ClCG07G008180 (gene) Watermelon (Charleston Gray) v2.5

Overview
NameClCG07G008180
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
DescriptionUnknown protein
LocationCG_Chr07: 21792593 .. 21795172 (+)
RNA-Seq ExpressionClCG07G008180
SyntenyClCG07G008180
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptide
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ACATAAGAAAACTAAGAAGGAAAGGTCTATTGTTAAATGAGTGGTCTTAACACTGAAATACCTTATCGATCATGTCATTGAGTTCATCAGGTATGTTTCTATGGATATTTTATATCAGCTCTCTACCTTTCTTAAAGATCTTGAAGGTAATACATTTACAATTAAATCTAATTTTTCTGTTGAGAAGCGTAGTAATTTGACTCATTTTGACTTGGTTGTGGTTACTGAAGAAACTAAGGTTGTGAGTGGTGACCAAATCATTAATAATATTGATAGTACTATAATGGAGTCTATGAATCTTGTTGACTTTGTTAATCATGTTGAGTTGTTTGATGCTTTGTTTGTTACTTCTGCTAAAATTGTGATCGATCATACTGTGGCTACTGAGATCATTGTTGAGCTTCATGTGTTGTGTGTTTTCATTATTGATAATATTGTTCTTGCTGAATCATTGGATAAAGTCTTTGTCTCTCTTGATACAGTTGTTGAATCTATTGTTCCAACTAGAAGCATTGGGAATATGAGTCATATGCCTGTTAGTTCATCTGAAAATATAGAAAATGTTAAGTCTCTGATTATTGATCAAGTTGAATTCACCATTTCTGTTGATACTGAGATTGATTCCCAAAAACTATTGATCTTGTTGTTTTCTAGGATACTATTAATGCTTTTGTTGGTATTGATTGTGTTTTTTAGGTGAATAAAGTTGTTACTGTTGTTTCACCTAGTCAGTTGGATGTTGTTTTTGAGAATGGGTTAAAGGATGTCAGTGCTTCTATTGTGGTGTCTACTAGTGGTGGTACTATGAATCGTTCTGTTTAATTAGATGTGAATGAGAAAATAATTGTTGATAGTGGTTTGGTTGATCAAGCTATTATGATTAATGATTATCAAGATGCAAGAAAAAAAATACTGTTGTTGAAAATGTTGATAGACTTGAATCAAACATTGGTTTGTGATGATAGAGATAAGTCTATTGTTAGTAAACAAGAAACTAGAGTTGCTGGAAATATTGTTCCTATTGCTTATGTGATTCTGTTGAGATTGAGGGTGTTTCTACTGTTACCAGTGGTAATATTAATGTTATTTCTGAAGATGTACATGAAATTGTTGATGCTTCTATCTTAGTTTCTACTTGTATGGATACTGCAAGTACCCATGCTAAGTTAGCGTTGTCTTAGAAAAATGTTGCTGATAATGACTTAGCTAAAAGTCTTGTTGACCTGTCTATTGTGTGTGTTGAGAATTTTGTCATTGGGAAAGGTTCTTTCTATTTAACGTTGAGTTAAATGTCTCTATCAGTCTTGGTACTGTTCTTTCCAATGCTAGAGAAAGTGCTAGTGAGGATGTGCCTCTTGTTGTTGAGGTCATGACTAATGATGTTTGGGGTGAAGGATCTGGAGGTGAATGGAACTCTGAGGAGATTGATGAAACTCCTTTGAGTGATTTGAGTAGAATGATTAAAATGAAAAATGGGGATGTTGTTGCTTTAAGTCTTAAAGGTTCCTACCTTCTATTTGAAAAAAATATGTTTGTCTCTAAGAGTGATACATTTGTTTCTACTAAAGATGTGGTTGAAGACTTAACCTTTGAGGAAGATATTCTTTATTATACTGATCATATTATTCACAATCCCTTGCTCTTCGATGTGAATATGCGTGAAGATATTTCAGAATTGAATGCTTGTGCCAATAAAACAATTGTTGAGAATGTTGATGTTGATTTTCTTATCAATAAAACTGTTTTGGATTTGCGCATGGACAATTTAGGTTCTAAGGGGCTTAAGGAAGTTAGTATATCTAATATTCCTACTGCTAATCATGTTGATGCTAAATATGTTGCTGATTCTGTTGTTTCCAATGTTGGGCCTGACATTAGGGATACATCCTTTGATGAAGATGATATTATTTTTACAATCTTCAGTAAGTTCAGAAAACGAACTACTAAAAATAAGAAGTTTTTAATTTACCTTAGAAGTTTGTTTTAAATATAGTTCTACATGTGAACCTGTTCTACTATGACTTGATCATTGAGATATTTTATGTGCTAAATCTATTCAAGAATTTGAGAGAACCAAGTAGTCTAGTGCTGAGAAACGTCTTGGTACGGGGTCTCTATGTTGTCTTTTTGCAACCTGATATAATAAACCAGTTGTTGGAAAGGGAAGATTTCATGTTTGTGTTGGAGCATTGTTTTGCTACAAAAGAGGTTATTATTACACTCTCTAGAGGTGTTCGTAAGCATTGGTCTAAGAATGGACAACTCGTCATTGTTGATCTCAATGTCACTTATGTTAGTGTTAATCAACGTCAGCTTGTTCTTGTATTCGTCCAAGACATTCCTCTATTGTTTGATGAGGATATTTTTTCCACTGATGATATCGATGTCTTGGATGGAGCTTTTCTTATTTCTTCTAATGTTGGAAACTACGGTAAGCAGGTTATTTCCTCTAAAGCATGGGCTTTGTGTGTTATCATTCGAAAAAATATTGATCGCATGATTGAAGTGAATGATTTGTTAAATTTGTTGAAGTTAGCTGTTAACTGTATCGATGAGGCCTCTTTTGTCACGGTTAGATGA

mRNA sequence

ACATAAGAAAACTAAGAAGGAAAGGTCTATTGTTAAATGAGTGGTCTTAACACTGAAATACCTTATCGATCATGTCATTGAGTTCATCAGGTATGTTTCTATGGATATTTTATATCAGCTCTCTACCTTTCTTAAAGATCTTGAAGGTAATACATTTACAATTAAATCTAATTTTTCTGTTGAGAAGCGTAGTAATTTGACTCATTTTGACTTGGTTGTGGTTACTGAAGAAACTAAGGTTGTGAGTGGTGACCAAATCATTAATAATATTGATAGTACTATAATGGAGTCTATGAATCTTGTTGACTTTGTTAATCATGTTGAGTTGTTTGATGCTTTGTTTGTTACTTCTGCTAAAATTGTGATCGATCATACTGTGGCTACTGAGATCATTGTTGAGCTTCATGTGTTGTGTGTTTTCATTATTGATAATATTGTTCTTGCTGAATCATTGGATAAAGTCTTTGTCTCTCTTGATACAGTTGTTGAATCTATTGTTCCAACTAGAAGCATTGGGAATATGAGTCATATGCCTGTGAATAAAGTTGTTACTGTTGTTTCACCTAGTCAGTTGGATGTTGTTTTTGAGAATGGGTTAAAGGATGTCAGTGCTTCTATTGTGGTGTCTACTAGTGGTGACTTGAATCAAACATTGGTTTGTGATGATAGAGATAAGTCTATTGTTAGTAAACAAGAAACTAGAGTTGCTGGAAATATTGTTCCTATTGCTTATGTGATTCTGTTGAGATTGAGGGTGTTTCTACTTCTTGGTACTGTTCTTTCCAATGCTAGAGAAAGTGCTAGTGAGGATGTGCCTCTTGTTGTTGAGGTCATGACTAATGATGTTTGGGGTGAAGGATCTGGAGGTGAATGGAACTCTGAGGAGATTGATGAAACTCCTTTGAGTGATTTGAGTAGAATGATTAAAATGAAAAATGGGGATGTTGTTGCTTTAAGTCTTAAAGGTTCCTACCTTCTATTTGAAAAAAATATGTTTGTCTCTAAGAGTGATACATTTGTTTCTACTAAAGATGTGGTTGAAGACTTAACCTTTGAGGAAGATATTCTTTATTATACTGATCATATTATTCACAATCCCTTGCTCTTCGATGTGAATATGCGTGAAGATATTTCAGAATTGAATGCTTGTGCCAATAAAACAATTGTTGAGAATGTTGATGTTGATTTTCTTATCAATAAAACTGTTTTGGATTTGCGCATGGACAATTTAGGTTCTAAGGGGCTTAAGGAAGTTAGTATATCTAATATTCCTACTGCTAATCATGTTGATGCTAAATATGTTGCTGATTCTGTTGTTTCCAATAAGTTTGTTTTAAATATAGTTCTACATGTGAACCTGTTCTACTATGACTTGATCATTGAGATATTTTATGTGCTAAATCTATTCAAGAATTTGAGAGAACCAAGTAGTCTAGTGCTGAGAAACGTCTTGGTACGGGGTCTCTATGTTGTCTTTTTGCAACCTGATATAATAAACCAGTTGTTGGAAAGGGAAGATTTCATGTTTGTGTTGGAGCATTGTTTTGCTACAAAAGAGGTTATTATTACACTCTCTAGAGGTGTTCGTAAGCATTGGTCTAAGAATGGACAACTCGTCATTGTTGATCTCAATGTCACTTATGTTAGTGTTAATCAACGTCAGCTTGTTCTTGTATTCGTCCAAGACATTCCTCTATTGTTTGATGAGGATATTTTTTCCACTGATGATATCGATGTCTTGGATGGAGCTTTTCTTATTTCTTCTAATGTTGGAAACTACGGTAAGCAGGTTATTTCCTCTAAAGCATGGGCTTTGTGTGTTATCATTCGAAAAAATATTGATCGCATGATTGAAGTGAATGATTTGTTAAATTTGTTGAAGTTAGCTGTTAACTGTATCGATGAGGCCTCTTTTGTCACGGTTAGATGA

Coding sequence (CDS)

ATGGATATTTTATATCAGCTCTCTACCTTTCTTAAAGATCTTGAAGGTAATACATTTACAATTAAATCTAATTTTTCTGTTGAGAAGCGTAGTAATTTGACTCATTTTGACTTGGTTGTGGTTACTGAAGAAACTAAGGTTGTGAGTGGTGACCAAATCATTAATAATATTGATAGTACTATAATGGAGTCTATGAATCTTGTTGACTTTGTTAATCATGTTGAGTTGTTTGATGCTTTGTTTGTTACTTCTGCTAAAATTGTGATCGATCATACTGTGGCTACTGAGATCATTGTTGAGCTTCATGTGTTGTGTGTTTTCATTATTGATAATATTGTTCTTGCTGAATCATTGGATAAAGTCTTTGTCTCTCTTGATACAGTTGTTGAATCTATTGTTCCAACTAGAAGCATTGGGAATATGAGTCATATGCCTGTGAATAAAGTTGTTACTGTTGTTTCACCTAGTCAGTTGGATGTTGTTTTTGAGAATGGGTTAAAGGATGTCAGTGCTTCTATTGTGGTGTCTACTAGTGGTGACTTGAATCAAACATTGGTTTGTGATGATAGAGATAAGTCTATTGTTAGTAAACAAGAAACTAGAGTTGCTGGAAATATTGTTCCTATTGCTTATGTGATTCTGTTGAGATTGAGGGTGTTTCTACTTCTTGGTACTGTTCTTTCCAATGCTAGAGAAAGTGCTAGTGAGGATGTGCCTCTTGTTGTTGAGGTCATGACTAATGATGTTTGGGGTGAAGGATCTGGAGGTGAATGGAACTCTGAGGAGATTGATGAAACTCCTTTGAGTGATTTGAGTAGAATGATTAAAATGAAAAATGGGGATGTTGTTGCTTTAAGTCTTAAAGGTTCCTACCTTCTATTTGAAAAAAATATGTTTGTCTCTAAGAGTGATACATTTGTTTCTACTAAAGATGTGGTTGAAGACTTAACCTTTGAGGAAGATATTCTTTATTATACTGATCATATTATTCACAATCCCTTGCTCTTCGATGTGAATATGCGTGAAGATATTTCAGAATTGAATGCTTGTGCCAATAAAACAATTGTTGAGAATGTTGATGTTGATTTTCTTATCAATAAAACTGTTTTGGATTTGCGCATGGACAATTTAGGTTCTAAGGGGCTTAAGGAAGTTAGTATATCTAATATTCCTACTGCTAATCATGTTGATGCTAAATATGTTGCTGATTCTGTTGTTTCCAATAAGTTTGTTTTAAATATAGTTCTACATGTGAACCTGTTCTACTATGACTTGATCATTGAGATATTTTATGTGCTAAATCTATTCAAGAATTTGAGAGAACCAAGTAGTCTAGTGCTGAGAAACGTCTTGGTACGGGGTCTCTATGTTGTCTTTTTGCAACCTGATATAATAAACCAGTTGTTGGAAAGGGAAGATTTCATGTTTGTGTTGGAGCATTGTTTTGCTACAAAAGAGGTTATTATTACACTCTCTAGAGGTGTTCGTAAGCATTGGTCTAAGAATGGACAACTCGTCATTGTTGATCTCAATGTCACTTATGTTAGTGTTAATCAACGTCAGCTTGTTCTTGTATTCGTCCAAGACATTCCTCTATTGTTTGATGAGGATATTTTTTCCACTGATGATATCGATGTCTTGGATGGAGCTTTTCTTATTTCTTCTAATGTTGGAAACTACGGTAAGCAGGTTATTTCCTCTAAAGCATGGGCTTTGTGTGTTATCATTCGAAAAAATATTGATCGCATGATTGAAGTGAATGATTTGTTAAATTTGTTGAAGTTAGCTGTTAACTGTATCGATGAGGCCTCTTTTGTCACGGTTAGATGA

Protein sequence

MDILYQLSTFLKDLEGNTFTIKSNFSVEKRSNLTHFDLVVVTEETKVVSGDQIINNIDSTIMESMNLVDFVNHVELFDALFVTSAKIVIDHTVATEIIVELHVLCVFIIDNIVLAESLDKVFVSLDTVVESIVPTRSIGNMSHMPVNKVVTVVSPSQLDVVFENGLKDVSASIVVSTSGDLNQTLVCDDRDKSIVSKQETRVAGNIVPIAYVILLRLRVFLLLGTVLSNARESASEDVPLVVEVMTNDVWGEGSGGEWNSEEIDETPLSDLSRMIKMKNGDVVALSLKGSYLLFEKNMFVSKSDTFVSTKDVVEDLTFEEDILYYTDHIIHNPLLFDVNMREDISELNACANKTIVENVDVDFLINKTVLDLRMDNLGSKGLKEVSISNIPTANHVDAKYVADSVVSNKFVLNIVLHVNLFYYDLIIEIFYVLNLFKNLREPSSLVLRNVLVRGLYVVFLQPDIINQLLEREDFMFVLEHCFATKEVIITLSRGVRKHWSKNGQLVIVDLNVTYVSVNQRQLVLVFVQDIPLLFDEDIFSTDDIDVLDGAFLISSNVGNYGKQVISSKAWALCVIIRKNIDRMIEVNDLLNLLKLAVNCIDEASFVTVR
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of ClCG07G008180 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of ClCG07G008180 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of ClCG07G008180 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of ClCG07G008180 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
ClCG07G008180.2ClCG07G008180.2mRNA