAAATATAAATTAAAAGAATATAATTTATTTTATTTAGAAACAATCGGTGGCAATGGACCAACAAATAGTGTTCTATTCAACGGTGTACAAAAATCTGGTAGGAGAGCTGGGATCGTCTGGAGCGGAAGCACACCTATCCAAATCTCTATTTACGGTTGTGATTGGAAGTAATGACATCTTCGGCTATCATCAGTCATCCGATCTGCGTAATAAGTACTCCCCACAGCAATACTTGGACTTGATGGCCTCCACTCTGGAGTCGCAGCTTAAGGTATAATAAATTATTTCTTTTTTTTTTCTTTTAATTATGAATTATAACAAAACATTTTCTTTTTCTAGTAAATTAAACAATTATTGTGAAATAGAAAAATAAGAATACTCAGCCGATAAGATAAGATTTGGATGGCCTCCATGAGACGGAAAGAAGTCCAATCATTTCTTATTTTAATAAATTAATTTTAACTATTTTCATTATTATTAATATTAATTTTGTGTTAAATTACAAATTTGATAATTTTAAAAATTAGGCCCCTCTAGTAATTATTCAAATTAATTTTTGGTTTTTGTTTTTAATAGTTAAGCCTATAAACACTATTTCCTCTTTCAAATTTCTTCTTTTGTTATCTACTTTTTACCGATGTTTTAAAAGAACCAAGCCAACAAATAGCTTTTAAAAACTTGTTTTTAATTTTGAAATTTAAGAAAGAATTCAACTATTGTACTTAAGAAAGATGCAACCCAAAACCCTAAATTAATTGAATGAATGGCAGCGATTACATGGGTATGGGGCAAGAAAATATGTGGTGGGTGGAATTGGATTAGTGGGGTGTGCACCATCACAAAGGAAGAGAAGCAAAACAGGGGAATGCGATGAGGAAGTCAATAATTGGGCCTCAACTTACAACATTGCTCTAAAGTCAATGCTTCAAAGACTAAAATTGGAGCTCAAAGACATTTCATTCTCCTACTTTGATGTATATCAAGTCATGTCCAACTTCGTTCGTACGCCATCTTCTTATGGTAACTCCTTTCTCCTTTTTTTTAGACTTCTCTTAGACTCCATTTATCTTTAATTTTCATTTATTTGAATTCAACGATTCTAAAATGTGTATATGTTTGATATTTTTGTGATATAATTAACAGGATTCACAGAGATTAAAAGTGCTTGTTGTGGGCTTGGGAATTTGAAGGCAGATGTTCCTTGTTTACCAATTGCAACATTTTGCTCAAATAGAAGCAACCATCTCTTTTGGGATCTCTATCATCCTACACAACAAGCCCATCAAATGTTTGCTAATTATATATTTGATGGTCCATTTACATACCCACTCAATGTCAAACAACTCATTGCTCTTTGAATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAATAAATAAATAAATATATATTTGTGGTTCTAATTTGTGTTTAATTTTTTTTAGTGAAATAAGTCATGCGTGAAAATTTGAATATCTGACCTCA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ATGGTCTCCCACAGACCCTTCTCCTTCAGCTTCTTCTTCCTCTTCTTCTTCCCAATTTTGTTTAGGGTTTCAAATTCTTCCTTAGTTCCAGCAATCTACGTGTTTGGAGACTCATTAGTGGATGTTGGAAACAACAACCACTTGAAGCTCTCACTAGCCAAAGCCAACTTTCCCCACAATGGACTTGATTTTCCTACCAACAAGCCCACCGGAAGGTTCTCTAATGGCAAGAATGCTGCCGACTATATTGCTGAGAAGGTGGGGTTGCCGACTTCGCCGCCATATTTGTCTCTCATATCCAAGTTTAGAAAGATTATCAATACGACACCGTTTAAGACAGGCGTCAGCTTCGCTTCTGGAGGAGCCGGAATTTTTAATGAAACAAATAATCTTTTTAAACAATCGGTGGCAATGGACCAACAAATAGTGTTCTATTCAACGGTGTACAAAAATCTGGTAGGAGAGCTGGGATCGTCTGGAGCGGAAGCACACCTATCCAAATCTCTATTTACGGTTGTGATTGGAAGTAATGACATCTTCGGCTATCATCAGTCATCCGATCTGCGTAATAAGTACTCCCCACAGCAATACTTGGACTTGATGGCCTCCACTCTGGAGTCGCAGCTTAAGTCTCAAGCTGCCGCCGCCACCTCTCCGTGTGGTTGCCGCCGTCTTCCACCCGATCGCCGTCGCCGGTTGTCGCTGTTGCTTGTTCTCTTAGTGGGTAAGAGTTTTTTTTTTGTGTCGTTGCGGCCTCCGTCGGAGTCTCAAGTCTGTCCTACTTTCCGGTTCAGGAAGATGGAATCCTCCGTGATAGCAGCTGAGCGCATTCTTTCGTATAATTTCAAGAACAAGAAGCTCTTAGAAGAAGCACTCACCCACTCCTCCTACTTCGACTCTGCCTCCTATGAGCGCCTCGAGTTTATCGGCGATTCAGCTATTGGCCTCGCTATTACCAATTATTTCTTTCTTGCTTATCCAGACCTCCATCAAGGCCAACTATCTTTACTTAGGGCTGCTAACATTAGCACCGAGAAGCTTGCTCGTGTTGCAGTCCGCCATGGATTGTATAACTATGTTAGGCGCAACGCCGCCGCTCTCGATGACAAGGTTAGAGAGTTCGTCGATTCCGTGGCCCTAGAACATAACTCAGTTCCGTATGGTGGGTTGGTGAAGGCTCCTAAAGTTCTTGCTGACATTGTGGAATCTGTAGCTGGTGCTGTCTATGTAGATGTTAATTTTGATCTTCAAACACTATGGGTGATAATTAGGGGTTTGTTAGAGCCTATCTATACTCTTGAAGACTTACAAGTAGAGCCCCAACCTGTAACTGTGCTCTTTGAAGTTTGCCAAAAAAATGGGAAGCAGGTAGATATCAAGAATTGGAAAAACGGTTCCAAGAACGTTGCAAGTGTTTATGTCGACGGTAGTTTTGTTGCTTCCGGCACTTCAATGCAAAAAGAAATTGCAAGGCTTAATGCTGCTAGAGAAGCTCTCATTAAATTGTCGGATTTCATGGACACCAGAATTAGAACAGTTGTAACTATTGATGGTATTGATGAATCGTTTGAGATTGAAGGGGCAAAGCATAAGCTACATGATTTTTGTTGCAAGAAAAAGTGGCCGAAACCAAATTACAGTACTGAGAAAGATTTAGGACCTTCACATGAAAGGAGATTTGTTTGCTCTGTTAAGATTTCCACTTCTTCCGGTACGCTCTATATGATGGGAGATGAGAAGTCAAGAGTAAAGGATGCAGAGAATTCTGCAGCCTCTTTGATGATTCGTGCTTTACAGGAAAGAAACTATCTCTAA MVSHRPFSFSFFFLFFFPILFRVSNSSLVPAIYVFGDSLVDVGNNNHLKLSLAKANFPHNGLDFPTNKPTGRFSNGKNAADYIAEKVGLPTSPPYLSLISKFRKIINTTPFKTGVSFASGGAGIFNETNNLFKQSVAMDQQIVFYSTVYKNLVGELGSSGAEAHLSKSLFTVVIGSNDIFGYHQSSDLRNKYSPQQYLDLMASTLESQLKSQAAAATSPCGCRRLPPDRRRRLSLLLVLLVGKSFFFVSLRPPSESQVCPTFRFRKMESSVIAAERILSYNFKNKKLLEEALTHSSYFDSASYERLEFIGDSAIGLAITNYFFLAYPDLHQGQLSLLRAANISTEKLARVAVRHGLYNYVRRNAAALDDKVREFVDSVALEHNSVPYGGLVKAPKVLADIVESVAGAVYVDVNFDLQTLWVIIRGLLEPIYTLEDLQVEPQPVTVLFEVCQKNGKQVDIKNWKNGSKNVASVYVDGSFVASGTSMQKEIARLNAAREALIKLSDFMDTRIRTVVTIDGIDESFEIEGAKHKLHDFCCKKKWPKPNYSTEKDLGPSHERRFVCSVKISTSSGTLYMMGDEKSRVKDAENSAASLMIRALQERNYL Homology
BLAST of Cla97C10G189490 vs. NCBI nr
Match: XP_038903239.1 (ribonuclease 3-like protein 2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 600.5 bits (1547), Expect = 1.6e-167 Identity = 307/338 (90.83%), Postives = 321/338 (94.97%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G189490 vs. NCBI nr
Match: XP_022965096.1 (ribonuclease 3-like protein 2 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 585.1 bits (1507), Expect = 6.9e-163 Identity = 295/338 (87.28%), Postives = 314/338 (92.90%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G189490 vs. NCBI nr
Match: XP_023551903.1 (ribonuclease 3-like protein 2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 583.9 bits (1504), Expect = 1.5e-162 Identity = 295/338 (87.28%), Postives = 313/338 (92.60%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G189490 vs. NCBI nr
Match: KAG6577457.1 (Ribonuclease 3-like protein 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] >KAG7015528.1 Ribonuclease 3-like protein 2 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 580.5 bits (1495), Expect = 1.7e-161 Identity = 293/338 (86.69%), Postives = 312/338 (92.31%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G189490 vs. NCBI nr
Match: XP_008449146.1 (PREDICTED: ribonuclease 3-like protein 2 [Cucumis melo] >KAA0055862.1 ribonuclease 3-like protein 2 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK24086.1 ribonuclease 3-like protein 2 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 579.7 bits (1493), Expect = 2.9e-161 Identity = 295/338 (87.28%), Postives = 315/338 (93.20%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G189490 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LTQ0 (Ribonuclease 3-like protein 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RTL2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 381.7 bits (979), Expect = 1.5e-104 Identity = 204/361 (56.51%), Postives = 267/361 (73.96%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G189490 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6ATG6 (Ribonuclease 3-like protein 2 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os05g0271300 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 261.2 bits (666), Expect = 3.0e-68 Identity = 146/276 (52.90%), Postives = 187/276 (67.75%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G189490 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FKF0 (Ribonuclease 3-like protein 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RTL3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 224.6 bits (571), Expect = 3.1e-57 Identity = 142/384 (36.98%), Postives = 207/384 (53.91%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G189490 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FIA1 (GDSL esterase/lipase At5g55050 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g55050 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 204.1 bits (518), Expect = 4.3e-51 Identity = 101/182 (55.49%), Postives = 133/182 (73.08%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G189490 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SP32 (Endoribonuclease Dicer homolog 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=DCL1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 203.0 bits (515), Expect = 9.7e-51 Identity = 126/349 (36.10%), Postives = 197/349 (56.45%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G189490 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HKS4 (ribonuclease 3-like protein 2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111465061 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 585.1 bits (1507), Expect = 3.3e-163 Identity = 295/338 (87.28%), Postives = 314/338 (92.90%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G189490 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DKE4 (Ribonuclease 3-like protein 2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold943G00580 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 579.7 bits (1493), Expect = 1.4e-161 Identity = 295/338 (87.28%), Postives = 315/338 (93.20%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G189490 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BM12 (ribonuclease 3-like protein 2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491097 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 579.7 bits (1493), Expect = 1.4e-161 Identity = 295/338 (87.28%), Postives = 315/338 (93.20%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G189490 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F189 (ribonuclease 3-like protein 2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111438633 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 573.9 bits (1478), Expect = 7.7e-160 Identity = 289/338 (85.50%), Postives = 309/338 (91.42%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G189490 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L1E2 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G192230 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 565.8 bits (1457), Expect = 2.1e-157 Identity = 287/338 (84.91%), Postives = 311/338 (92.01%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G189490 vs. TAIR 10
Match: AT3G20420.1 (RNAse THREE-like protein 2 ) HSP 1 Score: 381.7 bits (979), Expect = 1.1e-105 Identity = 204/361 (56.51%), Postives = 267/361 (73.96%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G189490 vs. TAIR 10
Match: AT5G45150.1 (RNAse THREE-like protein 3 ) HSP 1 Score: 224.6 bits (571), Expect = 2.2e-58 Identity = 142/384 (36.98%), Postives = 207/384 (53.91%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G189490 vs. TAIR 10
Match: AT5G55050.1 (GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein ) HSP 1 Score: 204.1 bits (518), Expect = 3.1e-52 Identity = 101/182 (55.49%), Postives = 133/182 (73.08%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G189490 vs. TAIR 10
Match: AT1G01040.1 (dicer-like 1 ) HSP 1 Score: 203.0 bits (515), Expect = 6.9e-52 Identity = 126/349 (36.10%), Postives = 197/349 (56.45%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G189490 vs. TAIR 10
Match: AT1G01040.2 (dicer-like 1 ) HSP 1 Score: 203.0 bits (515), Expect = 6.9e-52 Identity = 126/349 (36.10%), Postives = 197/349 (56.45%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (97103) v2.5
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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