ClCG09G002220 (gene) Watermelon (Charleston Gray) v2.5
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GAAGGCAAAAGAGAAATTAATAGAAACCCAGAAAGGTGAGAGAGTTTGGGAAGTTAAGGTTGAAAAGAGGAAAAATGAAGTCAATTTTGGTATTTTGCTTGGTCGTGAGCTTAGTAGTTGTAGTGAAGTCGGAAGGCGCCGGAAACGGCAACGGCAACGGCGGCGGAAGTTGCTATTTAAGCTGCATACTGAATGACTGCCGAAAGGGTGTGTTCCAATGTGCAGTTTGCATCGGAAAATGTGCAATAAACTTGGAGTCTTACTCAATGAAGGATAGACAAATGGACAATCGTGACTTCTGCAAGATTGGCTGTTCCACTTCTGTCTGCTCCAAGTTCGCCATCTCCGACAACCAATACTCAGGTCATTCTTTCTTAAACTTCTAAGTTAAACACTATGGTATTAGACCAACTGTTCCTACTCACTTACTCTCTTCATTAATTTTCATTTTCCACCCTACATGTGAGTTGTTAGTGCATGTTTTCGAGAGATTTTTAAATTATTAAAAATCATTTTTTTCATATTTAAAATCACTTCCAAAACACAGTTTTAGTGTTTGTTTGGTTAAAATTATTTTTTGATGTAATTTTTATATGATTAAAATTATTTTAAATGATTAAAATTGTTTTAACAGTGATTTTGAACTTAACAAAAATTATTTTAATTATTTCAGAATCACTTCCTAATATGACATTAATTAGTCAAAATTAATTTAATATTTAATTTTACACTTTTAAATGTAATCTTCATATCATAAAAATTAGTTTTTGAAGGATTAAAACCATGTTTATTTAGAGTCATTTTGAACATGACAAAAGTGATTTTAACGATTTTTCACTTCTCTCATTTCATCTAGTGAATATCTTTTGATGTGTAGTATAATGAGGTTGCCTAGGGCATGTCAACCTAGTTGAGATATTCCAGTGCTAAAGACGTGTCAACCTACTAATCTCTCGCCCTTGTATATTGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATCACACTCAAACATGCATGCCTAGAGTATCGATATAATAAATTTATCTACATCGTCCATATAGCTTAAACTTTTGGATTAATCATTGATTTAACAATCCTCGTCTAATTCCTACACATCTTTTCACAACTCATTTTGGTATAGGTTGCTCAATCACAATGGCAAACTCTTATTTATATATATATATATTAAAAACTTTTTTACTATGTGGTTGGATGGAGCTACAAAGAGATAAGTGTAGCTTAAATACATCCAAGTATTTATTCTTAATTTACTTTTTAATATCTTTAAATTTGGAGAAGTATAATTTTTTTTTATATATTATATAATTTTGCCTTTATGTACTCTAAAAATAGATGTTTTTTATTTATTTATTTATTTATTGTTGTTGTTAACGTGGCAGATGAGAGGGAAGTGAAAGCTTGTCTGAATTCGTGCAATCAAAGATGCACGGACAGTATGTATTAAGGAGAAGGGCGGAGACGGAGGAGGCTGGGATTGGCTTTCAAATATACTATGAATAAATAAATGTCAATATTGGTGTTAAAAAACCATTATTTGGCTATAATTAAGCTAATCCCAGATTAAGTTATGATATGTACTTTCAAGTTTCTACCTATACCCATCAATAATTAATATATGTGAAATATAGGGTTGCTTTATCCTATATGCTTGTGTGACAAATATTGCCAACAGTTCAATGTCCATGCATTATTATGTTCAATTTTAACCATATATAATAATTAACACTCACTAATTTCAATAATAATAATAATAATAAAAAGATTAACATGAAAAGCTCCCAAAACCCAACAACAAGATTCAAGGATGGAAATAATGTTACACCGAGAACAATCATGAAAATCATGGAAACGAAATACAATGTGGATTAATAGGCACACTAGTATTAGGTATAATTAATATTCTTTTATCAAAAAGATTATAAACATAATTGATTTTTGTTTGCTACATAAACCTCAAAAAAGGGGGAAAAAACAATGGTTTTTTAAAAATTCAAGTTGTAAAAGCATCTTTGGGTGTAATTAACCTACAAATATTTAACTATCAAAAACATGTGAGTGAATTAATTTGAGCAAAGATTGACCAAAGGATAAAACTTGAGACGCGTGTGTTTATGTTTGAGGTTTAAACGGATGGAAATTAAAATTTTAGGTTGAAAATTAATATGTCATGCCAAGTTTAGGGTGTATATCTTGGTTTTTTTTCACAAAAGTTTATATAACTTTGTTATAATTTTCTTTTTTTTAGAAATAAACATGGAAATTATAGAATAACATTTTAGAGTATATATATTCAAATATAGTTGGAGTAATTGTTTTAAATGACAAAACTACTGAAAATATTTTCAAATATAGTAAAATTTTACTATCCTATTGGTGACAGATAATAATAATTGATAGTAGTCTATTCGTGTCGATCACTAATAGATAGTGTTATTTTACTATATTTATAAATAAATTGACTTATTTTGTTATATTTAAAGGCAACAAAAAGACATGACTAAAAATAATTGTCCGAGCAATAATTTGGTGTGAGTTGATGAATTGGGGTTATCCAAAATAAAATTGTTACCCCTTTTAAATAATATGGTACTAAGAGGTCTCCAAAAAGAAAAGAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAATCAATGTGCTTAGTGATATATATATATATTATTTGTGTCATAATCGCAATCTATCGAGTGTATCTTGTAAATATTTTCAACAATTTTTTTATTTAAAATAATTTTCATATATATATATATATAATTGAAGTAATTGTAAGGGCAACTTGGTGTAAACTATAAAAAATTGTAATTATTTTTGGGCACAAATTTATTGGTGTGGGTAGTACTGTTTTATGATTAGTATTAGTTTTGAAGATAATAGTTGAAGTACAGTATAAACGTTCTAGAGATATATATAACTTTCAACTTTCAAGAGTGTCGGGTGGGATGACACTTGTAAGGTCGAGGGTCTACTGTCATATTATTTTAATTTTTAAGACTAAAATTATATAAATAAGGACATAAACTTCTTATACTCTAATCATATCCAACCAAGAAATTTCTCAACATCCTTACCTTTCTACCATTAATCATTATATATGGTTCTAAATTCTATGTGATAAGCATAACATCAACAATACTATCGAAGTAAAATGTGTTGGTCCATTCATTGGATGGAAACAAATAATTGTTTGTTGGTCATTCAACTTACTATTTGTTAATCGTTATTTGAATTGAAAGAAATAATTGATCAAGCACCCTTCAAGTTTAAGAAAGTGCTTGTAGTTTGGTGGGCTTCTTGAAACTAATCTTCAAAAACTACAGTTCTTATCGCTATTATGCTCTCATGTAATTTCCTGCTTTCCTTCTCATTTTCTTGTTGATGGCTTCTCTCCAGCCTTTGTTCTGTATGTTCTTACGAGTTCCTCCCTAGCTCTTCCCAGTGCTGATTTTGTGATATCAATATATTGGTATGGAACATGATGAGGGTACTAAAAATGTGTCAACTTAGTTGAGATATTATGATGCACCTACTAAACTTTCGGATCTCTAATATCTTTCTCTACAAAAATCATTAAAGAATTTTTTGAGTTAAGAGAAAAGTAAATTTAAATTCGATTTTCATAGTTATATCTTGTATGTACAATATTTAAAATGCAGCATATATTACAATTTAAACTTTATTAAAACAAAATCAAAAGACATCGCTATAACTATATGGATACAAACTATATTGGAATCCAAGTAATGGACCATTAGTTCTAACTAGTAATGATCAGAAGGGGTTAGTGTAATATATATATATATATATATATATATTTTACACAAAGGTACTTCTTAACAAATGTGAATTTAAGGTGGTTTACAATTTACGGGAGCATATATACCTCAACTAATTAAGATGAGTGATGAGCTTAAAATCTCCTTAATTTCTACATCTTTCTCCAACTAAAGAAAATAAATCACTAAGGTGGTTGGTTGTATGAGTCAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTCTTAAAGGTGATATAAAATATTTACCAAAAGGAACTTCTTAACCTTAGGTCAAGACCCAAACAACACAAAACCAAATTAAAGTACAAGAGCAAGAGCTCACACACAAACCAAACTACTAAAGCAAAGACTCAAACCAAAGGACAAGCAAGCTAGAAGAAAGCATTCAAGTCACAAAATAAAATAAATAAATAAATAAAAAAAGAGGAAAAAAAACTTAAGTGGCCTTTGACAAGCCAAGGGGGTGTTTGAGGTCCACCAAGAGTTTAGACTCATTAGCTATAGAGTGACAATCTACCATCAAAGAGGAGAGACATCATCTTGAAAAAACAACACCAAAGAAAAGAGAAGTATCTAGAGTACACAAGGACACAGACACTTGAGACGCCACCGGATAAGCCACGAGACAAGACTCAAGAACAGTGCCCCTAGGCCCGCTACTAAAAGACCTTCAAACAAATAACAGCAAGTACTGTTCAAATAGAAGAGAAACAACCCGACAACGTGACCCGTCAGATAAAGGAATTTGATAATTTTGAAGGCACAGTAGGTATGTAAGGGAAGTGGGTATTTAAGAAGGTGATTATGATCCCAAAAGAAGGCAAAAGAGAAAATGAAGTCCATTATTGTAGGTTGGTTTTGGTTATGAGCTTAGTAGTTGTAGGAAGGTCCACAACAGGCACAGAAGACCTGAGCAGCAGTAGTTGCTATATGAAGTGCAGGGGTGAATGCCTAATAGGTATGGTCCAGTGTGCAGTTTGCCTTCCACAATGTGCAATACAATCCTCCTCAATGCAAATGAACCAAATGGACAATCACTACTTCTGCAACCTTGGCTGTTCCAAGTTCATCAACATCCAAAACCCACCTCACTTCTCCCTCTTCATCTTCTTTGACGGTTGGAATGAGCGGTAAAAAGATTCATTCAAATTTACTTTTCTTAACTTACATTTTAATTTC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MKSILVFCLVVSLVVVVKSEGAGNGNGNGGGSCYLSCILNDCRKGVFQCAVCIGKCAINLESYSMKDRQMDNRDFCKIGCSTSVCSKFAISDNQYSDEREVKACLNSCNQRCTDSMVQCAVCLPQCAIQSSSMQMNQMDNHYFCNLGCSKFINIQNPPHFSLFIFFDGWNERAEDSGFSGVGKGGDSTVSGGIDCLVMCGLICLTGPVKCALCIGKCLIFPVGSNQGDNLSFCKLGCATSRCTKFLTNGHPVAGRSTASFGKCYAKCFVVCAITPGIPIGTCGAKCLADCLFIASSPMDFNHMDTHYFCKLGCATSLCTKFSTKKDPVAGRSIAAFRDCYSKCFDECAAKTPFIALHICAAKCMGECLINPPSPMASNHMDTHYFCKLGCATSLCTKFSTKENSG Homology
BLAST of ClCG09G002220 vs. NCBI nr
Match: KAG6575552.1 (Thionin-like protein 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 214.5 bits (545), Expect = 1.6e-51 Identity = 101/158 (63.92%), Postives = 116/158 (73.42%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG09G002220 vs. NCBI nr
Match: XP_008461038.1 (PREDICTED: beta-hordothionin-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 169.9 bits (429), Expect = 4.6e-38 Identity = 80/127 (62.99%), Postives = 100/127 (78.74%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG09G002220 vs. NCBI nr
Match: XP_038899787.1 (thionin-like protein 2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 165.2 bits (417), Expect = 1.1e-36 Identity = 74/92 (80.43%), Postives = 78/92 (84.78%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG09G002220 vs. NCBI nr
Match: KAG6575557.1 (Thionin-like protein 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 164.9 bits (416), Expect = 1.5e-36 Identity = 82/158 (51.90%), Postives = 96/158 (60.76%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG09G002220 vs. NCBI nr
Match: XP_023000407.1 (thionin-like protein 2 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 158.3 bits (399), Expect = 1.4e-34 Identity = 69/92 (75.00%), Postives = 76/92 (82.61%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG09G002220 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A8MRP4 (Thionin-like protein 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g12663 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 52.8 bits (125), Expect = 1.1e-05 Identity = 32/87 (36.78%), Postives = 42/87 (48.28%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG09G002220 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CDB8 (beta-hordothionin-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499744 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 169.9 bits (429), Expect = 2.2e-38 Identity = 80/127 (62.99%), Postives = 100/127 (78.74%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG09G002220 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KC18 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G446640 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 160.2 bits (404), Expect = 1.8e-35 Identity = 71/76 (93.42%), Postives = 74/76 (97.37%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG09G002220 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KDK0 (thionin-like protein 2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111494667 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 158.3 bits (399), Expect = 6.8e-35 Identity = 69/92 (75.00%), Postives = 76/92 (82.61%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG09G002220 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DDL8 (thionin-like protein 2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111019402 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 141.7 bits (356), Expect = 6.6e-30 Identity = 68/96 (70.83%), Postives = 75/96 (78.12%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG09G002220 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A061GC54 (To encode a PR protein, Belongs to the plant thionin family with the following members:, putative OS=Theobroma cacao OX=3641 GN=TCM_028663 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 124.4 bits (311), Expect = 1.1e-24 Identity = 71/157 (45.22%), Postives = 86/157 (54.78%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG09G002220 vs. TAIR 10
Match: AT1G12663.1 (Predicted to encode a PR (pathogenesis-related) protein. Belongs to the plant thionin (PR-13) family with the following members: At1g66100, At5g36910, At1g72260, At2g15010, At1g12663, At1g12660. ) HSP 1 Score: 52.8 bits (125), Expect = 7.7e-07 Identity = 32/87 (36.78%), Postives = 42/87 (48.28%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (Charleston Gray) v2.5
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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