ClCG08G004623 (gene) Watermelon (Charleston Gray) v2.5

Overview


Name	ClCG08G004623
Type	gene
Organism	Citrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
Description	Lipoxygenase
Location	CG_Chr08: 14680278 .. 14721087 (+)
RNA-Seq Expression	ClCG08G004623
Synteny	ClCG08G004623

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR

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TTTTATGCTTGCTGCTCTGTATTTGTCTAGATGTATGAATTTCTGTCTATTTGTTTACTTTGGTGTGATGAATTATGCCTTATACAATATGTGTTTGTTGAAATTTCTAGATAGACCTATCAAATTTTTTATTCTTAATGAGGTTTCAATTGTTTTTAATGCGTCAATTTGAGCAGTACTCATGTGCTAATCCATCCTTTATTTTCTATATGATGTCCTAATATCATGCTCAAATCAATGGGTGGATTATTGGAAGACTATTGTGGCATTTCTTCCTCAAATCTTGCTTAAGCAACTAGTACATATTATTGTAAAATTCCTGACATTTTTTTCTCAATTCGACTCTCACATTCTTTATTAGTATGTGAATATTGCTCCTAATCTTGTGAAATGTTCCCATTTCATTCCTTGTTTACTTTTGCTTGAATTCTTCCTTTGTGCAAATTCGTATAGTTCCAAAGTCAAGCTTCATCAATTTAAATGGGATACAAAGCTCTAAATTCAATTCATTCCCTTATTTTGATTCACTTTATTTGAAAAAAAAAAAGCCTATTATTTTAATTCAGCAAGTAAAATACCCAAGTAGATTTAGCAAGTTAGAATGATTTTTGATGTTTGATTTAGCAATTTAGAATGATTTGAAGAACCAAAATAAAGGGAGCACACAAACGATCATCACTGGAATTTAGGTGTGCTTTCTTTTTTTGCTTCATTTTCATGAGTTACCTCTAGTTTGTTTCTCCAGGAAGGGAACTCACTTAGGATCAAAGTAAAAAAAATTACTTTATTAACTTCTTCTAAGTGGTATAAACTCGTCTTTACTTTTCAAACCAAAACCATCTTTTCTATTGGCTCCAATTCCTTCTCTTCAAGTTGCCTCACTCCGCTTTCTCTCTTCAAGGTAAAAATTACATTTCATCTCTTACATTTCATCTTTTGGAGCGTAGAAATCTTTTCATGTATTTTTGTGTTCCATTTGCCTGCAAGGGAATGTGGAGGGTGAGATTGAATAAGGTGGTTTGATAGGATTTTCAATTCACATTAATATATGATTTCTTACAATTTGGAGGGTGAGATTGTTTTTCTTATCCTTAACTCATTTCCCAACTATCTTCACATGATTTTGGCTATATGATACAAAGAAGAGACTTATATTTCATGTCTTAAGCCCAATTGTGTGAAGCTGCTGAGCTATTATGTGAAAACTTGTTGAGCTGATTTTATTGTTTGTGATTTTTTTATTTATAAAGAGTAAAATAACTATCAATATTGCCTTAATCTTTCATTACTTCACATCTTCATGTTATTGCTATTGCCTAATAATGTTCTTAAAATACTTGTACTACTTAATCTTGTTGCTTTGCGTTCCAATTTTATTGCATGCATTATCTCATTCTATAACACTCATTCCAAGAATGATCACCAAATCTTGCAGGTACTTGTCTTTTAACAACCATAGTGGGTCGAGAGTGACACCAATGTCTATCAGCAACAAAACTGCGAATAGTCGAGCGATAGATTTTTCTAAGTTATCTTCTAGTGAGTTTTTTGTACCTCTTCTAGTTTTATCATAAACTTCAACACCTCTACGCCACCAACCTCCTCTTCTAGCTTTGTTTTCTCTAATTACTTTTCTATATTCTTCTATGGGAAGAAGGATGGATAGTTGGTTTGTCTTGATACAATCCTGAGGAAGAGAATATGGGGCTAAAGATACCTCTCCCAAGCTTCACCTCAAGTACGAAATATCGCTCATCTTTCCTATGTTAGGTCATTCTAACAGTTTTGGGTTAAGTCCACTTGTCTGTTGCTTTTTGAAGATTATCATTTGTTCTGATTTGCTTAATAATCTAAACCATGGAAGCAAGTAGTTGCAATAGTGAAAATATGGTTGTTTCTTTGTTGAAGATATGGATCCAAATGCATTGTTACCTTTTTAGATGACTAGCCATTTTAAGTAGTTTAGAAATTATAAATGTAGTCGATGCATTACTCTGTTCATGAATAGGTTAATAGCTCATGCTTCACTCTTTGTTGGTTTTTGTTTTTCAAACTCTGTCACTATTGGAGTGTCTAAAACATTAAAAGATCATTGAATGGGTTGAAATAGGAAGATAAAAATAAGAACAAAATTATGCCTTTTGATTTTGATTATGATTGTGGTTATTATAGATTGATTACACAAGAAGGTAAGTGTCATTTACAAACATATTTTATAACAGATTGATTTTTTGCCTTATATTGTGTTCAAACGCCATAGTTGTTGGAGCAAAAAGTTTCTATCTAGTTTCTATATAGTGTTGAATTAATAATTGGTTTTAGTAGTTGTATTGTTCTATGGCTAACTTATGGTTATCGTAAGCACTTCATATTTATGTTGTTTTGTGATTAGTTACAGTATCCAGTTCTGGGTTGTTTTGAGTTACTTCTTGGTCTTGGAGGGCAATTAAGCACCTTTAGGTGACATTGAGCGACGCTTAGCCATTTTTTTAGGTTATTTTGAGAGTCAAAGTATGATTTATACACTTTTCTAGAACCATTTAAATGGTTTTTATAGTTAAAATGACACATGACCACTTTGAAGATCTTTTTAGGTGGATTTGATAGATCAAATTGACACTTAGGCACTTTTTAAATTGTTTTGAGCATCAACGTGGTACTTAAAAATAACTCTTTTGGTCATCCATGAACACTTTTAAAAGACTTTGTATGGGAAGTAGTTAAGACATCCTGAGTTGTTTTGGATGGTTGATAATGACTTTATGTTCCTTCATTTGGAGGGGGGAGTTTAAATTATTGGGTTATTTGCCATTGTGTCTGATTCTTCCTTTTACTTCTTTTCATGCTAGTGTTATCTGTACTCGACTGTTTTGGATGACCAAAGAATGAGTATTCTTGCAAACCTTTGCATATTGGGATCAAGAAGAAAAATAATGTTGAGGGTTTTGTCCTTGATTCTTGATTTTTTTTTCGTTATTTTCTTGTAACTCTCTGGTTGATCTATTTTTCTGTGAGATTAGAAGTGTTTCTCTTTCTATTTATTGCCCTTAATGATTTGTACTATAAGATGATTTCGTGATTATTGTCACTCTTTTTAAATAAAAATAAGAATCTCAAAGTTCAATGATTGATATTATTTGTTGTTCATGTTGTTTTTAGGACCAATGTGTTTCACCCAAATATCAATAGCAATGGAATTATCTTCATATCCTTAAAGAACAATGGAGCCCTGCACTTACAATTTTAAAGGTTGAGTTTTGACTTGTGATTAAAGATTTATCCGGAGTATTTTATTTGCAAATCTAAGTGAACTTTTCTTTCTTGGGATTATATCTACTTTTTTTGTTTGGAGTTTTGCAAGTGGCTTCATTTTTGTAATCACCATATGTTAGAACACACTATTGATTACATTAACTTGTCATACTATATAGTGTTCTATTTTTTTATGCTAGAAATTTGAAGATTTTGTTTACTTTTATAATTTAATAATTTTGTGATTGTGGATAACATGAGAATTAATTTTTTGTTGCCACTATGCATAATATAGGCTAGGGGCTTCAATAGATATATATGTTAAAAACTTTCGAATTTCTTTCTTTATGTAAATTATTATTTCTTTTTTATGTAAATATATTTAAATACATTAGAAGTTTATAGACTAAAATAATCTTATTTTACAATAGTATTTAAAGTAAATTGTACAAACGTTTTGATGACAATAAAATCTTTAAAAAATAATGTCATTAAAAAGTGCTATTAAAGATCATTAAAGCATTTTTTTTTACTACTACAAAAAAAAAATGTTATAGAAAGATTTTATGACATTAAAATTATGCAATAAAAAATTAGTTATTTATAATGTTATTCTAATACGGTAAAAAAGAAAAAAAAAACTATTAAAAAGTTAGGAATTTCAATAACATGCCTAAAAATGCTATACAAAGTCTTTTATAGTATTTTTTAAGGCTATAAAAACTTTTTGATAGCATTTTTTTAACACTATGAAATGTCTACATAACATTAAATTAAAGCTATCGAATGTCAACTTTTTATAGCATTACTTATAGCCTTATAAAAAAGTTACGGAAAGTCGAGGACTTTCAATAACATCTGCTACGACAACATCTTTAAAATGCTATGGAAATGCTTTTATTGGGTTTTTACAGCGCTATGAAAAACGTTATTGAATGTCTTTTACAACATTTTTGTGCTGCTATGAAAAAACGTTATAAAAGACATTCTATAGCATTTTTTTACGCTATGAAAATTTTTCATAGCATAAAATTTGTGCTATCAAAAATGAACTTTTTATAGCGTTTTTGATAGTGGTGAAAAAATGCTATGGAAAGTCCAGGACTTTCAATAACATGAGCTACGACGACATTTCGTTAGGCCTATGAGGCCTAGTTTCCACTAGACAACCCCAAATGTGAAGATGTGTAATACAAGGCTTCTTTCCTATCCACAACTCATAAGGGGTTTTAGCTACCACTTTACTAGGTACCTTATTGAGTATATATGTTGTAGTCTTTAGTGCCGCACCTAAGAGAGATTCCGGTAAAGAAGAATGACTAATCATACTTTTTACCACATCCTTAAGTGTTCTATATTTCGCCTTTCCACCACACTATTCATGTCGGGTTTCTTCGAGATATAGTGTATTGTGGGACGATTCCACATTCCTCTAGGTATTTGGCAAAGAGCCCTAAACGTTGTTTACCTGATCCATCATATCTACCGTAGTATTCACCACCACGATCAGACTTGACAACCTTAATTTTCTTTCCACATTGAAGTTCAACTTTAGCTTCAAAATATTTGAAAAAATCTAAAGATTGAGACTTCTCATGAATTAAATAAAGGTGCCTATATCTTGTATAACTGTCTATGATGTAATAAAATATTGTTGTCCATTCAAAAAAGTCGTAGGGAATGGACCACAAATGTCTGTATGTATTAGTTTTAAGACGTATGAGCATTTGTTGGCACTTAATTTTCTTGTGTTTGTTTATTTTTTCTTAATACATTCCACACAAACTTCAAAGTTACTTAAATCAAGGGAATCAAGAATATCATCTGACACATGTCTTTGAATTCTTTATTTAGAGATGTGACTGAAAAGCGCTTGAAAAATGTTTTATTCTCTTAAATTAAGGAATTTTATATTAGATTTCACTTGTTTGTTAGTGGTTTTCAGGTCAAAATAAAGAAAACTAGAATTGAAAACCAAAAGATCAAAATCGAGCAAAAATCTAGCGAAAAAGAGAAGAAAAGTACAAAACTGCCAAAAATAGGGCAACGCCGCGACACTTTTTCTCGAGAGCAGCCTCTGCCTTCAATATAGCAGCACTATCATGGCACCAAGGGTAGGCTTTCATGATAGACAGCACGACAACACCATCTTACAGTGCAATGGCACTATCTTACAGTGCGACGGCGCTATTGACCAACATCGTGGCGCCAGTTTTCCATATTTGAAAATTCTATATTTTTGGGAAGAATTTTGGGTGGCCCTATAAATTGGAGGATTTCTAGTAACCCTAGACATCAAGAAATCAGAGAAAAACACACCAAAAGAGTCACAAAGAGTGAGTTAGCTGCAAGGAAGAGAGAAGAGTTCGAGAGAGAGTTTGGTGCCATTCAAGTTCCCGACGTGAAGACCGAAGGACATCTTGGCAGTTCCTCCTCAATCAAGGGTTTCTTCCTATTAGAGTTTTCCTTTCTTTACACTCTTTCTATGCTTAATTTGTTTGTGAACATGTTACTTAAAGCTATGAGTGGCTAAACTCTTTGGTTTTAGGGTATCGATG

mRNA sequence

ATGGAGGGTGGCATTTTGGAAGAAACAGTGTTTCCATCCAAATATGCCATGGAGATGTCAGCTGCTTTATACAAGAATTGGGTTTCTCATGAACACACACTCCCTGCAGTTGTCATCAAGAGATTGATTACACAAGAAGGACCAATGTGTTTCACCCAAATATCAATAGCAATGGAATTATCTTCATATCCTTAAAGAACAATGGAGCCCTGCACTTACAATTTTAAAGGTCAAAATAAAGAAAACTAGAATTGAAAACCAAAAGATCAAAATCGAGCAAAAATCTAGCGAAAAAGAGAAGAAAAGTACAAAACTGCCAAAAATAGGGCAACGCCGCGACACTTTTTCTCGAGAGCAGCCTCTGCCTTCAATATAGCAGCACTATCATGGCACCAAGGGTAGGCTTTCATGATAGACAGCACGACAACACCATCTTACAGTGCAATGGCACTATCTTACAGTGCGACGGCGCTATTGACCAACATCGTGGCGCCAGTTTTCCATATTTGAAAATTCTATATTTTTGGGAAGAATTTTGGGTGGCCCTATAAATTGGAGGATTTCTAGTAACCCTAGACATCAAGAAATCAGAGAAAAACACACCAAAAGAGTCACAAAGAGTGAGTTAGCTGCAAGGAAGAGAGAAGAGTTCGAGAGAGAGTTTGGTGCCATTCAAGTTCCCGACGTGAAGACCGAAGGACATCTTGGCAGTTCCTCCTCAATCAAGGGTTTCTTCCTATTAGAGTTTTCCTTTCTTTACACTCTTTCTATGCTTAATTTGTTTGTGAACATGTTACTTAAAGCTATGAGTGGCTAAACTCTTTGGTTTTAGGGTATCGATG

Coding sequence (CDS)

ATGGAGGGTGGCATTTTGGAAGAAACAGTGTTTCCATCCAAATATGCCATGGAGATGTCAGCTGCTTTATACAAGAATTGGGTTTCTCATGAACACACACTCCCTGCAGTTGTCATCAAGAGATTGATTACACAAGAAGGACCAATGTGTTTCACCCAAATATCAATAGCAATGGAATTATCTTCATATCCTTAA

Protein sequence

MEGGILEETVFPSKYAMEMSAALYKNWVSHEHTLPAVVIKRLITQEGPMCFTQISIAMELSSYP

Homology

[Close]

BLAST of ClCG08G004623 vs. NCBI nr
Match: XP_038877032.1 (probable linoleate 9S-lipoxygenase 5 isoform X1 [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 65.5 bits (158), Expect = 1.9e-07
Identity = 31/44 (70.45%), Postives = 34/44 (77.27%), Query Frame = 0


Query: 3   GGILEETVFPSKYAMEMSAALYKNWVSHEHTLPAVVIKRLITQE 47
           GGI E TVFPSKYAMEMSA LYK+WV HE  LPA +IKR +  E
Sbjct: 562 GGIFEATVFPSKYAMEMSAVLYKDWVFHEQALPADLIKRGMAME 605

[Close]

BLAST of ClCG08G004623 vs. NCBI nr
Match: XP_038877033.1 (probable linoleate 9S-lipoxygenase 5 isoform X2 [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 65.5 bits (158), Expect = 1.9e-07
Identity = 31/44 (70.45%), Postives = 34/44 (77.27%), Query Frame = 0


Query: 3   GGILEETVFPSKYAMEMSAALYKNWVSHEHTLPAVVIKRLITQE 47
           GGI E TVFPSKYAMEMSA LYK+WV HE  LPA +IKR +  E
Sbjct: 414 GGIFEATVFPSKYAMEMSAVLYKDWVFHEQALPADLIKRGMAME 457

[Close]

BLAST of ClCG08G004623 vs. NCBI nr
Match: XP_038721220.1 (probable linoleate 9S-lipoxygenase 5 isoform X2 [Tripterygium wilfordii] >XP_038721221.1 probable linoleate 9S-lipoxygenase 5 isoform X2 [Tripterygium wilfordii])

HSP 1 Score: 65.1 bits (157), Expect = 2.5e-07
Identity = 31/62 (50.00%), Postives = 42/62 (67.74%), Query Frame = 0


Query: 3   GGILEETVFPSKYAMEMSAALYKNWVSHEHTLPAVVIKRLITQEGPMCFTQISIAMELSS 62
           GG+LE TVFP+KYAMEMS+A+YKNW+  EH LPA ++KR +      C   + + +E   
Sbjct: 580 GGVLEHTVFPAKYAMEMSSAIYKNWIFTEHALPADLLKRGMAVPDSSCPHGLRLLIE--D 639

Query: 63  YP 65
           YP
Sbjct: 640 YP 639

[Close]

BLAST of ClCG08G004623 vs. NCBI nr
Match: XP_038721219.1 (probable linoleate 9S-lipoxygenase 5 isoform X1 [Tripterygium wilfordii] >KAF5738633.1 linoleate 9S-lipoxygenase 5 chloroplastic-like [Tripterygium wilfordii])

HSP 1 Score: 65.1 bits (157), Expect = 2.5e-07
Identity = 31/62 (50.00%), Postives = 42/62 (67.74%), Query Frame = 0


Query: 3   GGILEETVFPSKYAMEMSAALYKNWVSHEHTLPAVVIKRLITQEGPMCFTQISIAMELSS 62
           GG+LE TVFP+KYAMEMS+A+YKNW+  EH LPA ++KR +      C   + + +E   
Sbjct: 588 GGVLEHTVFPAKYAMEMSSAIYKNWIFTEHALPADLLKRGMAVPDSSCPHGLRLLIE--D 647

Query: 63  YP 65
           YP
Sbjct: 648 YP 647

[Close]

BLAST of ClCG08G004623 vs. NCBI nr
Match: XP_021988614.1 (probable linoleate 9S-lipoxygenase 5 [Helianthus annuus] >KAF5786360.1 putative linoleate 9S-lipoxygenase [Helianthus annuus])

HSP 1 Score: 65.1 bits (157), Expect = 2.5e-07
Identity = 30/46 (65.22%), Postives = 35/46 (76.09%), Query Frame = 0


Query: 3   GGILEETVFPSKYAMEMSAALYKNWVSHEHTLPAVVIKRLITQEGP 49
           GG+LE TVFP+KYAMEMSA LYKNWV  E  LPA ++KR +  E P
Sbjct: 621 GGVLEMTVFPAKYAMEMSAVLYKNWVFTEQALPADLLKRGVAVEDP 666

[Close]

BLAST of ClCG08G004623 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LUW0 (Linoleate 9S-lipoxygenase 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LOX5 PE=1 SV=2)

HSP 1 Score: 60.8 bits (146), Expect = 6.3e-09
Identity = 29/61 (47.54%), Postives = 40/61 (65.57%), Query Frame = 0


Query: 4   GILEETVFPSKYAMEMSAALYKNWVSHEHTLPAVVIKRLITQEGPMCFTQISIAMELSSY 63
           G+LE TVFPS+YAMEMS+++YKNWV  E  LP  ++KR +  E P     + + +E   Y
Sbjct: 594 GVLERTVFPSRYAMEMSSSIYKNWVFTEQALPKDLLKRGVAVEDPNSDNGVKLLIE--DY 652

Query: 64  P 65
           P
Sbjct: 654 P 652

[Close]

BLAST of ClCG08G004623 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q43191 (Probable linoleate 9S-lipoxygenase 5 OS=Solanum tuberosum OX=4113 GN=LOX1.5 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 60.1 bits (144), Expect = 1.1e-08
Identity = 28/44 (63.64%), Postives = 34/44 (77.27%), Query Frame = 0


Query: 3   GGILEETVFPSKYAMEMSAALYKNWVSHEHTLPAVVIKRLITQE 47
           GG+LE TVFP+KYAMEMSA +YK+WV  E  LPA +IKR +  E
Sbjct: 574 GGVLEMTVFPAKYAMEMSAVVYKSWVFPEQALPADLIKRGVAVE 617

[Close]

BLAST of ClCG08G004623 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q43190 (Probable linoleate 9S-lipoxygenase 4 OS=Solanum tuberosum OX=4113 GN=LOX1.4 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 58.9 bits (141), Expect = 2.4e-08
Identity = 26/44 (59.09%), Postives = 34/44 (77.27%), Query Frame = 0


Query: 3   GGILEETVFPSKYAMEMSAALYKNWVSHEHTLPAVVIKRLITQE 47
           GG+LE TVFPSK+AMEMSA +YK+WV  +  LPA ++KR +  E
Sbjct: 572 GGVLESTVFPSKFAMEMSAVVYKDWVFPDQALPADLVKRGVAVE 615

[Close]

BLAST of ClCG08G004623 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q41238 (Linoleate 9S-lipoxygenase 6 (Fragment) OS=Solanum tuberosum OX=4113 GN=LOX1.6 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 58.9 bits (141), Expect = 2.4e-08
Identity = 26/44 (59.09%), Postives = 34/44 (77.27%), Query Frame = 0


Query: 3   GGILEETVFPSKYAMEMSAALYKNWVSHEHTLPAVVIKRLITQE 47
           GG+LE TVFPSK+AMEMSA +YK+WV  +  LPA ++KR +  E
Sbjct: 569 GGVLESTVFPSKFAMEMSAVVYKDWVFPDQALPADLVKRGVAVE 612

[Close]

BLAST of ClCG08G004623 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P38415 (Linoleate 9S-lipoxygenase A OS=Solanum lycopersicum OX=4081 GN=LOX1.1 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 58.9 bits (141), Expect = 2.4e-08
Identity = 26/44 (59.09%), Postives = 34/44 (77.27%), Query Frame = 0


Query: 3   GGILEETVFPSKYAMEMSAALYKNWVSHEHTLPAVVIKRLITQE 47
           GG+LE TVFPSK+AMEMSA +YK+WV  +  LPA ++KR +  E
Sbjct: 572 GGVLESTVFPSKFAMEMSAVVYKDWVFPDQALPADLVKRGVAVE 615

[Close]

BLAST of ClCG08G004623 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A7J7CX31 (Lipoxygenase OS=Tripterygium wilfordii OX=458696 GN=HS088_TW13G01534 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 65.1 bits (157), Expect = 1.2e-07
Identity = 31/62 (50.00%), Postives = 42/62 (67.74%), Query Frame = 0


Query: 3   GGILEETVFPSKYAMEMSAALYKNWVSHEHTLPAVVIKRLITQEGPMCFTQISIAMELSS 62
           GG+LE TVFP+KYAMEMS+A+YKNW+  EH LPA ++KR +      C   + + +E   
Sbjct: 588 GGVLEHTVFPAKYAMEMSSAIYKNWIFTEHALPADLLKRGMAVPDSSCPHGLRLLIE--D 647

Query: 63  YP 65
           YP
Sbjct: 648 YP 647

[Close]

BLAST of ClCG08G004623 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A251TKU3 (Lipoxygenase OS=Helianthus annuus OX=4232 GN=LOX5 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 65.1 bits (157), Expect = 1.2e-07
Identity = 30/46 (65.22%), Postives = 35/46 (76.09%), Query Frame = 0


Query: 3   GGILEETVFPSKYAMEMSAALYKNWVSHEHTLPAVVIKRLITQEGP 49
           GG+LE TVFP+KYAMEMSA LYKNWV  E  LPA ++KR +  E P
Sbjct: 621 GGVLEMTVFPAKYAMEMSAVLYKNWVFTEQALPADLLKRGVAVEDP 666

[Close]

BLAST of ClCG08G004623 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5N6PQ14 (Lipoxygenase OS=Mikania micrantha OX=192012 GN=E3N88_06452 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 64.7 bits (156), Expect = 1.6e-07
Identity = 29/46 (63.04%), Postives = 36/46 (78.26%), Query Frame = 0


Query: 3   GGILEETVFPSKYAMEMSAALYKNWVSHEHTLPAVVIKRLITQEGP 49
           GG+LE+TVFP+KYAMEMSA LYKNWV  E  LPA ++KR +  + P
Sbjct: 544 GGVLEKTVFPAKYAMEMSAVLYKNWVFTEQALPADLLKRGVAVKDP 589

[Close]

BLAST of ClCG08G004623 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A059B3U3 (Lipoxygenase OS=Eucalyptus grandis OX=71139 GN=EUGRSUZ_H03535 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 63.9 bits (154), Expect = 2.7e-07
Identity = 33/63 (52.38%), Postives = 40/63 (63.49%), Query Frame = 0


Query: 2   EGGILEETVFPSKYAMEMSAALYKNWVSHEHTLPAVVIKRLITQEGPMCFTQISIAMELS 61
           +GG+LE TVFP KYAMEMSA LYKNWV  E  LPA +IKR +      C   +S+   + 
Sbjct: 604 DGGVLERTVFPGKYAMEMSAVLYKNWVFTEQALPADLIKRGMAIPDSRCPHGLSLV--IR 663

Query: 62  SYP 65
            YP
Sbjct: 664 DYP 664

[Close]

BLAST of ClCG08G004623 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A2P5E6Z2 (Lipoxygenase OS=Trema orientale OX=63057 GN=TorRG33x02_228550 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 63.9 bits (154), Expect = 2.7e-07
Identity = 32/62 (51.61%), Postives = 41/62 (66.13%), Query Frame = 0


Query: 3   GGILEETVFPSKYAMEMSAALYKNWVSHEHTLPAVVIKRLITQEGPMCFTQISIAMELSS 62
           GG+LE  VFP KYAMEMSAA+YKNW   E +LPA +IKR +  + P C   + + +E   
Sbjct: 573 GGVLESVVFPGKYAMEMSAAVYKNWDLTEQSLPADLIKRGVAVKDPSCPHGLRLLIE--D 632

Query: 63  YP 65
           YP
Sbjct: 633 YP 632

[Close]

BLAST of ClCG08G004623 vs. TAIR 10
Match: AT3G22400.1 (PLAT/LH2 domain-containing lipoxygenase family protein )

HSP 1 Score: 60.8 bits (146), Expect = 4.5e-10
Identity = 29/61 (47.54%), Postives = 40/61 (65.57%), Query Frame = 0


Query: 4   GILEETVFPSKYAMEMSAALYKNWVSHEHTLPAVVIKRLITQEGPMCFTQISIAMELSSY 63
           G+LE TVFPS+YAMEMS+++YKNWV  E  LP  ++KR +  E P     + + +E   Y
Sbjct: 594 GVLERTVFPSRYAMEMSSSIYKNWVFTEQALPKDLLKRGVAVEDPNSDNGVKLLIE--DY 652

Query: 64  P 65
           P
Sbjct: 654 P 652

[Close]

BLAST of ClCG08G004623 vs. TAIR 10
Match: AT1G55020.1 (lipoxygenase 1 )

HSP 1 Score: 52.4 bits (124), Expect = 1.6e-07
Identity = 27/47 (57.45%), Postives = 32/47 (68.09%), Query Frame = 0


Query: 3   GGILEETVFPSKYAMEMSAALYKN-WVSHEHTLPAVVIKRLITQEGP 49
           GGI E TVFPSKYAMEMS+ +YKN W   +  LPA + KR +  E P
Sbjct: 570 GGIFEITVFPSKYAMEMSSFIYKNHWTFPDQALPAELKKRGMAVEDP 616

[Close]

BLAST of ClCG08G004623 vs. TAIR 10
Match: AT3G45140.1 (lipoxygenase 2 )

HSP 1 Score: 42.7 bits (99), Expect = 1.3e-04
Identity = 23/63 (36.51%), Postives = 37/63 (58.73%), Query Frame = 0


Query: 3   GGILEETVFPSKYAMEMSAALY-KNWVSHEHTLPAVVIKRLITQEGPMCFTQISIAMELS 62
           GGI+E   +P KYA+E+S+A+Y K W   +  LPA +IKR + +E      +  + + + 
Sbjct: 605 GGIIETCFWPGKYALELSSAVYGKLWRFDQEGLPADLIKRGLAEEDKT--AEHGVRLTIP 664

Query: 63  SYP 65
            YP
Sbjct: 665 DYP 665

[Close]

BLAST of ClCG08G004623 vs. TAIR 10
Match: AT1G67560.1 (PLAT/LH2 domain-containing lipoxygenase family protein )

HSP 1 Score: 41.2 bits (95), Expect = 3.7e-04
Identity = 22/63 (34.92%), Postives = 35/63 (55.56%), Query Frame = 0


Query: 3   GGILEETVFPSKYAMEMSAALYKN-WVSHEHTLPAVVIKRLITQEGPMCFTQISIAMELS 62
           GGI+E    P KYAME+S+A YK+ W      LPA +++R + +E      +  + + + 
Sbjct: 626 GGIIESCFTPGKYAMELSSAAYKSMWRFDMEGLPADLVRRGMAEEDSS--AECGVRLVID 685

Query: 63  SYP 65
            YP
Sbjct: 686 DYP 686

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of ClCG08G004623 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
XP_038877032.1	1.9e-07	70.45	probable linoleate 9S-lipoxygenase 5 isoform X1 [Benincasa hispida]	[more]
XP_038877033.1	1.9e-07	70.45	probable linoleate 9S-lipoxygenase 5 isoform X2 [Benincasa hispida]	[more]
XP_038721220.1	2.5e-07	50.00	probable linoleate 9S-lipoxygenase 5 isoform X2 [Tripterygium wilfordii] >XP_038...	[more]
XP_038721219.1	2.5e-07	50.00	probable linoleate 9S-lipoxygenase 5 isoform X1 [Tripterygium wilfordii] >KAF573...	[more]
XP_021988614.1	2.5e-07	65.22	probable linoleate 9S-lipoxygenase 5 [Helianthus annuus] >KAF5786360.1 putative ...	[more]

BLAST of ClCG08G004623 vs. ExPASy Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description
Q9LUW0	6.3e-09	47.54	Linoleate 9S-lipoxygenase 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LOX5 PE=1 SV=2	[more]
Q43191	1.1e-08	63.64	Probable linoleate 9S-lipoxygenase 5 OS=Solanum tuberosum OX=4113 GN=LOX1.5 PE=2...	[more]
Q43190	2.4e-08	59.09	Probable linoleate 9S-lipoxygenase 4 OS=Solanum tuberosum OX=4113 GN=LOX1.4 PE=2...	[more]
Q41238	2.4e-08	59.09	Linoleate 9S-lipoxygenase 6 (Fragment) OS=Solanum tuberosum OX=4113 GN=LOX1.6 PE...	[more]
P38415	2.4e-08	59.09	Linoleate 9S-lipoxygenase A OS=Solanum lycopersicum OX=4081 GN=LOX1.1 PE=2 SV=1	[more]

BLAST of ClCG08G004623 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A7J7CX31	1.2e-07	50.00	Lipoxygenase OS=Tripterygium wilfordii OX=458696 GN=HS088_TW13G01534 PE=3 SV=1	[more]
A0A251TKU3	1.2e-07	65.22	Lipoxygenase OS=Helianthus annuus OX=4232 GN=LOX5 PE=3 SV=1	[more]
A0A5N6PQ14	1.6e-07	63.04	Lipoxygenase OS=Mikania micrantha OX=192012 GN=E3N88_06452 PE=3 SV=1	[more]
A0A059B3U3	2.7e-07	52.38	Lipoxygenase OS=Eucalyptus grandis OX=71139 GN=EUGRSUZ_H03535 PE=3 SV=1	[more]
A0A2P5E6Z2	2.7e-07	51.61	Lipoxygenase OS=Trema orientale OX=63057 GN=TorRG33x02_228550 PE=3 SV=1	[more]

BLAST of ClCG08G004623 vs. TAIR 10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT3G22400.1	4.5e-10	47.54	PLAT/LH2 domain-containing lipoxygenase family protein	[more]
AT1G55020.1	1.6e-07	57.45	lipoxygenase 1	[more]
AT3G45140.1	1.3e-04	36.51	lipoxygenase 2	[more]
AT1G67560.1	3.7e-04	34.92	PLAT/LH2 domain-containing lipoxygenase family protein	[more]

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (Charleston Gray) v2.5
Date Performed: 2022-01-31


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
IPR013819	Lipoxygenase, C-terminal	PFAM	PF00305	Lipoxygenase	coord: 2..59 e-value: 8.2E-11 score: 41.1
IPR013819	Lipoxygenase, C-terminal	PROSITE	PS51393	LIPOXYGENASE_3	coord: 1..64 score: 14.367688
None	No IPR available	GENE3D	1.20.245.10		coord: 1..64 e-value: 2.2E-6 score: 28.9
IPR036226	Lipoxigenase, C-terminal domain superfamily	SUPERFAMILY	48484	Lipoxigenase	coord: 2..45

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
ClCG08G004623.1	ClCG08G004623.1	mRNA

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0006633	fatty acid biosynthetic process
biological_process	GO:0034440	lipid oxidation
biological_process	GO:0031408	oxylipin biosynthetic process
molecular_function	GO:0046872	metal ion binding
molecular_function	GO:0016702	oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen