ChyUNG230400 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChyUNG230400
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold32_size1584725: 1392309 .. 1399771 (-)
RNA-Seq ExpressionChyUNG230400
SyntenyChyUNG230400
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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GAAAACAGAAGTCCCGGTAGAGACCGCAAGCCTTCCCAATCCAACGGGGGAGACACCTGGAAAAGATGTGATAGTCTAAACACGTCGAATCGTCCTGTCAGTTGCTACATATGTAACGGGCCACATCGGGCAAAGGAATGTCCAGATAAAGCGGCCTTCTATGCCTTTCAGGCCTCTTTGGCTGAAGACTCAGATGACAAGTTGAGTCAACCAGAGAAGGAAGATGGGCAAATGGAGGAAGTTCAAAATGTCCGAGTGGGAGCTATAAGACTCTTGTCGTCCCTCCAGAAGAAAGCGGGGGAGACAAGGGGAAGCACGAAAGGGGGCCTAGTATATGTTGACATCTGGATCAACCGAAAGCGTGCAAGAAGCACTATGGTCGACTCCGGTGCAACTCATAATTTTATAACGGTGGCCGAAGCCAGACGACTAAACCTTCATTGGAAGAAGGATGCGGGAAAAATGAAGGCCGTGAACTCTACAGCTCTACCCGTCGTTGGAGTAGTGAAACGAGCGGTGATACAGTTGGGAGGATGGAGCGGTTTCGTTGATTTCGTAGTTGTGAGCATGGATGACTTTGACATAGTCCTTGGAATGGAATTCCTTCTTGGACATCAAGTGATCATGATGCCTGCAGCTAGATGTCTGGTGATCACGGGGTCTACCCCCACCATTGTGCAGACAGACCTAGCAACCCAAAGGACTGAGAATGATCTCGGTCATGCAACTAAGGGAGGGCCGTGTTCAGAAGGACACAAGGTGTGTTGTGGAGAAATGTTGTGATGGGAAACGCGATAGTTTGCCCATGTCAGAATTGCCTACGAACAATAGTTGTCCTATGGCGCAGTCAGAGTCAACTGGACTCCGAAGACAGTCACAGAGATTGTCGAGTGCAGAATTCACTAGACCTGCAAAAGCTCCGTATGAAGCTCAAGCCATCTTACGGAAGGAAGAGGAAGGACGGTTGGATATGGACAGCCGTGTTCCGAAGCAAGCCCCGAGGAGAGGGCCAATTCTTGGGTCCGTGAGTGTGACCCAACCTGTTGAAGCTTACGTTAAGGCGTCTAATCATGCGTCGGGTGGCGTCCTAGTGCAGAATGGATGCCCTGTCGCATCTGAGCGTCAGAAACAAAGCACCTTAGAAGGTAGTTATGCGATGTTTGGAGAAGGAACGCTTGCCACGGTACGTAGTCTGAAAGATGGGAGACAGCGTTTCCAAGGACCTACACATGGAAGGGAGGCGAATAACGTTGTGAGCAACCGCGTTAATACTCAGTCGAAATGGACCTTGAGTCAAGCAAAGAGACAGAAAGACCTGTTCGAACTTGACTTTGAGTCAAAACCAAAGAAAGGAACGAGTAACTGGGCAGCTGGTGCCCTTAGTCAGAGAAAGGATCATGTGATTCCGTACGTGGTGACTCGTATACCGGCACGTCAAGTGGATGGCCTAATGCGGAACCCGTCAAGGGAATCCTTGCAGAAAAACTCTGTCACTGAAGTTGGTGTGGGTTTGGCTGAGATCAGTCAGGCAGAACAAAAGAATGGGGTTCAATTGTGGAAGTTGACCCAATTTTGTGTTAATGCTACAATGAATTCGTCAACAGATAGAAACCAGTTTGAGATTGGTTGTGGCGGACGTTCCGTACTGTCGCGCCCTGTTGATCCCTCCTATGCTGATAAGAATCCACAGGCTTGCAACAATACCAAGAGGTGGAAGCAGAAGCCAGACATCGTTCGGGTCGATCAAGAGGAAGCCTCGAAGCGGCGGGAAAAGTGGGTGGATAATAAATATCGCCCCTTAAATTTTTGTGTGAGAGACCGAGTCATTGTCAAACGGCGACCTGAAGCAGACTCGGTTATGAAGACACAAAGATCACCACCTCGTGAGAAGGCACGAGAGACAAGCAGAAGCAGAAGAAGTCCTCACTAAGGAAGTGAGGAAAAGTAGAAGACCCACGAGGAGAGGATACACAAGTTCAAGGCGAAGTGTAAGAGCCTCCTCGTGGAAGAAGCATGTGGAAGACGTACCAAGACCGTGAAGCATGGAAGCAGAAGATCGAAGGATTCCAGCTTTGCCAGTCGACGGGACGTCAACTGTTTAAGTGGGGGAGTGTGTCACGGACATATTTTTCCAAAGTGAGTTTACCTTTGGTTATATGCTCCGATTAGCTCCCATTTATCTTATCTTTAAGCACCATATTTAGTTTAAGCATTTGCTTTTCATTTTAAGTCATAAAGCTTGGGTGTGACGTTTCGGCATTTTCATATGCAAGCCTACCAGAGCCAAAAATGTCAAAATGTACTATAGTAAAAGTAAGAGAGAGGTTATTTTATTTTTTATAAAATAAAAAATAAGTAATAAAATAATACAAAATAATAATAACTAATAAACTAAATAATAAAATGGGCAATAATGTCGTTTTTGAAAATGCGGATGATTAATGTCGGTTTTAAACTGACATTAAACCTGTCTCATTAATGTCAATTTCATCCACATTTTCAAAAACGACATTAATGACCATTTCTCATTTTTTCTATCTGACATTAAAGGCCAAAATTCTTGTAGTGCTAATTACTTTGTCATATTCGTAATATGCAAAAAAGATGTGTCATTGACTATTTTTTTAAAAATGTTTTTGTCATGCAATTTCCCGATAATAAACAGGTTGAATAAATTAAAATATTAAACTTTGAAAATGTTAGGATTAATCTCACAACCTAATGGTTATAAAAGTAGAGTCACAACTACTACACTACAACCATATTTGAATAAAATAAAACATTATTTAGTATATATTATAATCTGACACTTCAAAATTAATATTAAAATACAAAAACCGATAATGTGACAGGGCACGTGTCCCTACTAGCCCTTTAATAAAATTCGCCCATGTCTGAGTTGTTGAACAAGATTGAATTTATTTAATTCTATAAACTCTCATTCCATTCTCTCTTTTATATATATATATATATATATATTAAAATTTTACAAGTTAAGAAAAAGAAGTTTGAATCCAATTTTATAATTGTCTAAAGGTTAAGTCTCTAAGATGCAAAAAATTTAGAATCAATTTTATTTTGGGTGATGGTTAAGCAAATTTTTGTTAAGTGTTGGAAAACGAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAGAAAAAGGCCAAATTTAAAGTTTTGATTTAAGTTGAGAGCATAAATGTCATTTTATTTTATTTCTATTAAATCAATAAAATATAAATATAAAGAAAGAAAATAACTCTTCTTTTCTCCTTCATGGAAGACCCATGGGCACCCCTCCTCTAGAAATCTCTCAATCTCACCGACAGCTATCCTGGGTCGTGTATTTAGTATGCTATCATGGTCGGATTGGGTGGAGGTTACTATTGTGGTGGGTAATAAATATGTGTGTGCTAGTTATGGCCTCATGATTCCATGGTCATGTGCGATCTTATCTTGGCTGTATATATAGACGTCTTGTCATGATCAGATTGGCTACATGTTTGATGGTTGATTGAGGATTATGTGACGATAACGGTGTATTTAATATTTTAATATCGATCCATATTTACTCATCTTGTTGAGCATATTTTACGAGTTTTTACATCTAACTATTTGCCACTCATTGAGTTTTTTGCTTACATTTTCAATGTTTTCTTCCCCTCTCCCCCCAGGTAGCAATGTAGGACCCAGCGTTGTTTGAACCCCCATCATTCTTGTAGATCTTCATTTTTGTATGTGTATAGTTTAAATTTTTGTCATGCATCATTGGGTTGTTAGTCTTGTCAAGAGAGACATTAAAAACTCATGTTTTGAAAGATCTCTCATTAGTTTGTAATCTTTTTGTATGTAATACTTAGTTTGTACCTTGAATTCTACTTGAATTTTTGAAACCGTCTAAATGTATGTAGTGAGACACACTTGTTGTATGTAGTATCTGAAGTTTGTTTATAATCTTATAGAAGTGGAAACATCTTCCTTTTCAGGTGTGGTTACCCCATAGTTAGGGGAGGTGTTGCCGAAATTTTTATAGACAATTTTACAAAAGTGTTTTATCAATCCTACATTTTAAAAGGAAATATTTCGATGAATAGATTCACACTACGATCTAGGTTAGAGGGAAAAACCTAGAATGGGGTGTGACAATTTTGGTATCAGAGTATGATTTTGGGAGACCTAAGGGTTATGCATTTGAGAAATCACATGCTTAGTAACGCTTTAGTGAGTTTCATGGGTTCTATTTACTAAATAAGTGTATTATATCTTTGCGTTATAGGAATCATGCCACGGGGTAGACCTCGAAAACTTCCTGTTCCAGAAGCTAGTAACGCTACTAGAGAAGCAACTATGGGGAACGAGGAGTCTGATGTCGAATCTAGTCGCCTCCATGTTGAGGTCAACGTGGAAGAGCTATTGCTAGATAGACTTGCTCAAAGATTGGCTTCAGGAATTAGATCGACACAACCAGACTCAGAAAAGAAGTATGGAATAGAACTATTGAAGGCATTAGGTGCCACCACTTTTTTCGGGACAACGAATCATGTAGATGTTGAAGCGTGGCTTACCTTAATTGAAAATTGCTTTAGAGTGATGGGATGTCTAAAGGACAGAAAAGTGGAACATGATAAAAAGTAGACGATGAGCTTCAGGTGATATAAGTTGGGATGAGTTTAAAAAGGCATTCTTTGATAAATTTTATCTGCGCTCTTTTAGTCATGAAAAATGAAATGAGTTATTGAAGCTCACTAAGGGCTAAATGACTATTGCTGAATATGAGAAGAAGTATACATAATTGTATAAGTACACCACTAGTGTGATTGAGGATGAGCCTGAAAGGTGCAAGCGATTTGAAGAGGGATTACGAGAGGAAATTTGTACTCTTGTGACAACTTGTGCAAACTAGATTGATTTCTCCAAATTAGTGGGGGCAGCACTAAGAGTGAAGAAAAGTGTAACTAAAAGGAAGCGTGAAAGAGAAACGTCCAAGAATGTACGTACATTCAGCACATC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mRNA sequence

GAAAACAGAAATGGGAGACAGCCTCACTAAGGGCTAAATGACTATTGCTGAATATGAGAAGAAGTATACATAATTGTATAAGTACACCACTAGTGTGATTGAGGATGAGCCTGAAAGGTGCAAGCGATTTGAAGAGGGATTACGAGAGGAAATTTGTACTCTTGTGACAACTTGTGCAAACTAGATTGATTTCTCCAAATTAGTGGGGGCAGCACTAAGAGTGAAGAAAAGTGTAACTAAAAGGAAGCGTGAAAGAGAAACGTCCAAGAATGGTCTGGTAAGAGCAGTGTATGTTATAACTGCGGCCAACCATGTCATTATCTTAGAGACTGTCTGCTTTTGA

Coding sequence (CDS)

GAAAACAGAAATGGGAGACAGCCTCACTAAGGGCTAAATGACTATTGCTGAATATGAGAAGAAGTATACATAATTGTATAAGTACACCACTAGTGTGATTGAGGATGAGCCTGAAAGGTGCAAGCGATTTGAAGAGGGATTACGAGAGGAAATTTGTACTCTTGTGACAACTTGTGCAAACTAGATTGATTTCTCCAAATTAGTGGGGGCAGCACTAAGAGTGAAGAAAAGTGTAACTAAAAGGAAGCGTGAAAGAGAAACGTCCAAGAATGGTCTGGTAAGAGCAGTGTATGTTATAACTGCGGCCAACCATGTCATTATCTTAGAGACTGTCTGCTTTTGA

Protein sequence

ENRNGRQPH*GLNDYC*I*EEVYIIV*VHH*CD*G*A*KVQAI*RGITRGNLYSCDNLCKLD*FLQISGGSTKSEEKCN*KEA*KRNVQEWSGKSSVCYNCGQPCHYLRDCLLLX
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
IPR001878Zinc finger, CCHC-typePROSITEPS50158ZF_CCHCcoord: 86..99
score: 9.438442

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
ChyUNG230400.1ChyUNG230400.1mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
molecular_function GO:0003676 nucleic acid binding
molecular_function GO:0008270 zinc ion binding