Cla97C09G163500 (gene) Watermelon (97103) v2.5

Overview
NameCla97C09G163500
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. 97103 (Watermelon (97103) v2.5)
DescriptionAmylomaltase
LocationCla97Chr09: 1235314 .. 1248828 (+)
RNA-Seq ExpressionCla97C09G163500
SyntenyCla97C09G163500
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
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mRNA sequence

ATGGGAGTAGAAGTAGGTCAGCCGTCGGGTATGGACAACGGTCAAAATAGGTTTCGACCACGGTCTCAAACGTTGAGCGCCGGTGATCTTCTACCACCGCCTCCGTCGCCGGAGAATTCGACTTTTTTGGAGTTCGAAAACATAGTTCTTATCAGAGTCCCAGAGAATCCAACAAGTTTCTATCCACGTTTCATTCTTGAAGATACTTGTAACCTTACTGATTTGGAGTTGGATGGCCACAGGTTGCATTTTTTCTTCCCTGTAGGTTTGCTAGAGTTTGGACAAGTGGAGGTAAACCTCATAACTCCTAGGTACAACAATTTAAGGAACAATAAAGGAAGCACGAGGGTATTTGAACCCCTAGGAAGTGCTGGTGTAAATGATATTTGGGTCATTGGTGCTCACAACAAGTTGCATTATATTGGTCAAGAATATGGTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGGAGTAGAAGTAGGTCAGCCGTCGGGTATGGACAACGGTCAAAATAGGTTTCGACCACGGTCTCAAACGTTGAGCGCCGGTGATCTTCTACCACCGCCTCCGTCGCCGGAGAATTCGACTTTTTTGGAGTTCGAAAACATAGTTCTTATCAGAGTCCCAGAGAATCCAACAAGTTTCTATCCACGTTTCATTCTTGAAGATACTTGTAACCTTACTGATTTGGAGTTGGATGGCCACAGGTTGCATTTTTTCTTCCCTGTAGGTTTGCTAGAGTTTGGACAAGTGGAGGTAAACCTCATAACTCCTAGGTACAACAATTTAAGGAACAATAAAGGAAGCACGAGGGTATTTGAACCCCTAGGAAGTGCTGGTGTAAATGATATTTGGGTCATTGGTGCTCACAACAAGTTGCATTATATTGGTCAAGAATATGGTTAA

Protein sequence

MGVEVGQPSGMDNGQNRFRPRSQTLSAGDLLPPPPSPENSTFLEFENIVLIRVPENPTSFYPRFILEDTCNLTDLELDGHRLHFFFPVGLLEFGQVEVNLITPRYNNLRNNKGSTRVFEPLGSAGVNDIWVIGAHNKLHYIGQEYG
Homology
[Close]
BLAST of Cla97C09G163500 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GEL7 (Amylomaltase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111453446 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 53.9 bits (128), Expect = 6.5e-04
Identity = 30/66 (45.45%), Postives = 37/66 (56.06%), Query Frame = 0 

Query: 15  QNRFRPRSQTLSAGDLLPPPPSPENSTFLEFENIVLIRVPENPTSFYPRFILEDTCNLTD 74
           + +   + ++L     L  P     S F   +NIVLIR PENP SFYPRF LEDT +  D
Sbjct: 650 EKKIASKLKSLVEESQLQNPDQIRRSLFELVQNIVLIRDPENPKSFYPRFNLEDTSSFND 709

Query: 75  LELDGH 81
             LDGH
Sbjct: 710 --LDGH 713

[Close]
BLAST of Cla97C09G163500 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GFH3 (Amylomaltase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111453446 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 53.9 bits (128), Expect = 6.5e-04
Identity = 30/66 (45.45%), Postives = 37/66 (56.06%), Query Frame = 0 

Query: 15  QNRFRPRSQTLSAGDLLPPPPSPENSTFLEFENIVLIRVPENPTSFYPRFILEDTCNLTD 74
           + +   + ++L     L  P     S F   +NIVLIR PENP SFYPRF LEDT +  D
Sbjct: 649 EKKIASKLKSLVEESQLQNPDQIRRSLFELVQNIVLIRDPENPKSFYPRFNLEDTSSFND 708

Query: 75  LELDGH 81
             LDGH
Sbjct: 709 --LDGH 712

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Cla97C09G163500 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cla97C09G163500 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cla97C09G163500 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A6J1GEL76.5e-0445.45Amylomaltase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111453446 PE=3 SV=1[more]
A0A6J1GFH36.5e-0445.45Amylomaltase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111453446 PE=3 SV=1[more]
BLAST of Cla97C09G163500 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (97103) v2.5
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..37
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 9..23

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Cla97C09G163500.1Cla97C09G163500.1mRNA