Cla97C08G152250 (gene) Watermelon (97103) v2.5

Overview
NameCla97C08G152250
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. 97103 (Watermelon (97103) v2.5)
DescriptionUnknown protein
LocationCla97Chr08: 20615648 .. 20620225 (+)
RNA-Seq ExpressionCla97C08G152250
SyntenyCla97C08G152250
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
GATATCTCGATTCATTTTTTTCCAATAGAAATCAAGCAACACGAGACTCCCTCGATCTTCCCTGCTTCACGGCTCTCTCACAACTCTCTCTCAAGGTTCTTAGCTCCTTTCTCTCTCCATTTTTATCTGCCTAGAATTTAATCTAACATTTCTTACTCTCCACTATGCTTTACTGTTTGTCTTGTGAATTACGGTGTATTTGATGGCTTGCTTTATAATTTATGATGTGAATTCTCCGCAGAGTTAAGAGGGGAAGAGAACGAACATATGTATTTGCTTATTTTTCCTTTTGCTTCCAGTCCTCTCTTCTGCGTCTGCTTTCTTCTCTGTTTTTGTCTAGTATCTGCAACCTCTTCTCTACCGAAAAAGTACTGCATGAGGCCACCTCAGTGTGGCTGCGGGATGCCTCAAATACAGAATAAAAAGTGCCCAGTTTCTGACCTCTCAATTATGTATTTGGAAAACAGAAAAGTTTCAGAATTTAAGACCAAATCTTCTCTCCAGCGTAAAGCATTTCCTGTTTGGTCAACCTAGGTCAACCCTTTTGGGATTGGCTTGGTGCGAAATTTCAAGTTGGTTAAACAATCAAACCAAAAATTTGGGTTCATTGACTTGGGTCTAGAAAGTACTTCTCCCTCTTTAGGATCCCCTTGTTTGGTTTGTAAGACCATTGAGAAGCTTATGAGGGATTTCTTGTGGGAAGGGGTAGATGAAGGAAAAGGGGCCTACCTTGTGAATTGGGACGTGATTAGGAAGTCTGTGGACATGGGAGGGCTTGAACTTGAGATTTTAAGGACTAGTAACAAACCGCTGTTAGGCGAAATGGCTTTGACATTTCCCTCTTGAGCCTGAACCCTTGGTGGAGGATTATTGTGAGCAAGTATAATTTCACCCCTTTGGGGGGCGGTCAAATGGGATTAAAGGCCCTCACAGAGATTTGTGGAAGGATATCTTTAGTCTTTGGGGGGAGGGGAGGAAAGGATCAAGAGGTGGGGGATAGACCCCCTTGCACTAGGTTTCCTCGTCTTTACCATTTATCTTTATCCTCTTCAAGACACTGTTTTGTGATTGAGTTCTTAGTATGGTCTGGGTGCTCCCTCTCTTTTTGATTTGGCTCCCGTTTTCCTTTGTCCGATAGAGAAATGATAGATGTTACAATGCTCCTATCTTTGATTTGAAGAGTTTGATTTTAGGATCAGCAGGAGAGATATGTGTATTTGGTGCCCTAACCCTTATAGAGGCTTCTCTTGTATTTGGTGCCCTAACCCTTATAGAGGCTTCTCTTGTATTTGGTGCCCTAACCCTTATGTGATAAGGATCCTTTTCTTGGTTCTGTTGAATATTAAGATTCCAAAGAATGTTAAGTTCTTTTTCTGGCTGGTTATCCATGGACAAGGCAACACTCTTGATAGGGTCTAGAGAAACTGACCTTCATTGATTGGTCTCGTTTTGTTGTATCCTCTGTCAGAAGGCAAAGGAAGACCTTGATCATAGCCTTTGGAGATTGACTTCATGCATTTTATGTGGAGTGATTTTTGTAGCTGATTGGTTTTTTGTTAGTTCGCCATAGAGATTTGAATGAGATGATTGAGGAATGCCCTCTCCATCTGCCTTTTTAAGAGGAGTCATTTCTTGTAGCTTATTGGGGTGTGTACTTTATTGTAGGACCTTTGGGAAGAGAGGAATAATTGAATGTTTAGAGGTTTGGAAAGGGATTCAAGTGATGGTCTCTAGTTGGATTCCATGTTTCTCTTTGGACTTTGGTGACGAAGGTTTTGTTGTAGCTATTTGATAGGCATTATTTAACACTACTAGAGTCCCTTCAATGCCCTCCCCTTTTGTGGGTTTTTCTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTCTTTTATATTTTAAATTTAAAAAAAAATGCTTGTATACTCTTTCATTTTTTTCCCCCAAATTAAAAGTTGTTTTCTCATTTTTTAAAAAGAAAAAAGGAAAAAAGGGGAAAAAAACGAAAACACATGCCTTCAGTTGTGTATCTTTCACTTATTAATGTATTTCAAATTTTTTGCTGATCTATCAGAATACTAAAGATTTGTAGATCAGAGTGAGCTTTGTGATGGCAACTGAACTGAAAGCAGCTTCTGAGGAAGTGAAGGTTGACCTCTTTGAGGATGATGATGAGTTTGAAGAATTTGAGATTAATGAAGGTTTGACTTGAAACTATTTGTCTTTTTTGTTCCTTCCCTTGTTTGGATTCCTTCACGATTGCCTTTAATTTGCACTCATTTTTCATTTATCAGTGCTTGTGTTGTGCAATTTCTCCTTTGTTTCAGCCAAAAGAATGTGAATGTTATGCAACGGTCTGAAAATCCTGATACTAACTCAATCCTAACTGCTGGCATTCTTCATTTGGATGCCTCATTACTGTTGCACTCATTCATTTCACAGAGGCCAGTCTCTATCGAAAAAAAAAAAAAAATCCATTATTTTGTAGTAAATTCTTGGAATCCAGTGTTTGAAGAAAATAAGGCAGAATGTTTGTAAACTCAATTGCAATAGTAAAAATTAGAAAAAAAACATATTGATGAGGATAAAGAAAAGTTGGAATAATGCATGGTTTTTAAAAGACCTCAAGTATACTTTATTTGGATGGACCTTTTTCTCTTTAAAATTTAAGCTATTAAAATTCTCTAGAGGTTTGTTTCAAGTTAATGTAAGAACTATTTTTTATTTTTTTATTTAATTAATTAATTAATTAATTTATTTTATTTAAAAAAAGCTTATAGAATTACTTCTTTTCCAAAAAGGAAAAAAAAGGTTTGTTTGGAGTTAATTTCTTTTGTTACATACATATTCGGATATTCCTTGTATGCTCAAAAGTGCTTGCAGTGGTACATAAGTAAGCTGGTAGAATAGCTTTTGAATGAATTTATTCAGATTTTGCTTTGATTACTGAAATGTTCTTGAAGTACATTTTTTTTTTCCAATTTATATTCCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGGATGACCATGAAACCACTTCTCTTTGTTCAGCGGAAGTGGGCGCTTTTCTTTATTTTTCAGAAATGGTTACAGTTACTTGATTGTTAAGAAGAGAATAAAGAATCTTTAGTTTTACATTCAGATCATGTGGTTGCTCGATGATGTTGTCAACTGAAACTATGATTTGAAGGTCCTGCTAGTCTTTTGTTTCCTTTAACAAGAAAAACATTTCAGTGACAAGGAAGTTTTGGAGTTTGTTAAATGGAGCATTATAGGTTGTTGGTGTGTCAATACTAAACTCTTGATAGCTTGTTAATTTCACGGATGTGCTTGTATATGTCGTGCCAGCATAACATTGTTAACTAACTTAATGTCTTATGTTCTATACTTTTCATTCGTCACAATGTGTTATTTGTTATGTTTCAAAACGAAGTGAAGGATTTGATAAATTACCAGTTAAGGGGGATCTTGTGACTAGAATATATCTCCCAAATGGTGTCATTACATTGTTTGAGAGCTTTTATGCATTTATTATTATTTTTATTTAACTAGGAGTGTGCTTGGGGTGCTTAAGTGCACCTTAACTGATCTCAAAGAACAGCCATTCGATTCTATGACATTATAACACGTTAGTGTCAAGAAACTTGTGAGAGTTTGTTCTAAGTAGGTAACCACCCTGAGGTTTTTGAACAAATTCCTCAGTGTCTTTTACTTTTTCACATGCTCAAGGGCAATATTAGGGCAAGTAATGGTGGTTCTTGTTTGAGTGCATATAGAAGTTTAAGTTAGAACTTTGTCATATATATCATATATGTCCTAGTCGTCCTAATCCTAACAATATTGCTGCTAATCAGAGAGTTCAGAGGTCTTTTCCTCCTTTTCAAAGTTATTATGCAACTCTAATCTTCCTCAGATTCTGGGGTAAAGCTTATTACTCTTCTTGTTGTTGGCCTAACATCTTTAAGCCTAATGATATTTTTGTGATCTTTCCTTTTGATTCTCATTGGTGAAAATGGATTACAGAGTGGGAAGTCAAGGAAGGCAAAGAAATTACTCAGCAGTGGGAAGATGACTGGGATGATGATGATGTTAATGATGACTTCTCGTTGCAGCTTAAGAGAGAATTGGAGAACAATGCTGAGAAAAAATGAAGAGACTCTAGACACTTTCTTTTTATCTGCCAACATCTATGTTTTATTTGCGCTGTTTGACCTTCAAGATGGTTTTATTGCCTTCTATATCTCAAATGGTGTCATTAATATTCATTTAAGATCAGCATATTGAATATCTATGGCCGTTGGCCCAGAAGATAAGGCATTCAGTTAATTTATCGATAGTCCTTGCTTTTACAATTCACTTTCACTTTCAAGTTTTGTCAAATTATTTAAGTTATCGGAAGGATTAGAGTTCTAATTGCGTTGTAATTCTATGGTAGTCACCTATTCAAATTTTATGAATTTTCTGTGATGGAGTAATCGTTCCATGACATTAATTAATGTAACAGTAAGTGAAAAAGAAAAGGAAAATGAAAAATAAGAAGCTTATTGGGTAAATTTAAACAACAAAAAGCTTTAAAGCAATTGGAAGCA

mRNA sequence

GATATCTCGATTCATTTTTTTCCAATAGAAATCAAGCAACACGAGACTCCCTCGATCTTCCCTGCTTCACGGCTCTCTCACAACTCTCTCTCAAGAATACTAAAGATTTGTAGATCAGAGTGAGCTTTGTGATGGCAACTGAACTGAAAGCAGCTTCTGAGGAAGTGAAGGTTGACCTCTTTGAGGATGATGATGAGTTTGAAGAATTTGAGATTAATGAAGAGTGGGAAGTCAAGGAAGGCAAAGAAATTACTCAGCAGTGGGAAGATGACTGGGATGATGATGATGTTAATGATGACTTCTCGTTGCAGCTTAAGAGAGAATTGGAGAACAATGCTGAGAAAAAATGAAGAGACTCTAGACACTTTCTTTTTATCTGCCAACATCTATGTTTTATTTGCGCTGTTTGACCTTCAAGATGGTTTTATTGCCTTCTATATCTCAAATGGTGTCATTAATATTCATTTAAGATCAGCATATTGAATATCTATGGCCGTTGGCCCAGAAGATAAGGCATTCAGTTAATTTATCGATAGTCCTTGCTTTTACAATTCACTTTCACTTTCAAGTTTTGTCAAATTATTTAAGTTATCGGAAGGATTAGAGTTCTAATTGCGTTGTAATTCTATGGTAGTCACCTATTCAAATTTTATGAATTTTCTGTGATGGAGTAATCGTTCCATGACATTAATTAATGTAACAGTAAGTGAAAAAGAAAAGGAAAATGAAAAATAAGAAGCTTATTGGGTAAATTTAAACAACAAAAAGCTTTAAAGCAATTGGAAGCA

Coding sequence (CDS)

ATGATGATGAGTTTGAAGAATTTGAGATTAATGAAGAGTGGGAAGTCAAGGAAGGCAAAGAAATTACTCAGCAGTGGGAAGATGACTGGGATGATGATGATGTTAATGATGACTTCTCGTTGCAGCTTAAGAGAGAATTGGAGAACAATGCTGAGAAAAAATGAAGAGACTCTAGACACTTTCTTTTTATCTGCCAACATCTATGTTTTATTTGCGCTGTTTGACCTTCAAGATGGTTTTATTGCCTTCTATATCTCAAATGGTGTCATTAATATTCATTTAAGATCAGCATATTGA

Protein sequence

MMMSLKNLRLMKSGKSRKAKKLLSSGKMTGMMMMLMMTSRCSLRENWRTMLRKNEETLDTFFLSANIYVLFALFDLQDGFIAFYISNGVINIHLRSAY
Homology
[Close]
BLAST of Cla97C08G152250 vs. NCBI nr
Match: KAG6584228.1 (hypothetical protein SDJN03_20160, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 61.2 bits (147), Expect = 5.6e-06
Identity = 41/68 (60.29%), Postives = 47/68 (69.12%), Query Frame = 0 

Query: 1  MMMSLKNLRLMKSGKS-RKAKKLLSSGKMTGMMMMLMMTSRCSLRENWRTMLRKNEETLD 60
          MMMS K+LRLMK+GKS +K +KL SSGK TGM MM M TS CS  ENWR   R+NE+   
Sbjct: 1  MMMSSKSLRLMKNGKSKKKVRKLHSSGKTTGMTMMSMTTSPCSFGENWRATPRRNEK--- 60

Query: 61 TFFLSANI 68
           F LS  I
Sbjct: 61 IFLLSYQI 65

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Cla97C08G152250 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG6584228.15.6e-0660.29hypothetical protein SDJN03_20160, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sorori... [more]
BLAST of Cla97C08G152250 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cla97C08G152250 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cla97C08G152250 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Cla97C08G152250.2Cla97C08G152250.2mRNA