ClCG01G001070 (gene) Watermelon (Charleston Gray) v2.5

Overview
NameClCG01G001070
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
DescriptionUnknown protein
LocationCG_Chr01: 923082 .. 929485 (-)
RNA-Seq ExpressionClCG01G001070
SyntenyClCG01G001070
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGCGGTAAGACCAGTGCCATCGATCCCGTCGGTAACTTCCTCGGCAGTGGAAGAAGAGGAAAATCCAGAGGGTCCTTTCCTTCTGAATAACCACATTGCTTCGATTAAAGAGAGATGGAATTTGAAGACGCAATCGGGAGTTATCCGAATCTGCAAATCCGCCTGAAACTTTAAGCTTCTATTGACCAACCACCGGCGGCCAAATCATTGAATTGATATGAACCATGCATTCTGCCACCTCTTTGCACACTCGCCATTTGTGCCCAAATTCACGTTGTATTTGTAACAAACTAGTGGGAAACATCTTAGAAGCTTTAACAAGCAATAATTGCCCAATTTAACGTTGGTTACCAACAAACACCATTAATATGGAAGTGATTTTAACATCAATTTTAATATAAAATATATGCTTTAAAAGGATAAAATTATGGAAGTGATTTTAACATCAATTTTAATGTAAAATATATGCTTTAACAGTATAAAATTAAAAGTTGAATTGGAGTGATTTTAAAATGGTTAAAATAATTTTTGTCATTTTTAAAATTAACGTGAAACATATTTTTAATTCTTTAAAACTAAATGATATAAAAATTGTATAAAAACTAAATTAGTTCTGAGGGATTAAAAATGTGTTTTCGAGTGATTTTAAAAATGACAAAAGTGATTTCTACCAATGTTATTTATGTGTGAGGGTTGGTGGCCATCATTGATTTGAACTCATGACTTTTTAACAATTTATTGAGACTCACTCTATTTTACCACTTGGATGGTTTATATGATTATTATTTTGTATTATATAATTTATAATACGTTACACAATACGTATGACATTTTTTTAAAAATAAATTGAGTTTATGACATGACATATTAGATTTCTAAATGTTTGTATCTTTATTTAATATAATTTGCATTCTAATTTCTATTGTTTGTCAAACATATGTTTTAATTTCAAAATCTAGATGCAATGAGAATATAAAAATGTTATTTTTAGAATTAGCACAATTTGGAGCACAAAATTCAAAAACAATTTTTGAAAATATAATTTTGCTATATTTATAAATATTTTAATTTCTTTTGTTATATTTGAAAAAAACGAATTTAAATTTTTTTTTTATATTGTTTTTAAAGTTATCTTAAATCCCTTTAATCATGCAAATTTTAAATTGGCCTCTTTCGGAAGTAAACAGATACACTCAATCTATGACTAATAGAATAAATTAAAAGCATATAATTGCTAGAATTCAAAACAAACACACAAACATTCAAATAATCTCTCCATAGAAACCAATGGTAAAAGAAGGTGAGAAGAAAAATTAGGCTTTACATGTCCATATTTTGATCTCCTACAATTATCATGATCTCAAGCCTTGAAAATTTCCTATTTCAATTTGTTCACATAAATTTTTACTCCTTTATTCTTTTATTGTCTATGATTAAGTTTTCGCCTTCAATCACTTTTATTTATAGTATACTTTATATTTCAAAACGAATACATAAATATTATAATTTTTGTATAGTTTTGACACTGACACAAGTATTATTTTCAATATATGTACATATTGTGCATCCATCACATTTTATGATTTAATCTTTATTTAGAAGGTAGTATGTAAATTTATATACGTATTTGTTTAAGTATTGGCTCTAATTATATAACATATAGTGTATTTGTGTCATCACGTCTCCAAACCGAAATATAGAATGTTCTTCTAAAAAAAAAACCAAATAAACTCTCACCCACATAATCATGTATTTGATTAATCTCAAAATATTCTTACCGGTCTCTACAGATAATTATATTTTGTCTCCTTAGATTTAAATCTATAAATTGAGATATTTGCTCAATTTTCAGATCTTCCTCAAGTTTGAATTCACATTACGTTTTTTCTGAAATGTTTTCAAATTTTGATTTATCTTTTCTTATTAAACCTTTAAATAGATAAATCCCCCATTAGTTTTTGTATTTAGCACATATAGGGAAATATATTAGGAATAAAGAGATTTTCAAATCAGTCATAATTACGACTTATCTTTACATTGAAACTAGGGATTGGATTTGCAATGATCTAGTGACTAATAGGACAAGAGAGAGTATTGATCTTCCCGTTATCAATCACTGATCATTTTATGATTGATTTTCAAAAGGTTATTCATCTAAGGTGGTAACTAATTGAGATAAAACATATAAGAAATGAAAGTTTTGACGGTTGTTTTAATTATGATCAAATTTGACAAGTATTATGGCAAAATCTTAAATCATTGTGAGATATATATTATTGATTTGGCATTTTGTTACTATGATTTGGTTTGATTAGAAACTCTTGTTCTTATTACTATCCCATCATGTGGATGCCCTAAAATCTCCACTTGTTTCGCCCCCCAATCACCCTCCCAATCTTGGCCATTCAATCCAAAAACCCTATAGAACTATATCTTTAATTTCCCTTTTCGCTGATGATGGTTGCCAAAGCAACCACATGAATTGGTACCCACTTTGCTCTAAAGTATTTACAATCTCCTTAACTTAGTTCTTGATTAGAGCTCTCTAGTTCCCAAAATAGAGGAATACCACACCGATTTAAATGGTTGTTGATTCAACCATTTTAGAATCTCGAATCTCTAATTCGATTCACTTGACTCATCGTTGTTATTTGAGTTCAAACTCAAAATCGACCCCACAATGTACTATGGTAAAAATTATTTTTTTTAAGGGTCTTAATCATTTCCATCTAATTTACTACACATGTTTATAGGTTAAAGATTAAAATGGTGAGTTCTCAAAATCAGATTGAATTTTCAACTTCTAGGAAGAAAAGTCATGTCAACCCTCGTTGACCTAAACTCACTTTGACATATTTAGGATGATTTGAACCTTAAAAAAATCATTTGGAGTTCATTTTGCATTTTTAGAGAAAAAAAGACGTGAATCTAAACTTTTTGGACACGAAGTAAATTATTTGTTTTTACATTGTGAATGTTTATTTTTCTATTAATAATTTTCTTAATCTATAGATTATTTTCGAAGATATTTCCAAAAATAGAAAAACGATTGAAAATAATTGCAAATATAGCAAAACTTTACTTTCTATCTATGATAGACCGCGATAGACCCAAATAGACATTTATTACTTTAGTGATAGACGCAAATAGATGTCTATCTAGGTATATCGGGTTCTATCACAAATAGAAATAAAATTTTGTTATATCTGTAAATAGTTTGATATTTTTTCTATTTATAATAATTTTTCTTATTTTCGTTATTTGATATAATTATTAATTAATAACCCTAACATTCATTTTTTTATCCAATTAACAACTTTCAGACCTCATTTGATAACCATTTGATTTTTTGTTTTTCATTTTTGAAAATGAAGCAAGACTACTTCTACCTTAAATCTCTTCACTTGTTATCTACTTTTTACCAATAGTTTAAAAAATGGACTATTTTCAAAAATAGAAAACAGTTGAAAATAATTACGAACATAGCAAAAATTTACTTTCTACCTCGATAGACCACGATAGACCCAAATAGACATTTGTCACTTTACCAGATAGACACAGATAAATGTCTATTTAGATCTATCGCAGTCTATAGAGATAAAAAGTAAATCTTGCTATATTTATAATAGTTTGATATTGTTTCTATTTATAATAATTTTCCTTAAAAGATCAAGCCAAAATTTGAAAACTAAAAAAAAAAAACTTTGTAAAAACTTGTTTTGTTTTTGAAATTTGGCTAAAAATTCAACTATTGTACTTAAAAAGATGCAAATCATTATGAAAATTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCTTAATGTAAATATTTTGTTTTTTGTCTTTGTTTTTTAAAATTAGGCCTATAAACACTAATTTCATCTTCAAATTACCAATGGTTTAAAAAACCAAACCAAAATTTGAAAACTAAAAAAATAGCTTTTCAAAACTTGCTTTTAATTTGCCAAATAATTTAACTATTATAATTAGGAGAGATACAAATAAATATAAGAAATAAAGTGGAGATAAATTTAATTTAAAAAAAAAAAATTACTTAACATTGCTAAAATAATTACCCATAAAATTTGGCTGTCAGCTCTATTTTCCAGCGTCGAAGGCCCACACCACGCCACGACCCCCCAGCCCACAAGATACCGGCGAAGTCAAGTCTGATGGGGTTGCTTTGTCTTCCATCCGAAACCCTAACTACCATCACGTGCGGCGGCCAGCTTCCTTGATAGAGGTCACGTGCCGAACACGAACCGCACACAAATTGTTAAGCTTAAGCGTCAGAGAGAAAAAAAAGAAAAAAAGAAAAAAAGAAAAATTGAAAAAAAAGAAAAACAATTAATAATTAAAAAAAAAATCTGAAAGTGCAGAATATCAACAGAGGGCTGTCTGAAACCCTAGCTCCAGTCCCTCCTTCTTCCTCCAATCTTTCCTTTGCTGTGCAACATTTCCATTTTCAAGGTACCAATTTATGTTTTTCGCCCTTCTGTGTTCCATTTCCCTATGTTTCTAGCTCTATCGTGTATTACCATATTTTAATTTGTCTTTTTAGCTCCTATTGGTTGGGATTCTGGTTCATTTCAATAACGTCAAGAGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAACACGAGCTTTGTTTTTAGGTACGAATTGCATTTTTTGGTAGTTTGTTGTTCCCTTGGAAATGGAGTCCGTTACTTTTTAATTTGTCGTCATAGGATACGATTTCTGATTCTAATTAATTAGATTTGTTTGTTTTTATGAAAAGAAAAAAAGAGGAAATGGGTATTGAATTTTCGCTTTTGGGTGGTTTTAGTTTGTTCGTTTGTTGGCATGTAGCTGCAGTAGGCACATTTTGCCGTTTTCTCTTAAATGGAATCTGGGCAACGGAAAATTTTCGATTCCTGGACTTTTGTTGTACGTACCATGCTTTATGAAATATGACGCAATATTGAGAATTTCTGGAATGTCTCCCAGTGTTGTGGCTGAAGTGTGGTCAGAAATGGAGTTTCACTAGCTACTACAATTGAAGTTGATTTATTTATGCTGAGTGCGCTTCTTGTAAGCCAGTGCACGACAATTTTGAAATTTGATCAGTATTTTGTTATTTGGCTTTGACACTTGATTTTGGAGTGAAATTTTATCAGTTCTCTTTGAGCTTAGCCTCTCGTGACTAGGATTTTAGATTTTGCATGGATCAATAGATTTAATTATAGAATAATGCAATTAATGGGGCTAAAATTGAAGGACGTGGTTGAGCTTGCATTTGTAGTTGACTGTTGAATGTAGTGATTGCGTGCTCCTTGGAAGGTCTTTACTGTTGAGCGTAGTGATTGCATGCTCCTTGGAAGGTCTACCCTCTAATTCAAACCGAAACTATTTTATCTTTTATCCCAAAGAAAAAAATCCTCAGTAATAAGTATCAAATCCATACTTGTAACATTGTCTGAAGGAGAGATTTCAATATTTCGTCGTCACCAAATTAGATTATTTGCTTTAAGGGTCAAAGCAACCACTATCGTTTTTGTTATGTGTGTTCTCTATGAACTTTTGTCCATCCTTAATAGTTTTAATATGCTCAACTACCAGCAAGCATCACCCCTTCTGAGTAAAGACTTTTAGGTCCAACTCATTTTCAGCTATAGTTTTGTTGCCAAGGTGAAGGTCAGGGTTAGTATCAAGGTGGTGGCTACTTTTTAGTTCCTTTGACTATTGTAGAATTTTTGAAGGAAAGATGGGTCGAGGATCTTGCATGTTCCTTTGATTGTAGATGGAAAAACTGTCTTTTTTTTGGCACTTCTATTGGTCTTCAAAAGGGACAAATGTGTTATCATTCTCTCCTACCCTCTTGAATATTGGTGATAGATTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAAAAAAAATTTAAAAAATAATAGCGAGTGAGAGGACTGAGAGATGACTGGAGTTCTTTAAAGTGGCATTTAGAGAATGGCTGGTGGCTAGCAGAATTAACTTTACAGTTATGCTTTGCAGCTGATTTAACTGTTGGCAGGTTCATTTACCTACTGTGCCACTGGTCAGGTTTCCATGTTCAGGTGGAAAGAAATTGATTGAACCAGAGTGTATTTTTTTTGTTCATCTAAAAATTGATGCTCTGTTATTATAAACAATAAATTCTTGTTGCTCAACATCTTTTTTTACTTGTGTGTGAGGTATGTCATGTCCTTTTATTTTGATATGGTACAAATGCATATCTAGTATGTCTTTGCATGTTACAGAGTGGTGGATATATTGTTTTCATATCTTTTCCAATAATTCTTGCTTTTATTTCTTTTGATCTCAGGTTTTTGGTTATTTGCTAGTCCTTGATTCTAAGTCCCTTCTGTGTAGTGCAGCTAGCTCTCTAAACTTCTATCATCAATAA

mRNA sequence

ATGGCGGTAAGACCAGTGCCATCGATCCCGTCGGTAACTTCCTCGGCAGTGGAAGAAGAGGAAAATCCAGAGGGTCCTTTCCTTCTGAATAACCACATTGCTTCGATTAAAGAGAGATGGAATTTGAAGACGCAATCGGGAGCCCACACCACGCCACGACCCCCCAGCCCACAAGATACCGGCGAAGTCAAGTCTGATGGGGTTGCTTTGTCTTCCATCCGAAACCCTAACTACCATCACGTGCGGCGGCCAGCTTCCTTGATAGAGCTCCTATTGGTTGGGATTCTGGTTCATTTCAATAACGTCAAGAGGTTTGTTCGTTTGTTGGCATGTAGCTGCAGTAGGCACATTTTGCCGTTTTCTCTTAAATGGAATCTGGGCAACGGAAAATTTTCGATTCCTGGACTTTTGTTAAATGGAGTTTCACTAGCTACTACAATTGAAGTTGATTTATTTATGCTGAGTGCGCTTCTTGTCTTTACTGTTGAGCGTAGTGATTGCATGCTCCTTGGAAGGAAAGATGGGTCGAGGATCTTGCATGTTCCTTTGATTGTAGATGGAAAAACTGTCTTTTTTTTGGCACTTCTATTGCGAGTGAGAGGACTGAGAGATGACTGGAGTTCTTTAAAGTGGCATTTAGAGAATGGCTGGTGGCTAGCAGAATTAACTTTACAGTTATGCTTTGCAGCTGATTTAACTGTTGGCAGGTTCATTTACCTACTGTGCCACTGGTCAGGTTTCCATGTTCAGGTTTTTGGTTATTTGCTAGTCCTTGATTCTAAGTCCCTTCTGTGTAGTGCAGCTAGCTCTCTAAACTTCTATCATCAATAA

Coding sequence (CDS)

ATGGCGGTAAGACCAGTGCCATCGATCCCGTCGGTAACTTCCTCGGCAGTGGAAGAAGAGGAAAATCCAGAGGGTCCTTTCCTTCTGAATAACCACATTGCTTCGATTAAAGAGAGATGGAATTTGAAGACGCAATCGGGAGCCCACACCACGCCACGACCCCCCAGCCCACAAGATACCGGCGAAGTCAAGTCTGATGGGGTTGCTTTGTCTTCCATCCGAAACCCTAACTACCATCACGTGCGGCGGCCAGCTTCCTTGATAGAGCTCCTATTGGTTGGGATTCTGGTTCATTTCAATAACGTCAAGAGGTTTGTTCGTTTGTTGGCATGTAGCTGCAGTAGGCACATTTTGCCGTTTTCTCTTAAATGGAATCTGGGCAACGGAAAATTTTCGATTCCTGGACTTTTGTTAAATGGAGTTTCACTAGCTACTACAATTGAAGTTGATTTATTTATGCTGAGTGCGCTTCTTGTCTTTACTGTTGAGCGTAGTGATTGCATGCTCCTTGGAAGGAAAGATGGGTCGAGGATCTTGCATGTTCCTTTGATTGTAGATGGAAAAACTGTCTTTTTTTTGGCACTTCTATTGCGAGTGAGAGGACTGAGAGATGACTGGAGTTCTTTAAAGTGGCATTTAGAGAATGGCTGGTGGCTAGCAGAATTAACTTTACAGTTATGCTTTGCAGCTGATTTAACTGTTGGCAGGTTCATTTACCTACTGTGCCACTGGTCAGGTTTCCATGTTCAGGTTTTTGGTTATTTGCTAGTCCTTGATTCTAAGTCCCTTCTGTGTAGTGCAGCTAGCTCTCTAAACTTCTATCATCAATAA

Protein sequence

MAVRPVPSIPSVTSSAVEEEENPEGPFLLNNHIASIKERWNLKTQSGAHTTPRPPSPQDTGEVKSDGVALSSIRNPNYHHVRRPASLIELLLVGILVHFNNVKRFVRLLACSCSRHILPFSLKWNLGNGKFSIPGLLLNGVSLATTIEVDLFMLSALLVFTVERSDCMLLGRKDGSRILHVPLIVDGKTVFFLALLLRVRGLRDDWSSLKWHLENGWWLAELTLQLCFAADLTVGRFIYLLCHWSGFHVQVFGYLLVLDSKSLLCSAASSLNFYHQ
Homology
[Close]
BLAST of ClCG01G001070 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A7C9DPU1 (Uncharacterized protein (Fragment) OS=Opuntia streptacantha OX=393608 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 59.3 bits (142), Expect = 2.9e-05
Identity = 31/56 (55.36%), Postives = 40/56 (71.43%), Query Frame = 0 

Query: 1  MAVRPVPSIPSVTSSAVEEEENPEGPFLLNNHIASIKERWNL---KTQSGAHTTPR 54
          +AVRP+PS PSVTSSAVE  ENP+ PFLLN+HI+   +RW +   KT+    T+ R
Sbjct: 14 IAVRPLPSTPSVTSSAVELPENPDNPFLLNHHISFHPDRWTIQPAKTKKKKTTSQR 69

[Close]
BLAST of ClCG01G001070 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A2P2JFZ9 (Uncharacterized protein MANES_06G150100 OS=Rhizophora mucronata OX=61149 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 55.5 bits (132), Expect = 4.2e-04
Identity = 25/36 (69.44%), Postives = 32/36 (88.89%), Query Frame = 0 

Query: 1   MAVRPVPSIPSVTSSAVEEEENPEGPFLLNNHIASI 37
           +AVRP PS P VTSSAV+++ENP+GPFLLN+HI S+
Sbjct: 98  IAVRPDPSTPFVTSSAVDDDENPDGPFLLNHHILSL 133

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of ClCG01G001070 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of ClCG01G001070 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of ClCG01G001070 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A7C9DPU12.9e-0555.36Uncharacterized protein (Fragment) OS=Opuntia streptacantha OX=393608 PE=4 SV=1[more]
A0A2P2JFZ94.2e-0469.44Uncharacterized protein MANES_06G150100 OS=Rhizophora mucronata OX=61149 PE=4 SV... [more]
BLAST of ClCG01G001070 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (Charleston Gray) v2.5
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 44..66
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 44..58
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..26

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
ClCG01G001070.2ClCG01G001070.2mRNA