ClCG08G001640 (gene) Watermelon (Charleston Gray) v2.5
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAAAAAAAAAAAGAGCATAGGTTATAGTTGCAGCCCAGTCATTGCCCATTGCCGATTCTAATTAGCATAACAAAACTATCTGTTGGTTTACTATTTATATTAGGAAAATTATTTGGATGTTCCTATCTTTTGCGCCCATAAACGTATCTAATCACAAGTTGGTTTGCGACAAAAAGAAAAAATTTTTTAAGAGAAAATATATTTTTATTTTTTTTCTTTTGCCGCACATGAAAGGGATGCTTAATATGTGTGCAACCTAAATATTATTCTTTATATTATTTAAAACTTTGTTACACAATTTTCTTTCTCTCATTTTTATTTAATCATTACATTACATAATTTGTAGGGGCTTACTCCGTCAATTTCGCCATTAAAAACAATTGTAAGATCCCAATCTGGCCCGCATCCTTAACCGGCGCCGGCAATCAACTCTCTACCACCGGCTTCAAATTACTCCCTGGATCGACCGCAACCGTGACGGTTAACATATCGTCGCCATGGTCTGGGAGGTTTTGGGCTCGAACTCTTTGCTCCGGAAATACAAATGGAAAGTTCACTTGTGGAACTGCAGACTGCGGCTCCGGCCAAGTCTCCTGCAACGGCGCCGGCGCAATTCCACCGGCAAGCCTGGTGGAGTTTACAATAGCAGCAAACCGCGGCCAAGATTTCTACGATATCAGCCTCGTCGACGGCTACAATTTGCCCGTTTCAGTGAGCCCAATAGGCGGATCAGGTGGTTGCAAACCAGTAGTTTGTGCAAGAAATGTGAATGCCGTTTGTCCACCGGAATTGGCCGTTAAAAGCCGGCGTGGAGTAGTGATAGGATGTAAAAGTGCGTGTATGGCTTTTAATAAGCCGGAATATTGTTGCAGCGGTGACCATAATCAGCCGGAAACTTGCCCACCGACGAATTATTCGAAGATATTCAAGAGCCAGTGCCCTCAAGCTTATAGTTATGCATATGACGATAAGACTAGTACTTTTACTTGCTCGGGTGGAGCTAATTATGCTATCACATTTTGTCCTTGATATTCACACTTGGTGGAAACCTTTACTTAAAATGAATAAATTAAATGCTTGATATATAATTTACCCAAACTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATGTTGTCAAGAGATTTCCAACCCATACTTATATTTGTAGCTTCTTTGTCTATGTTATTTAGGTCATGTTTATTAATGCGTGATCAAGATTGGTCTAATCGTAATGTGTTTCTCCATTCATGTGTCAATCACAAAAAGGAGTTGGATTACTTTGAGCCATATATATATAGACAGATTGCAATCCTAATATAATTTCCATTGAGGTTGTTTACATTTACACATGTAATGGAACGGAATAGGGTGTGACAATTACTATAATGCTTCGAAGATTTAGGAAAAAAATTACTAAACTAATCCAACGATTGTTGTTGCAGCAGTTGAGAGGAAAAATGATTTCATCTTATTTCACAAAGGAGAAATCCTCTCTTAAATATATCAATGAAGCTTCAATACACCCCGATCAATCTGCTCCTTGACAAAGTGACAATTTATTTCAATGTGTTTTGAGTACGTTCGTGAAATGTTGGATTAGAAGCAATTGCCATAGTAGCCTCATTAACATAATAAACAACAGTTGGCGTAGGGGAAGGAATCTGCAAATCATGTAAAACATGATAAATCCATAAAATCTCACTGGAAACCTGATAGCACCGAAAAGGTGCTATTTAGCTCCGCTTAATTTAAGGTTGTCACTCGATTTTACATGTTTATTTGGTTATTTTACAGATATCGAGCACTTATCAAGCACTTACAAATCTTTAGCCCTTACTCAAGAAAACCCAAAAGAATGAACCATCTTCATTTTTCCTCAAATTCAAAGTCCTTGCTGATGGAATTTCTCTCCGGCAGCCCTCACACAGCTACTAGATTGATTTTGAGAAAGTTTGGTTGAAGAAATTCTCATTTTGCACGAGCGAATTTTGCAAACCATGTTTCTTCTTCCGACCTTCTATTTATATCCCCAACCATCGGCTCTATGCAACACATAGGCGTGCCACTTCCTACTTCCTAATTTTCACTTTGAATATTAACTTACCACCTAATAACCCTTAATTAAATAATTACATATAATCATCCCAAAACTAAAAGAGATTGAATGCCTACCTCTTGGTTCATCCCGTCAACACATAGAACACATACACTTTAAGGTTCTTGGTTTAGCCTCACGCCCTTACTTTTCAATGCATCCATCTCATACTCTTCAATGCCGTGTCCTTTACTTCTCAACGCCTCTCGGCTTGAGACATCTTCAAAGCCTACTTGACTTAGGCCTCCTCCACGCATACTTCCCTTCAACGCTCATCACCTTAAAGCTTTGCCATGCTTTGTCGGCTAGTCTAACACTTCTTTAAACTCGACTAACCCTTAGCAACCTCAATGCCTACACCCTTGTTGCAAGCTAAAACTCACGGCTAAGGACAACTCTTGGCTTCTCATCTAGCAAACTTTTCCACGCATCCTTGGCCCTAAACAAGAAAAATTGACAAGTCCACAACACAAAACCTAACAACAAGACTTAGTTTAGCTAAGGACAAGTTAAGTGCTTACACTAAGGCTCTAATTAAACTAAGTGAATTAATCTTATTGGGTTCGATAAGCGGTTATATACAATTAAAGACATTTGCATTAAGGTTAAGGGTTCCATTGTGTGATTGATTAATTAGATAGCTTAATTAACTAACCGATTTTATATTTGAACCTAATTAAAGCATGCATTCTAGGTTCATAGAAAACCTATAATCCTAGCATAAGTGATTCAATTATTTGCTACTTAGGTGATTCAAGCAAGACCAACAATAAGGAGAGTGCAAACCTAAATCGATAGTCATGACAATCATTCATGATAGAAGGGCCAATCCACACCCAAATTCATATCTAGAAGTTCATTCAACAAAATCTCAAGATATTTACATTGGTTATTGCCACCCAAAACTAGAAATCTACTTACCTCTACAATCCATAGACAAAGTGTAGAAAGAGAACTCCAATACTTAATTACAACCTAAAAGAAAATAAGAACCTAAGTTAAAAGAGATGAAAAATAGTGAAAGAAGAAGAAATTTGCTCCATTCCTAGGCCTTCATTAGTTCTTCCATGATAAACTCTAAAAAAATGAAGAAGAAAGCTTTTCAAATATCGTGGGAGCGCCTAGGCGCTTAAGGAGAGTGCCTAGGTGCTTAGGGAGAGTGTCTACTCAGGTGCCAGATGGGCGCTTGGGTTCTTGCCAAGCGCACGCACGATGTGCATTAAAGTCTGGAGCACCTAAGTACTGCTCTGTTTCTTACTCTTAAGTGTTAAGCGCTTGAGAGAGCACCAACCAGCACCTGGGTGCTCTCCTGGGGACATTTCTTGTCATGTCCTGTCCCTTGAATCCTCGTGCCTCCAATGTGACTCCCAATAGCTCCAATTCAACCTTGAATTGCATGTAAGACTTTGTAATGCATGCTATGCTCAAGAATCTACAAAAATAGACATTTAAACATGCTAAACTAAACAAGCAAGCAAGGTTAGAGACATAAAAATAGCTCTTTTCGAGAGTTATGACAAGTGTATTCTGAAAGCAAAGAAAAGCATGCTAAGTGTCTCAAAATTGTGTTATAGATATTGTGTGACTAGAAGTTATATGCCAAATTCAGCAAATGTGAGTTTTGGCTGGATTGAGTTGTATTCTAGTGTCACGTAGTATCAATAGAGGAAGTAAGTATAGATCCTTAGAAGACTGAAGCCATAGTTAAGTGGGAATGACCCACTAGAGTGATTGAAGTTCGTAGTTTTTTGGCTCTAACAAGCTACTATCATTGGTTTGTGGAAGGATTCTAAAAAATAACACTTCCACTGACGAGTTTGATTAGGAAGAATGCAAAGTTTGAATGGACAGATGAATGTGAACGTTGTAAACCCTACTTCTATACTCCTAGTATCAAGCTAAGTGAGTTATTAGAAGTTGCGGACTTAGAGAATTTTTTTAAATTCATGTTAAAAGAGGAAAGGAAAATGAGTGGTGTAAGAAAGGCTTTGTTGTGGACTTAAGAAAATTATCTTTGTTTAGATTGAAAGAGGCGTGGAAAAGAGAGGCCAAGAAAGGCATGTTTGTGGACTTGGCCGTGGGAATGATTTTAAGCAAGTAGCTAGGCGAGTAGCTTAAGAAGGAAGTGAACAGGTGCTATGAAGAGGAGTAGCCGAGAGCTACTTTGACATGGAGTAGTCGGGTTGAGTGTTTTGGGTGTGGCCGACGTTGAGGAAAGAAATTAGGAAAATTTGGCTAAATATTGGTTTTGGGCGTGGACAACAATTGAGTAGTCGGGCCTAAGTGTGTGTGTGATGCGGGCACAAGGTGTTGGTGAGTAGATGAAGGATGCGTCTATAAAGTGTGATTTATGTTGGTTGATGTGTGCTTGAGTAGCAAGAAGGTAGGATGCGTTTTGTCACGCCCCTCCCAAGTACCCTATTAACCCAGGAGAAAGTGTGAGGACAGCAGACACCGACCCTCCTACGGCATCCACTGTCAACCTTATATCTTGACCATCACCTAATAAGTTCTTCACAATGATTTAACAACATACTTTAACTAGGGTTAAGCTATCATACTTACATTGATTTTCACTCAAACCATATATTTACATAAGTTCTTCAATATTGCCCTTAACCCTCTATATGTACAACTCATGTTTAAGAACAAATATTTACAATTCTCAAAATTCTAGACACTAATGGTGGGCCCAGACGAGTTGCTGTGTAGGCTAAGTGCCCCAGACTCCCTCGGTACCTGAAAAACAGAAAAACAAAGAAAACATGAGCTAGGTTGCCCAGTGAGTGACTTGTTTTGTAAAAACCTTCCTTAACTCGGAAACTAATCAGACTGTAATCATTCTAAAACAATGCGTAAATAACATCAATTCAAAGTCATATCCATGCAAAACATGCTCAAGTGGCA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BLAST of ClCG08G001640 vs. NCBI nr
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BLAST of ClCG08G001640 vs. NCBI nr
Match: XP_004141615.1 (cationic amino acid transporter 1 [Cucumis sativus] >XP_031741583.1 cationic amino acid transporter 1 [Cucumis sativus] >KGN52612.1 hypothetical protein Csa_008097 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1026.2 bits (2652), Expect = 1.6e-295 Identity = 518/586 (88.40%), Postives = 556/586 (94.88%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G001640 vs. NCBI nr
Match: XP_008459518.1 (PREDICTED: cationic amino acid transporter 1-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1017.3 bits (2629), Expect = 7.4e-293 Identity = 516/587 (87.90%), Postives = 553/587 (94.21%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G001640 vs. NCBI nr
Match: KAA0039344.1 (cationic amino acid transporter 1-like [Cucumis melo var. makuwa] >TYK00527.1 cationic amino acid transporter 1-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1013.1 bits (2618), Expect = 1.4e-291 Identity = 514/587 (87.56%), Postives = 551/587 (93.87%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G001640 vs. NCBI nr
Match: XP_038893779.1 (cationic amino acid transporter 1-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 995.7 bits (2573), Expect = 2.3e-286 Identity = 506/584 (86.64%), Postives = 540/584 (92.47%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G001640 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q84MA5 (Cationic amino acid transporter 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CAT1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 802.7 bits (2072), Expect = 3.8e-231 Identity = 394/561 (70.23%), Postives = 470/561 (83.78%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G001640 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O64759 (Cationic amino acid transporter 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CAT5 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 629.4 bits (1622), Expect = 5.7e-179 Identity = 321/570 (56.32%), Postives = 419/570 (73.51%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G001640 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SHH0 (Cationic amino acid transporter 8, vacuolar OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CAT8 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 560.1 bits (1442), Expect = 4.2e-158 Identity = 287/564 (50.89%), Postives = 398/564 (70.57%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G001640 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LZ20 (Cationic amino acid transporter 6, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CAT6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 421.8 bits (1083), Expect = 1.8e-116 Identity = 227/554 (40.97%), Postives = 346/554 (62.45%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G001640 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SQZ0 (Cationic amino acid transporter 7, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CAT7 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 419.9 bits (1078), Expect = 6.9e-116 Identity = 227/561 (40.46%), Postives = 354/561 (63.10%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G001640 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KW03 (AA_permease_C domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G647350 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1026.2 bits (2652), Expect = 7.7e-296 Identity = 518/586 (88.40%), Postives = 556/586 (94.88%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G001640 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CBK9 (cationic amino acid transporter 1-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498634 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1017.3 bits (2629), Expect = 3.6e-293 Identity = 516/587 (87.90%), Postives = 553/587 (94.21%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G001640 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BMU5 (Cationic amino acid transporter 1-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold169G001370 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1013.1 bits (2618), Expect = 6.8e-292 Identity = 514/587 (87.56%), Postives = 551/587 (93.87%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G001640 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K6G4 (cationic amino acid transporter 1-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111490510 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 991.1 bits (2561), Expect = 2.8e-285 Identity = 496/586 (84.64%), Postives = 538/586 (91.81%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G001640 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K040 (cationic amino acid transporter 1-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111490398 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 989.2 bits (2556), Expect = 1.0e-284 Identity = 495/586 (84.47%), Postives = 539/586 (91.98%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G001640 vs. TAIR 10
Match: AT4G21120.1 (amino acid transporter 1 ) HSP 1 Score: 802.7 bits (2072), Expect = 2.7e-232 Identity = 394/561 (70.23%), Postives = 470/561 (83.78%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G001640 vs. TAIR 10
Match: AT2G34960.1 (cationic amino acid transporter 5 ) HSP 1 Score: 629.4 bits (1622), Expect = 4.0e-180 Identity = 321/570 (56.32%), Postives = 419/570 (73.51%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G001640 vs. TAIR 10
Match: AT1G17120.1 (cationic amino acid transporter 8 ) HSP 1 Score: 560.1 bits (1442), Expect = 3.0e-159 Identity = 287/564 (50.89%), Postives = 398/564 (70.57%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G001640 vs. TAIR 10
Match: AT5G04770.1 (cationic amino acid transporter 6 ) HSP 1 Score: 421.8 bits (1083), Expect = 1.3e-117 Identity = 227/554 (40.97%), Postives = 346/554 (62.45%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G001640 vs. TAIR 10
Match: AT3G10600.1 (cationic amino acid transporter 7 ) HSP 1 Score: 419.9 bits (1078), Expect = 4.9e-117 Identity = 227/561 (40.46%), Postives = 354/561 (63.10%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (Charleston Gray) v2.5
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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