ClCG08G004920 (gene) Watermelon (Charleston Gray) v2.5

Overview
NameClCG08G004920
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
DescriptionUnknown protein
LocationCG_Chr08: 15313713 .. 15320446 (+)
RNA-Seq ExpressionClCG08G004920
SyntenyClCG08G004920
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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mRNA sequence

ATGTGGAGCAAAGAGGTGCGACACCAAAAACCCGATAGGCTACTGGACGATGCATTCAAGAGGTTCTTGAGCTTTGTGATGCCCGATCATTACCCCGCTATCCTTCCCTTCCCTGATCATATCCTCTACAATCCGCTTGAGCTCGAGGATGAAGAAAAAGAAAATGAAGAAGATGATGATACTCCCGCTCAGACCTAA

Coding sequence (CDS)

ATGTGGAGCAAAGAGGTGCGACACCAAAAACCCGATAGGCTACTGGACGATGCATTCAAGAGGTTCTTGAGCTTTGTGATGCCCGATCATTACCCCGCTATCCTTCCCTTCCCTGATCATATCCTCTACAATCCGCTTGAGCTCGAGGATGAAGAAAAAGAAAATGAAGAAGATGATGATACTCCCGCTCAGACCTAA

Protein sequence

MWSKEVRHQKPDRLLDDAFKRFLSFVMPDHYPAILPFPDHILYNPLELEDEEKENEEDDDTPAQT
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (Charleston Gray) v2.5
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 45..65
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 49..65

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
ClCG08G004920.1ClCG08G004920.1mRNA