ClCG08G006090 (gene) Watermelon (Charleston Gray) v2.5
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCACTGCAGAGACTTGTCGGGCAACAATCAGGTGCTACCCCAACCAGGTTGGATCTCCGACAATCCGGCCGTGGTCGGCGCCGACGAAATTGGGTACAGAGGCGCCGGAAAAATGAAATCTGTGATACCCAAGAGGAGGATGTTGGTGAAGACGATGATTTACAACTCTATTAAACATTGGATCATATCTTTCTTTCACAACCGCCACAAACCCATTTCCCACCACTTTTAATTATCTTCAATTCACTGCTTTGTAATAAACCCTTCTATCTTCTTCTTCTTCATGTTTTTGTTTTTGTATAAGCCTCTGTTTTCCTTTGTTTCATCTGATCACTAACAAAACAGAGCTTTTTTTATTTTTTTATTTTTTATTTTTTATTTTTTATTTTTATGTGATGCATTAAAGTTCTTTGTTTCTGCGTGATGAGTGGGTAATTGGGGTTCGTAATTGGGCGTTGTTCTTATTCAACCCAATTTAGAAACAGAGACTCCCCAAATCCGCCGGGAATTTTTCTTTTCCTAAAATTTTAATCTAAGCTATTTTTGTTTTATTTTGAATTTGACTTTGACTCAACAAGAAAACTTTGGACTCAAAGCCACATTTATTAATCCGTAATGAAAATTGATATAATCGTAATTGAATTCTATTCATGGATTGATCGTAATGGGTCATAATCTCAAACGTAATTAGATTGTCTTTTTACACGTTTATTTAGAATTATAAATTTATTGTATTTTCTGTTACAGTTGTTGATTGATTCTAAACATTAACAATAATTGTAATAGTAAATGTGAAAGGTTCATATTTCTCATATGGTAAGAATACACTAATGATAATAGTAACAGTAACGTAATTTTGGTATGCAAATAGATTGATTATCCTCCACTTGCCAATCGGTTTGCATTTCTTTTTTTTATTATAGAGGAGTGGGTTGCACGTGTTAGTAGAAGTACTAAATACAAAATAAACAACAACAAAAGTTATTCATTGGGGTTCACTTTTCAAATTATTATTCATTTATTACTTTTCCCATTGTGTAAACATGGTCTCAATTCTTTAACCTCCAAAATCATGAAGAAGAAAAAAACGCTTCATAGCCATTTATCTTTTGGTTTTTAGTTTTTAATTCTTAAAACTTAAGTATAGAATTCTACTCCTAAATTCTATATTTGATCATCTCTATTCCATTAATGTTGTTAGAAAATCAAACTAAATTTTAGAAACTAACAAAGCAGTTTTGAAATTTTTATTTTTATCTTAGAATTTAACTAGAAATTAAAGTGTTTATTTAAATTTAATAGAGGTGAAAATCATAATTAAAAACCCAAATTTGAAAACAAAAATGAGCTAAATTTTCTGGTACCAAAATAAACATTATTAGATAAAGATTGCCAAATTCATATATCGTGGTAAGCTTTGGGGGGATTACAGTCGTACAACAAAAGAAACAAATAAGTAATTAAATATAAAATACTAATTAAATCTTAATAAAAGTACACAAATTATACTAATACTAATAATAATAATAATAATAATAATAAGAAATCAAATGTGTAATAAGAAGTGTATAGCACAAACGTTGGGCTGCTAGTGTCAAAATTGGGCCCGCTTTGTGATCGATTGAATACCCATCACAATCATCATAATCTAACCTTTTATTTATTAAAATTTAAAGTTTGTGGTAAAAATTTGCTTACCATGTGTAAATTGTATCACTTGTATCTGCATAAATACCATTGAAATACAATGTATTTTTTTGGATTTGTATCATTTAGGGTATATTCACTTTTAACTTTTGTATGTGTTTATTTATTTATTTATTTTTGTTAAAAAAAAATTAGAGAGTTCAGCAACCATTTAAAATAGCTTTTGAAAATTTGAATTTATGAAGTAAGTTGGTTTGATAAAAACATGTAGAATAAACTTTTAGAAAAATGATTTTTTGAGTGTTGTTAATCTCTCCCTAATTTGTATAATACATAAAATTTATCAAAATACTCTCACTAGTCCTCTACCTCATTCTACCATGGTTGCTGATAGTGATCGCCCAAGGTTATCGCTAGGGGTGGCAGCCGACAACCAACTGCGGCGGTCACTACTACTAACTCTAGTGGCCACCTCGGATGACCACTTTCAACGATCTAACCCTAGCGGCCATTGTAACGACCCTCTCCGACAACGAACTCCAACAACGACCACATAGAGTCTTGCATCTTTCTACAACGGAAAAAACCCAGAGGTTATTTGTATTCCTCGAAAACCCCCGCCTACATCACCATTCAATATTTCTTAGCCCAAGATTAGTTGGATTAGCCCACTTTTCAATAGGTTATATATTTACTTATGCAACTTTCTTGATTGCCTCCACACCAAGCAAATTTAGTTAATTTTGTATGTGTTGTATCCTCAAAAATATCATTTCTTTCGATGGAGAAGGGGATCTTCTTTCTTATATTTCTACATCTAGGATCCGACTTGTATCATTGATACTACTCGGAATTGAATCATTATGGCAAGGAAAAGTTTAATTAAGAGAGAAAAGAAGAGGCAAAAATTGGAACAAAAATATCATTTAATTCATTGATCCTTAAAAAAAGAAATAAGCAATGGCCAACTTTAAAGAGCAACTGTATCGATTATCTCCAACAAGTAACACAACTACTAATTCTAATAACCAATTAGATTGGTAATATGCTAAAATAGCTCGACTTATAAATGTGTTTTTAAATTATTAGTTTATAGTGTTTAACAGTTGTCTTTTATAGTAGTTTAAAATTAATTTTAAAAAATAAAAAAATAAAAAATAAAACTCTTTTAGTATATAGCAAATGAAACAAAGTTGAGTATCAAAACACTCTTGAGGAAGTGTTAACAAACACACGAGTATTTTTATTTTAAACAATTCATTTTTATTTTAAGCAAATGAAACAACAAGTCTTAGTCTATGATGTATGTGGCTCCAAGTTTCTTCAAAAATCCCCGGGGTTACGATTGATTTTATTGTTTGTTTCATTGTTATTTCTGAGTTGGCCATGATATTTTCTTTTACCTTATTGTTGCCATCTTTAAGGCGTGGCTAAATTATAGGAGATCATTGATTATTTGGCATTATGATTCGTTTTGTCTCTCCGCTTTTGGAGGTGATCCTCGTTAATTGATTGCGTGGTTTTTTCCTTGTTTGGATCTTTTGGTTAGTCGACACTCTTGTCTTTTAGGTCAAGTTGTCGTCCTTGACAGACACACTTTTTGCTGATAGAGAAGAGACTTCGTGTGAAGTGTTTTGTTTTGTCACAATTGTGCCTATATCGTCATATCGAACAACTAAGATGAATGTTTGGTGTGCTATTGTTGTTGTTGCTGTCCTGTTAACGTGAATGGTGGTTAGTAAACGAGAATCAATCACCGAATGAAAAGGTAGAAGAGCAAAGTCGAGACTACATTAGATTCAAGGGGAGTCGAGTCTTAAAGCTCTTCTAGAAGGAGGTTTGAATTCAGGGGAGCCTGATACTCCTCACTAGATAATCTTGTCAAAATATTACTCATGTACGAATAGTTTGAGTAAAGGTGTAATCATAAACTTTATCTAGTGAATTTCTTTCATTCGGGCAGCTCGCCTGCCAAACGTAGATGCGGTTACAACAAACTAGGTTACGAACTATGTGTGTTATTTTTTTTTCTCTCTCTCTCTTGTTATCATTATTATCGTTAACATCATAGTAACTTTGTTCTCTAGTTGAGATCCGCCTAATTTCATTCATAGACACAGATAACCTGCTCTTAGCTCACCCTACTCTCTTGAGGAACTATCAATCGTTGCAATTGCTTGTTGGGCCATCTGGATAGATAGAAATATAGCTAATCTTGTCTGAATAAACCCACCCCGACTGCTTACATGAAAGTCAAATGGATCTTGAATCAGTTTTAAAGGAATTTTTGAATTCCTGAGCTCATAGCAAGTCAGAGTTCTATGACCTTGCTCCCTCCCTCAGCTCATGTTTCTCCCTTATGGAAACCACCTTTTTATTGGCTATCTCATATTAAATGTTGGTGCGGTGTGGAGCTCTTTTCCCTCTTCCTCAAGATTAATTGTCATAATTAGAGATTCTGCTGGTTCCTTGAAACTCATGGTTGTTCATTACTAGAATTTAGCTTATGAATCTCCCCTTACGGAAATCCTTGTCATTGCCCAACGAATTCGTCTTGCAGCTTCCCTTTCGTGCCCTAACATTGTAAGGAATTCGTTTTCTTTCTTATATTCTTTTCTAGATTATTCAACCACCCTTACATTAACAAACTTTGTACAAGCATGTTATATATTGTTTTTTATATTGCCATGTTGACAGTGTATTAGCAACAATAATGCTCTTTACATGTTTAAGTTGTTAGATTGGTGTGGTACATTAGAGGTAGTTTCTGAAGGTTGATGGTCTTCAAATGATCCAAAAGTTCTTGTCATCATCTTGGTCCACGAGTAGTGAGAGTTTGGGTAGACTTGCCAATAAAACATAATGCATTTTTATGGAGGTCAAACTTAGAAATGACATACATAGAAGATGCAATTAATCAGTAGTATAGTTGCATGGCCATCTAACAAAGTTTTAATTAATATATTTATCCATCGATTATTTTATTTCTTTATTTTAATAACTTTACTTGAACTTTTTATTACTTAACATTTTTTTTTTTTTTTTGTAGGTTGATAAAGGACTATTAGTGCATGCATCTCCAAGTATTTTGTGGTCAACCACAAACACAATTAAGTTGGTGTTATTTTGGAATTTGTTATCAACATGTTTTGTAATTTATAAATTTATTTTCTATTTTATCTCCAAGTTTCTAGTACTCATTACTATATTTCTTTTTTGTTGGGATATATGACTCTTGCATTGAAGGCTTAATTTGATAATATTTATTTTGAGATTATATAAATATAATTTTATTTGACTTCTAATGTGTAGCAATGTATGAACATAACAAACAATATATAGGATTATGAACATATTCGAGAAGTTATAAAATATGCAACATAGGATTTATTAAACCTATAAAAAGCTAATATATACTATTAACTAAAAACTCATTTTGACGATAAGCCTTATTATAGCTTTCATTAAATAAATAATTATACTTGCTATAATAGACAAATGATAGCCACATATTTTTGCTATAAAAGTACTTTTATAGCTTTTACAAAAATGCTATCTTACTTATTACAAAGAGAAAATGTGCTATTTGAAACTTGTATTTAAAGCATTTAAAGAACGCTAAAAAAAGAAAATCAAACAATTCATAGCATTTAGCAACTGCTATAGAAGAAAACTTTCTATAACATGTAACACAACGTTGTAAAAAGTTGGTCTTTTCTATAGCGTGGGTTGTCACGACTTTAGACCAAATGCTATAATAGACTAATGATAGCATTTTTTCGAAAGTATAGTAGACCTTTTTTCCTGTAGTGAAGCTATTAAGCTAATTTCTGGAGTTGAAGTTTGTCTTAGCCAATTGCCTGATTGAAGAAATTCGTGAGATTTTGTAATCCTTTAATAGAATATCATTTGAAGTTTCCCCTCGTATTTGTAACTTTGTAGCTGATAAAGCAACAAAGAAAGCTCAATGTTATTGCTTAAATGGTGTATGGCTATCCTCTTTCCCTAATTGGATTCCATCCATGGTAGTCATTGATTTATGATTTAATATCCTACAGGTTTCTTGACACCCAAATGTTGTATGATCAAGTGGGTTGTTTTGTAAAATTAGTTTGGGGTACACGTAAGTTGACTCGAACATTCACATCTTTATTAACAATAGACCCTGTAGGATTACCCCAATTCCAACCCCTGTTTCATTTTGTGAACCATCAACATGGAGTGTCCAAGCTGTAGCTGTGGAACCTCGGACGAGGGGGAGGAGCAAAGCAGCTCGACCGAGTTTACAAGGGAGAGGGGCTGCCCTTTTTTCTTTTCTGCATCAATCCTCATCCACCACCTATTTGACTTTTTTTTTTTGTGTAAATTTCTCACACTAGGATAGGGTCCAGTACAGGGCTCTTCTGGATCTCTAAAGATCGAAATTGAATGATTCTCCAATAACTTCACTTCTTTTTTTGGTTGTTCCGCTCAGTTGATCGATGGTTGTTCTGCTTTCTACCCATAGTTAAAACTAATATGGGATTGATAGACAATGGACAAAGTACAAGTGACAAAATTTTAGGCAAGGGCAGTGATAGATTGCACCTAATCTCATACTCAATTTTTCTTTTAAGGGGATGTTTGGCTCACCAACATGAGTTGGGTTGAGTTGGTAAAATTTTTTCTTAACAACCACTTCAAGTGACAAGCTTCGTCGACCACCTTCGCACAAGCAACTCTAGCGACATACTTTGACGACCACCTTCACGCGGCCAACTCCAACGACCAATCTAGGCTCAAAAAATCACCTCTAACGACAACTCCGACAAAGACCACCTTCCATGATCAACTCTGATGACAACCACCTCTGACAATCAACACTAACATTCACCTCAAACAACTAACTCCGGCAAAAGCTACCTCTAACGAGACCCTTAATGACAACCATATTTGATGTGGTTTCATACATCTTTTTTTAGATCACATTTTTGTATTTCCTCTATTTAGTCTTGGTGTTTCGATCTAATTCATTCCAGTCCTTTGAAGGTATGTTGTAGTATGTATATTTTAAATTTTATTTGCATTTAGCTTCATTATAATCGAAGTATAGTTGGTTATTTTTCTTGTAGGGCCCAAACTAATTGCACATTTCCTTCCACAATCAATTTGAGGTTTGTTAGTTTTAAGTTTGGAGTCTTTTATAATCCAAATTTTGTTTAATTGTTGGGGAACAATTTGTGATGTATTCAATGTTATTCATCGATATGCATTTTTATTTTAACATGTAAATAAACATTTTTGTGTACATTATTATTTCATTTGTAAGTGAAAAATTAGACTTAATCATAAAAAATGTTCGAACAAAAAAATTGTTTGCACAAAAAAAAAAATGTATCTCATTTCACTGTATTGGTGTAAAATGTAAAGAATCAAATGTTTAACAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGATAAGAAAAGAATTCATTTTTTATTAATTAACATCTATGGTTGATTAAAATCAATTGAACTTTAGGGAGTAGAGAAAATGTTCATGTTATTGGAATATGTCATGTTTTTTGGGATGTAAATAAAATTGTTATGCGATGGCTATGGTGAACATATATTACATTTTTCAAGAAGGAAAAACAAAAAGTTTTTTTTTTTATTTTTTAAGCCTATTAAGTATTTATAATTGGAGCTAAGTAGTTGTGAAAAGTTATCATTTGTTTGGAATATGTTTGGCGTTCAGAAATGGAAGTATATATATATATATATATGTTATGTAATTAAGTGTTAAAAATTGAATTAAAAATTTGTGTGTAGTTTATGTTTAATTTGTAAGAATTTATTATGTTTTAAGAATTAAAAAAAACTTTAAGTATTTTTTAGCATTAAAAGTTTTAGGAAAATATGTGAATAAAAAAAAATCAACACAAAATTAATTTTGTTTAGAAAAACTATACCAAATACTACAACTTAACTTAGAACACCGACAAAAATATTGTAACTCGCCAAATAATTTAAGTCTCCAAACAATAATTATCTACTCAAAACTCGGTGCTGTCCAGGGCCGTTAAGTGCTGAAAATTAAAAAATAGTAATAATAATTTTTTTTTATTTTTTAGAAAAATTATTACATGGCACACTACTATTCGGTGCAAGACATTTTTGATGAATCAGTGACGGCAGCATAAAACAGGGGTAAGAAAGTCTTTATACTCTCCTATAAAATCTCCGGGACTGGCCATAAACACAAACAACCAAACACTCTACGATAACAGAACTCTTAACCATGCAATCCACACTCTTTTCCGGCAACCCCATCGTCGTCGTCGCTGACGGTGCCGATCTTGCTCCAAACAATCCGGTGAATTCAGACACAGCTCCGGTGACGGCGATTGGGTACAGAGGCGGTGGAAATACGAAATCTGTGATACCCAAGAGGAGGGTGTTAGTGAAGACGATGATTTACCATTCTATTAAAAACTGGCTCCTATCCCTCTTTCGTCCCACGCCGTAG ATGCACTGCAGAGACTTGTCGGGCAACAATCAGGTGCTACCCCAACCAGGTTGGATCTCCGACAATCCGGCCGTGGTCGGCGCCGACGAAATTGGGTACAGAGGCGCCGGAAAAATGAAATCTGTGATACCCAAGAGGAGGATGTTGAATTTAGCTTATGAATCTCCCCTTACGGAAATCCTTGTCATTGCCCAACGAATTCGTCTTGCAGCTTCCCTTTCGTGCCCTAACATTTGTATTAGCAACAATAATGCTCTTTACATGTTTAAGTTGTTAGATTGGTGTGGTACATTAGAGGTAGTTTCTGAAGAACTCTTAACCATGCAATCCACACTCTTTTCCGGCAACCCCATCGTCGTCGTCGCTGACGGTGCCGATCTTGCTCCAAACAATCCGGTGAATTCAGACACAGCTCCGGTGACGGCGATTGGGTACAGAGGCGGTGGAAATACGAAATCTGTGATACCCAAGAGGAGGGTGTTAGTGAAGACGATGATTTACCATTCTATTAAAAACTGGCTCCTATCCCTCTTTCGTCCCACGCCGTAG ATGCACTGCAGAGACTTGTCGGGCAACAATCAGGTGCTACCCCAACCAGGTTGGATCTCCGACAATCCGGCCGTGGTCGGCGCCGACGAAATTGGGTACAGAGGCGCCGGAAAAATGAAATCTGTGATACCCAAGAGGAGGATGTTGAATTTAGCTTATGAATCTCCCCTTACGGAAATCCTTGTCATTGCCCAACGAATTCGTCTTGCAGCTTCCCTTTCGTGCCCTAACATTTGTATTAGCAACAATAATGCTCTTTACATGTTTAAGTTGTTAGATTGGTGTGGTACATTAGAGGTAGTTTCTGAAGAACTCTTAACCATGCAATCCACACTCTTTTCCGGCAACCCCATCGTCGTCGTCGCTGACGGTGCCGATCTTGCTCCAAACAATCCGGTGAATTCAGACACAGCTCCGGTGACGGCGATTGGGTACAGAGGCGGTGGAAATACGAAATCTGTGATACCCAAGAGGAGGGTGTTAGTGAAGACGATGATTTACCATTCTATTAAAAACTGGCTCCTATCCCTCTTTCGTCCCACGCCGTAG MHCRDLSGNNQVLPQPGWISDNPAVVGADEIGYRGAGKMKSVIPKRRMLNLAYESPLTEILVIAQRIRLAASLSCPNICISNNNALYMFKLLDWCGTLEVVSEELLTMQSTLFSGNPIVVVADGADLAPNNPVNSDTAPVTAIGYRGGGNTKSVIPKRRVLVKTMIYHSIKNWLLSLFRPTP Homology
BLAST of ClCG08G006090 vs. NCBI nr
Match: XP_022141661.1 (uncharacterized protein LOC111011963 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 80.5 bits (197), Expect = 1.7e-11 Identity = 41/65 (63.08%), Postives = 49/65 (75.38%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G006090 vs. NCBI nr
Match: TYK18680.1 (hypothetical protein E5676_scaffold481G00190 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 67.0 bits (162), Expect = 1.9e-07 Identity = 35/56 (62.50%), Postives = 39/56 (69.64%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G006090 vs. NCBI nr
Match: KAE8647261.1 (hypothetical protein Csa_018288 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 60.5 bits (145), Expect = 1.8e-05 Identity = 35/75 (46.67%), Postives = 43/75 (57.33%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G006090 vs. NCBI nr
Match: KAE8647260.1 (hypothetical protein Csa_018328, partial [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 60.5 bits (145), Expect = 1.8e-05 Identity = 32/57 (56.14%), Postives = 42/57 (73.68%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G006090 vs. NCBI nr
Match: KAG6602131.1 (hypothetical protein SDJN03_07364, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 60.1 bits (144), Expect = 2.3e-05 Identity = 35/67 (52.24%), Postives = 43/67 (64.18%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G006090 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CJW3 (uncharacterized protein LOC111011963 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111011963 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 80.5 bits (197), Expect = 8.1e-12 Identity = 41/65 (63.08%), Postives = 49/65 (75.38%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G006090 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3D590 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold481G00190 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 67.0 bits (162), Expect = 9.2e-08 Identity = 35/56 (62.50%), Postives = 39/56 (69.64%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G006090 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KFQ1 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G374720 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 60.5 bits (145), Expect = 8.6e-06 Identity = 35/75 (46.67%), Postives = 43/75 (57.33%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G006090 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KDQ7 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G374710 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 60.5 bits (145), Expect = 8.6e-06 Identity = 32/57 (56.14%), Postives = 42/57 (73.68%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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