Cla97C06G111410 (gene) Watermelon (97103) v2.5
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCGATTCCTTTTGGGAAGATCACCATTCTCGTTGGAGCTGGTTCATACACAGTAAACTTAGTATCTTATTTTTTTCTGGTTACTGAATGTGCTACGCTGTAATTTATTGCTTGCTTGATCTTGGTTCGGGGCAGAGGAGTTTGATGAACAAAAACTATAGTTTCAGTTGTGTAGGAAGGTCGATACTAGGTCTGTTTGTGTGGTTTGATAGTGGCGATTGGTTTTCTTCTTTGCCGGAATCTTAGCATTGAGGTTATACGTTAGCTTGAGGTTCTTCCAAGATGATCGACGCATATTATTGGTGAACTTGTGCTTGTTTAATTTTCCAATGTTGAAGTTTTTTAAACCCTAATATAACTGGAAGCACTGTCTGATTGAGTTTAGTGTGCTGTAGTCGAGTCTGCATACCATGAATTGTCATGTTTGACTGGTTGAGTTTCAAGCTAGTACGACTTTGAGTTTCAGATGCTGGAAACATTGCGAGTGGAGACGTCTTGAATTTCTGTCGTACTTGCACTAAATCATGCATTATGCCATTTTGGCGGCTACCTTTTTGAAAATGTGTAGAAATATATTGCTTGCAATGCTAGTTCGTCAGTTTTACCCGAGTTCTGGAGGAAATTAGTGCAAATCACGCATGGTCTATTCTTTCAGGTATTGTTGGCTCTGTTCTGGCAAAAGAGGGACGCCTGCCATATGTATCAGATTTTGTAGCAGGTGCTGTTAAGGTAATCTTCTGTATGAAACGTCGCCTCTTATTTCTGATGATTGGTTAAAAAAATGACCAAACTTGAATAGTATATGTTTTATAGGTTGTACAAGAGTGTCCTTGAGCCCTAAGGTTGAATGGTTGAAAAAAATTGAATTTTGCGCTCAAGTTCTTTTTTCTGGGCGGGGGGGTCTAATAGAGTGGAAAACTATAGAATCCTCTACAACACCTTGGAGACTGAACTAGTGCTTCAGACTTGAGTAAATAAATCTTAACACATAGAATTGTCAGCATCTGATTATTTTGATTGATAGCTCACCAAAACACAAAAGCTATTTTTAGAGAAGAACATAACTCATCCAGGGACAAGGAAACCTATTGCGGTTGTTTGGTTGGAGATATCTGTTTGTAAACTTTCCAACTAATCAACAGCCAGTTTTCTAATATTTTAAAACCAACAAAGACTGGATGTAGGTATGGTCAATTTTTTGGATTCTTATCGTCATTTATACTTGGACCTTAAATAATTTTTCCTGCTGCTAAGAATTTTTTTTCAGCTCAAAACCACTCTATTGATTCCAATTCAGAACCAAAGGACATGACGTGCTTTGTAATCAAAGTAGATGTTGAATCCAGTTAGCTTATGGGGGGATTATTGAGGAATATGTTGTTCTTGACTGGAGAATGATTGAGAAATAATTTTAATTATTAGTTTTAATGCAACCTGGCAGCTTAAATTTTAGGACCATTAGTGATGGGGTGGGTTTTCCCTCATTTATCTTGGTTAATTTAATGCTCTGTGATTGCATATTGATGTTTTTGTTCTTGACATTTATCTGTATTCTCTATGAAATGAACCTTCTTAAACTGAGACATTGTATGTTTTTTTTTGTTATTTCATCTATATACCTCTTGTCTAGCCAGTACATTTCTCCCTCACATTTCCTAATTGTTTGTCATTCACGTCAATTTTTGTGGTCTTAGATTTTTTGCTGTCTCCTATGCACAGATTGCTCTAAAGCGTATCAGTCGAGATGACTCTAGCACTTCAAAAAGCAAGCCACGCAATGACTCTTTAATGGCTCAGGTGTGTTTATTGAATTGATTGTCTTGAACAAAATGATTTAATTGTTAATTGTTTCAAACAATTGCAACTGGCTATGTTTCTCAATAAAGAAGAGTTTTTTGAATGAAGGTGGGAGGCTTGCCCTTATTTAGTCGGTCCTAAGTGGCATCTCGATCTACTTCACATGGCACTATAAAGTCCCTAGTGCAATTAGCAAGGCGTTTGAGAAAACGATAAGGGACTTCTTATGGAAAAGGGTTGAATAGTTGATGAGGGGTAAGATTCTCATCTTGTGGGATGGGAGGTGTTTTCTAAAATGCTGGATCTTTAGGGGTTAGGTATAGGTAAGTAGTGGCAACAAACAAGGCCTTGGTGGCTAAATGGGTTTGGACGTTATGGCACAAGGTTTTTGTTTCTTGTTAGCAGGTATGTCTGCACCCTTTTGGATGGATTGTTGGTGGATTATAGGCACTTTTAGAGACCCACGGAAAGCTATTTTGGCGGAGCTTCCTTTTCTTTCTCAGTTTCTTCAGTGTATTGTGAGAGATCGGAGGGATATTTACCTTTTGTAGGAAAAAAAGTGGTTTGGGGATAGACTTGCCTTTCTCCCGAAAAAGGTGACCTCATGCACACCTCCTCAGTAATAGTGTAACGGTGACCATTGCCATTCCAAGCCAGAGATAAGCCAAAAGTTTCCCAGCAATGAAGCTAGAGAGATTGAGCAAATTGACAGCCCACAATGAGTGATGTAAGTCCTCAGCTTGACACCTATAAATAATACACCAATGTGAGGCACAAATGAGGATTGGCTCTAAACATGATCCATAATGTTGACTCTCCCATGTAAAATCTAGCACAAAAGACCTTACCTTTCTAGGAATTTGAACCCTCCAGGTGGTATTGAAAGTAGGGGCAGCTTGAGACAGAGAATGGGCATGCAATATACAAAAAAAGAATGGCAAGAAAACCTCTAGAGGATCAGGTTCCACTGATTAGAATTCCTTCTCCCTTGGAACACTTGTTGATCTTGAAGAACAGAACAAAACTAACAATATCTAATGCCTCTCTATTAGGTAGATGACAAGTGAAACCTAATGACAAAGTAGTGGAAGGATCCAAACCCTGTAAAATAAACACCACAATGCAACTTCTTACTTGATAGATGATATAAATGTGAAAATGATTCACAAAATGTTTATCACTCGCCCACTAGTCTTCCCAAAAATACACATTCGAGCCCTCCTCAACAAAGCATTTAACAAACAAGAAAAAGGACGGGAAGCCAAAAGCAATCACTTTCTAAAGATTTTTATTAGACCCTATGGCACCACCATCTATAACCCAGTCGAAAGGCTGCGGGTCATAACATTGTGCAACAAAGTGTCAAGCTCCATAAAGAATTGTGACAACTATTTCACTAACAGTGTCTCATTAAGTAATTTCAAGCTCCCAATCCCTAGGTCACTCATGTCCACTAGCTTCACCACCACCTTGCACTTATCCAAATGTGACCCTTACCCCTCATCCACTCCTTCCCACTAGAAATTCCTTATCACCTTTAAGGAATAACTAGGAATTCCACTCAACACCGTTTGGATGAGAGTAAGCCTCCTCCTTTTGAGAAGGTCTTTCTCCAATAAGACCATCATTTTTAAATCTTATCCTACACCCCATTCCATAACATTTTGCTTCTCAAATTGCCTCCCAACGAAAGCCCAAGATATGAGGACCAAAGCTAACCCACCTTGCACCCAACAAAATAGGCCCAAGCACTTAGCTTAGAATGACAAAGTTTTTAAAAAAATATAACTTTTCCCTATATTCATAAGCCCCAAAATCATTTAAAAAAAAGGATGAAAAATGATTGAGATTCATAAAGGAATTCATTAAAAAAAAATTCATTTTCATGGGTCCAACAAACCGTATCCACTTTGTTTATACTTGGAAGAATGTTTGGCTGAAATATGCTTTAGCACAAAGACAAACCTGCAGCAATATGATAGATTCATTGCCATTACCTTCTTCCTTGAAGAGAATACAAATAAATTTAAGCGAGGATGATGAGACACTCCTGTGCTTTCTCTACAGTTTTAGACATTGTACTTCATGATTGGAAACTGGTTTGTTTGATTTGGGTGGCTCTAGTGGGAGAGTTACTTTCCTTAGTAGAGCCTATTTTGGTTGTTGATAACTAAAATGCTGCATTTGCAAGAACCAAATGGTTTACCTCTATTGGGTTTTCATTCCTTCTCTACAGTTTTATGGCTGCTGATAATCTCATTGTTTTTTGCAACTTCAGTAGAATTTCATATCCTATGAATTTCCTTGACACCAAAATGTTTTAGGGTCAATCGGGCTGTCCCGTGAGATTAGTTGAGGTGTGCGAGTTGGCCTGACACTCACGAATATAAAAATAAATAAATAAAAAGAAAGAAAGAAAGAGAAGAAGAAGTTTACTGTATTTTGTTTTAGTTTGAGGAAATGTGCTTAGAATTCACAATTAGGATCCACCTTCTTTTGTAATAATCTTTTCTGTTGATGTAACTTGCCAACATGAATATGTTTGCCATGACTATTTCATTTGCAAGTATTATTCTTTTTGTTCTTAGAGTTGCGCTGCTTAATTGCAATTAACACATTTACAGGTAAAAAGCTTACGTGAGGAACTGCAAATGTTAGCATCAAATCGCCAGATGACAATTGTGACCACTGGTGGAAGAGGTCTTGATGATATTTCTATGTTTTTCTTCTTTAGATAGATATTAATAAAGATCTCTTCTTGGTTCTTGCATCATCAAATGATTTTTTTTCTCTTTAAATTCTTGTTTAAAGAAAAAAAAAAAGAAGAAAAAATGCAAAGAACAAACAAAGTGCAACTTTTCAAATTTGAAATGCCCCTTGAAATATTTTTTTGGTCAATTATAACGACGGTTTATGCGATCTATGCTAACTGGAATCCTTTTTTGGAAATCTGGGGGTTGCCTCATCTTTCCTTCTTTTGAAGAAAATTTAAAAAAGGAAAAAGAAAAAGGAGAAACAGTGAAAGTCTTATTTTTAATTTGGGTTGTTGTTCCGTTTGGAAGGTTTTGGTTTTTTCTTATAATCATCCTTTTGCATTTTGGGATGAGCGGCATTCTTTACCTTCTTATTACTTGAAGAAAGTTTCAGTTTTCTATTAGAAAGTCTTCATTCTATTTCAATGTGGCAAGAAAGTGC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BLAST of Cla97C06G111410 vs. NCBI nr
Match: KAB5564828.1 (hypothetical protein DKX38_004882 [Salix brachista]) HSP 1 Score: 868.2 bits (2242), Expect = 5.2e-248 Identity = 486/842 (57.72%), Postives = 581/842 (69.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G111410 vs. NCBI nr
Match: KAF3431021.1 (hypothetical protein FNV43_RR25751 [Rhamnella rubrinervis]) HSP 1 Score: 841.6 bits (2173), Expect = 5.2e-240 Identity = 463/762 (60.76%), Postives = 570/762 (74.80%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G111410 vs. NCBI nr
Match: XP_008459852.1 (PREDICTED: probable DNA primase large subunit [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 774.6 bits (1999), Expect = 7.8e-220 Identity = 384/406 (94.58%), Postives = 391/406 (96.31%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G111410 vs. NCBI nr
Match: XP_038906614.1 (probable DNA primase large subunit [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 770.0 bits (1987), Expect = 1.9e-218 Identity = 382/406 (94.09%), Postives = 391/406 (96.31%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G111410 vs. NCBI nr
Match: XP_004140536.1 (probable DNA primase large subunit [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 769.2 bits (1985), Expect = 3.3e-218 Identity = 380/406 (93.60%), Postives = 389/406 (95.81%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G111410 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q84WJ2 (Probable DNA primase large subunit OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g67320 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 603.2 bits (1554), Expect = 4.1e-171 Identity = 285/402 (70.90%), Postives = 343/402 (85.32%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G111410 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P49643 (DNA primase large subunit OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRIM2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 311.6 bits (797), Expect = 2.5e-83 Identity = 166/407 (40.79%), Postives = 247/407 (60.69%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G111410 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P33610 (DNA primase large subunit OS=Mus musculus OX=10090 GN=Prim2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 307.8 bits (787), Expect = 3.5e-82 Identity = 165/408 (40.44%), Postives = 248/408 (60.78%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G111410 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O89044 (DNA primase large subunit OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Prim2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 307.0 bits (785), Expect = 6.0e-82 Identity = 162/407 (39.80%), Postives = 244/407 (59.95%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G111410 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9VPH2 (DNA primase large subunit OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=Prim2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 296.6 bits (758), Expect = 8.2e-79 Identity = 149/368 (40.49%), Postives = 227/368 (61.68%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G111410 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5N5NCQ5 (SBP-type domain-containing protein OS=Salix brachista OX=2182728 GN=DKX38_004882 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 868.2 bits (2242), Expect = 2.5e-248 Identity = 486/842 (57.72%), Postives = 581/842 (69.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G111410 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CBL6 (probable DNA primase large subunit OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498852 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 774.6 bits (1999), Expect = 3.8e-220 Identity = 384/406 (94.58%), Postives = 391/406 (96.31%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G111410 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KDK9 (DNA primase large subunit OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G094750 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 769.2 bits (1985), Expect = 1.6e-218 Identity = 380/406 (93.60%), Postives = 389/406 (95.81%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G111410 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DN30 (DNA primase large subunit OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold266G002300 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 764.2 bits (1972), Expect = 5.1e-217 Identity = 378/405 (93.33%), Postives = 388/405 (95.80%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G111410 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TE64 (DNA primase large subunit OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold122G00920 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 759.6 bits (1960), Expect = 1.3e-215 Identity = 378/406 (93.10%), Postives = 388/406 (95.57%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G111410 vs. TAIR 10
Match: AT1G67320.2 (DNA primase, large subunit family ) HSP 1 Score: 603.2 bits (1554), Expect = 2.9e-172 Identity = 285/402 (70.90%), Postives = 343/402 (85.32%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G111410 vs. TAIR 10
Match: AT1G67320.3 (DNA primase, large subunit family ) HSP 1 Score: 593.2 bits (1528), Expect = 3.0e-169 Identity = 286/438 (65.30%), Postives = 343/438 (78.31%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G111410 vs. TAIR 10
Match: AT1G67320.1 (DNA primase, large subunit family ) HSP 1 Score: 587.4 bits (1513), Expect = 1.6e-167 Identity = 280/402 (69.65%), Postives = 338/402 (84.08%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G111410 vs. TAIR 10
Match: AT1G24267.1 (Protein of unknown function (DUF1664) ) HSP 1 Score: 265.0 bits (676), Expect = 1.9e-70 Identity = 166/357 (46.50%), Postives = 231/357 (64.71%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G111410 vs. TAIR 10
Match: AT1G24267.2 (Protein of unknown function (DUF1664) ) HSP 1 Score: 260.8 bits (665), Expect = 3.5e-69 Identity = 167/358 (46.65%), Postives = 230/358 (64.25%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (97103) v2.5
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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