Cla97C03G051480 (gene) Watermelon (97103) v2.5

Overview
NameCla97C03G051480
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. 97103 (Watermelon (97103) v2.5)
DescriptionUnknown protein
LocationCla97Chr03: 620918 .. 627727 (+)
RNA-Seq ExpressionCla97C03G051480
SyntenyCla97C03G051480
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGGATTAAGGGCAGGTCGTTTATGTTTGTTGTTGCTGTTCTTGGTGGTCATAGTATGGTGTTTGCCAATTTCAGGTATGCCCTAATTTTTTCTAAGCGTTAGCAGTTCATACATGCATTCATTTTTTGAAGTCAAATATTTTTCAATCCTTTCTCTTGAATGCAAATTTGTTGAACTAAAAAGAGTAAGAGAGAAAATTGTCAAAATTACCCTGAAGTATGGTACGGTGGTAGTTGCAACCACACCTCCAAACTTTTAATTGTAAAAATTGAACCCTAAAATTTATTATAATTGTATAAATTGGATCATGATAAAAATTGAACTTACAGTTGAAAGTTTATGAGGTCATAATTGCAATTACCACCCTGCTTTAAGAATGATTTTTACAATTTACCTAAAAGTTAAAAAAAAAAAAAGTGTATCTAAGTTAGGGTTCATTATTTGTGGTTTTAGTAAAGTTAAAATAAGGCTCTTTTAACCAAACCCATCTCATTATTTGAGTTGCAACTTTTATTCTCTACCTTGACAATTCTAGTTTATGAGTAATTGTTGTCAACAATTGTTCACCGATTGATATAGGAGAGAGAAATTTAAATTTATATCTAGTGGTTATTAAAGAATATATAGATCTTCAAATCTACATCCAAAGATTATTAAGCGTGGCTATCTCACTCTATAATTATTTTTTCCTAATTGACACAATGGAACTAACCACCTTCAAACACACACATCATTATGGCATTTAATATATTTCAACCTTGATCTCTCACCCCAGTAAAAAATAAAAATAAAAAATTGGTTTGGTGGGTTTTATTAAAATTATTTGTATAAATATCAACGCAAATTAAAAATAGGGATGAGAGATTAAATTTTTAAAATTAGAGAAAATAATAGTTAGATGTCTTATTCACGGAACGAGGTTTAGATTTTCATTTATAGTTTTGTTAAGAAGTGAAAGGTGTTAGTCAATCCTTAATAAATTTAATTTGCTTATTATAGTATTTTCCAAATTGGTTTGAAAAAAATTCATGCACCGATAATTTTTCCAGAAGTGGTTAAATTTAAATTCGAATATAGTTATGTAAATCAAAACATCAATTACTATTTCAAAGGTTAATAATTTGATGTTTACGATTTCTTTAAACTCTTACACTCAAAAAATAATATCCATGGATACAATCCAATTATTGGATAAAAAACTTGCCCAATCCAAATAACTTCTATTAAAACCAACCAAACCCAATTATAAAATAGAGTTTGCTATTTTCATCCAATTTTTTTTTAAAAAAGTCGTGAAACATTAATTTCAAATAGTTAATTAATTTTAACTAATCATAAAGTTATGGTTAATTTTGGTTCACTACAAACTATTTTAGGGGAACTATATTGGTTATATATATATAATCTCAATTTCTTACACCCAACTCAATTTAGATTTCAACAAGTGTATTTATAAAATTCAAAGATGAAGAGTAAAATAGCATGTTTGGAATGATTTTGATATAGTTAAAAAATTACGTTTGTTTCATTTTCAAAATCATTTCGAAACATAGTTTTTAATAATTAAAAATCAATTTTAATTGTATGAAAATTGTATTTAAAATTATAAAATTAAACATCAAATTGATTATAAATAATTAAAGATATATTTCAAAGTGATTTTGGACATGATAAGAGTGATTTAATTATTTAAAGAAAATCTCCTAACATGATGCTTATCAGAGTATTTTGAATTATCTAAGTTATTACTTGAATACTCTCATTCATGAGGTCTCTAGCTTATGCAATTACACCTCTTAAAATATAAGTTACATATATGATATTTGTAGTGAAGAGCATAATTCAGTAATTAAGGTATCTTTTCCTGAACCACATGATACTAATAAAAAGATATGATGGTTTCCTTCAAATTTTTATTTGTTCAATTTAGACTCAAATTTATAATTAGTTTCTCAAAACATTCATTAAAGTCAACTGAGATAGAGATCTCGATGAATATTACGTTTTCAATAATGTTCAAATATGCTCAACACAAATCTTAAAATTAAAAAAAAAAAAAAAAATCAATACAAAGTATTTATTTGATTAGTATCATTTTACATGCATTGTTATAATAAAAATTAGTGATTGTACACTTCATTCATGAACCTACATGGTGCATGTGATATTTTACTTCTTATGATTCAATAAAAAACTAATCTCTAAAAAAAATAATTAAATCGGTTTGAACTATGCTCATATTATGTGTAAACTAATTAATTTATAAACAAAAAATAGAGAAAAATTAAAATGAAACCTCAAGAAATAAAATATGTACTAATATCTTTTGGATCCTTTGATAATGGGTTAAATTGACAAAAGATGTAAATGTTGGCCCTACATGCAAAGCCCAAACCATTTTCTAAATTTCCAATGCCCAAAGAATTTGGTTGTTAAATATGAAACTCTCAAGATTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTCCAAATTCATTAACTAGCTGAACTATGTTTAAATTAACATAACTAATGGGAATGAAATTTTTGAATTTACCATCTATATTATAAACGAGTAGATATCCTTCAACATAAATTTAGGTCAGTGAAATCATAGTATTAAAATGACAATGGACAATCTAATTAATTCATTTATAATTATAATTAGTCTTTTAGTTTTAATTGATTGAGCATAAATTGATTCTTTTTTTTTTCAAATATTCCTTATCAAATTTATTAAGGGTGCTCAAAAAATCTAATGACATGAAAAACTTGATCAACTCAATTCAACTTGTACGGTTTGAGTTTGATTATAACTCATCTAGGTTGGGTTGAGTTGAAATAAATGAAAACGTTATAAGTTGGGTTGGGTTGGTTTATGGGTTCACCTAAACAACCCAAACCAACCCAAACAATCCAAACCAATCCGAACTTATTATTAATTTTAATGTATATCCTTTTTACTAAGGATAAAATTATAGATACATATATTTATTTTAATTTTATTTAATTTCATGTTTTTTAAATAATTTTTTCTCAACAATTCTTAAAAACCATATTTTTAGATTTTGAAAAGAAAACTTTCATAATATAAATAAAAATTGAGTTGCAGTATATGAAAATAATAAAATAAATTTTATACATATTAACATTTTAAACAAAAATTTAAATAAATGACTAGAGTAATTCGAACTCGAATCAACCCAATCCAAATGTTTCATGCATGGTTGGGTTAGATTGGATTGAAGAAATTTACAATTCAAATAATTAAATGGTCTAAAAAAATCTTTCAATCCTATCCCACTCGTCCTTAGCTAAGCTTTGCATTGATTTTATTGGGATGAGAATCCATGAGGGACTCATCATCCACCACAAAATTAAGTAGTGGTGGAAAGAAGGTGCTTTGAAAATGTGTAAAAGTGAGATCCATGAATTCTGGAAATGGAAGGCCTTTTCTTATCTTTTTCAAGAGGATCTTCTTCTTTTCGAAATTACCCCTATAACTTTTTTTTCATTTTTCTTTTTTCTTTATGATGTTTTAAATTTGTGTCTAATACCAACAAAAAAATGTTTAATAAGTTATAAATTTTGTAATTTATATCTGATGGGTCCCTAAATTTTGAGAGTGTTTGATAAATCCTTTAATTTTTAATTATCTGTCCCGTAGGTTATTGGCATGTTTAAAATTTAATAAGTAATATATTCATTACATATGAAATTGAATTATGTATGTAATAAAACTATAACTAACTTTGAATTATGAGTTTAATACAACGGTGAATTTTAAAAAAATATCAGAGAATTCAAAGACTTATTAGGTACATTAAAATTAAAAATTTAAGAATCTATTAGACACAAAATTAAATTTAAAGATTTTTAGTTTTTTACAGTTTAGAGATCCATCAAACACAGATTTAATAGTTTTCAAAGTCATACTAGTCATTTTTTAACCTTCGTCAAACCAAATACACACAAATATGAAACTTTAGAGATTAAATATGTAATTTAACTTTATATGTGTTAACTTTTATTTAGTTTATCATTTTTCATTTAAACCACTAACATCCAACTATACACCAAAAACATCTAAAATTGTTCCTAAATCGTTCATAATCAGTGGGATTCTAGATTTAATTTTGGGCAAATTTTAAAAATCATCTTTGAAGTATGGTGGTAGTTGCAATTAAACTCTTAAACTTTCAATTTTAAAAATTAAACCCTTAAAATTATATAAATGTTGACATCGAGTCAAATTGGACCTTTTTTTAAAAAAAAAATAAAATTGGAACTTCAAACTTATACAATTGTATAAAATGTAACATTTGTATAAGCTTAAGAGTTCAATTCTTATCATTTGTGGGTTCAATATCTATAATTATTGTAAGCTTAAGGGTCTAATTTTAACATTGAAAGAAGTAGGGGCCTAAATTTTATAATTGAAAGTTTGAAGTTCTAATTACAACTACTACTATATCTTAAGGGTGGTTTTTGTTGTTTACCCTAAAAATAATGCCATCATTATAATCTTAAAATATATATTACCATCTCAAAAATCTACTCTAAAAAGCTATACCATGTATCTTATTTATTATTATTTTCTTTGTACTATCTTATTTATTTTTGATACGTATCTTATATTTATTAATATTAATTGAACAATTAAATTGGTAGGACATCACATCCATAACACTATTGGTATAAAATAAATTTAATAACAAATATTGTATTTAATATTAAAAGCGACAAACAAAGAGAAAGATAAAGCAGCCACACGACCAAATAATTTCTCATGTTTTACATACGAAGTTGCCTTTTGGTTTTTTAAAGAAAAAATAAAACATAATTATTATTATGACCAAATACTTTTAATTTAAAAAATCACGTGATCATATCTCGAGAAAAGCATCCCCACGTGATGAGGCAGTCATAACTATATAATAAATAATTTGGACCAAGTGGCTTTATTTTTTTATTATTTTATTATTTTTTATTATTTTTATTATTTTTTTGCAAACAACCAAACTCCATTCTAAATTATGCATCAGCAGGTTGCCCTTTCAATAAAAGATTCTTTGTGATTATTTCTTTATTATATAAATTTAAATCTTATTTTATTTTCACCCATCTTAATTTTATTGGATTTCATTCTTTTAAAATTTAAATAAAAAGAATAGCTTTTAGTAATTGGTTTTTTTTTAAAGCATGGTGGAGGTTTAAACAACAAACGTTTTAATCCTAGCATATATTTATATTAATTGAGTTAAATTTATTTTAAGTTTAGTTATCTGTTTTAATGAACATGATATGTATGTATATATAATAAATATTCGATGAATAACGTGTTGAATTTTAAAATGAGTTAAAATATTTTAATTTTTTTAGTTAAATGATAAAACAATTTTTATGAGGTATAATTTAGCAATTAAAACAACACATCTAATAAATTAGTATGAAATTTTGGAAAAAAAAAACTTTTCCAATATTTATTGTATATATGTGTGTGTGATAATAAGCTAATTCAATAATTTTTTTTAAAAATTAATCAAATTTGGGTTGTTGAATTCAAATCTTCAAATTACATGTAATATATATTTTAAAGTTAGAGACTTTAGAAACACCTGACTTTAAATAACAAATTACATGTAATATATATTTTATTTATTTAAAAAAAAAGTATTTTTTATAATATATATTTTTTGAAAGATTAATTTTTTACTAAGGTGACACGTTAGATGTTAAAGTACTTGAATTGACATTTTCCTAAATTATTGTCCATTCAAATTGATGATAACAACATAATAAAATAGCCAATATGTAATCTTGACTAAAGAATTAAAAAGAGAGAGAAAAAAAAAGAAAAAAAAGAAAGATGAACTTGAAAAATATGTTAATAGAGAACCTTATATGTATAATGTTTTTCTTAAAAACATAATAAATTATATTGTATTTCTCATTTTTGTGCGCTAAATTATATCAATGTAATTGAGCGTGATATCTATTATGTATTAAATCTCTAAATTGTAAAAAAATAATTGAATAATGTAAATTCCTAAATTTTATTATGATCTCATTTTATAATTATTTCAGTTTCAAATTTTTTTTCTTCAAAATACAGTACTACTTTACATGTTTGACTTTTTTTTTTTTTTTCCTGTTTTCTATTTTTTTAAAAGTTAAAGATGCGAAGAGAAATGTTAGAGAAATAAAAGTGTACAAATGTAAATAAATCATTTAAAGAGAGAATTTTATAGAAAGAAAACTAGAGAAAGAGAACAAATATTAGATAGAGAAAGAAACTGAAATGATATGGAGAGAGAAAAGATAAAAATTTGAGAGAGAAGATTAAGATTTTCTCTAATTAATAAATACTAGAGAGAGAACAATTAAAGGACTATATATATATATAAGAGAAATAAAAGTTTAAAAAGCGAGCTATATGTTATATTATTATAACTTTTTTTTTTCTTTAAAACCAAAAAAACCTTTTCTGTTATCTTCAATCATGAACATTATTCATAAAATGCTATATGCAACATGTTATTTGGATGAGTTTTAGCTGAATCTAACATGATGTGATAGATAACTTTGAACAAAATTAACGAACATATATACGTTAATATTTCATGTGAGAAATGATATTATATGTGTTTGAATAGGGAAAGATGATGACAAAATGGAGAACATAGCAACAACCATGGTGGAAAAAAGGTCTTTGATTGTGAAGATCAATGATTATGATGATCCAACACCAAATCAAGGGCATAATCCATTCAAGTCTAAACCAAAAAAGCCACACAATGATCCTACAAGAAAAGGCTAA

mRNA sequence

ATGGGATTAAGGGCAGGTCGTTTATGTTTGTTGTTGCTGTTCTTGGTGGTCATAGTATGGTGTTTGCCAATTTCAGGGAAAGATGATGACAAAATGGAGAACATAGCAACAACCATGGTGGAAAAAAGGTCTTTGATTGTGAAGATCAATGATTATGATGATCCAACACCAAATCAAGGGCATAATCCATTCAAGTCTAAACCAAAAAAGCCACACAATGATCCTACAAGAAAAGGCTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGGATTAAGGGCAGGTCGTTTATGTTTGTTGTTGCTGTTCTTGGTGGTCATAGTATGGTGTTTGCCAATTTCAGGGAAAGATGATGACAAAATGGAGAACATAGCAACAACCATGGTGGAAAAAAGGTCTTTGATTGTGAAGATCAATGATTATGATGATCCAACACCAAATCAAGGGCATAATCCATTCAAGTCTAAACCAAAAAAGCCACACAATGATCCTACAAGAAAAGGCTAA

Protein sequence

MGLRAGRLCLLLLFLVVIVWCLPISGKDDDKMENIATTMVEKRSLIVKINDYDDPTPNQGHNPFKSKPKKPHNDPTRKG
Homology
[Close]
BLAST of Cla97C03G051480 vs. NCBI nr
Match: XP_022964739.1 (uncharacterized protein LOC111464728 [Cucurbita moschata])

HSP 1 Score: 102.8 bits (255), Expect = 1.4e-18
Identity = 52/79 (65.82%), Postives = 62/79 (78.48%), Query Frame = 0 

Query: 1   MGLRAGRLCLLLLFLVVIVWCLPISGKDDDKMENIATTMVEKRSLIVKINDYDDPTPNQG 60
           MGLRAGRLC LLLF+V+IVWCLP+SGK D+ M+   + M+ K+SLI+ INDYDDPT NQ 
Sbjct: 53  MGLRAGRLCSLLLFMVLIVWCLPVSGKHDEDMK--MSIMLGKKSLIMNINDYDDPTANQR 112

Query: 61  HNPFKSKPKKPHNDPTRKG 80
           H+PFKSKPK P     RKG
Sbjct: 113 HSPFKSKPKMPQKGRKRKG 129

[Close]
BLAST of Cla97C03G051480 vs. NCBI nr
Match: KGN65814.1 (hypothetical protein Csa_023311 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 100.5 bits (249), Expect = 6.7e-18
Identity = 52/71 (73.24%), Postives = 59/71 (83.10%), Query Frame = 0 

Query: 1  MGLRAGRLCLLLLFLVVIVWCLPISGKDDDKMENIATTMVEKRSLIVKINDYDDPTPNQG 60
          MGLRAGRLCLLL+F+V+IV  LPISGK D +M+   T M  KR L VKINDYDDP+PN+G
Sbjct: 1  MGLRAGRLCLLLMFMVMIVLYLPISGKGDGEMK---TIMRGKRCLTVKINDYDDPSPNEG 60

Query: 61 HNPFKSKPKKP 72
          HNPFKSKPKKP
Sbjct: 61 HNPFKSKPKKP 68

[Close]
BLAST of Cla97C03G051480 vs. NCBI nr
Match: XP_022970490.1 (uncharacterized protein LOC111469456 [Cucurbita maxima])

HSP 1 Score: 97.8 bits (242), Expect = 4.4e-17
Identity = 51/79 (64.56%), Postives = 60/79 (75.95%), Query Frame = 0 

Query: 1   MGLRAGRLCLLLLFLVVIVWCLPISGKDDDKMENIATTMVEKRSLIVKINDYDDPTPNQG 60
           MGLRAGRL  LLLF+V+I WCLP+SGK D+ M+   + M+ KRSLI+ INDYDDPT NQ 
Sbjct: 33  MGLRAGRLGSLLLFMVLIAWCLPVSGKHDEDMK--MSIMLGKRSLIMNINDYDDPTANQR 92

Query: 61  HNPFKSKPKKPHNDPTRKG 80
           H+PFKSKPK P     RKG
Sbjct: 93  HSPFKSKPKMPQKGRKRKG 109

[Close]
BLAST of Cla97C03G051480 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HP46 (uncharacterized protein LOC111464728 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111464728 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 102.8 bits (255), Expect = 6.6e-19
Identity = 52/79 (65.82%), Postives = 62/79 (78.48%), Query Frame = 0 

Query: 1   MGLRAGRLCLLLLFLVVIVWCLPISGKDDDKMENIATTMVEKRSLIVKINDYDDPTPNQG 60
           MGLRAGRLC LLLF+V+IVWCLP+SGK D+ M+   + M+ K+SLI+ INDYDDPT NQ 
Sbjct: 53  MGLRAGRLCSLLLFMVLIVWCLPVSGKHDEDMK--MSIMLGKKSLIMNINDYDDPTANQR 112

Query: 61  HNPFKSKPKKPHNDPTRKG 80
           H+PFKSKPK P     RKG
Sbjct: 113 HSPFKSKPKMPQKGRKRKG 129

[Close]
BLAST of Cla97C03G051480 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LXM5 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G532220 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 100.5 bits (249), Expect = 3.3e-18
Identity = 52/71 (73.24%), Postives = 59/71 (83.10%), Query Frame = 0 

Query: 1  MGLRAGRLCLLLLFLVVIVWCLPISGKDDDKMENIATTMVEKRSLIVKINDYDDPTPNQG 60
          MGLRAGRLCLLL+F+V+IV  LPISGK D +M+   T M  KR L VKINDYDDP+PN+G
Sbjct: 1  MGLRAGRLCLLLMFMVMIVLYLPISGKGDGEMK---TIMRGKRCLTVKINDYDDPSPNEG 60

Query: 61 HNPFKSKPKKP 72
          HNPFKSKPKKP
Sbjct: 61 HNPFKSKPKKP 68

[Close]
BLAST of Cla97C03G051480 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I305 (uncharacterized protein LOC111469456 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111469456 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 97.8 bits (242), Expect = 2.1e-17
Identity = 51/79 (64.56%), Postives = 60/79 (75.95%), Query Frame = 0 

Query: 1   MGLRAGRLCLLLLFLVVIVWCLPISGKDDDKMENIATTMVEKRSLIVKINDYDDPTPNQG 60
           MGLRAGRL  LLLF+V+I WCLP+SGK D+ M+   + M+ KRSLI+ INDYDDPT NQ 
Sbjct: 33  MGLRAGRLGSLLLFMVLIAWCLPVSGKHDEDMK--MSIMLGKRSLIMNINDYDDPTANQR 92

Query: 61  HNPFKSKPKKPHNDPTRKG 80
           H+PFKSKPK P     RKG
Sbjct: 93  HSPFKSKPKMPQKGRKRKG 109

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Cla97C03G051480 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_022964739.11.4e-1865.82uncharacterized protein LOC111464728 [Cucurbita moschata][more]
KGN65814.16.7e-1873.24hypothetical protein Csa_023311 [Cucumis sativus][more]
XP_022970490.14.4e-1764.56uncharacterized protein LOC111469456 [Cucurbita maxima][more]
BLAST of Cla97C03G051480 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cla97C03G051480 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A6J1HP466.6e-1965.82uncharacterized protein LOC111464728 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC1114647... [more]
A0A0A0LXM53.3e-1873.24Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G532220 PE=4 SV=1[more]
A0A6J1I3052.1e-1764.56uncharacterized protein LOC111469456 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111469456... [more]
BLAST of Cla97C03G051480 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (97103) v2.5
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 50..79

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Cla97C03G051480.1Cla97C03G051480.1mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
cellular_component GO:0016021 integral component of membrane