Cla97C05G103290 (gene) Watermelon (97103) v2.5

Overview
NameCla97C05G103290
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. 97103 (Watermelon (97103) v2.5)
DescriptionDNA-directed RNA polymerase I subunit like
LocationCla97Chr05: 31485699 .. 31499894 (-)
RNA-Seq ExpressionCla97C05G103290
SyntenyCla97C05G103290
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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CCCACCCATGTTGATCTCGAGAAAAAGAATAATAATAATAACCTGGGTATATGTTCAAAATATATTTTTAGTTTCTATATTAAAAAACATGTGGGGTAAAAATTGTGGCTAAATTGTGGAACTTGGCAATTTCATGTCGACTACATAATATAAAACTCACACAAAAAGTTAAGTTGACCTCATTGTAAACAAAAAGATCAAAAGACATTAAATATTCAAATGGTTCTAAAAATAGAGAGACAATTATCAACGACTTGTTCTATCTACGATAAATATAGAAATTTGACTCGGTCGGTTCAATTACTCTGCAATTATTCCATCTTACCTTACCATGTATAAAAGCACAGATAGAAGAATCTTTAGCTTCCTATTTTACCCTTTAAAATGTTCGAATACCTATTTTGCCCTCACAATCACATATTCCCTCCATATTATTTTGTCAAAAAGAAAAATGCACGATAGACCAAATTATTTATTCTAAAATTATAGTTTTTTTTAGGGCTCTAAAATTATAGTTAACCTAAACCATCCTTAAAAAGAGAAATCATTATAATCAAATTAATATGGATGATTAGACTTGGCCTAAGAGTGGCTTATTGTTTCACATATGAATCCGTTTCTTTTCTTAGTGGTTCGATCATAGTGCTAAATTTAATTTAATTTATTTTTAATTTTATTTGTTCCCACATCCCCGATTTTAAGGAAGAAAAGCGATTTTGTTTTCCCCACGTTTCACCGAAAAGGCATGCACTCGCGCGCTTAAATATAGTTCGGAGGGAACTTGCAAAGACAAAGAGGCGCGAAACTCGTCCCTCGAAAAGAGCTCTCCATATTTAGAAACTTATCGGTACTCGCCGTCGCAGTTTCTCTCCGTCTCTCTGGATATCTCATCGCCAAACTCTCGGAGCTTCGTCGATGTCTACTTCGGATTCTTATGATTCAAGGTGGATCATTCACAGGTGCGCTTTAACCTTTTAGATTTCCTTTTTTTTTGTTCGAATCGGAATGCGTGATGCGATCGAAAAACCCTAGGTTTTTCGTGATTTATGCTTCTCCGTTTGTTATTTTTATCTCCGTTCCTCGTTTCCCCGGAATCTTCTCGTTCGTATCCGGAGAAATCGTTGTTGTAGAAGTTGTATGTAAGTGTCCGTACGATGTGTAATGAGGAAACGTTGTGTTCTGTTTTTCTTTCTGGCGTAGCTTTTCTTCGTTTTGGTATTTCGGGATTATTTAGTTTTAATCTCTTCTGGAGGCGTGATTTAATTAATCTGATTGTTATGGATGATCGAGACCTGGCTTGAGTTTGTAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGTAGAAAGTGTTTTATGAGTGCACTGTTTGCTGTATGGCTACGGATGTTTGATATCCTGCGAAGATTTGACGAATGCTGTTAAATGCCAATGGAAGAACGTACGAATTTATGAAATCTTGTTAGAGGCCATTGTAAAGAAAAAGAATAGAATAATCTTTCTATAAAATGCTTGTTTCATGTTTAGAGTAGAAAGCAGTCGAGATGAAGCGAAGATTCATTCTTATTGTGTAAATCTTGCATCAATTTTCATACCTCAGTTCCGAGCTGTAAACTTGAGGTATCCGTGGAACAATTTCCCCTAGTATCTTTTTATTCCTTTTATCCTATTCACAAGAACCATCGTGGAACTGAAATTCACATTTTACGTGTGGAATAGGTTAGTTGTTAAAGTAACTGTTGGTTTCAAAGTAATTATGCTTAGGCATTAGCATAATTCTGCAATAGATCTACAAATACTTGGCTGATTTCCGTCTTTATCCTGGTTTTGATTGTCTAACTTTGAAGTTAGCATGCGAGAACCTTCTTGGAAACTTAAAATTTGTTTGGAGAATTTATATAGCATGCGTGACTGTCATTTTATTTTAATCTTAATTTCTTTGGGCGCTGTTGACTCTGAAATCAGATTCATTTAGCATAATTGGCTGCTTATTGTTAGATTAACTCATTGGGGAACTGTGATAATAGATTTGTAGTAGGTTAAGATTCATTGTTGAGAATGCACAAACATCTTAACATTTATGTGGAAGATATGCATATAGCCACAGTGTAGTTTCTTAAGGGCACACTTGCAACCTATACACCTGTACATGCATATGAGTAAGGTGCACATTTGGTTCAACCATAATAAGGCTGATCTTTGATGGCGATCTCACTTGAACATGTATCTTAATGAGATCCAAATGCATGTTTTGACACCAGATTCCTTTTCCCCTTCAATTCATGTAGAAACTCACCATTTCTGAGCTTCTTCTTCATCTTCATCTAGAACTCTCTCATCTCCTTTTAAGTTGACTACTAAATATGATATTATTATTTCATTCTTCAATGATTGTAGCCAAGTTGTGAGCTATTTTGCAATTTAGTTTTTTAGGCCTTGACTCCTTTTGTACATTTCATTTATCAATAAAATTTTTGTAGGCAAAGAATGGTTGGTGTTATCAGTTTGCGAGCCTTTTTGCAATTTGGTTCTGTAAGGCTTAACTTCTTTTGGTACATTTCATTCATCAATGAAATTTATGTAGGCAAAGAATGGTTGGTATTTATCATTTATTTTTTTCTCTTGTTTGTGTGTAGGAAACAACAAACATAAGAAAATGTACAGTTTGCCAAGTCCATAGGCTTAATGAGTTATTTTCATGGATATCTTTCTGGAGTGTCTATTTTATTTATTTTTAAAAATTAATATGCATTATGTGCTTCATCTGGTTAGGCTCCTGGAAGCTTGTGTGTCTACCTTGTCTGAACATTGGATGCAGTGCATCTACTCTGATGAAAATGTTTACACTGTAATATATTTGAGCGAACATGAAGAATATATATGGGGTGAGCTATAAGTGTTAAGCTCGGTTTTCCTTGTTGATTGCATTTTTGATTTACTGGGTATCTTTAGAAGTTATTTTATTGCATCACCTGTGAGAAAAGATTTACTGTTTTAAGTTTACCAATATAAAAGAACATGACCTGAGATTCTTTAGGATGTTGGTGATGAGTATGCCAGTGATATGATTTGTGGTAAATCTAGCTTGCCAAATGCTTCTGGAGACGATCTCTTGCTTGCATGTAGTCAACCTTGTGTGACCAAAAGTTTATATAAACCCCTCCTCCAGCCTGAAAGAGACCGAACTCTGACTTTACGCTCAAAATCCTCTGTGACTCTTCTAGTTTCATAATATAGGCAGTCAAGGTTGAAAGTTTCCATTGTATTTAGATTGTTTTTTGAACATTACTTGAACTTTGACAATATCTTTTGATATTTGAGAACTGAAATATTGTCGTTCATAAGTGCTAGCTGATTCTGTAAAGAAATTGACATCATGGTCTCTAATATAAGAAGGCTATGTTATAAGAGTTCGATTAAAGCTATTAGGCTCATCATTTTAGTGTATTACACCATGCAGATCAAAACTGTAACGAAATGATCTATTGAATATCTTGTCTGGAGTGGGGCTTAAAATTATTTTTTGTTTCTTAATAGTAAAATGTGTGTTCATTGGTCACAACGTATTCGAATAATTATTTTTCTTAACTTGTTTTCCTTGTACTTTCAAAGATGAACCGATTTTCCTTTTTAGAACAAAAGTATGCTTCCTTTAGAAACGTGGGTATGTAAAACAGCGATTTCATGAGCTTGGTACCATCATATTTGAAAGGGAATACAAACAGCCATGTTAATGGCCAATGGGAAACACACTCAAACAAGTTACATCGTTCATCTCTTAATTACAAACATTGATATATTGGTTCAGTTTCTGTTATTTGTTCTGGTAAAGAATGTTGTTACTTAATGTGCCAAATACAATGGAAATGTTGTACCTCGGTTCATTAACATGCTAATTATATTATTATTATTTAAAATATCACCATTGTCTTTGTTTGCTTGTTAGTTATATTCGACCTTTTGGTGACACATCATAGTATTATTTAGGTCCACATATTTCTGTCTAAAATTCACCATAGCCAAATTGTAGCCTATAAAAATAGCTCAGTATATTTTTGATAAGATAAAGAAATAGTTCAGTATATAAGTTTGGCTCTGGTGCGTATTGCTACCTGGACTATCAATTCTTTTTAATTTGACGATGCCTTTTCTTCTTCTAGTTCACCGAGTCACGATCTGATACAAGATTGTCATCTGGGATGTAA

mRNA sequence

ATGTTAGGGTTTTTTTCTATTCCATATCAATTGAAGATTTCCCCATCTCTCCCATTTCTCTCTGCAATCTCTTCACCTTCTTCCCTCTCCCTTCCAGTCTACAAATTCCCTCTTCATTACTCATTTTTTAGGTGGCAATCTCAAATTTCCAGTAACCGCAGAAGATTCACAGCGTTTGCGAGCAACAAGAACAACGAATTGGACGGAAATATCAAGGAAAGAGAAGGAGAAAGAAATGGAGCGAATGGCTCCTCCAATGGCGGCGATGACTTGAGGAAAGAACGAGGACCGGTTTTCAATATCAAATGGGCTGAACTTTTGATCGATCCGGATCCTGACAACATTCTGGCCGTTGCATTGACTGGTTTGCTTGCTTGGGCAAGTGTTCAGAGACAAAGAGGCGCGAAACTCGTCCCTCGAAAAGAGCTCTCCATATTTAGAAACTTATCGGTACTCGCCGTCGCAGTTTCTCTCCGTCTCTCTGGATATCTCATCGCCAAACTCTCGGAGCTTCGTCGATGTCTACTTCGGATTCTTATGATTCAAGGTGGATCATTCACAGGTTTGCGAGCCTTTTTGCAATTTGGTTCTGATGTTGGTGATGAGTATGCCAGTGATATGATTTGTGGTAAATCTAGCTTGCCAAATGCTTCTGGAGACGATCTCTTGCTTGCATGTAGTCAACCTTTCACCGAGTCACGATCTGATACAAGATTGTCATCTGGGATGTAA

Coding sequence (CDS)

ATGTTAGGGTTTTTTTCTATTCCATATCAATTGAAGATTTCCCCATCTCTCCCATTTCTCTCTGCAATCTCTTCACCTTCTTCCCTCTCCCTTCCAGTCTACAAATTCCCTCTTCATTACTCATTTTTTAGGTGGCAATCTCAAATTTCCAGTAACCGCAGAAGATTCACAGCGTTTGCGAGCAACAAGAACAACGAATTGGACGGAAATATCAAGGAAAGAGAAGGAGAAAGAAATGGAGCGAATGGCTCCTCCAATGGCGGCGATGACTTGAGGAAAGAACGAGGACCGGTTTTCAATATCAAATGGGCTGAACTTTTGATCGATCCGGATCCTGACAACATTCTGGCCGTTGCATTGACTGGTTTGCTTGCTTGGGCAAGTGTTCAGAGACAAAGAGGCGCGAAACTCGTCCCTCGAAAAGAGCTCTCCATATTTAGAAACTTATCGGTACTCGCCGTCGCAGTTTCTCTCCGTCTCTCTGGATATCTCATCGCCAAACTCTCGGAGCTTCGTCGATGTCTACTTCGGATTCTTATGATTCAAGGTGGATCATTCACAGGTTTGCGAGCCTTTTTGCAATTTGGTTCTGATGTTGGTGATGAGTATGCCAGTGATATGATTTGTGGTAAATCTAGCTTGCCAAATGCTTCTGGAGACGATCTCTTGCTTGCATGTAGTCAACCTTTCACCGAGTCACGATCTGATACAAGATTGTCATCTGGGATGTAA

Protein sequence

MLGFFSIPYQLKISPSLPFLSAISSPSSLSLPVYKFPLHYSFFRWQSQISSNRRRFTAFASNKNNELDGNIKEREGERNGANGSSNGGDDLRKERGPVFNIKWAELLIDPDPDNILAVALTGLLAWASVQRQRGAKLVPRKELSIFRNLSVLAVAVSLRLSGYLIAKLSELRRCLLRILMIQGGSFTGLRAFLQFGSDVGDEYASDMICGKSSLPNASGDDLLLACSQPFTESRSDTRLSSGM
Homology
[Close]
BLAST of Cla97C05G103290 vs. NCBI nr
Match: XP_038891869.1 (uncharacterized protein LOC120081233 [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 208.4 bits (529), Expect = 7.1e-50
Identity = 125/185 (67.57%), Postives = 138/185 (74.59%), Query Frame = 0 

Query: 1   MLGFFSIPYQLKISPSLPFLSAISSPSSLSLPVYKFPLHYSFFRWQSQISSNRRRFTAFA 60
           MLGF +IP+Q +I PSL FLSAISSPSS SLP+ KFPLHYS+   QSQISSN RRFTAFA
Sbjct: 1   MLGFLTIPHQWRIPPSLSFLSAISSPSSFSLPLNKFPLHYSYSSSQSQISSNPRRFTAFA 60

Query: 61  SNKNNELDGNIKEREGERNGANGSSNGGDDLRKERGPVFNIKWAELLIDPDPDNILAVAL 120
           SNKNNEL GNIKEREGE NG  GSSNGGDDLRKERGPVFNIKWAELLIDPDPDNILAVAL
Sbjct: 61  SNKNNELGGNIKEREGEGNGTKGSSNGGDDLRKERGPVFNIKWAELLIDPDPDNILAVAL 120

Query: 121 TGLLAWASVQRQRGAKLVPRKELSIFRN-LSVLAVAVSL---RLSGYLIAKLSELRRCLL 180
           TGLLAWASVQ       V  K+  I  + L ++ VA+ +   R   + I KL   R+   
Sbjct: 121 TGLLAWASVQ-------VSTKQHHISSSRLHIIIVALQMCRDRYVNFFIRKLGVGRQLCG 178

Query: 181 RILMI 182
            IL I
Sbjct: 181 AILPI 178

[Close]
BLAST of Cla97C05G103290 vs. NCBI nr
Match: KAA0034669.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold65G006880 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK09220.1 uncharacterized protein E5676_scaffold475G002130 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 203.4 bits (516), Expect = 2.3e-48
Identity = 106/130 (81.54%), Postives = 115/130 (88.46%), Query Frame = 0 

Query: 1   MLGFFSIPYQLKISPSLPFLSAISSPSSLSLPVYKFPLHYSFFRWQSQISSNRRRFTAFA 60
           MLGF +IP+QLKISPSL  L +ISSPSSL LP+YKFPLH++FF  +  ISSNRRRFTA A
Sbjct: 1   MLGFLTIPHQLKISPSLASLPSISSPSSLFLPLYKFPLHHTFFNSKFLISSNRRRFTASA 60

Query: 61  SNKNNELDGNIKEREGERNGANGSSNGGDDLRKERGPVFNIKWAELLIDPDPDNILAVAL 120
           SNKN E  G+IKEREGERNGA  SSNGGDDL+KERGPVFNIKWAELLIDPDPDNILAVAL
Sbjct: 61  SNKNTEFGGSIKEREGERNGAKSSSNGGDDLKKERGPVFNIKWAELLIDPDPDNILAVAL 120

Query: 121 TGLLAWASVQ 131
           TGLLAWASVQ
Sbjct: 121 TGLLAWASVQ 130

[Close]
BLAST of Cla97C05G103290 vs. NCBI nr
Match: XP_008446780.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103489407 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 203.4 bits (516), Expect = 2.3e-48
Identity = 106/130 (81.54%), Postives = 115/130 (88.46%), Query Frame = 0 

Query: 1   MLGFFSIPYQLKISPSLPFLSAISSPSSLSLPVYKFPLHYSFFRWQSQISSNRRRFTAFA 60
           MLGF +IP+QLKISPSL  L +ISSPSSL LP+YKFPLH++FF  +  ISSNRRRFTA A
Sbjct: 23  MLGFLTIPHQLKISPSLASLPSISSPSSLFLPLYKFPLHHTFFNSKFLISSNRRRFTASA 82

Query: 61  SNKNNELDGNIKEREGERNGANGSSNGGDDLRKERGPVFNIKWAELLIDPDPDNILAVAL 120
           SNKN E  G+IKEREGERNGA  SSNGGDDL+KERGPVFNIKWAELLIDPDPDNILAVAL
Sbjct: 83  SNKNTEFGGSIKEREGERNGAKSSSNGGDDLKKERGPVFNIKWAELLIDPDPDNILAVAL 142

Query: 121 TGLLAWASVQ 131
           TGLLAWASVQ
Sbjct: 143 TGLLAWASVQ 152

[Close]
BLAST of Cla97C05G103290 vs. NCBI nr
Match: XP_011655841.1 (uncharacterized protein LOC105435592 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 198.0 bits (502), Expect = 9.5e-47
Identity = 102/130 (78.46%), Postives = 115/130 (88.46%), Query Frame = 0 

Query: 1   MLGFFSIPYQLKISPSLPFLSAISSPSSLSLPVYKFPLHYSFFRWQSQISSNRRRFTAFA 60
           MLGF +IP+QLK+SPS    ++ISSPSSL  P+YKFP+H++F+  Q  ISS+ RRFTAFA
Sbjct: 1   MLGFLTIPHQLKVSPS---FASISSPSSLFRPLYKFPIHHTFYNSQFLISSDHRRFTAFA 60

Query: 61  SNKNNELDGNIKEREGERNGANGSSNGGDDLRKERGPVFNIKWAELLIDPDPDNILAVAL 120
           SNKN E  G+IKEREGERNGANGSSNGGDDL+KERGPVFNIKWAELLIDPDPDNILAVAL
Sbjct: 61  SNKNTEFGGSIKEREGERNGANGSSNGGDDLKKERGPVFNIKWAELLIDPDPDNILAVAL 120

Query: 121 TGLLAWASVQ 131
           TGLLAWASVQ
Sbjct: 121 TGLLAWASVQ 127

[Close]
BLAST of Cla97C05G103290 vs. NCBI nr
Match: XP_023549272.1 (uncharacterized protein LOC111807677 [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 181.0 bits (458), Expect = 1.2e-41
Identity = 101/133 (75.94%), Postives = 110/133 (82.71%), Query Frame = 0 

Query: 1   MLGFFSIPYQLKISPSLPFLS---AISSPSSLSLPVYKFPLHYSFFRWQSQISSNRRRFT 60
           MLGF +IPYQ KISPSL   S   ++S+ SSLS P++KFPLHYS    +SQI   R+RFT
Sbjct: 3   MLGFLTIPYQWKISPSLSSSSSPFSLSTRSSLSFPLFKFPLHYS----ESQIPGKRKRFT 62

Query: 61  AFASNKNNELDGNIKEREGERNGANGSSNGGDDLRKERGPVFNIKWAELLIDPDPDNILA 120
           A ASN +N L GNIKEREGERNGA G SNGGDDLRKERGPVFNIKWAELLIDPDPDNILA
Sbjct: 63  ALASNNDNGLGGNIKEREGERNGAKG-SNGGDDLRKERGPVFNIKWAELLIDPDPDNILA 122

Query: 121 VALTGLLAWASVQ 131
           VALTGLLAWASVQ
Sbjct: 123 VALTGLLAWASVQ 130

[Close]
BLAST of Cla97C05G103290 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CD16 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold475G002130 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 203.4 bits (516), Expect = 1.1e-48
Identity = 106/130 (81.54%), Postives = 115/130 (88.46%), Query Frame = 0 

Query: 1   MLGFFSIPYQLKISPSLPFLSAISSPSSLSLPVYKFPLHYSFFRWQSQISSNRRRFTAFA 60
           MLGF +IP+QLKISPSL  L +ISSPSSL LP+YKFPLH++FF  +  ISSNRRRFTA A
Sbjct: 1   MLGFLTIPHQLKISPSLASLPSISSPSSLFLPLYKFPLHHTFFNSKFLISSNRRRFTASA 60

Query: 61  SNKNNELDGNIKEREGERNGANGSSNGGDDLRKERGPVFNIKWAELLIDPDPDNILAVAL 120
           SNKN E  G+IKEREGERNGA  SSNGGDDL+KERGPVFNIKWAELLIDPDPDNILAVAL
Sbjct: 61  SNKNTEFGGSIKEREGERNGAKSSSNGGDDLKKERGPVFNIKWAELLIDPDPDNILAVAL 120

Query: 121 TGLLAWASVQ 131
           TGLLAWASVQ
Sbjct: 121 TGLLAWASVQ 130

[Close]
BLAST of Cla97C05G103290 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BFX0 (uncharacterized protein LOC103489407 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489407 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 203.4 bits (516), Expect = 1.1e-48
Identity = 106/130 (81.54%), Postives = 115/130 (88.46%), Query Frame = 0 

Query: 1   MLGFFSIPYQLKISPSLPFLSAISSPSSLSLPVYKFPLHYSFFRWQSQISSNRRRFTAFA 60
           MLGF +IP+QLKISPSL  L +ISSPSSL LP+YKFPLH++FF  +  ISSNRRRFTA A
Sbjct: 23  MLGFLTIPHQLKISPSLASLPSISSPSSLFLPLYKFPLHHTFFNSKFLISSNRRRFTASA 82

Query: 61  SNKNNELDGNIKEREGERNGANGSSNGGDDLRKERGPVFNIKWAELLIDPDPDNILAVAL 120
           SNKN E  G+IKEREGERNGA  SSNGGDDL+KERGPVFNIKWAELLIDPDPDNILAVAL
Sbjct: 83  SNKNTEFGGSIKEREGERNGAKSSSNGGDDLKKERGPVFNIKWAELLIDPDPDNILAVAL 142

Query: 121 TGLLAWASVQ 131
           TGLLAWASVQ
Sbjct: 143 TGLLAWASVQ 152

[Close]
BLAST of Cla97C05G103290 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KRG8 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G615300 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 198.0 bits (502), Expect = 4.6e-47
Identity = 102/130 (78.46%), Postives = 115/130 (88.46%), Query Frame = 0 

Query: 1   MLGFFSIPYQLKISPSLPFLSAISSPSSLSLPVYKFPLHYSFFRWQSQISSNRRRFTAFA 60
           MLGF +IP+QLK+SPS    ++ISSPSSL  P+YKFP+H++F+  Q  ISS+ RRFTAFA
Sbjct: 1   MLGFLTIPHQLKVSPS---FASISSPSSLFRPLYKFPIHHTFYNSQFLISSDHRRFTAFA 60

Query: 61  SNKNNELDGNIKEREGERNGANGSSNGGDDLRKERGPVFNIKWAELLIDPDPDNILAVAL 120
           SNKN E  G+IKEREGERNGANGSSNGGDDL+KERGPVFNIKWAELLIDPDPDNILAVAL
Sbjct: 61  SNKNTEFGGSIKEREGERNGANGSSNGGDDLKKERGPVFNIKWAELLIDPDPDNILAVAL 120

Query: 121 TGLLAWASVQ 131
           TGLLAWASVQ
Sbjct: 121 TGLLAWASVQ 127

[Close]
BLAST of Cla97C05G103290 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GYA2 (uncharacterized protein LOC111458579 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111458579 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 176.0 bits (445), Expect = 1.9e-40
Identity = 99/133 (74.44%), Postives = 108/133 (81.20%), Query Frame = 0 

Query: 1   MLGFFSIPYQLKISPSLPFLS---AISSPSSLSLPVYKFPLHYSFFRWQSQISSNRRRFT 60
           MLGF +IPYQ KISPSLP  S   ++S+ SSLS  ++KFPLHYS    +SQI   R+RFT
Sbjct: 3   MLGFLTIPYQWKISPSLPSSSSPFSLSTRSSLSFSLFKFPLHYS----ESQIPGKRKRFT 62

Query: 61  AFASNKNNELDGNIKEREGERNGANGSSNGGDDLRKERGPVFNIKWAELLIDPDPDNILA 120
           A ASN +N L GNIKEREGERNGA G S G DDLRKERGPVFNIKWAELLIDPDPDNILA
Sbjct: 63  ALASNNDNGLGGNIKEREGERNGAKG-SKGDDDLRKERGPVFNIKWAELLIDPDPDNILA 122

Query: 121 VALTGLLAWASVQ 131
           VALTGLLAWASVQ
Sbjct: 123 VALTGLLAWASVQ 130

[Close]
BLAST of Cla97C05G103290 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JWP5 (uncharacterized protein LOC111489528 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111489528 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 173.7 bits (439), Expect = 9.3e-40
Identity = 98/133 (73.68%), Postives = 107/133 (80.45%), Query Frame = 0 

Query: 1   MLGFFSIPYQLKISPSLPFLSA---ISSPSSLSLPVYKFPLHYSFFRWQSQISSNRRRFT 60
           MLGF +IPYQ KISPSL   S+   +S+ S LS P++KFPLHYS    +SQIS  R+RF 
Sbjct: 3   MLGFLTIPYQWKISPSLSSSSSPFPLSTRSFLSFPLFKFPLHYS----ESQISGKRKRFA 62

Query: 61  AFASNKNNELDGNIKEREGERNGANGSSNGGDDLRKERGPVFNIKWAELLIDPDPDNILA 120
           A ASN +N L GNIKEREGERNGA G S G DDLRKERGPVFNIKWAELLIDPDPDNILA
Sbjct: 63  ALASNNDNGLGGNIKEREGERNGAKG-SKGDDDLRKERGPVFNIKWAELLIDPDPDNILA 122

Query: 121 VALTGLLAWASVQ 131
           VALTGLLAWASVQ
Sbjct: 123 VALTGLLAWASVQ 130

[Close]
BLAST of Cla97C05G103290 vs. TAIR 10
Match: AT4G40045.1 (unknown protein; Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). )

HSP 1 Score: 45.4 bits (106), Expect = 7.4e-05
Identity = 27/69 (39.13%), Postives = 40/69 (57.97%), Query Frame = 0 

Query: 63  KNNELDGNIKEREGERNGANGSSN-GGDDLRKERGPVFNIKWAELLIDPDPDNILAVALT 122
           + N  +GN   +E    G    +N  G+  +K++   F+ KW ELL +PD DN +AV L 
Sbjct: 39  RTNAQNGNDSAKESSGGGNRPVTNDDGNGSKKDQFAGFSFKWGELL-NPDQDNFVAVGLA 98

Query: 123 GLLAWASVQ 131
           G+L WAS+Q
Sbjct: 99  GVLTWASLQ 106

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Cla97C05G103290 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_038891869.17.1e-5067.57uncharacterized protein LOC120081233 [Benincasa hispida][more]
KAA0034669.12.3e-4881.54uncharacterized protein E6C27_scaffold65G006880 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK0... [more]
XP_008446780.12.3e-4881.54PREDICTED: uncharacterized protein LOC103489407 [Cucumis melo][more]
XP_011655841.19.5e-4778.46uncharacterized protein LOC105435592 [Cucumis sativus][more]
XP_023549272.11.2e-4175.94uncharacterized protein LOC111807677 [Cucurbita pepo subsp. pepo][more]
BLAST of Cla97C05G103290 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cla97C05G103290 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A5D3CD161.1e-4881.54Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold... [more]
A0A1S3BFX01.1e-4881.54uncharacterized protein LOC103489407 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489407 PE=... [more]
A0A0A0KRG84.6e-4778.46Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G615300 PE=4 SV=1[more]
A0A6J1GYA21.9e-4074.44uncharacterized protein LOC111458579 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC1114585... [more]
A0A6J1JWP59.3e-4073.68uncharacterized protein LOC111489528 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111489528... [more]
BLAST of Cla97C05G103290 vs. TAIR 10
Match NameE-valueIdentityDescription
AT4G40045.17.4e-0539.13unknown protein; Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae -... [more]
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (97103) v2.5
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 67..93
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR36789TRANSMEMBRANE PROTEINcoord: 26..130

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Cla97C05G103290.2Cla97C05G103290.2mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
cellular_component GO:0016021 integral component of membrane