ClCG04G006860 (gene) Watermelon (Charleston Gray) v2.5
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GCTATTATTGACAATTTGGAAGATGCACAGTGGGAAATAGATAGAGCAATATCAAAGTGTTTGGAAGAAAGCAAACCAGTTTACATTAGCATTTCTTGCAATTTGGTGGCCATTCCTCATCCTTCTTTCTCTGCCCAATCACTCATCCCACTCTCCCTTTCTTCAAAGTAATTAAATAATTCTTATCCCAAAATACTCCATCTTAAATTAAGTTAATCTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTCAAATCTTAGAATAAAATGGTAATACTTTGAAGACTAAATTGAAACTAAACCTAAAATTTAAATACTAAATGTATAACATTTTGAAACTTATAAACTAAATATAAACTAGATACCAAATTCAGGGGTCAAAAATGTATTTTTTCCTAAAAATTTTTTTATTAATCCTTAATTAATTTTTGTTCAATGGTCTTAAAGGCAAAGTAATCAGATGGGTTTGGAGGTTGCAGTGGAGAAAGCAGTTGAGCTTCTAAATAGCGCGGTCAAACCAGTGATGGTCGGCGGAAAGAAGCTACGATTCGCCAAAGCACAAGCTGCATTCCTCGAGCTAGCCGACACTTGTGGCTACGCCGTCGCCGTTACACCGTCGGCAAAAGGCATGTTCCCGGAGAACCACCCTCATTTCATCGGAATTTACTGGGGAACAGTTAGCTCCGCCTACTGCGGTGAGACTGTAGAAATAGCAGACGCCTCAATTTTCGTGGGAGCCACTTTAGACGAACTGGAAACCGTCGGCTACTCGCTTACTTACAAAAAGAACAAAGCCATTATGGTAGAAGCAGATCGCGTTGTGTTTCCTAATGGGTCGAGGTTTGGGCCGATTTTAATGAATGACTTCCTACGGGCCTTAACTAAGCGGCTCAAGCCCAATCTGACGGCTTATGAGAATTATTGTCGGATTTATATACCGGAGTCGGGTCCACGGCAATCGGAGTCGGGCGAGTCGTTGCGGGTCAACGTTCTTTTCAAGCATATTCAGAAAATGTTGACCAATAACATGACTGTGATATCCGAGACAGGTGACTCTTGGTTTCAATGTCAAAAATTGAAATTGCCACAATCATGCAGGTAAAACCTCCCTTTATGATCTTTTCTATTCTTTTAATTTTTGTCTATTGGGGAAGCCATTACAATTTCGGGCAAAAGAAAGCCGCAGATTCAGATCTTCATCTCTACATATATCAAATTGCTAAAATCACTCATGAAGTATGATGTTAGTTGTAAGTACATCCTTAAACTTTCAATCGTAAAAATTGGGCCCCTAAACTTCTAGAGTGTTAAAATTGGACCCTCAAGCTTACAATAATTGTAGAAATTAAACCTACAAATGATAAAAATTGAACCATCAAAGTTATGCCAAATGTTACCATTTATACAATTTGATCCAATTTTCACATTTATAAAAATTTGAGAACTCAAGTTTTAAAATTGAAAGTTTAAAGATGTTATTGCAACTACCACTATACTTCAAGGGTGATTTTGCAATTTACTTTTTTTTTTTTTTAATTATATAAATATCAACTAATATCTAAAGTCCAAATTGTTATTTTTGTAAAGAATAATAAATATTAGCAAGTGGCCAAAGCTAGGAGGGGTATGAAACTTCCTATATCAGGTTGAGGTTATCTATACCAAAGTGAAAAGGGAATGTTTAAGTTGACTTTTTAATTAGAGCATAGAAAAAAAAGTTATTTTCCAAGATCTTGAATAATGTCAAAACTTTTTGAAAAATAGAACCAAACGATCCATTCACGTTAATTTTCAAGTTTAATCCTTTTTTATTACTCTAGCTCTTGCTTTTTAAGAAAATAAATTACATTTTTTGTCCCTATAATTTGAGTAGATTTATTTTTGGATTTTCAAAATTTTAAAATCGACATTTTAATTTTTAAAGTTGGAAAAGAAATGATTTGTTTTTTAACATACTGTCAGTTTTCTGTTAGCTACATTACTATTGTAACCAAGAAGTTGATATGCGACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTAATTTGATTTTTTTAAAATAAACAAAATATTTTAAAAGTCTTTTTCAAATATAACAAAAGGAACCAAAATATTTACAAATATAGCAAAATTTTATTGTCTATCTATTTTTATTTTTCTATTTTAAATACCATTTTTTTTAGCATAAATCTTTCCCGTTTTAAATCATAGAAAAAGGGAGAAATAAGAAAGAAAAAAAAATATTTTTCTATTTTAAAAATTAAAAATGCTTTTTAATTTAGAAAAATGTTACATATAAACCTTTTTTTTATACAACAATTGTGAAGGTGGGGATTGAACCTACAACCTCTACAGATGGAGTACATATTAATACTATTAAATCAAGCTTACTTTAGGTCACATAAACTTTTTGGTAGCTACAATAATGAAAATTTTATGGTAAAGACCCAAAAACTCATTTTCTTAAACATAACAAATTAAAATGTCGAGCTTGAAAATATCAAATCCAAACTAAAAGAATATGTATTTAGCTATATTGATCTTGGCATCACCAAATCTCACGGGACTTCATTATTATGTGATATTATATATGTATGACATAAAGAGGGAAAAATGACTTTGAAAAATTGTAGGTATGAAGTGCAATTGTTATATGCATCAATTGGATGGTCTGTAGGAGCAACTCTTGGGTATGCACAAGGAGCACCAAATGAGCGAATAGTTCTATGTATTGGTGATGGAAGTTTTCAGGTCAATTGTATTTTCACTTTGGCTTTACTATTTTCAAAAATGTTTATAGATAAATACTTTTTTCGTCTATTGATTTTGGGTCTAGTTTCTATTTGGTCCTTAAGTTTCAAAATACTACATATTTGATTTTTAAATTTTGAATTTGGTTTTAATTTAGTCCATAAGTCTATAAATATTACAATTTTATCCTTGAGATTTGATAGTTTTGTTTCAATTTGGTCCTTAAGTTGCAAGATTTACACTTTTAAACTCAATTTTTTACTAAATACTCATGATTTGTTGTTAGGGTTAATGTCTATGGATTAATTTAAAAGAATCAAATAAATTATAATAAATTAAGTTTCATTATTTTTCATCACTATTAAAATTTAGAATTTAAATTCACTTTGTAATTATTTTAAATAAGTTAATGGACGTTAAAGCTAATGATTGAAAGTGAGTATTTAATAAAAAATCAAGGTTAAAAGTGGAAATTTTGAAACTCGGGGATCAAATTGAAACATAACTCAAATCTTAAAGGTAAAATTATTACATTGTAAAACCTAAGAACTAAATTGAAACTAGACAAAGAATTTAAAGACTAAATGTGTAACAATTTAAATTTAAGGACCAAATAAAAATTAGATCTAAAATTTAGAGACTAAAAAGTTAACTCATGTTTTTACGTGGATGCCAAAGTTTTATAAACTACACGAAAACGTTTATTTTTACACCAATTAAAATAAATTGTGCACAAAATTATTATTATTGTTTTATGAAGGATATGAAATGATTTTGGTGTTGTGTAGATGGCTCCCCAAGATGTGTCAACAATGTTAAGATTGAAGCAAAGGAGTATAATATTTTTGATAAATAATGGTGGATATACAATAGAAGTAGAGCTTCATGATGGCCCTTATAATGTCATAAAAAATTGGGATTATACAGCTCTAGTCAATGCCTTGCACAATCATGAAGGCAATTGTTGGACCACTAAGGTAAATTAAAATTTTAAGAATCAAATAAACATAAACCTAAGACCTAGTTTGGTAGTAATTTGTTTTTTAAAATTATGCTTATAGAGACTAATTCTACTTCCAAATTTCTTCCTTTGTTATCTATTTGTTACCAATAGTTTAAAAAACCAAGCCAAAATTTCTAAGACTAAAAAAAGTAGGTTTCAAAAACTTGTTTTTGTTTTTGGAATTTGGCTAAGAATCCAACTATTGTACTTAAGAAAAATGCAAATCATTATAAGAAATGAGAAAAAAATAGACTTAATTTTAAAAAACAAAATAATTGTCAAACAGAGCCTAAAAGTCTTAGAGATTGTACTTATAATTTAATTTGGAGTACTTAACCATCTATCTAATCATTAAACTCTTTTTCTCCATGTTAATGCTTTTAAGGACAAAATATTTTGGGTTTTGGCATATAGGTTCAAACAGAAGAAGAGTTGGTGAATGCAATTGAGACAGCAATGGGGGATCAAAGTGATTGTTTGTGCTTCATAGAAGTTATTGTTCACAGAGATGATACAAGTAAAGAATTACTTGAATTTGGAAATAAGCTTACTGCCCTTGGCAGTCGTCCTCCCAAACCAGCTTTATGATTTTTTTTTTTTTTCATTTTTAGACTTTTATATATATATATATATATATATCTTCAAGTATCATGAATTATGTAAGTCTTTGCTTCTTCCGTCAAAGTGAGAATAACTCAATCAAACTATTAGTGTTTATCCTCAACTACGAGTCAAGAAGTTTGAATTCTTGGCCTAGGTTAGAACTCAATGATGATGACGACAACGACGACGATCATAACAACAACAACTTAGCCATTAAAGTCTTGATTTTACATCAAGGTTCTTTACCACTTTCATTTTATAATTTTAATTATTGTGTTTGTAACCATTTATCTCTACCTCATATATCATATCTAGCTTGAATGAGTTAGAGTTGTAATTCCTCAATTTCAGAAGAGCACAAGTCAAGGTAAAAGCCTCAAGATCTTGCATAATCATGCTTAGTACAATACTTAAAAGTACCTTTTATGATATATTGTTAATTAGAAGGAATTTTTCTGAAATCATCTTGATCATCAACCAAATCTTCTCTTCTTAGAAATCTCCTCAAATAAGCTAATAATTTATTGGAGTCCGTTTGGATTTACTTAATAAATTTTATTTAAAACACTTTTGATAAATCCTTTAAAATACACTCCAAAATCTATTTGGAGTGGTTGTCAAAAACTCTAAATTTTTTCAAAATG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GCTATTATTGACAATTTGGAAGATGCACAGTGGGAAATAGATAGAGCAATATCAAAGTGTTTGGAAGAAAGCAAACCAGTTTACATTAGCATTTCTTGCAATTTGGTGGCCATTCCTCATCCTTCTTTCTCTGCCCAATCACTCATCCCACTCTCCCTTTCTTCAAACGCGGTCAAACCAGTGATGGTCGGCGGAAAGAAGCTACGATTCGCCAAAGCACAAGCTGCATTCCTCGAGCTAGCCGACACTTGTGGCTACGCCGTCGCCGTTACACCGTCGGCAAAAGGCATGTTCCCGGAGAACCACCCTCATTTCATCGGAATTTACTGGGGAACAGTTAGCTCCGCCTACTGCGGTGAGACTGTAGAAATAGCAGACGCCTCAATTTTCGTGGGAGCCACTTTAGACGAACTGGAAACCGTCGGCTACTCGCTTACTTACAAAAAGAACAAAGCCATTATGGTAGAAGCAGATCGCGTTGTGTTTCCTAATGGGTCGAGGTTTGGGCCGATTTTAATGAATGACTTCCTACGGGCCTTAACTAAGCGGCTCAAGCCCAATCTGACGGCTTATGAGAATTATTGTCGGATTTATATACCGGAGTCGGGTCCACGGCAATCGGAGTCGGGCGAGTCGTTGCGGGTCAACGTTCTTTTCAAGCATATTCAGAAAATGTTGACCAATAACATGACTATGGCTCCCCAAGATGTGTCAACAATGTTAAGATTGAAGCAAAGGAGTATAATATTTTTGATAAATAATGGTGGATATACAATAGAAGTAGAGCTTCATGATGGCCCTTATAATGTTCAAACAGAAGAAGAGTTGGTGAATGCAATTGAGACAGCAATGGGGGATCAAAGTGATTGTTTGTGCTTCATAGAAGTTATTGTTCACAGAGATGATACAAGTAAAGAATTACTTGAATTTGGAAATAAGCTTACTGCCCTTGGCAGTCCTGAAACCTTGTCCTCCACCATACCAATGCCAACCGTGGCCACTCGCTCAATGCTCAAGCCTCCCACCTCCAATGGCATTTATAAACCTCACTCCAAATCTAAAACCATTGATACTAACAATCGACCTCAAATGGCTGAGCCTACCGTCGTCCCGTCCACGTTGGGCCACTACCTAGCTCGTCGCCTAGTTCAAATCGGTGTCTCCGATATCTTTGCGGTCCCGGGGGACTCTAATCTCGTGCTACTCGATTACTTTGTGGCAGAAAAAGGGTTGAACCTTGTGGGGTGTTGCAGCGAGCTCAATGCTGGCTATGCAGCTGATGGCTACGCTAGACGTCGCGGTGTTGGAGCTTGTGCTGTGACCTTCACTGTTGGTGGACTCAGCCTCATCAATGCCATTGCTGGTGCTTACTCAGAGGATCTTCCTGTTGTTTGTATTGTCGGTGGACCCAACTCAAATGAATATGGATGTAATAAGAAGATTCTTCATCATACAATTGGGTTGTCGGATTTCAGTCAAGAACTCCAATGCTTTAAAACTGTCACTTGTCATCAGGCAGTTATCAATAATTTGGAAGACGCACAATGGGAGATAGATTGTGCAATTTCCAAGTGTTTGGAAGAGAGCAAGCCGATTTATATCAGCATTGCTTGCAATTTGGCAGCCATTCCTCATCCTTCTTTCTCTATGCAACAACTCCTTCCACCCTCAATCTCTCCCAAACAAAATAGCAAAATGTGTTTAGAGATAGCAGTTGAGAAGGCAGCTCAACTTCTAAATAATGCCATTAAACCAGTCCTGGTCGGAGGAAAGAAGTATGAGATGCAATTGGGATACGCATCTATTGGATGGTCTTTAGGTGCTACTCTTGGATATGCACAAGCTTCATTAGATGATCGTGTGGTTCTTTGCATTGGTGATGGAAGCTTTCAAATGGCTCCACAAGATTTGTCAACAATGTTAAGATTAGAGCAAAGGAACATAATATTTTTGATAAATAATGGTGGATACACCATTGAAGTTGAGATTCATGATGGCCCTTACAATGTCATCAAGAATTGGGATTATACTGCTCTTGTTGATGCCATGCATAATCAGAATGGCAATTGTTGGACAGCCAAGGTTCAAACAGAAGAAGAATTAGTGAAAGCAATTGAAATAGCATCGAGAGACCGAAGTGATTGTTTGTGTTTCATAGAGGCTATCGTTCATAGAGATGATACAAGTAAAGAGTTGCTTGAATTTGGGAACAAACTTGCTGCTATCAATGGTCGTCCTCCAAAGTCCTTATAG AIIDNLEDAQWEIDRAISKCLEESKPVYISISCNLVAIPHPSFSAQSLIPLSLSSNAVKPVMVGGKKLRFAKAQAAFLELADTCGYAVAVTPSAKGMFPENHPHFIGIYWGTVSSAYCGETVEIADASIFVGATLDELETVGYSLTYKKNKAIMVEADRVVFPNGSRFGPILMNDFLRALTKRLKPNLTAYENYCRIYIPESGPRQSESGESLRVNVLFKHIQKMLTNNMTMAPQDVSTMLRLKQRSIIFLINNGGYTIEVELHDGPYNVQTEEELVNAIETAMGDQSDCLCFIEVIVHRDDTSKELLEFGNKLTALGSPETLSSTIPMPTVATRSMLKPPTSNGIYKPHSKSKTIDTNNRPQMAEPTVVPSTLGHYLARRLVQIGVSDIFAVPGDSNLVLLDYFVAEKGLNLVGCCSELNAGYAADGYARRRGVGACAVTFTVGGLSLINAIAGAYSEDLPVVCIVGGPNSNEYGCNKKILHHTIGLSDFSQELQCFKTVTCHQAVINNLEDAQWEIDCAISKCLEESKPIYISIACNLAAIPHPSFSMQQLLPPSISPKQNSKMCLEIAVEKAAQLLNNAIKPVLVGGKKYEMQLGYASIGWSLGATLGYAQASLDDRVVLCIGDGSFQMAPQDLSTMLRLEQRNIIFLINNGGYTIEVEIHDGPYNVIKNWDYTALVDAMHNQNGNCWTAKVQTEEELVKAIEIASRDRSDCLCFIEAIVHRDDTSKELLEFGNKLAAINGRPPKSL Homology
BLAST of ClCG04G006860 vs. NCBI nr
Match: XP_038882338.1 (pyruvate decarboxylase 1-like, partial [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 710.3 bits (1832), Expect = 1.8e-200 Identity = 385/613 (62.81%), Postives = 406/613 (66.23%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG04G006860 vs. NCBI nr
Match: TYK10923.1 (pyruvate decarboxylase 1-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 703.4 bits (1814), Expect = 2.2e-198 Identity = 383/619 (61.87%), Postives = 411/619 (66.40%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG04G006860 vs. NCBI nr
Match: XP_008464266.1 (PREDICTED: pyruvate decarboxylase 1-like [Cucumis melo] >KAA0037738.1 pyruvate decarboxylase 1-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 701.8 bits (1810), Expect = 6.3e-198 Identity = 382/619 (61.71%), Postives = 411/619 (66.40%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG04G006860 vs. NCBI nr
Match: XP_004148630.1 (pyruvate decarboxylase 1 [Cucumis sativus] >KGN54657.2 hypothetical protein Csa_018093 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 694.5 bits (1791), Expect = 1.0e-195 Identity = 378/617 (61.26%), Postives = 408/617 (66.13%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG04G006860 vs. NCBI nr
Match: XP_023544035.1 (pyruvate decarboxylase 1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 654.4 bits (1687), Expect = 1.1e-183 Identity = 362/614 (58.96%), Postives = 390/614 (63.52%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG04G006860 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A2Y5L9 (Pyruvate decarboxylase 1 OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=PDC1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 492.3 bits (1266), Expect = 9.9e-138 Identity = 276/595 (46.39%), Postives = 333/595 (55.97%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG04G006860 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0DHF6 (Pyruvate decarboxylase 1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=PDC1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 492.3 bits (1266), Expect = 9.9e-138 Identity = 276/595 (46.39%), Postives = 333/595 (55.97%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG04G006860 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P28516 (Pyruvate decarboxylase 1 OS=Zea mays OX=4577 GN=PDC1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 487.3 bits (1253), Expect = 3.2e-136 Identity = 279/596 (46.81%), Postives = 333/596 (55.87%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG04G006860 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O82647 (Pyruvate decarboxylase 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PDC1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 474.2 bits (1219), Expect = 2.8e-132 Identity = 270/594 (45.45%), Postives = 333/594 (56.06%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG04G006860 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A2XFI3 (Pyruvate decarboxylase 2 OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=PDC2 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 472.6 bits (1215), Expect = 8.1e-132 Identity = 264/576 (45.83%), Postives = 321/576 (55.73%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG04G006860 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CG96 (Pyruvate decarboxylase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold107G00020 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 703.4 bits (1814), Expect = 1.0e-198 Identity = 383/619 (61.87%), Postives = 411/619 (66.40%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG04G006860 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7T4K4 (Pyruvate decarboxylase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold141G00340 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 701.8 bits (1810), Expect = 3.0e-198 Identity = 382/619 (61.71%), Postives = 411/619 (66.40%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG04G006860 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CL30 (Pyruvate decarboxylase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103502191 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 701.8 bits (1810), Expect = 3.0e-198 Identity = 382/619 (61.71%), Postives = 411/619 (66.40%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG04G006860 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0E0PNR8 (Pyruvate decarboxylase OS=Oryza rufipogon OX=4529 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 645.2 bits (1663), Expect = 3.4e-181 Identity = 359/762 (47.11%), Postives = 447/762 (58.66%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG04G006860 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0E0PNS1 (Pyruvate decarboxylase OS=Oryza rufipogon OX=4529 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 644.4 bits (1661), Expect = 5.8e-181 Identity = 359/762 (47.11%), Postives = 447/762 (58.66%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG04G006860 vs. TAIR 10
Match: AT4G33070.1 (Thiamine pyrophosphate dependent pyruvate decarboxylase family protein ) HSP 1 Score: 474.2 bits (1219), Expect = 2.0e-133 Identity = 270/594 (45.45%), Postives = 333/594 (56.06%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG04G006860 vs. TAIR 10
Match: AT5G01320.1 (Thiamine pyrophosphate dependent pyruvate decarboxylase family protein ) HSP 1 Score: 464.2 bits (1193), Expect = 2.1e-130 Identity = 265/593 (44.69%), Postives = 329/593 (55.48%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG04G006860 vs. TAIR 10
Match: AT5G01330.1 (pyruvate decarboxylase-3 ) HSP 1 Score: 459.5 bits (1181), Expect = 5.1e-129 Identity = 258/562 (45.91%), Postives = 314/562 (55.87%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG04G006860 vs. TAIR 10
Match: AT5G54960.1 (pyruvate decarboxylase-2 ) HSP 1 Score: 459.5 bits (1181), Expect = 5.1e-129 Identity = 267/595 (44.87%), Postives = 327/595 (54.96%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (Charleston Gray) v2.5
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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