ClCG02G008600 (gene) Watermelon (Charleston Gray) v2.5

Overview
NameClCG02G008600
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
DescriptionUnknown protein
LocationCG_Chr02: 11416388 .. 11418966 (+)
RNA-Seq ExpressionClCG02G008600
SyntenyClCG02G008600
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGTGAAGGGTGAGGGGGCTGGATGTGTGTTGTCATCAACTGGATGTCATACCCTGCAACCTAATGACATTAGGGATAAGTGGGCCATCTGGTTATATTTCATCATGTTGGGTTTTATGCCTTAAAACTCGTCGATTGTAAATGTAATTATTTGACCGTCATTAAATTATTTAATAAAGAGTTATTGATGTGTTACTTCAATAAGCATTATTGATTGTTTTTGTTTGTTTTGTCTTAATAACCCTAAATCCAATAAACTAAAACAATCAATAATGCTTATTGAAGTAACACATCAATAACTCGTCGATTGTAAATGTAATTATTTGACCGTCATTAAATTATTTAATAAAGAGTCATTGATGTGTTACTTCAATAAGCATTATTGATTGTTTTTGTTTGTTTTGTCTTAATAACCCTAAATCCAATAAACTAACATCCTATATTGTTTTATGAGTCTTGAACTGTATGTGGGGACATATGGAGATCAATGTTTAAGATACAGTCTAAAGGATCTATAGTATAGGGATAAGGCTGGGTACCTTATCCTAGTAACACTATGGATACGGTCCACTTTGTATTTGATACAAACGCAATGATCTAACGCGTTCATATAGGTGACATGCGAGTGAGGGTATCCTATGCAATGAGTTTGTATAAGACCTAGACCATGAAATAATGATCACTAGATGTAACTTCGTTGACTAGTTAGGTTTCTATTTCAATAGGATGACCTAGGCAATTTAGTCTTAATCCTTAATATATTATGAACTCCTGTCCACGAGGGATTGTCCTTTGATTTGTATGAGTCAGAGTGGTTGTTTGCTGACTTAATATGCCTACCATCTTGGGGACAAGACTGAGTGGGGAGCTAGGGACATAATTATACAAGATAGAATTCACTCATTCCCATCTTTAGGGTAAGTAAATATGTGTTCTCTTAAATGGGGCTCCAGGACTTGAACAAAGAGCCTACCCTTTTATTGGCCCGAAAGGGGTTTTTGTTTAATGGTTAGACCATAAATAGGTTGTTCATTAGAGAACCATTGGTACTTAAGGATTTAGAAGTAACTTAGGGTAAAACGGTAATTTGACCTAGCTGGTGTTACAAACACTTGTGAATGACTAATTTGTTGTTATTGGTTTATATCTATGGACACATAAATATATCTGCAGTGAGAAGAATGCAGCTATGGGTCTTTAGTGAAGTGTACCTACAGTGAATGAATATTGATTAATGTGGTTAATGAGTCTAGCCGATTAATCTCATATCGTTGGAGCTTTTGATCTGTAGGTCCATTAAGTCCCCTTCCTAGCTCGTAAAAAGTAATGAGATATTTATGTCTTGAATGAAATTTGATTGAAATTTACTTAGGGAAATAATATAATGTATGATGATACATTATAATATAAAGTTTATTTTGAACTTTACAATATGAATTTAATTTTGGATATGATACAAAATTAATTTTTTAGAAAATTAAATAGTTGAAAGAGTTCAAATATTAATATGAATTAGATTCATATTAAAACTATAGGTTAAAATTAATGTGTATTAGATGCACATTAAAACTATAAGTTACGAGAGAATAACAATTGAATATGATTTTTTCTTAAAAAAAAAAAAAACAATTGAATATGATTCAAATGTAGGTTAAGTTAAATGTTAAATATTAAATATTTAATTTGAAAATTTATTAATTGAAGAATTAATTTTCTTAATTTATTTTAATTAAATTTGATTTAATTAAATTAAATGAATTAAAACTATAGGTTATATGGGAGATGTTCATTTAAATATGATTTAAATGAAATAATTAATTAAATTAGATTTAATTAATTATTAATTATTATTTATTTATTTAATTGTTAAATTAAATAAAGAAAGAAATAAATTAATTAAAAAGGTAACTCTCATACGTGGGAGTTGCGCTTTATGTAGTTTAATCCCACGTCTCTTGATTGCTCTCTTAATAAAGACCTGCAAAAGAAACAGAGAAAGGAAAGTTTTTTTCTTGATAAAAATTTTCTTTAGTTTCTTCCCTTTATCAAGGATCCACAATCCTTTATTTCATCACATAGAGAATAGGAGAGGCTCATGCTGGGGGTGTTTAGAGTCAACAACGAATGTAATCTTCTATCTCTAAAGCATACTTAACCCTGAATGATGTTCTGTAATTTTTTCCCAATGTATTGGTATTTTAAAATCCCAATTTATTTCGAATTTGGTTCTGTATTGCTTCTGCTGTGTTAGGGATTTCAACCCTTTCACATCAAGCATAGGATCATGAGCCCGCACAACCATTTCATTGGAACGAGTCATGCTCCTTTACAACATTAGGAAAATCGTCCCTATTAACTTAGGAGGGATTATAAGGTAAGGAATGGTGGAGTGTGCCCTAGGATGAGAGGGCGCTTGTTCTTTCCTTCCCTCATATGCAAGTTGTGTGCTCGAGTAGATGAGGTGGTGGATGCAACAGAGGAATGTTGCAAAGCCAAGCCAGCAATTGATTTAGGCTTGATCAAGAGGCTTCAAGGAAGTATGGCCACTAGGAAGGGCAAGACCTTGATAAGCACTTGA

mRNA sequence

ATGGTGAAGGGTGAGGGGGCTGGATGTGTGTTGTCATCAACTGGATGTCATACCCTGCAACCTAATGACATTAGGGATAAGTGGGCCATCTGGATGAGAGGGCGCTTGTTCTTTCCTTCCCTCATATGCAAGTTGTGTGCTCGAGTAGATGAGGTGGTGGATGCAACAGAGGAATGTTGCAAAGCCAAGCCAGCAATTGATTTAGGCTTGATCAAGAGGCTTCAAGGAAGTATGGCCACTAGGAAGGGCAAGACCTTGATAAGCACTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGTGAAGGGTGAGGGGGCTGGATGTGTGTTGTCATCAACTGGATGTCATACCCTGCAACCTAATGACATTAGGGATAAGTGGGCCATCTGGATGAGAGGGCGCTTGTTCTTTCCTTCCCTCATATGCAAGTTGTGTGCTCGAGTAGATGAGGTGGTGGATGCAACAGAGGAATGTTGCAAAGCCAAGCCAGCAATTGATTTAGGCTTGATCAAGAGGCTTCAAGGAAGTATGGCCACTAGGAAGGGCAAGACCTTGATAAGCACTTGA

Protein sequence

MVKGEGAGCVLSSTGCHTLQPNDIRDKWAIWMRGRLFFPSLICKLCARVDEVVDATEECCKAKPAIDLGLIKRLQGSMATRKGKTLIST
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (Charleston Gray) v2.5
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availablePROSITEPS51257PROKAR_LIPOPROTEINcoord: 1..16
score: 5.0

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
ClCG02G008600.1ClCG02G008600.1mRNA