Cla97C06G110410 (gene) Watermelon (97103) v2.5
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AGTTTGATTTTATTTTGTAAAAAGAGGGAAAGAAAAGAAAAGGAAAAGAAGAGGCTCGTTCACGTTCAGCTGCCCCTTGCGGTTTCAACTGTCATCTTATCCGGCGACGACAACCGTCTACGTGCAGCGGCTTGACAGCAGATCCAGTGGGCGGAATCCACCTGCTGTAATCGACGAACGACGAACAGGACGCGGGCAACGCTGCACCGTTAGATGCGTCTCAGTCGCCCCCTGTTATTTTTCCGTTTCCAGCGACAGCAGTGAACGCTGGCGGAGGTTTCGATCTGCGTGACCCACAAGCTCCAGCAACGCCTTCTCAACTAACTCGTGGCCTTCAAACGACGCTCCAGCACCGTGCCGCTCGCGCACGACCTCTCCCAGCGAACCCTCGGCCTCCATTGGCGGCGACTCCTTCCGGCAGTGGCAATCCGCAACACCCACGGCTCGATTGTCTCTGGATCTGATTACCCACTTTGCTTCGGCGGCGAATCTGTGAGTTCGAAGGATTTCGCACACTGTCCAGCAAGGCTAAAGGTCTTTGAGCGAGTTTTGTGGGTAATGTTGATCTTAATCGCTTTTCAAACCCAATTCAAATGTTGTAAATTGGACTCTTAACCCCTGCAATTTTGTTATACGTAGGTTTTTTAAATGTTATAAATGGATTTTAACCCCTGAAATTTTGTTATACTTAGGTTCGGACTGTTTAATTGGGATCTAGAGGCAGTTTTGGAGGAAAGGACAGTTGGGTGGCCTATCTAAGCGCTTTTTGGGTAAAATTACCGTGTTGATTGGACTTCAAATGTATGGTATTAGTCTTAGAATATGTTTTTTAGGTTTTTTGTCAAAATTTTCTGTAAGGGAAAAAGAAAAAAGGATTAAGTTGTTTGAAATCGCTTTGAGGTAAGTGAATCTTCTATCAGAATGCCCTAGTGCTAGGTTGGATAAGTGCATGATGTTTGAACTGTTCTGAATGTTGTCTGCGAATGTAGAATGTCGGATGATGGATAATGCATGATGAATAACAAATGTAGAAAAGATGAATGTTGATAACTGAAAGACTGTGTGACAGTTGTGAAAGTTGTTTCATGTTGCATCATAGATCGTTTGCTGGCTGAGCCATATGGTCAATGTAAGCATGTTTTTTGCTTCCACATTATTACATGAGTTAATGAATCTTATTTGTAAAAGTTGAGTAATGAGATCATTTAAACTGTTTATATATGTTTAAATTTTTTTCAAGGGGATCCCAAATAAAGTTTTTTATTTTTTTATTTTTTTATTTTTTATTTTATTATTTTACAGAAAATAGAAATGATTATCTATACTTTTTCTCAAGGATTTTTAAATGACATTAGCATGCGTGTAGTAATGTCCCTAGTTAGTTTAAGTTTAAAAGGTCGGGTTGTTACACTTCAAATCAAATTGAAATTGAAATCCTATGTTTTTTATTCAAACCAACATGGGAAATGATTTCAAATCCATTATGGATTTCAAATCTGAGGCTTCCAAAGGTTGTTAATTTTATGTTGACAATTTTCTTCCAGGGACTTCCACTAACGCTGCTCTTAAGAATTAGGGAATCATGATCGGAGTTGGGAAGATCAAGCAGTATTCTAATGTCCTGGACAGACCTCTCAGCAAGGGCAAACAAGAGGTTGTGCTCTTTCTCTCTATAGACTCATGGCTCCTTTTTTTCTTGTGAAAATTTCTTCATTTTGTTTAAAGTAGAGCTCTTCAGTTCCTTCCTCAATTTTGTCGTTACATTTCCTCAAATGATGTCACTGTAATCCCTCAAATGATATAGTTTAGCGAAGCTAAAACTTAAGATCCCACCATTTTTGGGCTTTGATGAGCTTGTAAATTCGCAAGGATTTTGACTTGAGTATTTTTCTTTTACTAAAAGATATTATATACATGTTTATTTAATCTGGAGCTGAATCCTTTGAGCTTGGCATATTATTTCTTTAGACCCCTTATCTGCAATATTATGATTAGTTTAAATGAATTTGAGCTAAAATATGTTTGTGACTACGTTTATTTATAGGTGAGTTTGAGTGCATTTGCATTCTTGTTCTCCGAACTTGTGCAATACAATCAGACTCAGGTCGACAATATTGCTGAGTTGGAACGAAGGTAATCTTTCATTTTGAAGCTATTATATTTTAACTGACGACACTTCATCTTTATGGTCTTTGTTTTTGTTGGAGAGGGGGTAAAAAAATTAACAGGAGACGTGATTAATATTTCATATGTCAATAATGGCTAATGATCTAGGTTTGAAATTTCTAATGTTTTTGCGTATCCTTTTTTGATTCTTTTCCTTTTGATATATATCTTTTTAAAGTAATAAATAGAGAATTTGTATAAATAACTTAACTAGAAAAACTTAGAGTTTTGTAGGGACGAGATTACCCTACACTAAAAGTGATAATCAACTAAAAGAACTCTAGTCCAAGCTTATGAAAAAGATAGGAATATTGCAAAATGATTTTGGAGCACTCTAACTTGAAGGTTTGCATTGTTTTGGTCATACAAATGAAAAGGGATGATTTTGGAGCTCTTTCCCAGAAGGCTAAAGATTGCATTTGAACTAAAAATCCTAGCTTTGTCCTCAAACCACTATACTGCCATTTAATGAGGACTTCTTCCAGCTTCTTTGGAGAATACCAAGTTAACTAAAAAACTTGACAAGTAAAATTCCAACTACAATGAAGTAGGCATCTGATACGAGTTGGAAACCCCAAGGCCTAAGTGCATCCGCGTGCGAAGTAGGCACAACTGCCACGAGTAATGAAGATGATGTGTATGGTTCCTTTGAAGCCATAATCATAAGCACAAGATGTGGAGAAAGAACTATGGGCTTTGTTTCAGAATTTTAGATGTCAATAGCATGTGTAGAAGAAGACCGTGCTTCAGAACCTTAGGCGATGTCTCATATGAAGTGGAGAACAAATATGTGCGGTACTTGTGCAATCTGACTAGGAGCACGTTGGATGAAAAAATTGTTTTTTTCTCGGCCCGATTTCAGTGCGACTCAACCCGCCCAAGCTCATTTGTTTTAGAGAGTCAAGTCACCCATGTTTGAAGGAATTTTCACATCCTCGATTCAACGCACTTGGGATGATTTCAAGATTTGTTGTGGTGTTGTTTTGATCCAGCCTATATAGAAAAGGGGGTCTTTGTGGGATTTTTTTTATTAATTTTATTCTTGGTCATGCTACAAAAATGGCAAAGAAGAAAATATTTCCAACCATCGGAAGAAGCATTCCTTAAGGGGGGGTGGATTTTTTCCTGGAAGGATAGTATTGATGTAGTAGGAATAATGGTTAATTTTGTGTAATTCCATGATTGATCCTGTTTAGTTCTTTAGTTCTCCTTTTGGGTTTCTTTTTTGGTTTTTTGTTCTTAGTTTGCTTATAATTCTCCATAGATAGAGAATTCCTCTCATGTATCCTAACTTTTGATTCATAATAAGATTTGTGATTTGATTCCGGGAGAATTCTCTCCTTTAATCCACTAGACTACACTATTTAAGTTTGTTCTTTGACTTCATTCGGAGGATTTAGGCAGTTAAATGCTGCTGTTCAGAGATAGAACTTGGTCTTGTTGGGGGCGATGCTATTTTTGCGTCCATGAGGCACTCCAATGTGAATGACGTTGAATTTCAAAACGTTTTAGTTATTTGACAAAATACTTCTTTTCATACTCTCTCTCACATGCATACATACATATATATAACTTATAATAATATTGGCAACCATACTGTCTAGGAATAGTAACAACAATGTTGTCCTTTCTTGTTACTTTCTATTTCTTTTATTTGCACGCTAGAATTGTTTATCTGAAAGTTTGATGGCTTTGAGGTAAAATGAATCAGGTTGGAGGATGCAGGCTATGCAGTCGGTGCTCGAGTATTGGAACTTTTTTGTCATCGAGAGAAGGTATTGAATCTTATGTTAAGAGCTAATTGAGCGTGAGCCTTTATTCTTAATTTGAACCACCCCATTTTGGTTTCTGCTGGATTTTATTTTCTTACAAAAGCTTTGAAATACATAAGAAGCGTAGAGTTGATCTGAAATCTGGTTCAAGATTTTTTTATTTTTTTTATTTTTTTTTTATTTATTTTTTATTTATAATTATTATTTTATTTTATTTATTTATTTATTTTTGTGCGTGCGCGTGTGTGTCCATGCCATTAACTTCCTGTTATTTAGCTAATATATTAGAAAGTTGATTGGATTTTTGTAAAATTAACCCAGGCAAAGACCAAGAAAGAACAAAAATTATAAGGATGATGTGACATTAATTTCCTTATTTTAATTTGTTACAAAATAAACACTGAAATTTTATCCAACAAAAAATATTAAATATAAAAAACACGTAGAATAAATAAATAAAATCTGATCAAAGAAAAATATCTTTGCAAACAAATTTTAAACTTACAATGTCTGAAAACATTTGAAAAGAAAATTGTGTGCGGAACAATTTTGTTGGAACTACTGTAAGCAATACGCCCAGACAACTTCTTAGCTACTTTAAACGTTAATTATCATTAATTTTCTTCTACTTGCAATGCAGACGGTGAATCTGTTTTATCATAAAAGTTTAGTTATTGATTAATTATTATTAGAGCATCAATATTCCACATAAATCAGAAAAATGCCTCTCCCTCTCTCTCCCTTGCCACATCCCCACCCCTTGGCCCATCGACTACCCGTCATCTCCCCCATGCTCTATTCGCTGTCTAACCGTCACTGCCACAACAACCTGAGGCAGACCCATTCCTTCAAAATAGAAAAGTCCTTCAACATTGAAGATTTCAACGACCATTTTGCATCTCATGAAGAATCCAGCGCCAAAAGCTTCTCTCTTACCTTTGCAGAAGAATTGCTACCATTGCTCAATTACTGATTTTCTAGGCTGTGTAGTCTTCCTCTGACCTATAAATTCTTTCTGGAATTGAGAACAGAGGATTATGGCTTGTGGGTAGAAAA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MIGVGKIKQYSNVLDRPLSKGKQEVSLSAFAFLFSELVQYNQTQVDNIAELERSHNHKHKMWRKNYGLCFRILDVNSMCRRRPCFRTLGDVSYEVENKYVRLEDAGYAVGARVLELFCHREKVADSLEKGTEHEDEYMISEKELLVNRFISIPKDMGAFNCGAFVAGIGVLDNAGFPAVVTAHFVPVEGQQRPRTTILIKFAEEDFRFSRWGFSLVVLVCFVYLMLDLIIRLLLIGAMGRKKTEEGGGNAKVKPGKDVSGKREKLSVSEMLASMDQKPDKPRKGSSSLSSGAKPQAKAPKKVSSYTDGIDLPPSDDEEEETVSEEEQQSISSQKRLPWQDRAEVKPLEVAVSDKELKKRERKDMFVAHAAEQARQEALKDDHDAFTVVIGSRASILDGNDEADANVKDITIENFSVSARGKELLKNASVKISHGKRYGLVGPNGMGKSTLLKLLAWRKIPVPKNIDVLLVEQEVVGDGRTALQAVVSANEELVKLRQEVADLQNSDGGKDENDDEDDAGERLAELYEQLQLLGSDAAEAQASKILAGLGFTKDMQARPTRSFSGGWRMRISLARALFVQPTLLLLDEPTNHLDLRAVLWLEEYLCRWKKTLVVVSHDRDFLNTVCNEIIHLHDLKLHFYRGNFDDFESGYEQRRKEMNKKFEIYDKQVKAAKRSGSRAQQEKVKDRAKFAAAKEASKKKSKGKIDEDDPLPEAPRKWRDYSVEFHFPEPTELTPPLLQLIEVSFSYPNREDFRLSDVDVGIDMGTRVAIVGPNGAGKSTLLNLLAGDLVPTEGEVRRSQKLRIGRYSQHFVDLLTMEETPVQYLLRLHPDQDGLSKQEAVRAKLGKFGLPSHNHLTPIAKLSGGQKARVVFTSISMSKPHILLLDEPTNHLDMQSIDALADALDEFSGGVVLVSHDSRLISRVCEDEEKSEIWVVENGTVESFPGTFVEYKEELQKEIKAESGDRREVSLAGQEEDRFIAILLISPPSIVSPATQFLAKSWRLADRKVVRFEKNITKRGAVPETSVKKGKEYPVGPLLLGFFVFVVIGS Homology
BLAST of Cla97C06G110410 vs. NCBI nr
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BLAST of Cla97C06G110410 vs. NCBI nr
Match: XP_008462810.1 (PREDICTED: ABC transporter F family member 4-like [Cucumis melo] >XP_008462811.1 PREDICTED: ABC transporter F family member 4-like [Cucumis melo] >KAA0066330.1 ABC transporter F family member 4-like [Cucumis melo var. makuwa] >TYK00949.1 ABC transporter F family member 4-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1340.1 bits (3467), Expect = 0.0e+00 Identity = 697/727 (95.87%), Postives = 712/727 (97.94%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G110410 vs. NCBI nr
Match: XP_023543438.1 (ABC transporter F family member 4-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023543439.1 ABC transporter F family member 4-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1338.9 bits (3464), Expect = 0.0e+00 Identity = 695/727 (95.60%), Postives = 710/727 (97.66%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G110410 vs. NCBI nr
Match: KAG6595451.1 (ABC transporter F family member 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1336.2 bits (3457), Expect = 0.0e+00 Identity = 693/731 (94.80%), Postives = 711/731 (97.26%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G110410 vs. NCBI nr
Match: KAG7027450.1 (ABC transporter F family member 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1333.9 bits (3451), Expect = 0.0e+00 Identity = 692/731 (94.66%), Postives = 710/731 (97.13%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G110410 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9M1H3 (ABC transporter F family member 4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ABCF4 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1116.7 bits (2887), Expect = 0.0e+00 Identity = 590/732 (80.60%), Postives = 648/732 (88.52%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G110410 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q767L0 (ATP-binding cassette sub-family F member 1 OS=Sus scrofa OX=9823 GN=ABCF1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 515.4 bits (1326), Expect = 1.5e-144 Identity = 310/695 (44.60%), Postives = 430/695 (61.87%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G110410 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8NE71 (ATP-binding cassette sub-family F member 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ABCF1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 509.6 bits (1311), Expect = 8.4e-143 Identity = 316/743 (42.53%), Postives = 449/743 (60.43%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G110410 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7YR37 (ATP-binding cassette sub-family F member 1 OS=Pan troglodytes OX=9598 GN=ABCF1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 508.1 bits (1307), Expect = 2.4e-142 Identity = 312/718 (43.45%), Postives = 445/718 (61.98%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G110410 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6P542 (ATP-binding cassette sub-family F member 1 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Abcf1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 505.4 bits (1300), Expect = 1.6e-141 Identity = 318/737 (43.15%), Postives = 454/737 (61.60%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G110410 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CJD6 (ABC transporter F family member 4-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103501091 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1340.1 bits (3467), Expect = 0.0e+00 Identity = 697/727 (95.87%), Postives = 712/727 (97.94%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G110410 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GFN1 (ABC transporter F family member 4-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111453748 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1340.1 bits (3467), Expect = 0.0e+00 Identity = 696/727 (95.74%), Postives = 710/727 (97.66%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G110410 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VGP5 (ABC transporter F family member 4-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold602G001250 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1340.1 bits (3467), Expect = 0.0e+00 Identity = 697/727 (95.87%), Postives = 712/727 (97.94%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G110410 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LNE5 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G431120 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1335.5 bits (3455), Expect = 0.0e+00 Identity = 694/727 (95.46%), Postives = 711/727 (97.80%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G110410 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HMB1 (ABC transporter F family member 4-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111465942 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1331.2 bits (3444), Expect = 0.0e+00 Identity = 690/727 (94.91%), Postives = 709/727 (97.52%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G110410 vs. TAIR 10
Match: AT3G54540.1 (general control non-repressible 4 ) HSP 1 Score: 1116.7 bits (2887), Expect = 0.0e+00 Identity = 590/732 (80.60%), Postives = 648/732 (88.52%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G110410 vs. TAIR 10
Match: AT5G60790.1 (ABC transporter family protein ) HSP 1 Score: 426.0 bits (1094), Expect = 8.7e-119 Identity = 239/559 (42.75%), Postives = 359/559 (64.22%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G110410 vs. TAIR 10
Match: AT1G64550.1 (general control non-repressible 3 ) HSP 1 Score: 425.2 bits (1092), Expect = 1.5e-118 Identity = 257/615 (41.79%), Postives = 372/615 (60.49%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G110410 vs. TAIR 10
Match: AT5G58030.1 (Transport protein particle (TRAPP) component ) HSP 1 Score: 256.9 bits (655), Expect = 7.0e-68 Identity = 148/232 (63.79%), Postives = 155/232 (66.81%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G110410 vs. TAIR 10
Match: AT5G64840.1 (general control non-repressible 5 ) HSP 1 Score: 233.8 bits (595), Expect = 6.3e-61 Identity = 172/575 (29.91%), Postives = 299/575 (52.00%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (97103) v2.5
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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