ClCG03G010800 (gene) Watermelon (Charleston Gray) v2.5

Overview


Name	ClCG03G010800
Type	gene
Organism	Citrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
Description	Unknown protein
Location	CG_Chr03: 19796100 .. 19806765 (+)
RNA-Seq Expression	ClCG03G010800
Synteny	ClCG03G010800

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

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mRNA sequence

ATGTGTAGTAGTGGAAGACTTCGCAGGCAAACTGAGGTCAGGACTCATGATGCTACCATGAGGTCGGTTGAAGAAAGTGAGGGTGAGTCAAGTTATCCACAGATAAGAGTCGGAGCAGATGAGTCTCGAAGAAGAAAGGTTCTTTATGCTCGATCGCCGTCAGTTGTCCTACTTGACTGCCCCGATGTTGTTGCTCGTGTGCTCGACGTTCTGCTCATGCTTCATGCTCGTGGAAGACAACGTCGTTCGTGCTCGTTGCTGAAGCTTCGACCTGCTCATGCTCATGAAGTCACTGGAAGTCAATTGTCGTGCCCGCCGCCTGCTGCCATCGCCATTCCTTCTCGTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGTGTAGTAGTGGAAGACTTCGCAGGCAAACTGAGGTCAGGACTCATGATGCTACCATGAGGTCGGTTGAAGAAAGTGAGGGTGAGTCAAGTTATCCACAGATAAGAGTCGGAGCAGATGAGTCTCGAAGAAGAAAGGTTCTTTATGCTCGATCGCCGTCAGTTGTCCTACTTGACTGCCCCGATGTTGTTGCTCGTGTGCTCGACGTTCTGCTCATGCTTCATGCTCGTGGAAGACAACGTCGTTCGTGCTCGTTGCTGAAGCTTCGACCTGCTCATGCTCATGAAGTCACTGGAAGTCAATTGTCGTGCCCGCCGCCTGCTGCCATCGCCATTCCTTCTCGTTAA

Protein sequence

MCSSGRLRRQTEVRTHDATMRSVEESEGESSYPQIRVGADESRRRKVLYARSPSVVLLDCPDVVARVLDVLLMLHARGRQRRSCSLLKLRPAHAHEVTGSQLSCPPPAAIAIPSR

Homology

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of ClCG03G010800 vs.


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BLAST of ClCG03G010800 vs.


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BLAST of ClCG03G010800 vs.


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InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (Charleston Gray) v2.5
Date Performed: 2022-01-31


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 9..24
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 1..37

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
ClCG03G010800.2	ClCG03G010800.2	mRNA