Cla97C05G093880 (gene) Watermelon (97103) v2.5

Overview
NameCla97C05G093880
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. 97103 (Watermelon (97103) v2.5)
DescriptionUnknown protein
LocationCla97Chr05: 14104524 .. 14111223 (-)
RNA-Seq ExpressionCla97C05G093880
SyntenyCla97C05G093880
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGGATATCGACTCGTATGGATACTCTTTCCAGGTATAATACATATGCTATGATATATATCAAAAAACACATCACTTATTAAAGTAACATAAATCATATACTCAATGTTGTAGAAAGATCGATAAGCAAATAATGATGAGTAAAATGATATTGAGGTGGAAGGAGAACAAGTTGATGTGGTTTATATTCTTTAAAAAACACATCCATTTTAAGGTTGAAAAACTTCGTGCAAGCAAGAAGAAAATGTGCCTATTGAAGTCATCAAACAACATTTGGCACAATTGGGTAAGAAGCAAAGAAAATCAATGTGGAGAACAAAAAAGGTAAAGTAACCGTTTTATTTTATAAATAGATATTAATAAATTCAACATATATCCTATATATACTTATATTTATATAATAACACTGTAGAGTGCTGACTAAACATCGATGAAATCACCAGAAACAAGACAACATCAGCAAGCTCGTCATGTTGTGGAAAATAGGGTAAAATCCGAATATATAGTGAATATACATAAATGTTTGTTATACTATACTAAATGATATTTAATATGTGGTGCTTATTTTGAAATATAAAACAATACAACGAAAAACGTACAAAGACAGAAGAGCACACAAGTGTTGGGAAGGAAAAAACAAAGTTTAGTAGTGATGTTGGGAAAGAAAGATGTATTTCGAATATAATTAATGTTTAATTTTGTTTTTATGTAAACTTAAATGATTTCATTGTTACACAATTTTTAAATATATTGTAGAATATCCGTGGGAAAACTAAGATGAATGAAGATAATTATAGGAGAGGGAATATGAGGGGTAGAGATCAGTACAAGCTATATGAGGTATGTATTATATATACACACTCATACAATTACCTTTGTACAAAATTGTGAAGAATGTTACTTTTTTACAGGATGCACCCTACCTAGACATAAGTGGTCTAGTGTACAAAAGTCAAATACTTATGCTAGGTTTGAAATCATTCGAAACATTAAGGACAACCTAAGTAGGAAACATCTTGGCTAGATTCCTACTTAGTCCTTTCGGTTATTTCCTAAACCTAAAACTTAGCACATTCTCTAGCTAACTATTGTATCACCAAATAAGGAGACAATTTAGTATCACAAAAGAGGATGAACTCACATTCAATTTTGAAGGAAAAATAGTAAAATTTGGGATAACTGACTTTGAAAAAATAACAGGACTTAATTGTGAGGAAATGCCAACCTTGGATATGCACAAATATAACGGCAAATTCGTAAACAAATACTTCAACCAAATGTCTCCAATTAGAAGATTAGTTTTAAGTGAAATGTTTATGAATAGGGAGTCTATAAAAAAGAAGGATAGAGTAAAGCTTGCAAAACTGTGTTTCCTATCAAATATCCATGAGAGCATATTGCATAAATGACCATAGTGGAGACAATAAAAAAATCTATCATGAATGCAGATTTTTTACAAGTGGGAAAGCTGGCTTCCCACATGCTTTGGTTGTTTGGGCATTCGAATGCATCCCTAATTTGTCAGGACCGTTAATGTTTTGTTGCCAACATATTTCCTCAAGAATTTCAAAGATGAACAACTGGTTGATTGACGTTCATTCGATTGGAATGAATTAGCAAGGAAGATCTTTGACAAAGACGATGTCATTGACCTCTTATTATTAGTAATATATATGCATGTTTATATTATAACTACTACTGTTTATGTCTAATTCACTAATATATTTAACTTAAATCTCCAATTTGAAATCTATGAGATGATGGGTGAGCGTGATTTTGGTGTGAGGATTATTTATCAAACTGAATCTAATAGGGGCAATGAACTAAATATGACTTAAAATCTACTAAAATATTTCGAAGAGTTTCGAGATCTAGTGATAAGTAAGTTTGAAGACTTGAAAAAGAAAATGGACTTATTGACTAGAGAAATTAAAAAAATTTCAAGATGAGAAAGAAAATGAAGAAAACAATGAGGAAATCAACACTGAGGAAGAAGATGGAGATGGGGGTGGTGATGGAGATAATAGAGGAAGAGGGAATGAGAGTAAAGATGGTGCAGGCATAGAGCACATTGAGAGAGCAAATTTGGAAGAAAACGACAAAAATGAAGAGCAAGACCAAGTTCAAGGTGAATATATGATACTTTAGATATGTACTGATATTTATATTATATGTAATTTTAGAAAGCATATTGAAGTAGTTATTTAGCACCATGTTTATATAATATGTACTACTGAAAATGCTATTAGAAATCCTAACTCCTGTTGTTTATTGAAATTTTATAACATGGAAGGTATATGTTTGAGCTCTAGCATCTTTAGCATAAACTTCTTACTTGAAGTAGATAAACTAGAAAATGAGGCGATGAAGGTATACAACTACCCTACATAGCTATATGAAATGTTTAGCCCTAATATGTTACATGCTATTTGTTTTTAATATTTGTATATATTGTAGGGAAAAAGAAAGATTACAAACACATTCAATAACTATGACATAAAGGTTGTCAACAAGCTGTAAGCTGTACTCAATTGAACTAATAAATTTGTTGACTTAAAAATATACATGTACAATGCTTTATGATTAACGTACTGTTGTGTATATTGTAGCAACTATAGGGTATGGGTTTATTTGTGAACAAATATGCTCAAGGACAAAGGGAACATAGACGATCGTACCTTCTAAAATGGTTAAATCTCCATGCACAACCAAATTTGGATCAACAAAGGAGAAGATAAAGGAGAGGATGAAAATTAAGACTCAGTATCTCAATGAAACATTATTCAACTTATTGTCCCAAATGTAACTCGATGTCAAGTGAACACCAACTTTAGACTTGTTCTGTTTTTTGAACTTTAAGAATTTAATGTGCTTTTTTAAATAGCTTCTAATTTATATGTTATGGGATTTGGTCATCTATTGTGATTTTAGCCAGCTCCCTAATTTATATGATAATGGATATAGTATTATGTGACGTTTTCATAAATTTACACGTTTACAGGGTTTATACGATATATGAATGAGTACACTACATAAACGTTTATCTATATACTCCCCACTTTATTACAAATGTACTTATACTTTGATCGTGTACGACTAAAACTAAATCTCTATTAAGGATTAGACAACTTTTAATTTGATCAATATATAAATACTAACAACTATAAGCTTATTTCAAACATAAAGATGGAAAACTGGACTTTTTTTTATTGTGTAATAGTATTAGGTAAATATAGGCTTATGCATATAACTTTCGTAACATGTTGAATGTACTCTTGGTTTATAGAACATTTGATATATAAATATAGTATGTTCGCACGTGACTATAAGTTAAAGTAAATTTTATTTATAAATACTAGTAACTCTTGGTTTATAACTAGCTTATTTCAAATGTAAAACATGCAAAATAATATTTCATTAATAATAAATAGTACTAATAATACTACTACGTGAATACAAGTTGAATGATTCCCCACAAGCTTTCTTCATTTCAAAAATGTAAAATTAATATCTCCTCATATTGAACATAATTAATGTTAATAAACCAACAAAACAAATAAGAAAATTGAACTTTGTAAGTAAGGCAACTATTGTGTAAATGTAAACCTGCAACTCTTAAGATTGTGCCTTCGTCTTCCACAACGACTACACTTCATGATCTTCTTAAACTTCATTTGTGAAGTAATTCTCAACTTCTTCGATCCGCCAACCGGACGCTTAACATTTGCTGAGAAATGGAAGGAACAACATCCCTACAAGTAAGGAAAATTAAAACGATTTGCACCCATTTTTAATGCAATAAACGGAAGATGATTGTTTCCAAAAATGAAGTCAAACTTGGCATTTTATTTAAGAAAAATCATTGGATTTTCGGTAATTTTAAAATAATGGATTACAAAGTCATATGGTCTGAATTATGGGTAGATTCCTTAAATGAATTAATTCAAATAAAAAGAAGATTTGTGAAATTGATAGGTTGAAGAGGATTTTTCCATGTAAATTTTCATTTCTTTAATAATAGACACATGTATATATGTGTTTCTAAATGTGTGGGTGAAGGGTGGTGCCGCAAATTAAAAAGGAAAAAGGAGACCGACAACAATATATTTTTTTTTGGGACTGCATAAGCTTTTTCGTGCGGTCCAATTGCGGCAGTGAGTTTATTGAAAAATACAGTGTATTTTTCTTGGATTTGGGTGTTTTTCTCCTACTATTAATTCCAAGATAGCGAGTTGTGGTATAGGGAATCAATTAATAGTTCGTGTTGGGTTATTTGGGTAGAGATTTGTAGCGCGAGTTTGAAATCTTTGGCAATCTTCATCATGGTAGAACCTGTTGTAGAGGATTGAACATAGTCCCAAGTTTGGGGCAAACCAGTATATTTTTCGGTGTCATTCTCTTTTCCCTTATCTTTATTATTTGATATTTTATAATCATTAGCCTTTTTTGGCGCTAACATGTGAACTGGGAGTTTCAGATATAATTTAGTTTATTCCACATTTAATTATATCACATAAAACTCCCAACAAAGATTTGATCTAAACCGTTCATGCAAAGACATGCGAGTGGGGTATCCTATACAAATGGTTTGTATAAAATTGGACCGTGAATTAGTTAATCTCTCCTTATTAACATAATTGACTAAAGCTATTAACATTTCATAGGATGACTACATGTAACTCGATCTTAATCCTTAGGGGGTTATGGACTCCTACTTCTGAGTGTTTATCCTTTGATTTGTATAGGTGAGAGTGGCCCGTGTTGCCGATTCAATAAGTCTACCATATTGGAGATAAGACCAAATGGGGAGCTAGGAACATAGCTACACAAGATGAAATTCACTCCTTCGATTTAGGATAAAGTAGAGAGGAGTTGTTCCTTTTAGGTGTTGAATCCAGGTCTTGAACAATGGGGTCCGTCCCTCTCATTGGCCCAAGAGGAATTTTGTTTATGGTAGGATATAAATAGGTTGTTCATTAGAGGATAAGTGAGACTTAAGGA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mRNA sequence

ATGGATATCGACTCGTATGGATACTCTTTCCAGAATATCCGTGGGAAAACTAAGATGAATGAAGATAATTATAGGAGAGGGAATATGAGGGGTAGAGATCAGTACAAGCTATATGAGAAATTAAAAAAATTTCAAGATGAGAAAGAAAATGAAGAAAACAATGAGGAAATCAACACTGAGGAAGAAGATGGAGATGGGGGTGGTGATGGAGATAATAGAGGAAGAGGGAATGAGAGTAAAGATGGTGCAGGCATAGAGCACATTGAGAGAGCAAATTTGGAAGAAAACGACAAAAATGAAGAGCAAGACCAAGTTCAAGCCATCTATCTCTATCACACGCCATCAACTGCCGCATGCCCCCGTCCATGTCGAGACTGCCATCAACATCTTCAGGTTGCCGTTGTCGAGGAGGATAACGCCGGTAAGTCCCATGGATCTTCCTCTCTCTCTCAGTCACCCTCCCCTTCTCGTTCTCTCTCCTCATATCTCTTTTTTGCAAAGCCTCACCCTCAAACGAAGTCGTCGATCACATGCTCTACTGCTACTGTTTACCAGTTACCGCCGCTACTGCCGTCGTGTGGTCGCCGGAGGAATTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGATATCGACTCGTATGGATACTCTTTCCAGAATATCCGTGGGAAAACTAAGATGAATGAAGATAATTATAGGAGAGGGAATATGAGGGGTAGAGATCAGTACAAGCTATATGAGAAATTAAAAAAATTTCAAGATGAGAAAGAAAATGAAGAAAACAATGAGGAAATCAACACTGAGGAAGAAGATGGAGATGGGGGTGGTGATGGAGATAATAGAGGAAGAGGGAATGAGAGTAAAGATGGTGCAGGCATAGAGCACATTGAGAGAGCAAATTTGGAAGAAAACGACAAAAATGAAGAGCAAGACCAAGTTCAAGCCATCTATCTCTATCACACGCCATCAACTGCCGCATGCCCCCGTCCATGTCGAGACTGCCATCAACATCTTCAGGTTGCCGTTGTCGAGGAGGATAACGCCGGTAAGTCCCATGGATCTTCCTCTCTCTCTCAGTCACCCTCCCCTTCTCGTTCTCTCTCCTCATATCTCTTTTTTGCAAAGCCTCACCCTCAAACGAAGTCGTCGATCACATGCTCTACTGCTACTGTTTACCAGTTACCGCCGCTACTGCCGTCGTGTGGTCGCCGGAGGAATTGA

Protein sequence

MDIDSYGYSFQNIRGKTKMNEDNYRRGNMRGRDQYKLYEKLKKFQDEKENEENNEEINTEEEDGDGGGDGDNRGRGNESKDGAGIEHIERANLEENDKNEEQDQVQAIYLYHTPSTAACPRPCRDCHQHLQVAVVEEDNAGKSHGSSSLSQSPSPSRSLSSYLFFAKPHPQTKSSITCSTATVYQLPPLLPSCGRRRN
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (97103) v2.5
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableCOILSCoilCoilcoord: 34..61
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 18..50
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 141..160
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..106
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 68..102
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 51..67
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 139..160

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Cla97C05G093880.1Cla97C05G093880.1mRNA