ClCG03G011860 (gene) Watermelon (Charleston Gray) v2.5

Overview
NameClCG03G011860
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
DescriptionUnknown protein
LocationCG_Chr03: 23715265 .. 23720139 (-)
RNA-Seq ExpressionClCG03G011860
SyntenyClCG03G011860
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGGATGAACCATTGAAGTTGTTGGCCAAGTCTAGGTTTGAGTGGAACACTTTGCTAAAGGTTATCCGAACGCTGGCCCTAAATTGCCTAACTCCAGAAGCCCATCTATAATGACCCAAACAATCATTAAGTGTATTTTCTAATTTTATTATATTATTATGTTTTTGGTAATTTAGATAAACTAGTATAATTAACTATTTAAATTTAGTTTAGAGTCCTTCATAGACTTAATTTCTGATAATTGTGAGTTATTAAGCTTAAATGATATAATTTCTTTATGAAGGTCGATTTCAATACTAGTTTGAATATGATTATTACAATTCTATTAAAAAAAACAATTACTCTAAATATTTGTAAGTTTGTTATGTTTATGTTTATTTATTTGAATAGTAGAAGGGAAGAATGAATATAAATGCAAGATTATTTAACTTGGTGGGAACGTGATTTTAAGTGGATGTAGGGTATAGTCATTTACAATTTTTTGTAGTTGTAACTTTTTGTCATAAGTTTTTAATTAAATTATTGAGAAGGTAACACAAGATAATTAGGGTTCTTAAAAAAAGTGTTTAAATTCATTAATTAGTACTTGTTTAAAAAGGCTACATAGGAAATAGGAAGAATTCTAGTTATAAGAGTTTAGTTTAGGATTTCTTGGTTGTGCATGCATGGAGGAGGGAGAAAAAGAGGTTTACTCACTTTCCAAAAATGTTGTCTATTAAGTTTTCCAAGTACCCTTTCTTTTATCCTTCAAGAGAGCCTAAATAAATCTGAAAATTTATTCTCTAACCCCCACCCTAGTGCTGTAAATCACACTTCTTAGAGAAAATATTGTGTATTCAAAGTTGTTTCAAGTCGTGTTGTTAGATTTCACATGATTGTTAAATGGTGGCGTCAAATCGGCAAGAAAAACCCCTTTTTAATCTCCTTTTGTAGTGAATCTTTCCCTATTCATTCTTGTAGACCCTAAGTATGTTCATACTTCTTTTCTAAGGTATTCAAGCATTATCTCAAACTCCTTAGTTACTTAAGGTTTCCTCCACCCATCATTACGGCAGAAAGGAAAACGCATCAAACGATAAGGACATTATCTCTACCTTTCAATTTCCTTTACAGGTTATTCTTAACAAACCTAGGTGTTTTTTAGTGCTATTTAGATCTTAAAATGTTGGTTTTAGGTATGAAAATCAAAATGAAAAGGGTTCAAAATAGCCCTTAAAACTAGTGTAAAATTCTGTTTTATTGGTTTATAAAATCTTTCTAGTTTTAGCTTGTTTGATATCAAAATTAAAATACGTTGGCTATAAAACTTTGAAATCATGATCAACAGTTAGGGTTAGCCAAAAAGTATGTTTAAGGCATTAAAATTAATCTTTATGATTTATTTTTTATAAGGCTAAATTTTGGTAAAAACACAATTACTTGAGTTTTCAATTTGTTTCATTAATCTTAAAATTTACAAATAATTTTCATGTATTTTTATGTATAAGTTAGAGGCTAATAAGATCACTAAAATGATTAAGTAATGAGATTTGTATAATTATTTTATTAGTATGGATAACTATGAAAACTAATATGTAGTTTAGGTTAGCTAGATAAATTAGTGTACTTAGCTAGCTACTGAGCTTCATTTAGGAAATCAAATTTAATTTGTTAAAAGCTAATTGAAATCATGATAAATGTTATATAGGAACCTTATAAAGGATTTAAATTTCAAGCTTGAGATAAGAGGATTCTATCATACGTCACCGAATTGTGTGTTTTATTTTTGTGTTGTTCAATTGTATAGTTGTATGATTACTCATAAGTAGCTTCCACCATATGTTGTTAATTGAATGTTTATAATATATATATGTGATTTATAGTTTATAGTTGTGTTTGACTTTTATAAATAATTATACATTGAATTGTTTTCTTGAATCGTGAAGTGTTGAATGTTTGAATTGATTATTGAATAAGACTGATTTATTATGTTTCTTTTATATATGTTTGAGGGAATCTTGTTGATTTGTGACATTTAATTAATGTTTGAGAAAACATGTTACAATGTGTAAATTATCCATGGTTTTTCGCTTCTGATGATTTATATTAGCATGTTGATTGATAATACATGTTTAGGTTAAGCATGCCATCATTATGTGTTACATTGCATTGAAGTTTAGTTTATTAGTCTTATGTGTAATGGAATTAAGTAAGAATATGTTACGCATGAAATATCCAAATTAAGCAGTTATGTTATGCAGCAAGGTGCATGATATGATAAGTATAATTTTTGCTAACGATTGGGTCTAGGAAACAAAACTAGTTCATGTTAATGGTATTTATAAGGGGCAATTACCTTGTAAATATTACATACATAATTGACAGTTATGGTATGGGGTATTGCTACAAAGCATGAGGCTAAATAAAGTATATTAATATGTATGTAGGGATATGCAAGCAAGTGAAAATAAATTTAGTTAGGTTGTTTCATGATTTAAATGACAGGATAGGTTATGGGAGCATGCACGTATGATGTGTGTGATTGATAACTTGTAGAAATACAAGTTATAATTATTCTTCTTAGAATAATGGAGAGAAATTAATGAAATATGCGGCAATCTTGACTTAAAATTGTTGATAAAAATCTTCTCTATGTTCAGCATGTTGAATTATTTAAGGCATATTTAAGGAAGATAAAATTTATTTAAAACACCTAATCTTTTGCAGATAATTGCTTGAATTGAATGCATGCATCCAACAAGCAATCAAATGCAGAACCAAAGACCTTGAGTCGCATGCTTTGGGATCTTTGATACCTACAACCTGACCTTTGGAAGATATTCTGCCCTAATTAGCACTACATCGATCACCTACTAGTCAGAGGTTGACGAAGGGTAGACTCATAATCTGCAGTGCATTAGTAGCAAGGAAATGTCAACATACCAATGTACAATGCAAGCTCTATAAATATACCAAGCCAAAGACAAAAAGAATGTTGTTGAAACCCTTGGACTTTGGTCATCTTTAAGTAGAACCCTTCCAAGAAGACAACCGGAGATAGAGAGCTCGAGAGAGTAATCTTCTCACTGACCAACTATCCCACCACCACAAAGCATGTGTCCATCACCGACGGGAATAAGAGATTGTGACCGTCGGCCTGATACCCTACTTTCTTATCTTTTATGCTTTCTTCAATTGTTTACTTTTATATTTTAAGAAATTGAATATGTTTGTAACAACTTTACTTTATCCATTATTTTCATCTATCCTTCATGAGTTTCACTTCTCTTAATCTATCCACTTTACTTGTTAAAGCCATGAGTAAGTAAATCTATTGAGGGTTGAGGTAAAGTTATCATCTTTCCATTGAACAAATCTTAAAATTACTCTGTTTTGCTTAATGTGTTTGAACTTATTGCTCATTTCCATTTAATTAGTCGAAATAAGTAGCTATAATCAACTGCTTGAGAGAGTAATTGATTGTGAATTTCATCAAGCAAAGTAAGAAATTTTTTTAGAAATAGAAATAACTTTAAGTTCAATAAATCTTCAACCATGCTTCATAGAAATATGATTCATGTGGTTTGTTAACCGAGAGGTGCAACCTAAATAAGATTGAGAACATGGAAGAAAACATAAGAAGCGTTCCAAGGATAGATGATAACGACCCCTAACCCTATTTTTCTCATTCATATAACACTTTTGTTGTTAACTACCGTGCACCCTACATTCCATCATTACCATCGCCTTTAGTTTATTTTATAACTTAAGTTCATTAGACATTTTATAATTTCTTGTATTCGAGAGACCATTCATACTTACAAGAGAACTAATGTAAACCAAAATCCTTGTGTTCGACCTCAAACTCATCGAGAAAACTTATTTTTAGTTTATACTTTGGTTAAAAGTAGGAAAGTTTGTTCTAAAATATCGTTTATGTATCACACATCTAGACTTACAACAATGATTAAGCATGAAGGTTCCTTATGATAGGAACCACTTACAGAGTATTTTTTTATACTACTTCTCATGGTTTTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTAGATAGTCATGTAGATGATAATGATGAGTTCGTCGAGACTGATCTTGGGAGTGAAAAGGAGGAGCTATGAGACATCTCGCCTTAATTTTAATTTAGTTAATTTAGAACCACATATTTATTTTATGTTTATTTCATATTTAAGACCATATTGTTGTTTTATAATTGTCACTGCTAAACTCTAATTTCAAGTTTTATTTAGCATGATAAGATACATTTCTAGTGGAAGCATGAGGTGTATTTTTTAAGAAATTATATTTTATGAGTAATTACCGCTATTTAATTTAATTAAATATATGTAAAAATTGGTCTCATTACACCATCTATGACTCTACATCATCAAGAAATCCCTCATTCCCATGATGCATGATGCCTCAATCTCAAGAGATCGGGTAATGGCAATCTTCTGCATCATGTAGGGAATTCAAATGGACATTAGTCGCATCATCGCGATGAACGGAAGGGGCACTCTTCTTCCCCGTTTTTGTGACAAAGCTATGTGCCAATATGAGCATAATGGAAGGGGCACCTGAAGTGGTAGTGAATGGAATCATCACCAACCAAGTTTCCAGAAGGTTGTTGAGAGATTCCCTGCATATCCCTAAAGCCCCTAAGTTGAAGAGGAGAAAATTAGTGAAGAAGCACTTTGAGATCCCGACGTCAAGTTCCAATCAAAATGGTATGGAGGAAGAAACTCAACTCAATGCCCGACTCTCAATAATTGAAGAAGAAATAACCCTCATTCCATACTATCCTCCGGCTACTCCACTAGAAGAAGATAGGGCATTATCTCCTCTGCTTCCTCAAAAATCCATAATGAACCCTCCTCACTGCTAG

mRNA sequence

ATGGATGAACCATTGAAGTTGTTGGCCAAGTCTAGGTTTGAGTGGAACACTTTGCTAAAGCTATGTGCCAATATGAGCATAATGGAAGGGGCACCTGAAGTGGTAGTGAATGGAATCATCACCAACCAAGTTTCCAGAAGGTTGTTGAGAGATTCCCTGCATATCCCTAAAGCCCCTAAGTTGAAGAGGAGAAAATTAGTGAAGAAGCACTTTGAGATCCCGACGTCAAGTTCCAATCAAAATGGTATGGAGGAAGAAACTCAACTCAATGCCCGACTCTCAATAATTGAAGAAGAAATAACCCTCATTCCATACTATCCTCCGGCTACTCCACTAGAAGAAGATAGGGCATTATCTCCTCTGCTTCCTCAAAAATCCATAATGAACCCTCCTCACTGCTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGATGAACCATTGAAGTTGTTGGCCAAGTCTAGGTTTGAGTGGAACACTTTGCTAAAGCTATGTGCCAATATGAGCATAATGGAAGGGGCACCTGAAGTGGTAGTGAATGGAATCATCACCAACCAAGTTTCCAGAAGGTTGTTGAGAGATTCCCTGCATATCCCTAAAGCCCCTAAGTTGAAGAGGAGAAAATTAGTGAAGAAGCACTTTGAGATCCCGACGTCAAGTTCCAATCAAAATGGTATGGAGGAAGAAACTCAACTCAATGCCCGACTCTCAATAATTGAAGAAGAAATAACCCTCATTCCATACTATCCTCCGGCTACTCCACTAGAAGAAGATAGGGCATTATCTCCTCTGCTTCCTCAAAAATCCATAATGAACCCTCCTCACTGCTAG

Protein sequence

MDEPLKLLAKSRFEWNTLLKLCANMSIMEGAPEVVVNGIITNQVSRRLLRDSLHIPKAPKLKRRKLVKKHFEIPTSSSNQNGMEEETQLNARLSIIEEEITLIPYYPPATPLEEDRALSPLLPQKSIMNPPHC
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
ClCG03G011860.1ClCG03G011860.1mRNA