Cla97C07G138400 (gene) Watermelon (97103) v2.5

Overview
NameCla97C07G138400
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. 97103 (Watermelon (97103) v2.5)
DescriptionUnknown protein
LocationCla97Chr07: 26152173 .. 26182010 (+)
RNA-Seq ExpressionCla97C07G138400
SyntenyCla97C07G138400
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptide
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AATCTTTTATTAAGATGATAATGTGAGTGGGGAAAACTCCTATTTATAGAGTTTATTACAATGGAGGTAAAAGGGAATTAACCTAGAATATTACCCAATTATAACCCCTTTCTTCCTACATCAAGCCTCTTCGTGAGATGTTCTTTCATTGCATCCAATATTGATATTAACATTGCAAAACTTACTGTTTACTCTGAGACTTGTAAACCAAAGTTAGGCACCTATGGTATGGATGAATGTTTTTTTTCCTCACAGTAATCATGTTGTAGTAGGATTAAGGATAAATGGGGTTAATTTCATATTAATCTTGGTTATCCTTTGTTAAAATGAATTATCCCAATTTACCTCTAATTGGGAATCTTATAGATTATTATTTCTTGTGTGTATTTGTGTTTGTTTATGTGTTCGACCATAAAAAAATTTACTTGTCAGTTTCTTAAAGGAAGTTTAAATTACTCTGAATCAATAATCTTCTAATTATTTCAAGTTGTTAATTGTTACACTACTTTTGTAAAATTTTGTTCTATCTTCCTTTCTCACCCTTTCTTGGGGTGGGTTGGGCTGTGGAAGAGCACAATAAAGGCGTGTGCTATGTTATGTCTACAGCAGCCATTGACAATTATCATTTGGCAGATTTTTAATGATAAGATGCTGAAGATTAGTGTCAAAAGATGTATACGTACAGCAATCAAATTGCGGAAGAAATATTTTTCCAAGGTGAGATGCAGATTTAAGGGTTTTTTTAACTTGTTCTTTTTTTTAAATTTTTTTTTTTAAATTTATTATTATTATTATTATTATTAATCTTGCCATATTGAGTTTTTTAATGCACCAATTGCTATCAACCCTTTTTATCTTGAAGGGCAAAATGATATTTCTCCACTCATAAACTGAATCAATTATCTCGATTGGTTGCTATATATATATATTTGCTTATATTAAATATAGATGTGCAACATGATACATGACCGTCCATTGACCCGATCATCATTTATTACATAGTGATAAAGTCCAGAGAATTTTTATTACGGAAAAGTTTGCACAACAATCATGCTCTTTTTTATTAATATTAAAAAAGAATACAATATTTCTGAATGTTATAATATTCTTCTTTTTTTTCTCATTGTCAGTTGGAGATTTATTTGGTGATCAGTGATCACAGTGAATTGAACGACTAGGAGAATATTTTATATTGCTCGTGTGGGGGCATTATTGTTCACGTTTATGTTATTATGATATGATTCTTTTCCAAAAAGTTTTTATTGAAGTACTTTGAAACTTGCCTCTTTTTGTATCAGGTAATCAAGAAAAGGAGCCTCCGATCTCATTATGAGGACTAGAGCTGCACCATTTATACGAAGCAACAACTGCAATAATAGCTGTTATGAAACAGTTGATGAAAAATGCATCGGCAGTTCAAAAATTCAAATTGAGGTTTATGCAGACTGCCTCTGCTTCAGATTCTTTATCGGTAACTTTACAATTGACTCATAATGTCTGCATTTATAACGCTCTTTGTGGACAATAAAATTCAGATAACATGTTAATTCTTATATTTATAATTTATGGACAATATTATTACAGAACATGATGTAATCAAATAAAAGTTCTAATTATTCATTTTCTCTTTCATATATGTTTGAGAGGGTGGAAAATAGAAAGCCAGAGTTCAATCTACTCAAATCATTTACCTCTTTAAAGAGGACTTGTCGGGCTTCTATACAATGTACTTCAGTACTTGTTCTTTGTTTTGCTTCCCTACCTCTGTTTGTACTTTCAATGATGAACAAGAGTCGTTTGCCCTTATTTTGGGTTGGGTGGTGTGGTTTTGGATTTTTGAAAACCATGTTTAGCCAATGTAATCAATATCTTGCAAACACAACCCCATGGGCAGTTGCTTGCCGCTCACCACCTACCACACTTGCTTCCAACCACCCCCGTGGTTGCAATTTTCTTCTTCTGTTTTGTTTTGTTCTCTCTACTGTTCAAACTTCAGTTTCTTTTATTTCATCTTTTTTACCTAGGTAAAGGACTTAGTTGCTGATTAGATTGGCTACTATTTAGTTAAGAAACAAACGCTGACTTAGATGATGTAGTAGGGTTAGGATAAATTAGGGTATTATGGTTAAATCCGTAATCGATTAGGATTAGGATTAGTTTCTTTGATTAATTAGGATCTGGATTAGTTAATTTCCAATTCTCTATAAGTAGAGAAATTGTCTTATTGTGTTGGTAACTTTTAATTGATAATAAAGACTTTGATTTGATTCTTAGAGAATGTTCTCCTTTTATCTTTTAGGGTACATCAATTTGGTATTAGAGCAACCGTATGGGTCAACATTGACTACCGTCGGTGGAAGATTGAGAAACTCTTGGCGATGCCGATCGCAAGAAGGAGCTTTGTGAGCTATGCTCGTTGATAAACAACACATATCTAATTAGGGAGAACCCTTTAAATTCTAGCAAAGAAAGAGGAATTGGTGAATTTTTTTAAGATTTTGCAAAAATGAACTAATTATAATCAAGGAAGATGCCTAGGAAAAGTTGCAGCAGTGGTGAGGCAAGAAAGTCAAATTTACTCCCAAAAACAATGTTGGAATTTTTATTCAAGTGATTTGGAAGAGGAACATCACGTCACTCATGCTCGATTTTATCAAAGAACATGTCAAGATCCACCATGGAATTTTGGTTATAGTGATTCAAGCAATGTCAATGAAGATTTTGAAATATGAAAACAAATTGTCATTAACAAGAAGAAATTTGAAGATCTAATTAGACCAATTTTTCTAGAAATCGACGTTAGAATTTAGACTTCGATGATTCAGAAAGTGATTCAAAGTGTGGAAATTATTATGGCAACATCAGAAGGCACCCATAAATCATTACTACAACGGTTATAAGGCTGAAACTTATTCAAGAATACCCAATTTGTACATTAGCCCTGAAGTATCGAAGAAAATGAATAAGGGAGTAAAAGAGATCCAACGTTTTGTTGGCTAAGGTGACTCAAAATATGGATCAACTTTCATAACCATGGCAAGAGTTCAAAAAAGAAATAATTCAAGAAAATCAAAGCCAAGAGCTTGTTGGATTAAATAAAGATCAAGAATTCAACCAAGATTGTGGAATCTTGTAAAGAAACACATAAGACAAAAAACCCAAAAGAAATTTGGAACCCACACATGGACCAACTGAGCAAGGAAGAAAAAATGAGCGAAGAAAAATCTGAATTTGAAGCTAAGGAAGTCTTGTTCAAGAAAGAAGATGTAACAATAGACGGTGGCAATTCTGGAAAAGAAGATAATAACCATGTTTAACCAGATTTGAAGAAGTTTGAATCTCTGGTTGTAGTCCGATTGCTTGGAAGACAGCGAGGAAGAGTACGTGGAAACGCATGATCCATTTGAAGACCCTGAGATCCGACCTAACATGTATGCTCAATTCCTTGTATGTGTTTAATGCGATCCAACCCGGGTTCGATCCTCCATACTTTTGATTTGCTGCCTCCATTTTCGTGAGTTTATTTCAATCTATTTCTTCACAAATTCTTGGGTTATGCAATAACAAATTTTCAAATGGATTTATGGGTTGCTTTGATACTCCAACTTTGGCTAAAATGGTTGAGCAAAATCTTGGTGGTAGGCGTATATAGAATTCTCAGCAACCAAATAAAAATTTTGATGAGGGTCATGCTTTATAGTTTTCAAATTGTTTGTGGGCTCCTTCAATCTTTGTAGTGTAGTTGTAGTACAAGATTTCTACAAGCCAATGATTTTATTTAGAATTTTTACAAATCATCCAGGGACTCTATATTTTTCATTTTCCTTTTGAAACTTGAGGATGAGTTTTTGGGAGGGATAGAATGATGTAGTAGGATTCGGATAAATTAGAGTCTAAGAAGCATGGATACGAATACGAGACACAGACACAACACAGACATGGCGACACACCATATTTTAAATATCTAGGACACCACGACAATAACACGTTTATTAAAGTATACATTGTAAAAAATATATATCATTTTCATACCAAAATAAAATTCAAAGTAAATGAGTTGATGCATTTATATGTTTAAAAGACTTAACTTGATGTATTTCACACTCAAAAGTTATTATTATTATTATCATATGTGTCTTTTTAGTCTACTCAACAAGTGTCTGATATGTGTCCAACAAGTGTCGAAATGTCCAAATGTATGACACGTGTTAGACACAAACATGCTAGCCAAACTAAAGTGTCCATGCTTCTTAGATTATGGGCCAAATCCATAATTGATTAGGAAATTAGAATTAGTTTCCATATTGATTAGGATTTCTTGGACAAAGTTCTCCTTTTATCGTTTAAGCTACATCAATAGGGGTCCCCAGAGGTTGTAAGAGGTATTACTTTCATATCAATACAAGATTGTCTCAAGAAAATTAGTTTACACTACAAAATTGTCGGTTGCTTAGAAAAGATTACGACTAGGTTTGGGATGGAGGTACCTACAAACTGATCACTGGACAGTTGCTCTCAATAAATTTCACAATCAACTTGTAGTTAACTCACATTTCATAAGGTGGATGATCATTTCATGCCCAATCTGAAAATCTTCCATGGTCGTCAATCCTTGCAATTCCAAGATTGCTCCCTTATACCACCAACTCCTTTAAGGTGGCTCTGACACATCATCATCACTTCGTTGTCCATATGCAGATGCACAGCTTTGCCACAATCCCAACAGAGATGAAATTGCACGCCCCGGCGATCATCGAAATGACCATTCCCTCCATCTTAAATCGATCCCATATTTGAATTATGGGATCTCTGCCACTTTCCCTTCGTTTGCTTCTTAA

mRNA sequence

AGGAAACGGTCTGTTGCGTAAATGGCGAGGGAGATTCTCTTCCTCAACCTCTACCCAAACCTAAGTTTAAACCTATTTGTGAATTTCAGAGATCTCTTCAGCTCTTCCTTATTCAATCGAAGCTTTCGAGACAATTCCCCGCTCTCCCCATCATGTGATTCATTTTGCTGTTCTCTCAAGTCTCAATGATACCAATCATCCATTGATTGCTTATTCCTTCCCTCTTTTTTCCATGCCATGCCGCATTTGTTTTCTTCATCTTTTATTATACCCGCAAGTGTTTCTTCTACTTCTTTTTGCTTGCACGGGATTTCTTCAAGAAAAGGCTACAACCCAGAATTGGTGTTTGTTCATCCGATTTTTGCCGGGCAATGGTAGCAGAGGTTGTTGAATCAAGAAAGAAGGGTGGTTTTGGTTTTCTGGATTGTAATGTCTTGTGGTGGAGAAGCTGATAAGCAATGGACTTGTGCAAAAGCCGGCGCTGCTAGTTTGCAGAGAGTGGGTTTGATTGTGCGAGACATTGGCGAGCCATGCCTTTCACAATCGCCCATAAAGGTTGTTATAACTGTAAACAGAATGCTCAAGCCAGAGAAGTGGCTGGCAGCATTTGATAGTGATGGAAAGGCTCTTGGCTTTCAGAAGACACTCAAATCAATAGTTTTGGGGGGTGTGGATCCGTCTATTAGGGCAGAAGTATGGGAATTTTTGCTTGGTTGTTATGCCGTAGGTAGCACTGCTGAGCACCGAGGCCAACTAAGGACTGCCAGAAGGGAACGTTACAAGGACCTGATAGAGGAGTGTCGGATGATACATTCTAGCATAGGAACTGGTTCCCTTGCCTACCCCGTGGGTTCTAAAGTTATGGATATGAGGACGTCATCTAAAGATGGACCGAGGGAAGCTGAGAGTGAAAGTAGAGAAGTTTCCGTTCATAATACGAATACAGTAGAAGATTCTTTTTGTAGGAATAATAATTGTATAGATAAATCATACACATGCCAAAGGGAAAGCTCGAGTGATTCAGCAGAACTTGTGAGTGTTAGGGAAAGTACAGATAGTGTGGCAGTTGGGTCTGCCTGTTGTGTCCCCATTTCTGATCCTTGTAATTGTTATTCCCTAAAACCTGGGAGTGAAGCAGATGGATCAGCAATTGTTACAGAAAATGATTATGATTTTCCTCCTCTACCTGTCATTGACTTGTTTGACAAGGACAACAAAGATAAGAACAAATATTTCTTGCATAATGCCAAACTTTCAACTCAACGTGAACTGAGATTTGAAGATGGCAGCATGCACAGTTTTCAGATAAATAACAACGAAGATTTAGTTATTGAATCAACTGCCTCATCCTCTAACAATGTTTCTCATCCCATTAGCTCTGAAATTGAAATGATACATCTTGATTCAAGTGACCCAGAATTTCAGCACAATAGCTCGTGCAATAACACGAATCCAAATGTACCAGAAACGGAATACTTAAATGCAACAGTCTACCGTAATAGTGCTGTCAGTGAAGATAGAGTATCTGAATGGCTTTGGACCCTGCACCGAATAGTGGTAGATGTGGTTCGAACAGATAGTCATCTTGAGTTCTATGAGGATACGAGAAACTTAGCTAGGATGTCAGATATCCTTGCAGTTTATGCATGGGTTGATCCTGCGACTGGTTATTGTCAAGGAATGAGTGACTTGCTGTCTCCTTTTGTTGTTCTATTTGAGGATAATGCTGATGCATTTTGGTGCTTCGAGATGCTCTTAAGGAGAATGCGTGAGAATTTTCAAATGGAAGGCCCAACTCGGGTGATGAAACAGTTGGAGGCATTGTGGAACATTTTGGAACTTACTGACAAGGAAATCTTCACTCACCTGTCACATGTAGGTGCTGAGAGCCTACATTTTGCATTTCCGATGCTCTTGGTACTTTTTCGTCGGGAGTTATCATTTAATGAGGCACTTTGTATGTGGGAGATGATGTGGGCTGCTGATTTTGACGAATCAAGAGCTTACAGTTTAGAGGTTAGTTGTCTGGAAGCATTGACATTACAACTTCCAAGAGGCTCGGAAGTGGAAATAAGTGAAGGAGACATAGAGAATACCAACGTGAAAGACACCTTACAATCAAATAATGGAAATTTGGAACGTTCTTCATGTGACAATGCTGGAATGAAGTCAACATCTATCCATGCTTTTTGTGGTTTGACAAGGAATCTTTGTTCAAGGAATGATCCTACGAAGAAGTGCACTGTAATATCATCAACTAAGCAAGGTGATGATGAGCTTCCTGTTTATTGTGTTGCCGCAATCCTTATAATGAATCGCCAAAAGATAATTAGAGAAACGCGTTCTATTGATGATCTGATAAAGATTTTTAATGATAAGATGCTGAAGATTAGTGTCAAAAGATGTATACGTACAGCAATCAAATTGCGGAAGAAATATTTTTCCAAGGTAATCAAGAAAAGGAGCCTCCGATCTCATTATGAGGACTAGAGCTGCACCATTTATACGAAGCAACAACTGCAATAATAGCTGTTATGAAACAGTTGATGAAAAATGCATCGGCAGTTCAAAAATTCAAATTGAGGTTTATGCAGACTGCCTCTGCTTCAGATTCTTTATCGATGCACAGCTTTGCCACAATCCCAACAGAGATGAAATTGCACGCCCCGGCGATCATCGAAATGACCATTCCCTCCATCTTAAATCGATCCCATATTTGAATTATGGGATCTCTGCCACTTTCCCTTCGTTTGCTTCTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGAGGACTAGAGCTGCACCATTTATACGAAGCAACAACTGCAATAATAGCTGTTATGAAACAGTTGATGAAAAATGCATCGGCAGTTCAAAAATTCAAATTGAGGTTTATGCAGACTGCCTCTGCTTCAGATTCTTTATCGATGCACAGCTTTGCCACAATCCCAACAGAGATGAAATTGCACGCCCCGGCGATCATCGAAATGACCATTCCCTCCATCTTAAATCGATCCCATATTTGAATTATGGGATCTCTGCCACTTTCCCTTCGTTTGCTTCTTAA

Protein sequence

MRTRAAPFIRSNNCNNSCYETVDEKCIGSSKIQIEVYADCLCFRFFIDAQLCHNPNRDEIARPGDHRNDHSLHLKSIPYLNYGISATFPSFAS
Homology
[Close]
BLAST of Cla97C07G138400 vs. NCBI nr
Match: KAE8649086.1 (hypothetical protein Csa_023805, partial [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 55.8 bits (133), Expect = 2.2e-04
Identity = 28/44 (63.64%), Postives = 32/44 (72.73%), Query Frame = 0 

Query: 8  FIRSNNCNNSCYETVDEKCIGSSKIQIEVYADCLCFRFFIDAQL 52
          + +    +NSCYETVDEKCIGSSKIQ EVYA    FRFFI  +L
Sbjct: 5  YTKQQKYSNSCYETVDEKCIGSSKIQTEVYATA-SFRFFIVQRL 47

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Cla97C07G138400 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAE8649086.12.2e-0463.64hypothetical protein Csa_023805, partial [Cucumis sativus][more]
BLAST of Cla97C07G138400 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cla97C07G138400 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cla97C07G138400 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Cla97C07G138400.2Cla97C07G138400.2mRNA