ClCG10G009540 (gene) Watermelon (Charleston Gray) v2.5
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGATTGCGGAACTGGGGATTGACGCATCCACTTCTAATGAAGCTACCACCTTTCGAGACAAAGGTCATGCTAACCTGACAGGTTCATATCACTTCTCTAATTAAAGTTGCTTGGGAGCTTTATCTAACCCCTCCTTTTTGTTTCTTATTCTTCTTTTTAGTAATGGCTCCTAGGAAGTCCATGCGCTAGAGAATGATTGCCGAACTGAGGATTGGCGCATCCATTTCTAAAGCAGCTGCCACCTTTTGAGACTCCTAATCTGATAGGTTCATATCACTTCTTTAATTTCTTCTTGAATAGCTATCAAAAGTTACCTGGGAGGTTTATCTAATGTCTCTTTTTTTTTCTTTTGTTCTTCTTTTTAGAAATGGCTCCTAGGAAGTCCATGCGCTAGAGAATGATTGTTGAACTGGGGATTGGCACATCCACTTCTCATGCTCCTTCTATTGACTCACTTCCAATAATTTCTTCTATGGGTGCTTGAACTAGGATTGAACCAATCCATGCTTCATTTGAAGAGCCACCTTCTCGACGCGCATGCCTTCGAGCCTCTCCACTTCATGACTTTTCTCAACAAACTGTGATGTTATCAACCCCCTCAACTGTTGAAGGGACCAACTCATCCACCCCCAACCCTTTTGATATTGATGATCCTTACGAATCTTATAGCAACGAGGTTGCACTCGGGCTATGACTCAGTGGTCGTGTTTGAATGAGAGTGCCTTTGCCAGATGGCAATCCGACCCAAAATTGCGTATAATAAAAGCCAACCACCACCTCGACATGGTAAGTGGCTCCATTAAACTATCTTTCATTTTTTCTCGATAAGAGGAGTTGTTTCATTCATCTGTACAAAGTGACTATTAAGCTATACATTTGTATTTTCCAGCCATACATTTTTATCTTTCTTGTCTCTTTTCTTTAGGCATCTTTTGAATTATCCATGTCATGCCAAGGATTGAGTGAAGAGGTAGAATGTCTTTGGCGGTCTCTTTTCTTTAGGCATCCTTTGAAATATCCATGTCATGCCAAAGATTGAGCGAAGAGGTAGAATATCTCAGGCGAAACTACGTTCCTCGTACAGGGAGAAAAAGACAAACTTCTAATTGCTTGAGCAAAATAGAAGACTTAAAATTCTCATTGCAAATTTGAAAAAATACAAACTTCTCACTACAGAAGTCTGAAAAGAAACCTATTGAAAACTATTGAAAAAGAGAAGGGAAAATAACACAAGATTTGATACACACAAATGTTACCAGGGAAAAAATAAATAGAGACCAAATATCTATAAAAGGAAAAGATATTGGGGATTATAAAAGGAAAATACAAAATCTACAAAATCTACAAAATCTCCCAAATATTCTCTTTTTATTTTCAACACTCCCCCTCAAGATGGGACGTAAATATCAATAAGACCCATCTTGCTAACACATGCGTCAAAGCTCTGCTTAAGTAATTCCTTGGTAAGAACATCAACAACTTGTTGGCTAGAAGGGATATAAGGAATACAAATACTTCTATTTTCCAGTTTTTCCTTTATGAAGTGTCTATCAATCTCCACATGTTCTATTCTATCATGCTGAACTGGATTGCTTGCAATGCTAATAGCAGCCTTATTGTCACAATAGAGTTTCATTGGTAGTTTACTGTTTTGGTGAAGATCAGATAGAACTTTCTTCAACTAGATTTCTTCACAGATGCCATGACTCATAGCTCTGTATTCAGCTTCAGCACTACTTCTAGCAACCACACTTTGCTTTTTACTTCTCCAAGTTACAAGGTTACCCCAAACAAAGATACAGTACCCAGAGGTAGATTTTCTGTCGATCACTGATCCTGCCCAGTAAGAGTCTATATAGGCTTCAATGCATTTTCTGTCGGATTTTCTAAACATCAACCCTTTTCCTGGTGTGCTTTTCAAATATCTTAAAATCCTGTTTACAGCTTCCATGTGTTCTTTGTAGGGAGCCTGCATAAACTGGCTCACAACGTTGACAACATAGGAAATGTCTAGTTTAGTGTGTGCTAGGTAAATTAGTCTTCCAACTAGATGTTGGTACCTTTCTTTATTAACAGGAACTTTGTCAACAGACTCTCCCAATTTGGCATTAGACTCGATAGGAGTGTGAGCAGGCCTGCATCCGGTCATATCTGTTTCTTTCAGTAAATCAATTGTGTATTTCGTTGAGAAACTGAGATTCCTTCTCTTGACCTCGCCACCTCCATCCCAAGAAAATACTTCAGGTTTCCTAGGTCTTTGATTTCAAATTCGTCTGCCATTTTCTGTTTTAGCTTGTTGATTTCAGCAGTATCATCTCCTGATAAGACAATGTCATCAACGTACACAATCAGAACGACAACTTTACCTGAGACAGACCTTTTTGTAAACAAGGTATAGTCAGAGTATCCTTGAGTGAAGCCTTGGGACTTAACAAATGTGGTAAATCTTTCAAACCACGCTCTCGGTGATTGTTTTAACCCATACAGGGTCTTTCTAAGTTTGCACACATTGGTTAAATTGGGCTTCAAAGCCAGGATGACTCATATACACCTCTTCTTCTAAATCACCGTTTAAAAAGGCATTTTTCACATCTAGCTGATAAAGAGGCCAATCTTTGTTGACAACAACCGACAGAAGAACCCTGATCATGTTTAACTTTGCGACAGGAGAGAAAGTCTCAGAATAGTCTACCTCAAAAGTCTGAGTGAACCCTTTTGCTACAAGCCTGGCTTTATACTTGTCAAGAGTTTCGTCAGATTTATACTTCATTGTGAACACCTACTTACACCCAACTGGTTTATGCCCTTTCGGAATAGCAACGCGTTCCCATGTATTATTTTTCTCGAGAGCTCTCATTTCTTCCATAACGGCAGCCTTCCACTCAGGAATTTCCATAGCCACATATATGTTTTTCGATGTAGTTACAGTGTCAAGGCTGGCAGTAAACGCTCTGAACTTAGAAGACGGATTGTTATAAGAGAGGAAGCTATACATAGGATACCTGGTGCAAGACCTTGTGCCTTTTCTCAAAGCAATGGGCATGTCAAGGGTGGCATCATACTCTCCTGGTTTGTCGAGTTCTTCTTCAGTTGTGGAATTCTGAGGCATGATCTCATTTTCATTCTCTTGAACTGTTGTTGACACTACATTGCTCTCAGCAATCTGGTTATTTTATGTCATATCATCTCTATCATTTTCTACCGGCAATTTTGTCAGATCAACAATATCATTTTCAACACAAACATTTTCAGCGCAAACAGTATTATTATTAGGGTCAGTAATACCTTGAGCCTGTGTTGGTTCAGAAGATTGGACCAGAGCCGGCATGTTAGTAGGGGCCATTATTTCCTTTCTAAGATTCTTCCTGTAGTACGTTATCCATGGGACCTGTCTGGTGGGTAGGACAGTGTCGTGGGTTGTCAGGATGGGTTCAGGAAGAGGATTAGGATAGTTAGTTTCTTCATTACTACTCTCCCCTTGAAGAGGACTAACGGGAAAGAAAGGTTTATCTTCCAGGAAGGTGATATCCATAGGGATGAAATATTTCTGGGAAATGGGATGGAAGCATTTATAACCACGCTGGTGGAGAAGATACCCAACAAAGACACATTTCTGGGTACGAGGGGCAAACTTAGTCTGGTTGGGACCGAAGATATGGACAAATGCAGTACACCGAAATACTCGGAGAGGGACATCAGGTATAAGGCGAGTGGTAGGGTAAGACAGTTTGAGACAGTCAAGAGGAGTTTGGAAGTTGAGAATACGGGAAGGCATCCTATTTATAAGATGAGCTGCAGTAAAGACTACATCCTCCTATAGGTAAGACGGAAGAGAGGTCGACAACATGAGAGACCGAGCAACTTCGAGGAGATGACGGTTTTTTCTTTCAGCCACTCCATTTTGTTGGGGTGTATAGGCATACGAGCTCTGGTGAACAATACCTTTAGTGGATAAGAACTCACGAAGGGTATTGGTGAGGAATTCACTATCATTGTCACTCTGAAAGATGACAATTTTGGCATTAAACTGAGTTTCAATGGTGGTGTAAAATTGTTGGAAAGTGGATGAGACCTCAGACTTATCTGTTAAAAGGAAGACCCAAGTAAGGCGAGTGTGGTCATCGATGAAGGTAACGAACCAATGCTTACCCGAAGAAGTGGTAATCCTTGAGGGACCCCAAACATCACTGTGAATAAGAGTGAAAGGTTGAGAGGGTTTGTAAGGTTGGGACGTAAAAGAGACCCTATGTTGTTTCGCTCGAATACACACATCGCAAGATAAAGAAGAGATGTCAACTTTATTAAATAAATGAGGAAATAAATATTTCATATATTGGAAATTTAGGTGGCCAAGACAGAAGTGCCACAACATACAATCATTTTCAGAAGTTGAAAAATAGGAAGATAACAGACTAGCCCTATAACTATGCCTAGAGGAAGTATCACCATTAAGGAAATAGAGTCCCCTATTGTGCTGGGCAGTGCCAATCGTCCTCCCCGAGCTCAAGTCCTGAAAAATAACATCATCTGGTGAGAAAGCCACACGATAGTTTAGATCTCTGGTTATCTTACTCACAGACAGTAAATTATGAGAGATTTTAGGAACATGCAGCACATTCTATAATATCAAACTATCAAATGGAGAAATGTGACCCTTGCCGGCAACAGGGGCAAGTTTCTTGTCAGCAATCCGAATTTTTTCATTACCAGCACATGGATGATAAGAGAGGAAATTGTCAGAAGTTCTAGTTAGATGGTCTGTAGCTCCTGAATCAAGAATCCAGGATTTCTTGCCAGTAATACTGAGGAGACTCAAGGATTGAGAAATACCTGATTGCGCAATCGCCCTAAGAGAGGAAATACCGGTGTTAGCTGGGCTGTTCTCCTGATGTTGTGGCTGAGAGACACTAGTAGTCTCACTCACCAGAGCCTTGTTGGGTTTGTTGTTTGGAGGTCGTTGTTTGCCATTCGGGGCTGACCATGTAACTTCCAG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ATGATTGCGGAACTGGGGATTGACGCATCCACTTCTAATGAAGCTACCACCTTTCGAGACAAAGGTCATGCTAACCTGACAGAAAAGTTGACACAAATTTTGGAGGCAGAACGAGAGTCTCAAGGATCTTTCCAGGTACTACCCTTCCATTACGTGGAAATATCAAAACTTCTTTTCGACCATGCACGAGATGACGTTCCTGACATGTATTTGGTGAGGTCTCTTATTGAAGATATCAGGGATGTTAGGTTTCACAAAGTTGAAGCGAGCTTGGGGTCCATTGATACACGCACATCTGCAGTGAAGATTAAAGATTTATCTGCCATGGAAGTGAATATAGTTCGACCGTTCGTCATTAGAGCGCTGCAAGCAATTTACAAGCATGGAAATCCAGAGTTGGTCCCAGATCAAGATAGGATGACCAATGTGCAGCCACAAGGACATGATCATGGACAAAGATATGTTGTCCTTATGGTCAATTCTGATAGAATCGAGGCAAATAATCTTTTCTTAGCTCATGATGGGTACCATTGTATAAGCTGTGGATGTGTTACCTTTACGTATTGGGGGAATAATATGCTTTGGTTGAGCATATCAATTGATGTATTTCGTTCAGAAGTAGTTATGGTGTGCCAAGCTGCAACCCAGACAAGATTTCGGGCATTGAAACATGAGAATGGAATTGCAGGAAAACCAACAATTATAGTTAGAGTGATCGCATGCTTTCAACCTTTGCAGAATTGTCAGGCTGAGTATTTTCGACATTTGCTTAAGCCTGTCACGTGGTTGTTTTGCTGGATGGTTGGGGCTGATAACTCTCGGCTTGATTTTGAGCATTTTGCTTGGCAACTGCACAATCATAATTCCATGAATGCATCAGTAGATATCAAGCAACAGGAAAGCTTCCAAATGAATACCAACCGTGGAAATTGCATATTTTCCACATGTGTGGGAGGAATGCAAGGGTTTGCAATTCCACCAATACCCAGTTTTAAAGTGGAACACCTAAATGTTGTCCAGGGATCACGTCAGTGCTTATCCCCTCATTTCCAGAACTCACTTGGTACTCTCATGCCTTGTCAGAAAGAAAAGGAATCTATGCATTATGCTCATGCTGGCCCTAGTGAGATGCTTGTGTCAAAATCAAATAATGAGTCCTATCCGAAAGGTTTTCTTATCTTTGATCAATCTGGAAACCAGAAAAGATTGATGTATGCTCCTATGTGTCCTGTTTATATCCCCTCAACTGTTGCTGAAAACAAGCGTTGTGGTTGGCTTGAAGAAGAAGGGGGAGCTGGGGACATTAATTCGGTCAAGTATTTTCCAAATACTCTGTCCAGTGAGAATAATGTAGCTGATGGAGAGAGTAGTGAAATGCATGAAGACACGGAAGAAATAGATGCATTACTTTACTCAGACTACGATGGGACTGGTTGTAGTAGTGATGATGAAGTGACTAGCACAGGGCATTCTCCAGAGATGATCAATGTGCATTGTGAGAAGGAAGAACAATGTCAAGAAACTACTACAGAAGTTGCTAGTTCTGATGGCCCAAGAAAAAGGCAGAGAGTTAATGATGGGGGCTACATAAAATCACTGCCAGTTGCTACGGTTTCTTGTGCAAGAGTTGAATCACAGAACTTAGCCAATGATGCGGAATCAAGCTGTGGCATGGTCCATAAGGAAGAGGCTGGAACAACAGATGTTGATTTTTGCAATTCTTCTTCTTGCAAAAAAGGCAGGATCAAGGAGACGCTGAGAGTACTTGAGAGTTTAGTTCCTGGAGCAAAGGGCAAGGACCCAGTGTTGGTTATTGATGAAGCTATTAATTACTTGAAGTCCTTAAAACATGAAGCTACCGCTCTAGGTGTGAGCTGCTATTAG MIAELGIDASTSNEATTFRDKGHANLTEKLTQILEAERESQGSFQVLPFHYVEISKLLFDHARDDVPDMYLVRSLIEDIRDVRFHKVEASLGSIDTRTSAVKIKDLSAMEVNIVRPFVIRALQAIYKHGNPELVPDQDRMTNVQPQGHDHGQRYVVLMVNSDRIEANNLFLAHDGYHCISCGCVTFTYWGNNMLWLSISIDVFRSEVVMVCQAATQTRFRALKHENGIAGKPTIIVRVIACFQPLQNCQAEYFRHLLKPVTWLFCWMVGADNSRLDFEHFAWQLHNHNSMNASVDIKQQESFQMNTNRGNCIFSTCVGGMQGFAIPPIPSFKVEHLNVVQGSRQCLSPHFQNSLGTLMPCQKEKESMHYAHAGPSEMLVSKSNNESYPKGFLIFDQSGNQKRLMYAPMCPVYIPSTVAENKRCGWLEEEGGAGDINSVKYFPNTLSSENNVADGESSEMHEDTEEIDALLYSDYDGTGCSSDDEVTSTGHSPEMINVHCEKEEQCQETTTEVASSDGPRKRQRVNDGGYIKSLPVATVSCARVESQNLANDAESSCGMVHKEEAGTTDVDFCNSSSCKKGRIKETLRVLESLVPGAKGKDPVLVIDEAINYLKSLKHEATALGVSCY Homology
BLAST of ClCG10G009540 vs. NCBI nr
Match: KAG6576874.1 (Transcription factor basic helix-loop-helix 143, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 703.7 bits (1815), Expect = 1.4e-198 Identity = 358/430 (83.26%), Postives = 374/430 (86.98%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009540 vs. NCBI nr
Match: XP_038903965.1 (transcription factor bHLH143-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 631.7 bits (1628), Expect = 6.7e-177 Identity = 315/362 (87.02%), Postives = 333/362 (91.99%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009540 vs. NCBI nr
Match: XP_022922510.1 (transcription factor bHLH143-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 606.7 bits (1563), Expect = 2.3e-169 Identity = 307/362 (84.81%), Postives = 323/362 (89.23%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009540 vs. NCBI nr
Match: XP_022984572.1 (transcription factor bHLH143-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 606.7 bits (1563), Expect = 2.3e-169 Identity = 307/362 (84.81%), Postives = 322/362 (88.95%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009540 vs. NCBI nr
Match: XP_023552238.1 (transcription factor bHLH143-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 602.8 bits (1553), Expect = 3.3e-168 Identity = 306/362 (84.53%), Postives = 322/362 (88.95%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009540 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9C7A8 (DNA replication complex GINS protein PSF2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=GINS2 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 165.6 bits (418), Expect = 1.8e-39 Identity = 89/137 (64.96%), Postives = 106/137 (77.37%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009540 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FMF4 (Transcription factor SAC51 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SAC51 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 130.2 bits (326), Expect = 8.3e-29 Identity = 111/311 (35.69%), Postives = 153/311 (49.20%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009540 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FY69 (Transcription factor bHLH143 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BHLH143 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 129.8 bits (325), Expect = 1.1e-28 Identity = 117/337 (34.72%), Postives = 166/337 (49.26%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009540 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FGB0 (Transcription factor bHLH145 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BHLH145 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 95.5 bits (236), Expect = 2.3e-18 Identity = 73/242 (30.17%), Postives = 115/242 (47.52%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009540 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ASX9 (Transcription factor bHLH144 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BHLH144 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 67.8 bits (164), Expect = 5.0e-10 Identity = 62/237 (26.16%), Postives = 92/237 (38.82%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009540 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J2I7 (transcription factor bHLH143-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111482828 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 606.7 bits (1563), Expect = 1.1e-169 Identity = 307/362 (84.81%), Postives = 322/362 (88.95%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009540 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E8Z4 (transcription factor bHLH143-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111430490 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 606.7 bits (1563), Expect = 1.1e-169 Identity = 307/362 (84.81%), Postives = 323/362 (89.23%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009540 vs. ExPASy TrEMBL
Match: B7SHL0 (Putative transcription factor OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G113170 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 584.7 bits (1506), Expect = 4.5e-163 Identity = 291/356 (81.74%), Postives = 311/356 (87.36%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009540 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3C6Q0 (Transcription factor bHLH143-like isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold544G00320 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 574.7 bits (1480), Expect = 4.7e-160 Identity = 291/361 (80.61%), Postives = 314/361 (86.98%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009540 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CHY7 (transcription factor bHLH143-like isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103501164 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 574.7 bits (1480), Expect = 4.7e-160 Identity = 291/361 (80.61%), Postives = 314/361 (86.98%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009540 vs. TAIR 10
Match: AT3G12530.1 (PSF2 ) HSP 1 Score: 165.6 bits (418), Expect = 1.3e-40 Identity = 89/137 (64.96%), Postives = 106/137 (77.37%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009540 vs. TAIR 10
Match: AT3G12530.2 (PSF2 ) HSP 1 Score: 165.6 bits (418), Expect = 1.3e-40 Identity = 89/137 (64.96%), Postives = 106/137 (77.37%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009540 vs. TAIR 10
Match: AT5G64340.1 (sequence-specific DNA binding transcription factors;transcription regulators ) HSP 1 Score: 130.2 bits (326), Expect = 5.9e-30 Identity = 111/311 (35.69%), Postives = 153/311 (49.20%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009540 vs. TAIR 10
Match: AT5G09460.1 (sequence-specific DNA binding transcription factors;transcription regulators ) HSP 1 Score: 129.8 bits (325), Expect = 7.7e-30 Identity = 117/337 (34.72%), Postives = 166/337 (49.26%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009540 vs. TAIR 10
Match: AT5G50010.1 (sequence-specific DNA binding transcription factors;transcription regulators ) HSP 1 Score: 95.5 bits (236), Expect = 1.6e-19 Identity = 73/242 (30.17%), Postives = 115/242 (47.52%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (Charleston Gray) v2.5
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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